Výpis publikací

DROZDOVÁ, Eva, Dana FIALOVÁ, Filip PARDY, Michael DOUBEK, Blanka KŘÍŽOVÁ, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Lenka FALK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Jak jsme zkoumali Gregora Johanna Mendela. 1. vyd. Brno: Masaryk university press. s. 1-103. Munice 7. ISBN 978-80-280-0433-0. 2023.

DROZDOVÁ, Eva, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Dana FIALOVÁ, Filip PARDY, Michael DOUBEK, Blanka KŘÍŽOVÁ, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK a Lenka FALK. Jak jsme zkoumali Gregora Johanna Mendela. Lekce z historické antropologie a paleogenetiky. 1., elektronické vyd. Brno: Masarykova univerzita. 103 s. Munice, číslo svazku 7. ISBN 978-80-280-0434-7. 2023.

DROZDOVÁ, Eva, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Dana FIALOVÁ, Filip PARDY, Michael DOUBEK, Blanka KŘÍŽOVÁ, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK a Lenka FALK. Jak jsme zkoumali Gregora Johanna Mendela. Lekce z historické antropologie a paleogenetiky. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita. 103 s. Munice, číslo svazku 7. ISBN 978-80-280-0433-0. 2023.

PARDY, Filip, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Terézia KURUCOVÁ. Nové trendy v sekvenování nové generace a jejich aplikace v onkologické diagnostice. In XLVII. Brněnské onkologické dny in Klinická Onkologie. 2023.

STRÁNSKÁ, Kamila, Sabina ADAMOVÁ, Michaela BOHÚNOVÁ, Jan SVATOŇ, Karol PÁL, Eva ONDROUŠKOVÁ, Marie JAROŠOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Karolína ČERNOVSKÁ, Jakub Paweł PORC, Filip PARDY, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Solving complex karyotypes in leukemia samples using long-read sequencing. In European Human Genetics Conference (ESHG), Glasgow, United Kingdom. 2023.

ILÍK, Vladislav, Klára PETRŽELKOVÁ, Filip PARDY, Terence FUH, Fréderic NIATOU-SINGHA, Quentin GOUIL, Louise BAKER, Matthew RITCHIE, Aaron JEX, David GAZZOLA, Hanchen LI, Ricardo FUJIWARA, Raffi AROIAN, Barbora PAFČO a Erich SCHWARZ. A new reference genome for the human hookworm Necator americanus. In ICOPA 2022. 2022.

ILÍK, Vladislav, Klára PETRŽELKOVÁ, Filip PARDY, Terence FUH, Fréderic NIATOU-SINGHA, Quentin GOUIL, Louise BAKER, Matthew RITCHIE, Aaron JEX, David GAZZOLA, Hanchen LI, Ricardo FUJIWARA, Raffi AROIAN, Barbora PAFČO a Erich SCHWARZ. A new reference genome for the human hookworm Necator americanus. In ICOPA 2022. 2022.

DROZDOVÁ, Eva, Dana FIALOVÁ, Eva CHOCHOLOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Anna ŠENOVSKÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Romana SARVAŠOVÁ, Lenka FALK, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Michael DOUBEK a Filip PARDY. Body remains of abbot Gregor Johann Mendel. Folia mendeliana. Moravske Zemske Museum, roč. 58, č. 1, s. 37-51. ISSN 0085-0748. 2022.

DROZDOVÁ, Eva, Dana FIALOVÁ, Eva CHOCHOLOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Anna ŠENOVSKÁ, M. PEŠKA, A. ZŮBEK, Michael DOUBEK, Filip PARDY a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Body remains of the founder of genetics Gregor Johann Mendel - a case study. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

FIALOVÁ, Dana, Eva DROZDOVÁ, Eva CHOCHOLOVÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Filip PARDY, Anna ŠENOVSKÁ, Hana SVOBODOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Genetická identifikace kosterních pozůstatků Gregora Johanna Mendela. In Genetická konference Genetické společnosti Gregora Mendela a XXIX. Genetické dny, 2022. ISBN 978-80-7302-182-5. 2022.

