Výpis publikací

BUDINSKÁ, Eva, Martina ČARNOGURSKÁ, Tina CATELA IVKOVIĆ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Marie BOUDNÁ, Lucie PIFKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Beatrix BENCSIKOVA a Vlad POPOVICI. An invasion front gene expression signature for higher-risk patient selection in stage IIA MSS colon cancer. Frontiers in Oncology. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2024, roč. 14, April 2024, s. 1-8. ISSN 2234-943X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fonc.2024.1367231.

ŠUSTR, Filip, Táňa MACHÁČKOVÁ, Martin PEŠL, Jana SVAČINOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Zdeněk STÁREK, Bohuslav KIANIČKA, Ondřej SLABÝ a Jan NOVÁK. Identification of Plasmatic microRNA-206 as New Predictor of Early Recurrence of Atrial Fibrillation after Catheter Ablation Using Next-generation Sequencing. MOLECULAR DIAGNOSIS & THERAPY. AUCKLAND: ADIS INT LTD, 2024, roč. 28, č. 3, s. 1-10. ISSN 1177-1062. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s40291-024-00698-x.

BOUDNÁ, Marie, Táňa MACHÁČKOVÁ, Petra VYCHYTILOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Renata BARTOŠOVÁ, Tina CATELA IVKOVIĆ, Dagmar AL TUKMACHI, Robin JUGAS, Lucie PIFKOVÁ, Jana ORLÍČKOVÁ, Jan KOTOUČEK, Marketa PAVLIKOVA, Milana ŠACHLOVÁ, Lucia BOHOVICOVÁ, Teodor STANĚK, Jana HALÁMKOVÁ, Igor KISS, Tomáš GROLICH, Martin SVOBODA, Zdeněk KALA, Kamila SOUČKOVÁ a Ondřej SLABÝ. Investigation of long non-coding RNAs in extracellular vesicles from low-volume blood serum specimens of colorectal cancer patients. CLINICAL AND EXPERIMENTAL MEDICINE. MILAN: SPRINGER-VERLAG ITALIA SRL, 2024, roč. 24, č. 1, s. 1-14. ISSN 1591-8890. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10238-024-01323-1.

VYCHYTILOVÁ, Petra, Sára VILMANOVÁ, Lucie PIFKOVÁ, Tina CATELA IVKOVIĆ, Marie MĄDRZYK, Robin JUGAS, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jan KOTOUČEK, Milana ŠACHLOVÁ, Lucia BOHOVICOVÁ, Teodor STANĚK, Jana HALÁMKOVÁ, Igor KISS a Ondřej SLABÝ. Optimized procedure for high-throughput transcriptome profiling of small extracellular vesicles isolated from low volume serum samples. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. Berlin: WALTER DE GRUYTER, 2024, roč. 62, č. 1, s. 157-167. ISSN 1434-6621. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1515/cclm-2023-0610.

BOUDNÁ, Marie, Andres DELGADO CAMPOS, Petra VYCHYTILOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ a Kamila SOUČKOVÁ. Strategies for labelling of exogenous and endogenous extracellular vesicles and their application for in vitro and in vivo functional studies. Cell Communication and Signaling. LONDON: BMC, 2024, roč. 22, č. 1, s. 1-15. ISSN 1478-811X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12964-024-01548-3.

VAVRUŠÁKOVÁ, Barbora, Lukáš MORÁŇ, Kateřina VAŠÍČKOVÁ, Lenka KREJČÍ, Kamila SOUČKOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ a Marek SVOBODA. Immune surveillance and carcinogenesis - the role of endoplasmic reticulum stress. In XXII. Interdisciplinary Meeting Of Young Life Scientists, 15-18.05.2023. 2023.

SOUČKOVÁ, Kamila, Barbora VAVRUŠÁKOVÁ, Kateřina VAŠÍČKOVÁ, Lukáš MORÁŇ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Matej JASÍK, Zuzana NIMMERTONDLOVÁ, Lenka KREJČÍ, Ondřej SLABÝ a Marek SVOBODA. Optimalizace přípravy syngenních myších modelů pro účely studia procesů souvisejících se stresem endoplazmatického retikula. In XXVI. Biologické dny. 2023.

