Závěrečná práce: Vendula Peňázová: xOpat on Jupyter: digital pathology viewer deployments
Bakalářská práce
xOpat on Jupyter: digital pathology viewer deployments
Anotace
xOpat je open-source webový prohlížeč pro digitální patologii, určený pro práci s mikroskopickými snímky tkání digitalizovanými procesem zvaným whole-slide imaging (WSI). Jeho modulární architektura ho činí vhodným jak pro výzkum, tak pro klinické použití, ale jeho nasazení vyžaduje znalost infrastruktury, kterou většina koncových uživatelů, například patologové nebo biomedicínští výzkumníci, nemá …více
Abstract
xOpat is an open-source, browser-based viewer for whole-slide images in digital pathology. Its flexible architecture makes it suitable for both research and clinical use, but setting it up requires infrastructure knowledge that most end users, such as pathologists or biomedical researchers, do not have. This thesis presents two complementary deployments that make xOpat usable without manual setup. …více
Zadání práce
25. 5. 2026 15:41, Mgr. Jiří Horák
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Quality Control of Histopathology Whole Slide Images: Focus and Blurring Measurements
Bc. Samuel Tichý -
Visualization of Digital Pathology Images and Results of Their Analyses Using Deep Neural Networks
Mgr. Nikoleta Češeková -
Detection of metastases in immunohistochemically stained lymphatic tissue using deep learning methods
Mgr. Miroslav Mažgut -
Quality Control of Histopathology Whole Slide Images: Detection of Tissue Folding and Tearing
Bc. Erik Sedlák -
Whole slide image viewer for pathological data
Mgr. Jiří Horák -
Empaia-compliant WSI Case Viewer for xOpat
Bc. Adam Bujdák -
Smart Annotations in xOpat Viewer
Bc. Miriam Střihavková -
Tissue Classification in Digital Pathology
Mgr. Jaroslav Kubín




