Výpis publikací

ŠIMARA, Pavel; Irena KOUTNÁ; Stanislav STEJSKAL; Petr KRONTORÁD; Zdeněk RUČKA; Martina PETERKOVÁ a Michal KOZUBEK. Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling. Neoplasma. Bratislava, Slovensko: AEPress, s.r.o., 2009, roč. 2/2009, č. 56, s. 141-149. ISSN 0028-2685.

KOUTNÁ, Irena. Gene Expression differences in bone marrow hematoietic stem cell subpopulation. In KOUTNÁ, Irena; Martin KLABUSAY; Martina PETERKOVÁ; Viera HRABČÁKOVÁ; Michaela POTĚŠILOVÁ; Petr KRONTORÁD a Michal KOZUBEK. 3rd ESF functional genomics conference. 2008.

TESAŘOVÁ, Lenka; Irena KOUTNÁ; Martin KLABUSAY; Viera HRABČÁKOVÁ a Petr KRONTORÁD. Gene Expression Profiling During Ex Vivo Granulopoiesis: a Possible Tool for Quality Assessment of CD34+ Cells from Lymphoma Patients. In 3rd ESF Functional Genomics Conference. 2008.

MATULA, Pavel; Martin MAŠKA; Ondřej DANĚK; Petr MATULA; Michal KOZUBEK a Petr KRONTORÁD. Acquiarium 1.0. 2007.

KLABUSAY, Martin; Viera HRABČÁKOVÁ; Irena KOUTNÁ; Petr KRONTORÁD; Jiří MAYER a Drahomír HORKÝ. Comparison of two methods of hematopoietic stem cell isolation and evaluation of the ex vivo cultured and differentiated cells with cDNA microarrays. In Haematologica – The Hematology Journal. 1. vyd. Italy: European Hematology Association, 2007, s. 468-468, 548 s. ISSN 0390-6078.

KOUTNÁ, Irena; Lenka TESAŘOVÁ; Martin KLABUSAY; Petr KROTORÁD; Michal STREHOVSKÝ; Martina PETERKOVÁ a Viera HRABČÁKOVÁ. Expression Profiling of CD34+ of Peripheral Blood of Patients with Lymphoma During ex vivo Granulocytic Differentiation. 2007.

KRONTORÁD, Petr; Irena KOUTNÁ a Michal STREHOVSKÝ. Interactive Transcription Maps Over Microarray Data. 2007.

KRONTORÁD, Petr. JABS-I. 2007.

ŠIMARA, Pavel; Irena KOUTNÁ; Stanislav STEJSKAL; Martina PETERKOVÁ; Petr KRONTORÁD a Zdeněk RUČKA. Large-scale Microarray Analysis of Protein and mRNA Level Changes in HL-60 Cells. 2007.

KOUTNÁ, Irena; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Eva BÁRTOVÁ; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. New insights into gene positional clustering and its properties supported by large-scale analysis of various differentiation pathways. Genomics. United States: Elsevier Science Inc, 2007, roč. 89, č. 1, s. 81-88. ISSN 0888-7543.

KLABUSAY, Martin; Irena KOUTNÁ; Viera HRABČÁKOVÁ; Petr KRONTORÁD a Jiří MAYER. Srovnání dvou metod imunomagnetické separace hematopoetických kmenových buněk (CD34+ a Lin) z transplantátů PBSC pomocí cDNA microarrays během ex vivo kultivace. In XXI. Olomoucké hematologické dny s mezinárodní účastí, Olomouc, 16.-19.6.2007. 2007. ISBN 978-80-7346-078-5.

KLABUSAY, Martin; Viera HRABČÁKOVÁ; Irena KOUTNÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Michal KOZUBEK a Jiří MAYER. Srovnání metod CD34+ a Lin– selekce buněk ze štěpu periferních kmenových buněk pacientů s lymfomy a vyhodnocení jejich ex vivo diferenciace pomocí cDNA microarrays. In XXXI. Brněnské onkologické dny s XXI. konferencí pro sestry a laboranty. 1. vyd. Brno: Masarykův onkologický ústav, 2007, s. 182-183, 410 s. ISBN 978-9780-86793-09-2.

STREHOVSKÝ, Michal; Irena KRONTORÁD KOUTNÁ a Petr KRONTORÁD. TransMap Viewer. 2007.

JANSOVÁ, Eva; Irena KOUTNÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Silvie KŘIVÁNKOVÁ; Jan ŽALOUDÍK; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. Comparative transcriptome maps: a new approach to the diagnosis of colorectal carcinoma patients using cDNA microarrays. Clinical Genetics. Denmark: Blackwell Munksgaard, 2006, roč. 69, č. 3, s. 218-227. ISSN 0009-9163.