MORÁŇ, Lukáš, Barbora VAVRUŠÁKOVÁ, Kateřina VAŠÍČKOVÁ, Lenka KREJČÍ, Kamila SOUČKOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ a Marek SVOBODA. Role of Endoplasmic Reticulum Stress in Immune Surveillance and Immunotherapy of Ovarian and Renal Cell Carcinoma. In Imaging Principles of Life. 2023.

MORÁŇ, Lukáš, Barbora VAVRUŠÁKOVÁ, Kateřina VAŠÍČKOVÁ, Lenka KREJČÍ, Kamila SOUČKOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ a Marek SVOBODA. The role of endoplasmic reticulum stress on immune surveillance and the effectiveness of immunotherapy in treatment of ovarian and renal cell carcinoma. In 12th International Conference Analytical Cytometry. 2023.

AL TUKMACHI, Dagmar, Michaela RUČKOVÁ, Marek VEČEŘA, Táňa MACHÁČKOVÁ, Petra POKORNÁ, Markéta HERMANOVÁ, Michal HENDRYCH, Leoš KŘEN, Ivana ROŠKOVÁ, Václav VYBÍHAL, Hana VALEKOVÁ, Radim JANČÁLEK, Jiří ŠÁNA, Martin SMRČKA a Ondřej SLABÝ. Tumor tissue and cerebrospinal fluid microRNA profiles enable the classification of brain metastasis accordingly to their origin. In AACR Annual Meeting 2023; April 14-19, 2023; Orlando, FL. 2023. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/1538-7445.AM2023-3758.

SOUČKOVÁ, Kamila, Kateřina VAŠÍČKOVÁ, Barbora VAVRUŠÁKOVÁ, Lukáš MORÁŇ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Matej JASÍK, Ondřej SLABÝ a Marek SVOBODA. Use of Syngeneic Mouse Models to Study the Role of Endoplasmic Reticulum Stress in Ovarian and Renal Cell Carcinoma. 2023.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Petra VYCHYTILOVÁ, Marie BOUDNÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Marketa PAVLIKOVA, Jan KOTOUCEK, Jana HALÁMKOVÁ, Dagmar AL TUKMACHI, Jiří ŠÁNA, Petra POKORNÁ, Milana ŠACHLOVÁ a Ondřej SLABÝ. Utility of RNA sequencing for transcriptome analysis of small extracellular vesicles derived from blood sera of colorectal cancer patients. In 114th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research (AACR). 2023. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/1538-7445.AM2023-6709.

SOUČKOVÁ, Kamila, Barbora VAVRUŠÁKOVÁ, Kateřina VAŠÍČKOVÁ, Lukáš MORÁŇ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Matej JASÍK, Zuzana NIMMERTONDLOVÁ, Lenka KREJČÍ, Ondřej SLABÝ a Marek SVOBODA. Využití syngenních myších modelů ke zkoumání vlivu stresu endoplazmatického retikula na karcinom ovaria a ledviny. In XLVII. Brněnské onkologické dny, XXXVII. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky Laboratorní diagnostika v onkologii 2023. 2023.

KNEDLÍKOVÁ, Lenka a Pavlína DANHOFER. 6.16 Analysis of Gut Microbiota in Children With ASD Using the Next-Generation Sequencing Approach. 2023. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jaac.2023.09.423.

NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Tereza NOVÁKOVÁ, Július GODAVA, Petr HUDE, Víta ŽAMPACHOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Petr NĚMEC, Helena BEDÁŇOVÁ, Ondřej SLABÝ, Julie DOBROVOLNÁ, Lenka ŠPINAROVÁ a Jan KREJČÍ. Cirkulující mikroRNA jako biomarkery rejekce u pacientů po srdeční transplantaci: od profilování k validaci kandidátních molekul. In 49. Pracovní setkání Komise experimentální kardiologie. 2022.

PEKÁR, Stanislav, Lenka DUŠÁTKOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Luis F. GARCÍA a Charles R. HADDAD. Gut-content analysis in four species, combined with comparative analysis of trophic traits, suggests an araneophagous habit for the entire family Palpimanidae (Araneae). Organisms Diversity & Evolution. Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, 2022, roč. 22, č. 1, s. 265-274. ISSN 1439-6092. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s13127-021-00525-9.

NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Lucie ULRICHOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Miroslav SOUČEK a Bohuslav KIANIČKA. Identification of plasmatic microRNAs associated with pulmonary embolism in patients with acute-onset dyspnea – pilot results. In Czech Cardiovascular Research and Inovation Days. 2022.

