Výpis publikací

HALAŠTOVÁ, Barbora; Kateřina NAVRÁTILOVÁ; Richard PAVČÍK; Lenka KRAJČOVIČOVÁ; Jan BÖHM; Barbora ZWINSOVÁ a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Asociace bakterií metabolizujících sirné látky s Parkinsonovou chorobou. In Jak na mikrobiom. 2026.

CERULOVÁ, Sabina; Jan BÖHM; Barbora ZWINSOVÁ; Jan KŘIVÁNEK a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Bacteriome Analysis of Oral and Ceacal Samples from GALNT3-Deficient Mice. In Jak na mikrobiom. 2026.

ZWINSOVÁ, Barbora; Ondřej TOMÍK; Jan HOFMAN; Petra BRENEROVÁ; Pavla HOLOCHOVÁ; Michal JEŠETA; Lenka MEKIŇOVÁ a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Bacteriome and mycobiome signatures in vaginal and stool samples across three menstrual cycles. In Jak na mikrobiom. 2026.

HOFMAN, Jan; Barbora ZWINSOVÁ; Petra BRENEROVÁ a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Methodological assessment of the male reproductive microbiome. In Jak na mikrobiom. 2026.

JANAK, David; Bohumil BAKALAR; Marta FRIDRICHOVA; Barbora ZWINSOVÁ; Robert ZAJICEK; Břetislav LIPOVÝ a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. When probiotics turn deadly: a case of Lacticaseibacillus rhamnosus sepsis in a burn patient. Folia Microbiologica. Springer, 2026, 6 s. ISSN 0015-5632. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s12223-026-01445-x.

ZWINSOVÁ, Barbora; Vojtěch BARTOŇ; Jan BÖHM a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Advanced Computational Resources for Multi-Omics Analyses in Microbiome Research. In CTLS 2025. 2025.

ZWINSOVÁ, Barbora; Vojtěch BARTOŇ; Jan BÖHM a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Advanced Computational Resources for Multi-Omics Analyses in Microbiome Research. In CTLS 2025. 2025.

CAMANDONA, Alessandro; Amedeo GAGLIARDI; Nicola LICHERI; Sonia TARALLO; Giulia FRANCESCATO; Eva BUDINSKÁ; Martina ČARNOGURSKÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Barbara MARTINOGLIO; Lorenzo FRANCHITTI; Gaetano GALLO; Santina CUTRUPI; Michele DE BORTOLI; Barbara PARDINI; Alessio NACCARATI a Giulio FERRERO. Multiple regulatory events contribute to a widespread circular RNA downregulation in precancer and early stage of colorectal cancer development. BIOMARKER RESEARCH. LONDON: BMC, 2025, roč. 13, č. 1, s. 1-18. ISSN 2050-7771. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s40364-025-00744-8.

KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Lenka; Soňa SMETANOVÁ; Jacek MARCINIAK; Kristýna BRODÍKOVÁ; Dominika POLAŠTÍK KLEKNEROVÁ; Barbora LAKOTOVÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Vojtěch THON; Petra VÍDEŇSKÁ a Eva BUDINSKÁ. Sampling frequency matters: mapping of the healthy infants' gut microbiome during the first year of life. Current Research in Microbial Sciences. Elsevier B.V., 2025, roč. 9, January, s. 100470-100484. ISSN 2666-5174. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.crmicr.2025.100470.

KRČMÁROVÁ, Dominika; Pavla HOLOCHOVÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Michal BARTOŠ; Milan URÍK; Filip RŮŽIČKA a Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Targeted identification and quantification of selected bacteria associated with otitis media – a methodological study. In Setkání biochemiků a molekulárních biologů 2025. 2025.

CHOCHOLOVÁ, Eva; Eva DROZDOVÁ; Dana FIALOVÁ; Pavel ROUDNICKÝ; Zbyněk ZDRÁHAL; Barbora ZWINSOVÁ; Kateřina NOVOTNÁ; Filip PARDY; Jakub HYNŠT; Marek PEŠKA; Antonín ZŮBEK; Kateřina MRÁZOVÁ; Vladislav KRZYŽÁNEK; Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel. Folia Mendeliana : supplementum ad Acta Musei Moraviae. Moravian Museum Brno, 2022, roč. 58, č. 1, s. 57-61. ISSN 0085-0748.

CHOCHOLOVÁ, Eva; Eva DROZDOVÁ; Dana FIALOVÁ; Pavel ROUDNICKÝ; Zbyněk ZDRÁHAL; Barbora ZWINSOVÁ; Kateřina NOVOTNÁ; Filip PARDY; Jakub HYNŠT; Marek PEŠKA; Antonín ZŮBEK; Kateřina MRÁZOVÁ; Vladislav KRZYŽÁNEK; Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Metagenomic and proteomic analysis of dental calculus of abbot Gregor Johann Mendel. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022. ISBN 978-80-11-01750-7.

