Výpis publikací

VACULÍK, Ondřej, Silvie BERNATOVÁ, Mojmir SERY, Martin ŠILER, Ota SAMEK, Katarína REBROŠOVÁ, Filip RŮŽIČKA a Pavel ZEMÁNEK. Advanced Algorithms for Bacterial Analysis in Body Fluids Using Raman Tweezers. In 2023 Optica Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences, Vancouver, Canada. 2023. ISBN 978-1-957171-21-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1364/OMA.2023.AW3D.2.

SAMEK, Ota, Katarína REBROŠOVÁ, Filip RŮŽIČKA, Zdeněk PILÁT, Martin KIZOVSKÝ, Silvie BERNATOVÁ, Marketa BENESOVA, Adéla MIKULOVÁ, Martin ŠILER a Pavel ZEMÁNEK. Effects of antimicrobials on microbial Raman spectra as the first step for detection of antimicrobialresistance. In 12th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy (ICAVS12), Krakow, Poland. 2023.

HRABOVSKÁ, Miroslava, Katarína REBROŠOVÁ, Martin ŠILER, Ota SAMEK a Filip RŮŽIČKA. Možnosť rozlíšenia klinicky významných kvasiniek pomocou Ramanovej spektroskopie. In XXXII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2023, Brno, CZ. 2023. ISBN 978-80-280-0314-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P280-0314-2023.

REBROŠOVÁ, Katarína, Martin ŠILER, Ota SAMEK a Filip RŮŽIČKA. Možnosť sledovania citlivosti mikroorganizmov voči antimikrobiálnym látkam pomocou Ramanovej spektroskopie. In KMINE. 2023.

REBROŠOVÁ, Katarína, Martin ŠILER, Ota SAMEK, Jan JEŽEK, Veronika HOLÁ a Filip RŮŽIČKA. Potential use of Raman spectroscopy for detection of antimicrobial resistance. In ECCMID 2023, Copenhagen, Denmark. 2023.

RŮŽIČKA, Filip, Katarína REBROŠOVÁ, Veronika HOLÁ, Silvie BERNATOVÁ, Martin ŠILER, Ota SAMEK a Jan JEŽEK. Raman Spectroscopy For Identification Of Microbes From Chronic Wounds And Other Clinical Materials. In ASM Microbe, Houston, Texas, USA. 2023.

REBROŠOVÁ, Katarína, Silvie BERNATOVÁ, Martin ŠILER, Jan MAŠEK, Ota SAMEK, Jan JEŽEK, Martin KIZOVSKY, Veronika HOLÁ, Pavel ZEMÁNEK a Filip RŮŽIČKA. Rapid Identification of Pathogens Causing Bloodstream Infections by Raman Spectroscopy and Raman Tweezers. Microbiology Spectrum. WASHINGTON: American Society for Microbiology, 2023, roč. 11, č. 3, s. 1-15. ISSN 2165-0497. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.00028-23.

REBROŠOVÁ, Katarína, Martin ŠILER, Ota SAMEK a Filip RŮŽIČKA. Sledovanie účinnosti antimikrobiálnych látok pomocou Ramanovej spektroskopie. In XXXII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2023, Brno, CZ. 2023. ISBN 978-80-280-0314-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P280-0314-2023.

REBROŠOVÁ, Katarína, Silvie BERNATOVÁ, Martin ŠILER, Ota SAMEK, Veronika HOLÁ a Filip RŮŽIČKA. Identification of microbes from human body fluids by Raman spectroscopy. In FEMS Conference on Microbiology, Belgrade, Serbia. 2022.

REBROŠOVÁ, Katarína, Silvie BERNATOVÁ, Martin ŠILER, Ota SAMEK, Veronika HOLÁ a Filip RŮŽIČKA. Možnosť využitia Ramanovej spektroskopie pri identifikácii mikroorganizmov z telesných tekutín. In 29. KONGRES ČESKOSLOVENSKÉ SPOLEČNOSTI MIKROBIOLOGICKÉ. 2022. ISBN 978-80-88379-18-8.

