Thesis/Dissertation: Bc. Martin Mejzlík: Image segmentation and description of arthropods
Master's thesis
Image segmentation and description of arthropods
Segmentace a popis obrazů členovců
Abstract
Tato práce se zabývá segmentací a popisem obrazů členovců. Jejím cílem je vyvinout snadno rozšiřitelnou aplikaci pro segmentaci a popis obrazů členovců.
Abstract
This work deals with segmentation and description of images of arthropods. Its goal is to develop an easily extensible application for segmentation and description of images of arthropods.
Thesis description
Cílem práce je vyvinout aplikaci funkční v prostředí MS Windows pro segmentaci a popis členovců v obrazech pořízených statickou kamerou, která bude snadno rozšiřitelná o nové metody formou modulů pro (1) segmentaci objektů (tj. vytvoření binární masky objektu), (2) hledání odlesků v obraze, (tj. vytvoření masky pixelů, které se mají ignorovat při výpočtu parametrů regionů beroucích v úvahu hodnotu pixelů vstupních obrazů), (3) segmentaci masky objektů (tj. rozdělení masky objektů na menší části - regiony odpovídající částem objektů, jako jsou hlava, hlavohruď, končetiny, apod. a podregiony jednotlivých regionů umožňující jemnější dělení regionů, např. rozdělení končetin na tři podregiony proximal, medial, distal) a (4) výpočet parametrů jednotlivých regionů a podregionů. Při hodnocení bude přihlíženo primárně k celkovému návrhu aplikace, uživatelské přívětivosti a snadnosti její rozšiřitelnosti o nové moduly. Nebude hodnocena kvalita výsledků jednotlivých modulů (například kvalita segmentace nebo rozdělení na regiony a podregiony). Musí být však zřejmé, jak budou jednotlivé moduly fungovat.
Vyvinutá aplikace musí umožňovat:
- načtení obrazů ze zadaného vstupního adresáře
- nastavení rozlišení obrazů
- zobrazení seznamu načtených obrazů včetně přehledu o jejich rozlišení, provedených segmentacích a uživatelských potvrzeních (Data browser)
- prohlížení obrazů a výsledků segmentace (Image viewer)
- manuální korekci vypočítaných masek a map regionů a jejich odsouhlasení (tj. potvrzení jejich správnosti) (Mask editor)
- korekce masky odlesků a map regionů musí probíhat pouze nad (typicky potvrzenou) maskou objektů
- pro vybrané obrazy spuštění modulů pro (1) segmentaci objektů, (2) nalezení odlesků, (3) segmentaci masky objektů do regionů a podregionů, (4) výpočet parametrů regionů a podregionů
- export vypočítaných parametrů regionů a podregionů pro vybrané obrazy do Excelu
Textová část práce musí obsahovat popis vytvořené aplikace včetně jednoduchých ukázek, jak je možné aplikaci rozšiřovat o nové metody. Použitelnost aplikace bude demonstrována na datech dodaných vedoucím práce.
21/5/2020 10:28, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., UČO 3019
- Entered/Edited 19/6/2020 15:53, Helena Kryštofová
- Record made 30/4/2020 12:29, Jana Zemanová, UČO 9619
- Accessible from: 19/5/2020 08:13, Alena Dvořáková
- Thesis/dissertation received 19/5/2020 08:13, Helena Kryštofová
- Attempt: 2
Attachments
Theses on a related topic
List of theses with an identical keyword.
-
Image segmentation and description of arthropods
Mgr. Martin Mejzlík -
Similarity measurement of spiders and ants
Mgr. Jan Ježek -
Anthropod Image Segmentation
Mgr. Vendula Teuchnerová -
Detection and Quantification of Tunneling Nanotubes in Multidimensional Bioimage Data
Bc. et Bc. Jakub Rádl, UČO 521144 -
Fast Level Set-Like Algorithm for Biomedical Image Segmentation
Mgr. Lóránt Oroszlány, UČO 359231 -
ImageJ plugin for characterizing diffuse and compact structures
Mgr. Martin Dřímal -
ImageJ plugin for correcting chromatic shifts
Bc. Stanislau Dubrouski, UČO 374641 -
Usage of HDR for efficient reconstruction of 3D objects
Bc. Petra Tomanová