CHOCHOLOVÁ, Eva; Eva DROZDOVÁ; Dana FIALOVÁ; Martin ČERNÝ; Barbora ZWINSOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ; Kristýna BRZOBOHATÁ a Kateřina NOVOTNÁ. Metagenomic research of the ancient human dental calculus as a potential source for the study of rare infectious diseases. In The Biomania Student Scientific Meeting 2022. 2022. ISBN 978-80-280-0040-0.

CHOCHOLOVÁ, Eva; Eva DROZDOVÁ; Dana FIALOVÁ; Kateřina NOVOTNÁ; Pavel ROUDNICKÝ; Zbyněk ZDRÁHAL; Kateřina MRÁZOVÁ; Vladislav KRZYŽÁNEK; Barbora ZWINSOVÁ; Filip PARDY; Marek PEŠKA; Antonín ZŮBEK; Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulárně biologická analýza zubního kamene a mumifikované tkáně Gregora Johanna Mendela. In Genetická konference Genetické společnosti Gregora Mendela a XXIX. Genetické dny. 2022. ISBN 978-80-7302-182-5.

KOTÁSKOVÁ, Iva; Vít SYROVÁTKA; Hana OBRUČOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Veronika HOLÁ; Eva BLAŠTÍKOVÁ; Filip RŮŽIČKA a Tomáš FREIBERGER. Actinotignum schaalii: Relation to Concomitants and Connection to Patients’ Conditions in Polymicrobial Biofilms of Urinary Tract Catheters and Urines. Microorganisms. Basel: MDPI, 2021, roč. 9, č. 3, s. 1-23. ISSN 2076-2607. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/microorganisms9030669.

ZWINSOVÁ, Barbora; Viacheslav PETROV; Martina HRIVŇÁKOVÁ; Stanislav SMATANA; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Natálie KAZDOVÁ; Vlad POPOVICI; Roman HRSTKA; Roman ŠEFR; Beatrix BENCSIKOVÁ; Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ; Veronika BRYCHTOVÁ; Rudolf NENUTIL; Petra VÍDEŇSKÁ a Eva BUDINSKÁ. Colorectal Tumour Mucosa Microbiome Is Enriched in Oral Pathogens and Defines Three Subtypes That Correlate with Markers of Tumour Progression. Cancers. MDPI, 2021, roč. 13, č. 19, s. 1-25. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/cancers13194799.

SELINGEROVA, I.; Eva BUDINSKÁ; Barbora ZWINSOVÁ; B. MAZALOVA; B. BENCSIKOVA; D. VALIK a L.Z. DUBSKA. Anti-alpha gal antibodies in the context of blood group and stool and tumour-adjacent microbiome in colorectal cancer patients. In Immuno-Oncology Congress of the European-Society-for-Medical-Oncology (ESMO). 2019. ISSN 0923-7534.

CHOCHOLOVÁ, Eva; Dana FIALOVÁ; Eva DROZDOVÁ; Radim SKOUPÝ; Kristýna BRZOBOHATÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ a Václav CHOCHOLA. Looking at the health of past populations through the lens of human dental calculus. In The Biomania Student Scientific Meeting & EUSynBioS Symposium 2019. 2019. ISBN 978-80-210-9373-7.

CHOCHOLOVÁ, Eva; Dana FIALOVÁ; Eva DROZDOVÁ; Radim SKOUPÝ; Kristýna BRZOBOHATÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ a Václav CHOCHOLA. Microbial Contamination of Ancient Human Dental Calculus Studied by Scanning Electron Microscopy and Metagenomic Approach. In 6th International Anthropological Congress of Dr. Aleš Hrdlička. 2019. ISSN 2336-4777.

KOTÁSKOVÁ, Iva; Hana OBRUČOVÁ; Barbora MALIŠOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Tereza PEROUTKOVÁ; Milada DVOŘÁČKOVÁ; Petr KUMSTÁT; Pavel TROJAN; Filip RŮŽIČKA; Veronika HOLÁ a Tomáš FREIBERGER. Molecular Techniques Complement Culture-Based Assessment of Bacteria Composition in Mixed Biofilms of Urinary Tract Catheter-Related Samples. Frontiers in Microbiology. Lausanne: Frontiers Media SA, 2019, roč. 10, č. 462, s. 1-15. ISSN 1664-302X. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00462.

VÍDEŇSKÁ, Petra; Kristýna ŠMERKOVÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Vlad POPOVICI; Lenka MICENKOVÁ; Karel SEDLAR a Eva BUDINSKÁ. Stool sampling and DNA isolation kits affect DNA quality and bacterial composition following 16S rRNA gene sequencing using MiSeq Illumina platform. Scientific reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2019, roč. 9, SEP 2019, s. 1-14. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-019-49520-3.

