Master's thesis

Image segmentation and description of arthropods

Segmentace a popis obrazů členovců

Bc. Martin Mejzlík
Abstract

Tato práce se zabývá segmentací a popisem obrazů členovců. Jejím cílem je vyvinout snadno rozšiřitelnou aplikaci pro segmentaci a popis obrazů členovců.

Abstract

This work deals with segmentation and description of images of arthropods. Its goal is to develop an easily extensible application for segmentation and description of images of arthropods.

Thesis description

Cílem práce je vyvinout aplikaci funkční v prostředí MS Windows pro segmentaci a popis členovců v obrazech pořízených statickou kamerou, která bude snadno rozšiřitelná o nové metody formou modulů pro (1) segmentaci objektů (tj. vytvoření binární masky objektu), (2) hledání odlesků v obraze, (tj. vytvoření masky pixelů, které se mají ignorovat při výpočtu parametrů regionů beroucích v úvahu hodnotu pixelů vstupních obrazů), (3) segmentaci masky objektů (tj. rozdělení masky objektů na menší části - regiony odpovídající částem objektů, jako jsou hlava, hlavohruď, končetiny, apod. a podregiony jednotlivých regionů umožňující jemnější dělení regionů, např. rozdělení končetin na tři podregiony proximal, medial, distal) a (4) výpočet parametrů jednotlivých regionů a podregionů. Při hodnocení bude přihlíženo primárně k celkovému návrhu aplikace, uživatelské přívětivosti a snadnosti její rozšiřitelnosti o nové moduly. Nebude hodnocena kvalita výsledků jednotlivých modulů (například kvalita segmentace nebo rozdělení na regiony a podregiony). Musí být však zřejmé, jak budou jednotlivé moduly fungovat.

Vyvinutá aplikace musí umožňovat:

  • načtení obrazů ze zadaného vstupního adresáře
  • nastavení rozlišení obrazů
  • zobrazení seznamu načtených obrazů včetně přehledu o jejich rozlišení, provedených segmentacích a uživatelských potvrzeních (Data browser)
  • prohlížení obrazů a výsledků segmentace (Image viewer)
  • manuální korekci vypočítaných masek a map regionů a jejich odsouhlasení (tj. potvrzení jejich správnosti) (Mask editor)
  • korekce masky odlesků a map regionů musí probíhat pouze nad (typicky potvrzenou) maskou objektů
  • pro vybrané obrazy spuštění modulů pro (1) segmentaci objektů, (2) nalezení odlesků, (3) segmentaci masky objektů do regionů a podregionů, (4) výpočet parametrů regionů a podregionů
  • export vypočítaných parametrů regionů a podregionů pro vybrané obrazy do Excelu

Textová část práce musí obsahovat popis vytvořené aplikace včetně jednoduchých ukázek, jak je možné aplikaci rozšiřovat o nové metody. Použitelnost aplikace bude demonstrována na datech dodaných vedoucím práce.

The thesis has been checked:
21/5/2020 10:28, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., UČO 3019
Language used
Czech Czech
Defence date
19/6/2020
The thesis was defended successfully

Supervisor

doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., UČO 3019
CABO KVI FI MU

Reader

Mgr. Karel Štěpka, Ph.D., UČO 172454
CABO KVI FI MU

Masaryk University Faculty of Informatics
Programme
Applied Informatics
Field of Study
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.