REBROŠOVÁ, Katarína, Silvie BERNATOVÁ, Martin ŠILER, Jan JEŽEK, Jan MAŠEK, Veronika HOLÁ a Filip RŮŽIČKA. Use of Raman spectroscopy for identification of microorganisms from human body fluids. In 32nd ECCMID, The congress of ESCMID, Lisabon. 2022.

REBROŠOVÁ, Katarína, Silvie BERNATOVÁ, Martin ŠILER, Ota SAMEK a Filip RŮŽIČKA. Detection of pathogens in human body fluids by Raman spectroscopy. In XXX. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2021. 2021. ISBN 978-80-210-9882-4.

REBROŠOVÁ, Katarína, Silvie BERNATOVÁ, Martin ŠILER, Filip RŮŽIČKA, Ota SAMEK a Jan MAŠEK. Raman spectroscopy – a rapid tool for differentiation among microorganisms causing bloodstream infections. In World Microbe Forum. 2021.

MAŠEK, Jan, Katarína REBROŠOVÁ, Martin ŠILER, Ota SAMEK a Filip RŮŽIČKA. Využití Ramanovy spektroskopie pro identifikaci mikroorganismů způsobujících infekce krevního řečiště. In XXX. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2021. 2021. ISBN 978-80-210-9882-4.

PILAT, Z., M. KIZOVSKY, J. JEZEK, S. KRATKY, J. SOBOTA, Martin ŠILER, O. SAMEK, Tomáš BURYŠKA, Pavel VAŇÁČEK, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a P. ZEMANEK. Detection of Chloroalkanes by Surface-Enhanced Raman Spectroscopy in Microfluidic Chips. Sensors. Basel: MDPI AG, 2018, roč. 18, č. 10, s. 1-18. ISSN 1424-8220. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/s18103212.

SAMEK, Ota, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Martin ŠILER, Mojmir ŠERÝ, Vladislav KRZYŽÁNEK, Kamila HRUBANOVÁ, Pavel ZEMÁNEK, Veronika HOLÁ a Filip RŮŽIČKA. Identification of individual biofilm-forming bacterial cells using Raman tweezers. Journal of Biomedical Optics. Bellingham: SPIE, 2015, roč. 20, č. 5, s. "051038-1"-"051038-6", 6 s. ISSN 1083-3668. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/1.JBO.20.5.051038.

MLYNÁRIKOVÁ, Katarína, Ota SAMEK, Silvie BERNATOVÁ, Filip RŮŽIČKA, J JEZEK, A HARONIKOVA, Martin ŠILER, Pavel ZEMÁNEK a V HOLA. Influence of Culture Media on Microbial Fingerprints Using Raman Spectroscopy. Sensors. Basel: MDPI AG, 2015, roč. 15, č. 11, s. 29635-29647. ISSN 1424-8220. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/s151129635.

SAMEK, Ota, Pavel ZEMÁNEK, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEZEK, Mojmir SERY, Petr JAKL, Martin ŠILER a Filip RŮŽIČKA. Monitoring the influence of antibiotic exposure using Raman spectroscopy. In Anita Mahadevan-Jansen; Wolfgang Petrich. Proceedings of SPIE : BIOMEDICAL VIBRATIONAL SPECTROSCOPY VI: ADVANCES IN RESEARCH AND INDUSTRY. San Francisco, California, United States: SPIE, 2014, s. 1-6. ISBN 978-0-8194-9852-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2038595.

BERNATOVÁ, Silvie, Ota SAMEK, Zdenek PILAT, Mojmir SERY, Jan JEZEK, Petr JAKL, Martin ŠILER, Vladislav KRZYŽÁNEK, Pavel ZEMÁNEK, Veronika HOLÁ, Milada DVOŘÁČKOVÁ a Filip RŮŽIČKA. Raman tweezers on bacteria: Following the mechanisms of bacteriostatic versus bactericidal action. In Jürgen Popp; Valery V. Tuchin; Dennis L. Matthews; Francesco S. Pavone; Paul Garside. Proceedings of SPIE : BIOPHOTONICS: PHOTONIC SOLUTIONS FOR BETTER HEALTH CARE IV. Brussels, Belgium: SPIE, 2014, s. 1-7. ISBN 978-1-62841-077-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2052538.