ŠUSTR, Filip, Táňa MACHÁČKOVÁ, Martin PEŠL, Karolína TRACHTOVÁ, Jana SVAČINOVÁ, Zdeněk STÁREK, Lenka ŠPINAROVÁ, Bohuslav KIANIČKA, Ondřej SLABÝ a Jan NOVÁK. microRNAs as the predictors of atrial fibrillation recurrence after catheter ablation: next-generation sequencing study. In EHRA 2022. 2022. ISSN 1532-2092. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/europace/euac053.272.

ŠUSTR, Filip, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jana SVAČINOVÁ, Jan OPPELT, Karolína TRACHTOVÁ, Ondřej SLABÝ, Zdeněk STÁREK, Martin PEŠL, Lenka ŠPINAROVÁ, Bohuslav KIANIČKA a Jan NOVÁK. MikroRNA-206 predikuje časnou rekurenci fibrilace síní u pacientů po katétrové ablaci. In 49. Pracovní setkání Komise experimentální kardiologie. 2022.

MĄDRZYK, Marie, Táňa MACHÁČKOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Tina Catela IVKOVIĆ, Kamila SOUČKOVÁ, Jan KOTOUČEK, Josef MAŠEK, Tomáš LOJA, Milana ŠACHLOVÁ a Ondřej SLABÝ. Sekvenování dlouhých nekódujících RNA v exozomech u pacientů s kolorektálním karcinomem. Klinická onkologie. Praha: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2022, roč. 35, Supplementum 1, s. "S138"-"S141", 3 s. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48095/ccko20221S107.

KISS, David, Táňa MACHÁČKOVÁ, Kamila SOUČKOVÁ, Pavel FABIAN, I. KREPELKOVA, M. SVOBODA a Igor KISS. An Independent Validation Study of Candidate microRNAs as Predictive Biomarkers for Bevacizumab-based Therapy in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. In vivo. ATHENS: Greece : International Institute of Anticancer Research, 2021, roč. 35, č. 5, s. 2809-2814. ISSN 0258-851X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21873/invivo.12567.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Petra VYCHYTILOVÁ, Kamila SOUČKOVÁ, Richard LAGA, Ladislav ANDROVIC, Gabriela MIXOVA a Ondřej SLABÝ. Barriers in Systemic Delivery and Preclinical Testing of Synthetic microRNAs in Animal Models: an Experimental Study on miR-215-5p Mimic. Physiological research. Praha: Fyziologický ústav AV ČR, 2021, roč. 70, č. 3, s. 481-487. ISSN 0862-8408. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.33549/physiolres.934571.

NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jan KREJČÍ, Julie DOBROVOLNÁ a Ondřej SLABÝ. MicroRNAs as theranostic markers in cardiac allograft transplantation: from murine models to clinical practice. Theranostics. Lake Haven: Ivyspring International Publisher, 2021, roč. 11, č. 12, s. 6058-6073. ISSN 1838-7640. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7150/thno.56327.

PARIMUCHOVÁ, Andrea, Lenka DUŠÁTKOVÁ, Ľubomír KOVÁČ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ a Stanislav PEKÁR. The food web in a subterranean ecosystem is driven by intraguild predation. Nature Scientific Reports. London: NATURE RESEARCH, 2021, roč. 11, č. 1, s. 4994-5004. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-84521-1.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Petra VYCHYTILOVÁ, Kamila SOUČKOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Dominika BRCHNELOVÁ, Marek SVOBODA, Igor KISS, Vladimír PROCHÁZKA, Zdeněk KALA a Ondřej SLABÝ. MiR-215-5p Reduces Liver Metastasis in an Experimental Model of Colorectal Cancer through Regulation of ECM-Receptor Interactions and Focal Adhesion. Cancers. BASEL: MDPI, 2020, roč. 12, č. 12, s. 1-21. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cancers12123518.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Karolína TRACHTOVÁ, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Martina FARKAŠOVÁ, Lukáš FIALA, Roman ŠEFR, Igor KISS, Matej SKROVINA, Michal DOSOUDIL, Ioana BERINDAN-NEAGOE, Marek SVOBODA, Ondřej SLABÝ a Zdeněk KALA. Tumor microRNAs Identified by Small RNA Sequencing as Potential Response Predictors in Locally Advanced Rectal Cancer Patients Treated With Neoadjuvant Chemoradiotherapy. CANCER GENOMICS & PROTEOMICS. ATHENS: INT INST ANTICANCER RESEARCH, 2020, roč. 17, č. 3, s. 249-257. ISSN 1109-6535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21873/cgp.20185.

