Diplomová práce

Vliv chemické modifikace DNA vybranými elektrochemicky aktivními skupinami na její interakce s nabitými povrchy elektrod

Effects of chemical modification of DNA with electroactive moieties on its interactions with charged surfaces of electrodes

Bc. Vojtěch Němec
Anotace

DNA je sama o sobě elektroaktivní, její značení redox-aktivními modifikacemi může nicméně poskytnout zvýšenou citlivost a specifitu při její elektrochemické analýze. V této diplomové práci bylo zkoumáno chování dvou typů modifikací obsahujících elektroaktivní nitroskupinu na povrchu visící rtuťové kapkové elektrody (HMDE) a byla provedena jejich inkorporace do DNA metodou primer extension (PEX). Produkty …více

Abstract

DNA possesses an intrinsic electroactivity, nevertheless, labelling with redox active modifications can provide enhanced sensitivity and specificity for its electrochemical analysis. In this thesis, behaviour of two types of modifications containing an electroactive nitro group, on the surface of hanging mercury drop electrode (HMDE) was investigated by cyclic voltammetry and their incorporation into …více

Zadání práce
Elektrochemické metody jsou osvědčeným analytickým nástrojem vhodných pro studium struktury, chemické modifikace a interakcí DNA. Voltametrické signály nemodifikované DNA na rtuťových elektrodách, související s redukcí nukleobází nebo s adsorpčně-desorpčními jevy, jsou vysoce citlivé ke změnám v konformaci DNA (např. ke změnám způsobeným tvorbou zlomů, vazbou interkalátorů nebo změnami v superhelikální hustotě). Vyšší citlivosti či selektivity detekce konformačních změn je v principu možno dosáhnout při využití strukturně selektivní modifikace DNA elektrochemicky aktivními skupinami. Bez ohledu na množství výsledků získaných pomocí empiricky vyvinutých metod (např. technik založených na enzymatické inkorporaci modifikovaných nukleotidů) je potřebné podrobněji pochopit, jak modifikace DNA, zejména těch, které jsou v její dvoušroubovicové struktuře lokalizovány v jejím velkém žlábku (tedy v místech, kde míra dostupnosti párů bází ovlivňuje interakce DNA s elektrodovým povrchem. V rámci této diplomové práce budou zkoumány vlastnosti DNA modifikovaných vybranými elektroaktivními skupinami s důrazem na redox aktivní skupiny kovalentně vázané k bázím v oblasti velkého žlábku (např. organické nitroderiváty). Bude zkoumán jejich vliv na adsorpčně desorpční chování takto modifikované DNA na negativně nabitém povrchu rtuťových a uhlíkových elektrod.
Práce zkontrolována:
5. 1. 2022 13:32, doc. RNDr. Miroslav Fojta, CSc., učo 31900
Plný text práce
1,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
11. 2. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Miroslav Fojta, CSc., učo 31900
SIBP CSB CEITEC MU

Oponent

doc. RNDr. Karolina Schwarzová, Ph.D.
Katedra analytické chemie, PřF UK

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.