Bakalářská práce

Eficient calculation of the nearest mutual distances of cell masks

Konstantin Yarovoy
Anotace

V oblasti zpracování biomedicínských obrazů je většina obrazových analýz založena na snímcích s označenými, segmentovanými 2D a 3D obrazy jader a buněk, které byly pořízeny optickým mikroskopem. Jednou z často používaných operací na těchto snímcích je výpočet přesných vzdáleností mezi všemi buňkami na snímku. Často je součástí složitějších operací zpracování obrazu, a proto by výpočet vzdáleností neměl …více

Abstract

In the field of biomedical image processing, most of the image analyses are based on images with labeled, segmented 2D and 3D images of nuclei and cells that were captured with an optical microscope. One of the often used operations on these images is a calculation of precise distances between all cells in the image. It is often a part of more complex image processing operations, and thus, computation …více

Klíčová slova
organic cells distance calculation image processing 3D image processing Voronoi diagram Distance transform object distance
Zadání práce
Cílem je naprogramovat rozumně rychlý algoritmus pro nalezení a vypočítání vzdálenosti zadaného počtu nejbližších segmentačních masek k zadané masce pomocí mapy vzdáleností. Program tuto úlohu realizuje pro všechny masky ve vstupním obraze. V práci se popíše a předvedou výsledky několika různých přístupů, jako například řešení založené na mapě vzdáleností (distance transform), grafový přístup získaný Voroného rozdělením obrazu nebo určení vzdálenosti pomocí povrchů masek. Předvedením výsledků přístupu se rozumí implementace přístupu, změření rychlosti výpočtů, uvede se teoretická složitost postupu a uvede se přesnost výsledků.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2023 11:12, RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D., učo 4203
Plný text práce
1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
29. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D., učo 4203
CABO KVI FI MU

Oponent

Aleksandra Melnikova, Ph.D.
KVI FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Informatika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.