KOPKOVÁ, Alena, Jiří ŠÁNA, Táňa MACHÁČKOVÁ, Marek VEČEŘA, Lenka RADOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Václav VYBÍHAL, Martin SMRČKA, Tomáš KAZDA, Ondřej SLABÝ a Pavel FADRUS. Cerebrospinal Fluid MicroRNA Signatures as Diagnostic Biomarkers in Brain Tumors. Cancers. BASEL: MDPI, 2019, roč. 11, č. 10, s. 1-12. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cancers11101546.

GROLICH, Tomáš, Zdeněk KALA, Vladimír PROCHÁZKA, Martina FARKAŠOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Lukáš FIALA a Matěj ŠKROVINA. Deep sequencing of circulating and tissue microRNAs in rectal cancer patients undergoing neoadjuvant chemoradiotherapy in correlation with tumour regression grade. In 14th Scientific and Annual Meeting of the European Society of Coloproctology, Austria Centre, 25–27 September 2019. 2019. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/codi.14775.

FARKAŠOVÁ, Martina, Zdeněk KALA, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Lukáš FIALA a Matěj ŠKROVINA. Deep sequencing of circulating microRNAs in rectal cancer patients after neoadjuvant chemo-radiotherapy in correlation with final nodal status and T-stage. In Abstracts of the 14th Scientific and Annual Meeting of the European Society of Coloproctology, Austria Centre, 25–27 September 2019. 2019. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/codi.14775.

KOPKOVÁ, Alena, Jiří ŠÁNA, Marek VEČEŘA, Táňa MACHÁČKOVÁ, Pavel FADRUS, Júlia BOHOŠOVÁ a Ondřej SLABÝ. Global analysis and validation of miRNA levels in cerebrospinal fluid of brain tumor patients. In AACR Annual Meeting on Bioinformatics, Convergence Science, and Systems Biology. 2019. ISSN 0008-5472. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/1538-7445.AM2019-1806.

ŠUSTR, Filip, Jan NOVÁK, Táňa MACHÁČKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Zdeněk STÁREK a Miroslav SOUČEK. Hledání plazmatických mikroRNA jako prognostických biomarkerů rekurence fibrilace síní po katétrové ablaci – pilotní data. In XXXVIII. Dny Mladých Internistů. 2019.

NOVÁKOVÁ, Tereza, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jan NOVÁK, Petr HUDE, Július GODAVA, Víta ŽAMPACHOVÁ, Jan OPPELT, Filip ZLÁMAL, Petr NEMEC, Helena BEDANOVA, Ondřej SLABÝ, Julie DOBROVOLNÁ, Lenka ŠPINAROVÁ a Jan KREJČÍ. Identification of a Diagnostic Set of Endomyocardial Biopsy microRNAs for Acute Cellular Rejection Diagnostics in Patients after Heart Transplantation Using Next-Generation Sequencing. Cells. Basel: MDPI, 2019, roč. 8, č. 11, s. 1-13. ISSN 2073-4409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cells8111400.

NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Tereza NOVÁKOVÁ, Július GODAVA, Petr HUDE, Víta ŽAMPACHOVÁ, Jan OPPELT, Petr NĚMEC, Helena BEDÁŇOVÁ, Ondřej SLABÝ, Julie DOBROVOLNÁ, Jan KREJČÍ a Lenka ŠPINAROVÁ. Identifying urinary microRNAs for heart allograft rejection monitoring using small RNA sequencing - Pilot results. In ESC365. 2019. ISSN 1388-9842.

VYCHYTILOVÁ, Petra, Alena SVOBODOVÁ KOVAŘÍKOVÁ, Tomáš GROLICH, Vladimír PROCHÁZKA, Kateřina SLABÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jana HALÁMKOVÁ, Marek SVOBODA, Zdeněk KALA, Igor KISS a Ondřej SLABÝ. MicroRNA Biogenesis Pathway Genes Are Deregulated in Colorectal Cancer. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2019, roč. 20, č. 18, s. 1-13. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms20184460.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, V. PROCHAZKA, Z. KALA a Ondřej SLABÝ. Translational Potential of MicroRNAs for Preoperative Staging and Prediction of Chemoradiotherapy Response in Rectal Cancer. Cancers. BASEL: MDPI, 2019, roč. 11, č. 10, s. 1545-1556. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cancers11101545.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Tomáš GROLICH, L. FIALA, Vladimír PROCHÁZKA, M. ŠKROVINA, Zdeněk KALA a Ondřej SLABÝ. Využití sekvenování nové generace v analýze cirkulujících mikroRNA jako prediktivních bio markerů u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem rekta. Klinická onkologie. Ambit Media a.s., 2019, roč. 32, č. 2019, s. 157-159. ISSN 0862-495X.

