Bakalářská práce

Porovnáváni biologických sekvencí za účelem předpovědi struktury a funkce proteinů

Comparing biological sequences in order to predict structure and function of proteins

Monika Michalovová, učo 256590
Anotace

V této bakalářské práci představujeme program schopný ohodnotit úspěšnost metod porovnávání sekvencí podle jejich schopnosti popisovat funkční a strukturní podobnosti. Informace o těchto funkčních a strukturních podobnostech čerpáme z databází PDB, CATH, SCOP a Gene Ontology.

Abstract

In this bachelor thesis we introduce a program which is able to assign a level of significance to sequence comparing methods according to their ability to express functional and structural similiarities. We gather information about these similiarities from databases such as PDB, CATH, SCOP and Gene Ontology.

Klíčová slova
porovnávání sekvencí DNA protein perl CATH SCOP GO PDB Needleman-Wunsch
Zadání práce
Nastudujte různé metody porovnávání biologických sekvencí. Vytvořte program, který dokáže vybrané metody ohodnotit podle jejich schopnosti popisovat funkční a strukturní podobnost odpovídajících molekul na základě informací obsažených v databázích Gene Ontology, PDB a CATH. Program by měl obsahovat možnost testovat co nejširší spektrum metod a obsahovat vzorová data pro demonstraci jeho fungování. Pro snadnou obsluhu testování bude program obsahovat grafické uživatelské rozhraní.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
6. 2. 2011 23:34, doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
21. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
KSUZD FI MU

Oponent

prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
CF BioData CSB CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.