Závěrečná práce: Jakub Raček: Optimalizácia Rektangulárnej Abstrakcie v Nástroji Pithya
Bakalářská práce
Optimalizácia Rektangulárnej Abstrakcie v Nástroji Pithya
Optimising Rectangular Abstraction in Pithya
Anotace
Cieľ práce je optimalizovať nástroj Pithya, konkrétne tvorbu rektangulárnej abstrakcie (prechodového systému) na základe vstupného biologického modelu, zadaného pomocou diferenciálnych rovníc. Prvou optimalizáciou je odstránenie redundantného vyhodnocovania vrcholov v modeloch s riedkými závislosťami. Pre vyhodnotenie prechodu je nutné vypočítať derivácie vo všetkých vrcholoch daného facetu v rámci …více
Abstract
The goal of this thesis is to optimise the Pithya tool, specifically the generation of rectangular abstraction (transition system) based on input biological model expressed by differential equations. The first optimisation removes redundant evaluation of vertices in models with sparse dependencies. To decide if a transition exists, it is necessary to compute derivation values in every vertex of a given …více
Zadání práce
27. 5. 2019 10:37, RNDr. Samuel Pastva, Ph.D., učo 410286
- Zadáno/změněno 28. 6. 2019 16:16, Helena Kryštofová
- Záznam založen 2. 5. 2019 13:39, Jana Zemanová, učo 9619
- Zveřejnit od 27. 5. 2019 09:24, Alena Dvořáková
- Práce převzata 27. 5. 2019 09:24, Alena Dvořáková
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Paralelní syntéza parametrů z formulí hybridní logiky HUCTL
RNDr. Samuel Pastva, Ph.D., učo 410286 -
Škálovatelná syntéza parametrů pro hypotézy formulované v logice CTL
RNDr. Samuel Pastva, Ph.D., učo 410286 -
Geodetické kulečníky
Bc. Petr Smolík -
Rewriting complex biological models in stochastic process algebras: a case study
Mgr. Andrej Tokarčík -
Modely laseru
Mgr. Nikol Drongová -
Konverzia interakčných sietí na čiastočne špecifikované Booleovské siete v nástroji CaSQ
Mgr. Bc. Ivan Frák -
Využitie LLM na extrakciu formálnych vlastností biologických modelov z literatúry
Ing. Richard Harman -
Parameter Synthesis of Dynamical Systems via Model Checking
RNDr. Martin Demko, Ph.D., učo 325073