FADRUS, Pavel, Alena KOPKOVÁ, Marek VEČEŘA, Jiří ŠÁNA, Jan OPPELT, Táňa MACHÁČKOVÁ, Václav VYBÍHAL, Martin SMRČKA a Ondřej SLABÝ. Global microRNA analysis in cerebrospinal fluid in glioblastoma patients. In The 15th Meeting of the Asian Society for Neuro-Oncology (ASNO 2018), Bejing, China,. 2018.

NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Tereza NOVÁKOVÁ, Dalibor MLEJNEK, Július GODAVA, Petr HUDE, Víta ŽAMPACHOVÁ, Jan OPPELT, Petr NĚMEC, Helena BEDÁŇOVÁ, Ondřej SLABÝ, Julie DOBROVOLNÁ, Jan KREJČÍ a Lenka ŠPINAROVÁ. Hladiny vybraných plazmatických mikroRNA u pacientů po srdeční transplantaci odrážejí probíhající celulární rejekci štěpu - primární výsledky sekvenací. In 46. pracovní konference Komise experimentální kardiologie. 2018. ISSN 1801-6103.

KOPKOVÁ, Alena, Jiří ŠÁNA, Pavel FADRUS, Táňa MACHÁČKOVÁ, Marek VEČEŘA, Václav VYBÍHAL, Jaroslav JURÁČEK, Petra VYCHYTILOVÁ, Martin SMRČKA a Ondřej SLABÝ. MicroRNA isolation and quantification in cerebrospinal fluid: A comparative methodical study. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2018, roč. 13, č. 12, s. 1-12. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0208580.

ŠUSTR, Filip, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jan OPPELT, Ondřej SLABÝ, Zdeněk STÁREK a Jan NOVÁK. Použití sekvenování nové generace při hledání kandidátních mikroRNA jako biomarkerů rekurence fibrilace síní po katetrové ablaci - pilotní data. In 46. pracovní konference Komise experimentální kardiologie. 2018. ISSN 1801-6103.

NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jiří ŠÁNA, Tereza KÁFUŇKOVÁ, Július GODAVA, Petr HUDE, Víta ŽAMPACHOVÁ, Petr NĚMEC, Helena BEDÁŇOVÁ, Ondřej SLABÝ, Julie BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Jan KREJČÍ a Lenka ŠPINAROVÁ. Levels of various microRNAs are altered in endomyocardial biopsies during acute cellular rejection in patients after heart transplantation. In Europena Society of Cardiology Congress 2017. 2017. ISSN 0195-668X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/eurheartj/ehx493.P6030.

VYCHYTILOVÁ, Petra, Jana MERHAUTOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Irene GUTIERREZ-GARCIA, José GARCIA-SOLANO, Lenka RADOVÁ, Dominika BRCHNELOVÁ, Kateřina SLABÁ, Marek SVOBODA, Jana HALÁMKOVÁ, Regina DEMLOVÁ, Igor KISS, Rostislav VYZULA, Pablo CONESA-ZAMORA a Ondřej SLABÝ. MiR-215-5p is a tumor suppressor in colorectal cancer targeting EGFR ligand epiregulin and its transcriptional inducer HOXB9. Oncogenesis. New York, USA: Nature publishing group, 2017, roč. 6, č. 11, s. 399-412. ISSN 2157-9024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41389-017-0006-6.