DROZDOVÁ, Eva, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Dana FIALOVÁ, Filip PARDY, Blanka KŘÍŽOVÁ, Marek PEŠKA, Kristýna BRZOBOHATÁ, Jan Emil BIERNAT a Jiří DUŠEK. Gregor Johann Mendel. Cesty ke genomu zakladatele genetiky | Begründer der Genetik – die Wege zu seinem Genom | Ways to the genome of the founder of genetics. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita. 197 s. Masaryk University Contributions to Genetics 1. ISBN 978-80-280-0080-6. 2022.

PARDY, Filip, Veronika NAVRKALOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ a Boris TICHÝ. Long read targeted sequencing enables genomic analysis of translocation hotspots in lymphoproliferative diseases. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

PÁL, Karol, Pavla MRHAČOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Sabina ADAMOVÁ, Michaela BOHÚNOVÁ, Jakub Paweł PORC, Filip PARDY, T. RAUSCH, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Vladimír BENEŠ, Boris TICHÝ a Karla PLEVOVÁ. Long-read whole genomes sequencing used to detect complex chromosomal rearrangements. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Barbora ZWINSOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Filip PARDY, Jakub HYNŠT, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Kateřina MRÁZOVÁ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel. Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae. Moravian Museum Brno, roč. 58, č. 1, s. 57-61. ISSN 0085-0748. 2022.

CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Barbora ZWINSOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Filip PARDY, Jakub HYNŠT, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Kateřina MRÁZOVÁ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel. In Mendel Genetics Conference 2022. ISBN 978-80-11-01750-7. 2022.

CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Kateřina MRÁZOVÁ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Barbora ZWINSOVÁ, Filip PARDY, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulárně biologická analýza zubního kamene a mumifikované tkáně Gregora Johanna Mendela. In Genetická konference Genetické společnosti Gregora Mendela a XXIX. Genetické dny. ISBN 978-80-7302-182-5. 2022.

FIALOVÁ, Dana, Eva DROZDOVÁ, Eva CHOCHOLOVÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Filip PARDY, Anna ŠENOVSKÁ, Hana SVOBODOVÁ, Kateřina NOVOTNÁ, Boris TICHÝ, Marek PEŠKA, Antonín ZŮBEK, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Multidisciplinary approach to identification of Gregor Johann Mendel's skeletal remains. Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae. Moravian Museum Brno, roč. 58, č. 1, s. 29-36. ISSN 0085-0748. 2022.

FIALOVÁ, Dana, Eva DROZDOVÁ, Eva CHOCHOLOVÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Filip PARDY, Anna ŠENOVSKÁ, H SVOBODOVÁ, Boris TICHÝ, M. PEŠKA, A. ZŮBEK, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Multidisciplinary approach to identification of Gregor Johann Mendel´s skeletal remains. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

PARDY, Filip, Jakub HYNŠT, Dana FIALOVÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Lukáš HEJTMÁNEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Reconstructing of the genome of Gregor Johann Mendel using state-of-the-art molecular and bioinformatics tools. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

ĎURINÍKOVÁ, Anna, Adam FOLTA, Filip PARDY, Jan SVATOŇ, Marie DRNCOVÁ, Barbora WEINBERGEROVÁ, Petr CETKOVSKY, Zdeněk RÁČIL, Pavel JINDRA, Tomas SZOTKOWSKI, Pavel ZAK, Jiří MAYER a Ivana JEŽÍŠKOVÁ. Single and multiple point NRAS mutations in acute myeloid leukemia: a study of 327 well molecularly characterized patients. LEUKEMIA & LYMPHOMA. ABINGDON: TAYLOR & FRANCIS LTD, roč. 63, č. 13, s. 3237-3240. ISSN 1042-8194. doi:10.1080/10428194.2022.2116931. 2022.

ŠENOVSKÁ, Anna, Eva DROZDOVÁ, Ondřej VACULÍK, Filip PARDY, Kristýna BRZOBOHATÁ, Dana FIALOVÁ, Jaromír ŠMERDA a Petr KOS. Cost-effective straightforward method for captured whole mitogenome sequencing of ancient DNA. Forensic Science International. Clare (Ireland): Elsevier, roč. 319, February 2021, s. 1-7. ISSN 0379-0738. doi:10.1016/j.forsciint.2020.110638. 2021.