SAMEK, Ota, Katarína MLYNÁRIKOVÁ, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Vladislav KRYŽÁNEK, Martin ŠILER, Pavel ZEMÁNEK a Filip RŮŽIČKA. Reproducible and time-course study of yeast biofilm by Raman spectroscopy. In Proc. SPIE. 9441, 19th Polish-Slovak-Czech Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics, 94411M. 2014. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2176031.

SAMEK, Ota, Silvie BERNATOVÁ, Jan JEŽEK, Zdeněk PILÁT, Vladislav KRZYŽÁNEK, Martin ŠILER, Pavel ZEMÁNEK, Katarína MLYNÁRIKOVÁ a Filip RŮŽIČKA. Time-course study of bacterial and yeast biofilms exposed to antimicrobial agents by Raman spectroscopy. In Proc. ICORS XXIV, 24th International Conference on Raman Spectroscopy. 2014.

ŠILER, Martin, Lukáš CHVÁTAL a Pavel ZEMÁNEK. Metallic nanoparticles in a standing wave: optical force and heating. Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer. 2012, roč. 2012, 15/10/2012, s. nestránkováno, nestránkov. ISSN 0022-4073. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jqsrt.2012.10.005.

OHLÍDAL, Ivan, Daniel FRANTA, Martin ŠILER, František VIŽĎA, Miloslav FRUMAR, Jaroslav JEDELSKÝ a Jaroslav OMASTA. Comparison of dispersion models in the optical characterization of As-S chalcogenide thin films. Journal of Non-Crystalline Solids. NORTH-HOLLAND, 2006, roč. 352, 52-54, s. 5633-5641, 8 s. ISSN 0022-3093.

OHLÍDAL, Ivan, Miloslav OHLÍDAL, Daniel FRANTA, Vlastimil ČUDEK, Vilma BURŠÍKOVÁ a Martin ŠILER. Měření mechanického napětí v tenkých vrstvách pomocí kombinované optické metody. Jemná mechanika a optika. Přerov: Physical Institute, ASCR, 2005, roč. 50, č. 3, s. 72-75. ISSN 0447-6441.

ŠILER, Martin, Ivan OHLÍDAL, Daniel FRANTA, Alberto MONTAIGNE-RAMIL, Alberta BONANNI, David STIFTER a Helmut SITTER. Optical characterization of double layers containing epitaxial ZnSe and ZnTe films. Journal of Modern Optics. London, UK: Taylor and Francis, LtD, 2005, roč. 52, č. 4, s. 583-602. ISSN 0950-0340.

OHLÍDAL, Ivan, Miloslav OHLÍDAL, Daniel FRANTA, Vladimír ČUDEK, Vilma BURŠÍKOVÁ a Martin ŠILER. Mechanical stresses studied by optical methods in diamond-like carbon films containing Si and O. In SPIE's 49th Annual Meeting. Bellingham, Washington, USA: SPIE - The International Society for Optical Engineering, 2004, s. 139-147. ISBN 0-8194-5465-6.

ŠILER, Martin, Ivan OHLÍDAL a Petr KLAPETEK. Mikroskopie magnetické síly: Aplikace při studiu pevných disků. Československý časopis pro fyziku. Praha: Fyzikální ústav AV ČR, 2003, roč. 53, č. 2, s. 124-127. ISSN 0009-0700.

ŠILER, Martin, Petr KLAPETEK a Ivan OHLÍDAL. Aplikace mikroskopie magnetické síly při studiu záznamového prostředí pevných disků. Jemná mechanika a optika. Přerov: Physical Institute, ASCR, 2002, roč. 47, 6-7, s. 216-219. ISSN 0447-6441.