MANU NATH CAPOOR, externista, Filip RŮŽIČKA, Jonathan E. SCHMITZ, Garth A. JAMES, Táňa MACHÁČKOVÁ, Radim JANČÁLEK, Martin SMRČKA, Radim LIPINA, externista FAHAD AHMED, Todd F. ALAMIN, Neel ANAND, John C. BAIRD, Nitin BHATIA, Sibel DEMIR-DEVIREN, Robert K. EASTLACK, Steve FISHER, Steven R. GARFIN, Jaspaul S. GOGIA, Ziya L. GOKASLAN, Calvin C. KUO, Yu-Po LEE, Konstantinos MAVROMMATIS, Elleni PONECHAL MICHU, Hana NOSKOVÁ, Assaf RAZ, Jiří ŠÁNA, A. Nick SHAMIE, Philip S. STEWART, Jerry L. STONEMETZ, Jeffrey C. WANG, Timothy F. WITHAM, Michael F. COSCIA, Christof BIRKENMAIER, Vincent A. FISCHETTI a Ondřej SLABÝ. Propionibacterium acnes biofilm is present in intervertebral discs of patients undergoing microdiscectomy. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2017, roč. 12, č. 4, s. nestránkováno, 17 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0174518.

NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Tereza KÁFUŇKOVÁ, Július GODAVA, Petr HUDE, Petr NĚMEC, Helena BEDÁŇOVÁ, Ondřej SLABÝ, Julie BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Jan KREJČÍ a Lenka ŠPINAROVÁ. Využití RNA sekvenování v identifikaci nových klinicky relevantních biomarkerů – přehled a vlastní výsledky se zaměřením na monitoring akutní rejekce u pacientů po srdeční transplantaci. In 45. Pracovní Setkání Komise Experimentální Kardiologie - "Omics technologie v kardiovaskulárním výzkumu a v klinice". 2017.

KÁFUŇKOVÁ, Tereza, Jan NOVÁK, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jiří ŠÁNA, Július GODAVA, Petr HUDE, Víta ŽAMPACHOVÁ, Petr NĚMEC, Helena BEDÁŇOVÁ, Ondřej SLABÝ, Julie BIENERTOVÁ VAŠKŮ, Jan KREJČÍ a lenka ŠPINAROVÁ. Změny hladin microRNA ve vzorcích endomyokardiální biopsie během akutní celulární rejekce u pacientů po srdeční transplantaci. In XXXIV. KONFERENCE ČESKÉ SPOLEČNOSTI PRO HYPERTENZI, XXVI. KONFERENCE PRACOVNÍ SKUPINY PREVENTIVNÍ KARDIOLOGIE ČKS a BLOK ČESKÉ ASOCIACE SRDEČNÍHO SELHÁNÍ ČKS. 2017.

MLČOCHOVÁ, Hana, Ondřej SLABÝ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Anja RABIEN, Lenka RADOVÁ, Pavel FABIAN, Kateřina SLABÁ, Alexandr POPRACH, Ergin KILIC a Klaus JUNG. EPITHELIAL-MESENCHYMAL TRANSITION-ASSOCIATED MICRORNA/MRNA SIGNATURE IS LINKED TO METASTASIS AND PROGNOSIS IN CLEAR-CELL RENAL CELL CARCINOMA. In XL. brněnské onkologické dny a XXX. koncerence pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Brno. 2016. ISSN 0862-495X.

MLČOCHOVÁ, Hana, Táňa MACHÁČKOVÁ, Anja RABIEN, Lenka RADOVÁ, Pavel FABIAN, Robert ILIEV, Kateřina SLABÁ, Alexandr POPRACH, Ergin KILIC, Michal STANIK, Martina LOJOVÁ, Marek SVOBODA, Jan DOLEZEL, Rostislav VYZULA, Klaus JUNG a Ondřej SLABÝ. Epithelial-mesenchymal transition-associated microRNA/mRNA signature is linked to metastasis and prognosis in clear-cell renal cell carcinoma. Scientific Reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2016, roč. 6, August, s. nestránkováno, 12 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/srep31852.

ILIEV, Robert, Michal FEDORKO, Táňa MACHÁČKOVÁ, Hana MLČOCHOVÁ, Marek SVOBODA, Dalibor PACÍK, Jan DOLEZEL, Michal STANIK a Ondřej SLABÝ. Expression Levels of PIWI-interacting RNA, piR-823, Are Deregulated in Tumor Tissue, Blood Serum and Urine of Patients with Renal Cell Carcinoma. Anticancer Research. Athens: The International Institute of Anticancer Research, 2016, roč. 36, č. 12, s. 6419-6423. ISSN 0250-7005. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21873/anticanres.11239.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Hana MLČOCHOVÁ, Michal STANIK, Jan DOLEZEL, Michal FEDORKO, Dalibor PACÍK, Alexandr POPRACH, Marek SVOBODA a Ondřej SLABÝ. MiR-429 is linked to metastasis and poor prognosis in renal cell carcinoma by affecting epithelial-mesenchymal transition. Tumor Biology. Dordrecht: Springer, 2016, roč. 37, č. 11, s. 14653-14658. ISSN 1010-4283. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s13277-016-5310-9.