DVOŘÁČKOVÁ, Barbara, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, Šárka PAVLOVÁ, Viera HRABČÁKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Filip PARDY, Andrea MAREČKOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Přímá mutační analýza genu TP53 bez nutnosti izolace DNA u vzorků periferní krve a kostní dřeně hematoonkologických pacientů. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

PARDY, Filip. Method optimizzation and development in CF genomics. In XXth Interdisciplinary meeting of young researchs and students in the field of chemistry, biochemistry, molecular biology and biomaterials in Chemické listy. 2020.

TICHÝ, Boris, Filip PARDY, Kristýna BRZOBOHATÁ a Tereza DEISSOVÁ. Ověřená metodika RT-LAMP Detekce viru SARS-CoV-2019. Neuveden, 2020.

VOREL, Jiří, KRYSTYNA CWIKLINSKI, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Filip PARDY, David POTĚŠIL, Lucie JEDLIČKOVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ a Martin KAŠNÝ. Omics analyses and functional proteins of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea). In Parasitic Helminths: New Perspectives in Biology and Infection. 2019.

VOREL, Jiří, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Filip PARDY, David POTĚŠIL, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Lucie JEDLIČKOVÁ, Hana DVOŘÁKOVÁ, Libor MIKEŠ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Monogenea, fish parasites and their unknown molecules. In International Symposium on Flatworm Biology. 2018.

VOREL, Jiří, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Filip PARDY, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Libor MIKEŠ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Monogeneans in the pores. In 24th Helminthological Days. ISBN 978-80-7444-057-1. 2018.

TOM, Nikola, Filip PARDY, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Základní bioinformatické pojmy a postupy využívané pro analýzu DNA pomocí sekvenování nové generace. Transfuze a hematologie dnes. Praha: Společnost pro transfuzní lékařství a Česká hematologická společnost ČLS JEP, roč. 24, č. 3, s. 174-180. ISSN 1213-5763. 2018.

VOREL, Jiří, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Filip PARDY, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Hana DVOŘÁKOVÁ, Lucie JEDLIČKOVÁ, Libor MIKEŠ, Dagmar JIRSOVÁ, Božena KOUBKOVÁ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Could nanopore sequencing help us improve genome assembly of Eudiplozoon nipponicum (Polyopisthocotylea, Diplozoidae)? In 6th ECIP meeting - European Centre of Ichtyoparasitology. ISBN 978-80-210-8799-6. 2017.

BRHELOVÁ, Eva, Mariya ANTONOVA, Filip PARDY, Iva KOCMANOVÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Martina LENGEROVÁ. Investigation of next-generation sequencing data of Klebsiella pneumoniae using web-based tools. Journal of Medical Microbiology. Reading: Society for General Microbiology, roč. 66, č. 11, s. 1673-1683. ISSN 0022-2615. doi:10.1099/jmm.0.000624. 2017.

WAYHELOVÁ, Markéta, Jan OPPELT, Jan SMETANA, Filip PARDY, Hana FILKOVÁ, Renata GAILLYOVÁ a Petr KUGLÍK. The clinical impact of targeted „next-generation“ sequencing in molecular diagnostics of intellectual disabilities and multiple congenital abnormalities. In The Biomania Student Scientific Meeting 2017. ISBN 978-80-210-8737-8. 2017.

WAYHELOVÁ, Markéta, Jan OPPELT, Denisa VESELÁ, Jan SMETANA, Filip PARDY, Hana FILKOVÁ, Dita MATUCHOVÁ, Jana ŠOUKALOVÁ, Renata GAILLYOVÁ a Petr KUGLÍK. The clinical utility of array-CGH and targeted NGS in idiopathic intellectual disabilities and developmental delays: a case report of SCN2A p.Ala263Val variant. In The European Human Genetics Conference ESHG 2017. ISSN 1018-4813. 2017.

