Bakalářská práce

Quality Control of Histopathology Whole Slide Images: Detection of Tissue Folding and Tearing

Erik Sedlák
Anotace

Rastúce využitie algoritmov umelej inteligencie v medicíne si vyžaduje kvalitné datasety na trénovanie týchto algoritmov. Neustále narastajúca veľkosť týchto datasetov spôsobuje, že manuálna kontrola kvality je v súčastnosti nepraktická, najmä ak by ju mali vykonávať už preťažení zdravotnícki profesionáli. Táto práca predstavuje proces na zrýchlenie spracovávania mikroskopických snímkov (WSI) a implementuje …více

Abstract

In medical fields, the increasing reliance on artificial intelligence algorithms puts pressure on high-quality datasets on which the algorithms are trained. The ever-increasing size of these datasets makes manual quality control inefficient, especially when it would need to be done by already overburdened medical professionals. This thesis presents a pipeline to speed up the processing of microscopic …více

Klíčová slova
quality control WSI tissue folding tissue tearing artifact detection digital pathology image processing
Zadání práce
Úkolem studenta bude navrhnout metody sloužící pro kontrolu kvality mikroskopických histopatologických snímků, konkrétně k detekci míst, kde došlo k přehnutí nebo přeložení tkáně přes sebe, případně kde se ve tkáni objevily trhliny. Cílem bude vyznačení oblastí, které kvůli přítomnosti takových artefaktů nejsou vhodné pro další automatickou analýzu.

Navržené metody student implementuje a začlení mezi nástroje vyvíjené v rámci skupiny RationAI. Student se bude podílet na vývoji obecné infrastruktury, která umožní pro histopatalogické snímky spouštět nejen tyto, ale i jiné metody pro kontrolu kvality. Praktickým výstupem budou zdrojové kódy a podrobná dokumentace. Textová část bude zahrnovat také hodnocení výkonu a úspěšnosti detekce. Součástí bude i analýza toho, v jakém zvětšení/měřítku je vhodné analýzu provádět.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
20. 12. 2024 04:32, Mgr. Karel Štěpka, Ph.D., učo 172454
Plný text práce
57,5 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
5. 2. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Karel Štěpka, Ph.D., učo 172454
CABO KVI FI MU

Oponent

Mgr. Lucia Hradecká, učo 456675
CABO KVI FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Informatika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.