CAPOOR, Manu N., Filip RŮŽIČKA, Táňa MACHÁČKOVÁ, Radim JANČÁLEK, Martin SMRČKA, Jonathan E. SCHMITZ, Markéta HERMANOVÁ, Jiří ŠÁNA, Elleni PONECHAL MICHU, John C. BAIRD, Fahad S. AHMED, Karel MÁCA, Radim LIPINA, Todd F. ALAMIN, Michael F. COSCIA, Jerry L. STONEMETZ, Timothy WITHAM, Garth D. EHRLICH, Ziya L. GOKASLAN, Konstantinos MAVROMMATIS, Christof BIRKENMAIER, Vincent A. FISCHETTI a Ondřej SLABÝ. Prevalence of Propionibacterium acnes in Intervertebral Discs of Patients Undergoing Lumbar Microdiscectomy: A Prospective Cross-Sectional Study. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2016, roč. 11, č. 8, s. 1-12. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0161676.

FEDORKO, Michal, Michal STANÍK, Robert ILIEV, Martina LOJOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Marek SVOBODA, Dalibor PACÍK, Jan DOLEŽEL a Ondřej SLABÝ. Combination of MiR-378 and MiR-210 Serum Levels Enables Sensitive Detection of Renal Cell Carcinoma. International Journal of Molecular Sciences. Basel: MDPI AG, 2015, roč. 16, č. 10, s. 23382-23389. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms161023382.

MLČOCHOVÁ, Hana, Renata HÉŽOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Martina LOJOVÁ, Alexandr POPRACH, Radek LAKOMÝ, Pavel FABIAN, Marek SVOBODA, Rostislav VYZULA a Ondřej SLABÝ. Charakterizace exprese epiteliálních a mezenchymálních markerů zapojených do procesu EMT u pacientů s renálním karcinomem. In XXXIX. brněnské onkologické dny a XXIX. konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Brno. 2015.

JURÁČEK, Jaroslav, Hana MLČOCHOVÁ, Michal STANÍK, Barbora PELTANOVÁ, Robert ILIEV, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jitka MLČOCHOVÁ, Renata HÉŽOVÁ, Jan DOLEŽEL a Ondřej SLABÝ. Urinary cell-free microRNAs as potential biomarkers of urothelial carcinoma of the urinary bladder. In 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research 2015, Philadelphia. 2015.

HÉŽOVÁ, Renata, Robert ILIEV, Hana MLČOCHOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Michal STANÍK, Michal FEDORKO, Alexandr POPRACH, Jan DOLEŽEL, Dalibor PACÍK, Marek SVOBODA, Rostislav VYZULA a Ondřej SLABÝ. Zvýšená hladina cirkulujících miR-378 a miR-210 v séru pacientů s renálním karcinomem. In XXXVIII. brněnské onkologické dny a XXVIII.konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Brno. 2014. ISBN 978-80-86793-32-0.

MLČOCHOVÁ, Hana, Renata HÉŽOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Martina RÉDOVÁ, Alexandr POPRACH, Radek LAKOMÝ, Pavel FABIAN, Marek SVOBODA, Rostislav VYZULA a Ondřej SLABÝ. Analýza mikroRNA asociovaných s procesem epiteliálně-mezenchymální tranzice jako potenciálních markerů pro predikci rizika a časný záchyt metastazování u pacientů s renálním karcinomem. In XXXVII. Brněnské onkologické dny a XXVII. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky. 2013. ISBN 978-80-904596-9-4.

MLČOCHOVÁ, Hana, Renata HÉŽOVÁ, Táňa MACHÁČKOVÁ, Martina LOJOVÁ, Alexandr POPRACH, Radek LAKOMÝ, Pavel FABIAN, Marek SVOBODA, Rostislav VYZULA a Ondřej SLABÝ. EMT-related miRNAs as a potential markers for prediction and early detection of metastasis in renal cell carcinoma. In TEMTIA 2013, The 6th International EMT Meeting, Alicante, Spain. 2013.