Bakalářská práce

Quality Control of Histopathology Whole Slide Images: Focus and Blurring Measurements

Samuel Tichý
Anotace

S rostoucím využitím automatizované analýzy v digitální patologii nabývá na významu nutnost zajistit dostatečnou kvalitu vstupních obrazových dat. Tato práce se zaměřuje na detekci rozmazaných oblastí v digitalizovaných histologických preparátech. Rozmazání obrazu, které je způsobené nesprávným zaostřením nebo různými artefakty, může výrazně ovlivnit spolehlivost následné analýzy. Kvůli velikosti a …více

Abstract

With the growing use of automated analysis in digital pathology, it becomes increasingly important to ensure sufficient input image quality. This thesis focuses on the detection of blurred regions in digitalized histopathological tissue slides. Blurring, caused by incorrect focus during scanning or by various artifacts, can significantly affect the reliability of further analysis, but is not always …více

Zadání práce
Úkolem studenta bude navrhnout a implementovat metody sloužící pro kontrolu kvality mikroskopických histopatologických snímků, konkrétně k detekci míst, v nichž je snímek rozostřený nebo rozmazaný. Cílem bude toto rozostření kvantifikovat a vyznačit oblasti, které kvůli němu nejsou vhodné pro další automatickou analýzu. Součástí práce bude průzkum dostupných metrik pro hodnocení ostrosti obrazu a jejich adaptace pro histopatologické snímky.

Navržené metody student implementuje a začlení mezi nástroje pro kontrolu kvality vyvíjené v rámci skupiny RationAI. Praktickým výstupem budou zdrojové kódy a podrobná dokumentace. Textová část bude zahrnovat také srovnání výkonu a úspěšnosti implementovaných metod. Součástí bude i analýza toho, v jakém zvětšení/měřítku je vhodné analýzu provádět.
Práce zkontrolována:
26. 5. 2025 09:50, Mgr. Karel Štěpka, Ph.D., učo 172454
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
26. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Karel Štěpka, Ph.D., učo 172454
CABO KVI FI MU

Oponent

Nikomidisz Jorgosz Eftimiu, M.Sc.
stud FI MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.