FIALOVÁ, Dana; Eva CHOCHOLOVÁ; Eva DROZDOVÁ; Kristýna BRZOBOHATÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ; Václav CHOCHOLA a Bohuslav KLÍMA. Study of domestication via human dental calculus in the Early Middle Ages. In 6th International Anthropological Congress of Dr. Aleš Hrdlička. 2019. ISSN 2336-4777.

ZWINSOVÁ, Barbora; Veronika BRYCHTOVÁ; Martina HRIVŇÁKOVÁ; Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ; Beatric BENCSIKOVÁ; Roman ŠEFR; Rudolf NENUTIL; Petra VÍDEŇSKÁ a Eva BUDINSKÁ. Vliv mikrobiomu na vznik a vývoj kolorektálního karcinomu. Klinická onkologie. Ambit Media, a.s., 2019, roč. 32, č. 4, s. 261-269. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://doi.org/10.14735/amko2019261.

ZWINSOVÁ, Barbora; Jan OPPELT; Petra VÍDEŇSKÁ a Eva BUDINSKÁ. Identifikace mikrobiomu kolorektálního karcinomu z RNAseq dat nádorové tkáně a jeho korelace s klinickými proměnnými a molekulárními podtypy. In Brněnské onkologické dny. 2018. ISSN 0862-495X.

BYSTRÝ, Vojtěch; Tomáš REIGL; Adam KREJČÍ; Martin DEMKO; Barbora HANÁKOVÁ; Andrea GRIONI; Henrik KNECHT; Max SCHLITT; Peter DREGER; Leopold SELLNER; Dietrich HERRMANN; Marine PINGEON; Myriam BOUDJOGHRA; Jos RIJNTJES; Christiane POTT; Anton W. LANGERAK; Patricia J. T. A. GROENEN; Frederic DAVI; Monika BRUGGEMANN a Nikos DARZENTAS. ARResT/Interrogate: an interactive immunoprofiler for IG/TR NGS data. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 33, č. 3, s. 435-437. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw634.

KOTÁSKOVÁ, Iva; Petra VÍDEŇSKÁ; Hana OBRUČOVÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Barbora MALIŠOVÁ; Veronika HOLÁ a Tomáš FREIBERGER. Comparison of Culture and Sequencing-Based Assessment of Bacterial Consortia Composition in Biofilms of Catheters. In ASM Microbe 2017, New Orleans. 2017.

KOTÁSKOVÁ, Iva; Petra VÍDEŇSKÁ; Hana OBRUČOVÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Barbora MALIŠOVÁ; Veronika HOLÁ a Tomáš FREIBERGER. Comparison of Culture and Sequencing-Based Assessment of Bacterial Consortia Composition in Biofilms of Catheters. In ASM Microbe 2017. 2017.

KOTÁSKOVÁ, Iva; Barbora ZWINSOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ; Veronika HOLÁ a Tomáš FREIBERGER. Comparison of ready-to-use bioinformatic tools for 16S rRNA amplicon next-generation sequencing data analysis. In International Conference on Clinical Metagenomics, Ženeva. 2017.

FIEDOROVÁ, Kristýna; Juraj BOSÁK; Barbora ZWINSOVÁ; Matej LEXA; Jiří LITZMAN; Tomáš FREIBERGER a David ŠMAJS. Gastrointestinal microbiome in patients with primary immune deficiencies. In Food, Microbiota and Immunity, Třešť. 2017.

HANÁKOVÁ, Barbora; Jan OPPELT a Eva BUDINSKÁ. Identification of subtype specific microbiome from tumour tissue RNAseq data in colorectal cancer. In 15th European Conference on Computational Biology. 2016.

JENSEN, Niels F.; Jjan STENVANG; Mette K. BECK; Barbora HANÁKOVÁ; Kirstine C. BELLING; Khoa N. DO; Birgitte VIUFF; Sune B. NYGARD; Ramneek GUPTA; Mads H. RASMUSSEN; Line S. TARPGAARD; Tine P. HANSEN; Eva BUDINSKÁ; Per PFEIFFER; Fred BOSMAN; Sabine TEJPAR; Arnaud ROTH; Mauro DELORENZI; Claus L. ANDERSEN; Maria U. RØMER; Nils BRÜNNER a José M.A. MOREIRA. Establishment and characterization of models of chemotherapy resistance in colorectal cancer: Towards a predictive signature of chemoresistance. Molecular oncology. Oxford: Elsevier Science Inc., 2015, roč. 9, č. 6, s. 1169-1185. ISSN 1574-7891. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.molonc.2015.02.008.