POSPÍŠILOVÁ, Šárka, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY a Michael DOUBEK. Analýza genových aberací spojených s Ph-like ALL. In Schůzka Centra kompetence MOLDIMED, Olomouc, červen 2016. 2016.

PARDY, Filip, Boris TICHÝ, Karol PÁL, Nikola TOM, Kateřina ČERNÁ, Marek MRÁZ a Kristýna HRAZDILOVÁ. Introduction of nanopore sequencing to genomic core facility RNA workflows. In London calling, Londýn, květen 2016. 2016.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Boris TICHÝ, Barbara KANTOROVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Filip PARDY, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Marek MRÁZ, Karla PLEVOVÁ, Eva DIVÍŠKOVÁ, Alexandra OLTOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. Detailed analysis of therapy-driven clonal evolution of TP53 mutations in chronic lymphocytic leukemia. Leukemia. London: NATURE PUBLISHING GROUP, roč. 29, č. 4, s. 877-885. ISSN 0887-6924. doi:10.1038/leu.2014.297. 2015.

TICHÝ, Boris a Filip PARDY. Metoda pro klasifikaci endoparazitů primátů. Brno: Veterinární a farmaceutická univerzita Brno. 1 s. 2015.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Gabriela PAVLASOVÁ, Michal JEŽ, Nikola TOM, Filip PARDY, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER, Jaroslav KOČA, R. CALOGERO, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNA involvement in DNA damage response and BCR signaling in malignant B cells. In AACR Annual Meeting 2015. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Vasileios BIKOS, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show feature sof somatic hypermutation process with prominent diference between IGHV mutated and unmutated chronci lymphocytic leukemia. In CEITEC PhD Retreat. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Marek MRÁZ, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show features of somatic hypermutation process with prominent difference between IGHV mutated and unmutated chronic lymphocytic leukemia. In 20th Congress of the European Hematology Association in Haematologica. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Vasileios BIKOS, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show features of somatic hypermutation process with prominent difference between IGHV mutated and unmutated chronic lymphocytic leukemia. In International Workshop Algorithmics, Bioinformatics and Statistics for NGS data analysis. 2015.

TICHÝ, Boris a Filip PARDY. Sekvenování virové DNA z terénních izolátů. Brno: Veterinární a farmaceutická univerzita Brno. 1 s. 2015.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Filip PARDY, Nikola TOM, Kateřina MUSILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jaroslav KOČA, Calogero RINOLDO, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. Biological and clinical relevance of mirnas induced in chronic lymphocytic leukemia (CLL) cells during administration of therapy in vivo and in vitro. ISSN 0390-6078. 2014.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Boris TICHÝ, Barbara KANTOROVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Filip PARDY, Lenka RADOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. Deep sequencing for identification of minor-clone TP53 mutations before their clonal selection by therapy in chronic lmyphocytic leukemia. In 16th International p53 workshop, Švédsko. 2014.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Nikola TOM, Filip PARDY, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER a Jaroslav KOČA. Identification of microRNAs involved in DNA damage response in malignant B cells and their biological and clinical relevance. In AACR Annual Meeting, San Diego. 2014.

ANTONOVA, Mariya, Eva BRHELOVÁ, Filip PARDY, Zdeněk RÁČIL, Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Sekvenování nové generace jako nástroj moderního mikrobiologického výzkumu. In XXII. Moravsko-slovenské mikrobiologické dny. ISBN 978-80-87735-13-8. 2014.

PLEVOVÁ, Karla, Kamila BRÁZDILOVÁ, Kateřina BURČKOVÁ, Marek BORSKÝ, Karol PÁL, Filip PARDY, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Boris TICHÝ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Significance of genomic abnormalities in evolution of biclonal chronic lymphocytic leukemia. In Human Genome Meeting, Švýcarsko. 2014.

BRHELOVÁ, Eva, Mariya ANTONOVA, Filip PARDY, Iva KOCMANOVÁ, Zdeněk RÁČIL a Martina LENGEROVÁ. Whole genome sequencing of multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae strains. In CEITEC Annual Conference Frontiers in Material and Life Sciences. ISBN 978-80-210-7159-9. 2014.