Diplomová práce

Evoluce struktury proteinů vápníkových kanálů

Evolution of protein structure in calcium channels

Bc. Michaela Bayerlová, učo 222902
Anotace

Uvoľňovanie vápnika je mechanizmus nevyhnutný pre svalovú kontrakciu. Ryanodínové receptory (ryrs) sú proteíny vápnikových kanálov sarkoplazmatického retikula exprimované predovšetkým v kostrovom a srdcovom svalstve a v mozgu. V mojej práci som sa zamerala na evolučný vývoj týchto proteínov a na identifikáciu možných evolučne významných miest v ich sekvencii. Na zvýšenie systematického pokrytia som …více

Abstract

The mechanism of calcium release is essential in muscle contraction. Ryanodine receptors (ryrs) are calcium release channel proteins of the sarcoplasmic reticulum expressed mainly in skeletal and cardiac muscles and in brain. I focused on evolution of these proteins and on identification of possible evolutionary hot-spots in the sequence. To increase the systematic coverage, I predicted the genes for …více

Klíčová slova
BLAST predikcia génu fylogenetická analýza ryanodínový receptor selekčná analýza gene prediction phylogenetic analysis ryanodine receptor selection analysis
Zadání práce
The mechanism of calcium-induced calcium release is essential in muscle contraction both in skeletal and cardiac muscle tissue. The applicant will identify domains in proteins that build calcium channels in a range of different taxa. This information will be used to search annotated and well as non-annotated public sequence databases for homologous proteins. The structure of the proteins will be predicted and possibility of their identification will be quantified. The resulting data will be analysed with respect to evolution of the proteins and possible evolutionary hot-spots in the sequence will be identified and interpreted.

Práce bude vypracována v anglickém jazyce.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
24. 5. 2011 05:59, doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
Plný text práce
940,7 KB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
13. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
RECETOX PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Literatura

  • DI BIASE, V a C FRANZINI-ARMSTRONG. Evolution of skeletal type e-c coupling: a novel means of controlling calcium delivery. Journal of Cell Biology. 2005, roč. 171, s. 695-704. ISSN 0021-9525.
  • SHERIDAN, DC; H TAKEKURA; C FRANZINI-ARMSTRONG; KG BEAM; PD ALLEN a CF PEREZ. Bidirectional signaling between calcium channels of skeletal muscle requires multiple direct and indirect interactions. Proceeding of the National Academy of Sciences of the USA. Washington, DC, USA: National Academy of Sciences of the USA, 2006, roč. 103, s. 19760-19765. ISSN 0027-8424.
  • VAZQUEZ-MARTINEZ, O; R CANEDO-MERINO; M DIAZ-MUNOZ a JR RIESGO-ESCOVAR. Biochemical characterization, distribution and phylogenetic analysis of Drosophila melanogaster ryanodine and IP3 receptors, and thapsigargin-sensitive Ca2+ ATPase. Journal of Cell Science. Cambridge: Company of Biologists Ltd., 2003, roč. 116, s. 2483-2494. ISSN 0021-9533.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.