KOUTNÁ, Irena; Martin KLABUSAY; Viera HRABČÁKOVÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Michal KOZUBEK a Jiří MAYER. Evaluation of CD34+ - and Lin- -selected cells from peripheral blood stem cell grafts of patients with lymphoma during differentiation in culture ex vivo using a cDNA microarray technique. Experimental hematology. Netherlands: Elsevier Science Inc, 2006, roč. 34, č. 7, s. 832-840, 10 s. ISSN 0301-472X.

KOUTNÁ, Irena; Petr KRONTORÁD; Lenka TESAŘOVÁ; Martin KLABUSAY; Viera HRABČÁKOVÁ a Michal KOZUBEK. Transcription density map as a new tool for evaluation of various expression profiles: Ex vivo differentiation of CD34+ cells. In ISREC Conference on Cancer Research. 2006.

KOUTNÁ, Irena; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA a Michal KOZUBEK. Vybrané aplikace technologie cDNA microarrays v onkologickém výzkumu. Klinická onkologie. Czech Republic: ApS BRNO, 2006, roč. 19, č. 2, s. 338 - 341. ISSN 0862-495X.

KRONTORÁD, Petr; Zbyněk SVOBODA; Irena KOUTNÁ; Eva JANSOVÁ a Michal KOZUBEK. Analýza obrazů získaných snímáním microarrays. In Analytická cytometrie III. 2005. ISBN 80-239-5155-6.

PAVLÍK, Tomáš; Eva JANSOVÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA a Michal KOZUBEK. Aplikace FDR a FWER testovacích procedur na data ze studie kolorektálního karcinomu. In Analytická cytometrie III. 2005. ISBN 80-239-5155-6.

KOUTNÁ, Irena; Eva JANSOVÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. cDNA Microarray Technology as a Tool for Better Understanding of Progress of Malignant Diseases. In Prague Post Genome Technology Workshop. Prague, Czech Republic: Czech Pattern Recognition Society, 2005, s. 69-72. ISBN 80-01-03239-6.

JANSOVÁ, Eva; Petr KRONTORÁD; Irena KOUTNÁ; Stanislav STEJSKAL; Petr MATULA; David SVOBODA; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. Combination of cDNA microarray technology and fluorescence leads to better understanding of relationships between gene expression and epigenetic regulation. In MGED8 Abstract book. 2005.

KOUTNÁ, Irena; Petr KRONTORÁD; Eva JANSOVÁ; Zbyněk SVOBODA; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. Důkaz klastrování genů na chromosomových doménách studiem diferenciací buněčných nádorových linií. In Analytická cytometrie III. 2005. ISBN 80-239-5155-6.

KRONTORÁD, Petr; Zbyněk SVOBODA; Irena KOUTNÁ; Eva JANSOVÁ a Michal KOZUBEK. New practical tools for microarray data analysis. In MGED8 Abstract book. 2005.

SVOBODA, Zbyněk; Petr KRONTORÁD; Eva JANSOVÁ; Irena KOUTNÁ a Michal KOZUBEK. Normalizační metody ve zpracování dat z DNA Microarrays. In Analytická cytometrie III. 2005. ISBN 80-239-5155-6.

JANSOVÁ, Eva; Irena KOUTNÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. Sledování změn genové exprese u pacientů s kolorektálním karcinomem pomocí cDNA microarrays technologie a jejich diagnostika pomocí transkripčních map. In Analytická cytometrie III. 2005. ISBN 80-239-5155-6.

KOUTNÁ, Irena; Jiří MAYER; Martin KLABUSAY; Petr KRONTORÁD; Eva JANSOVÁ; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. Transcriptional profiling of human CD34+ cells during in vitro differentiation. In MGED8 Abstract book. 2005.

KOZUBEK, Michal; Petr MATULA; Pavel MATULA; David SVOBODA; Jan HUBENÝ a Petr KRONTORÁD. Automated image analysis in fluorescence microscopy: From isolated cells to tissues and microarray images. In Biophysics of the Genome. First Edition 2004. Brno: Masaryk University, 2004, s. 44-46. ISBN 80-210-3560-9.

KOUTNÁ, Irena; Eva JANSOVÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Tomáš PAVLÍK; Eva BÁRTOVÁ; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. Clustering of genes with similar regulation patterns during monocyte and granulocyte differentiation of HL-60 cells. In Biophysics of the Genome. First Edition 2004. Brno: Masaryk University, 2004, s. 38-43. ISBN 80-210-3560-9.

JANSOVÁ, Eva; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Irena KOUTNÁ; Tomáš PAVLÍK; Michal KOZUBEK; Marie JAROŠOVÁ; Jan ŽALOUDÍK a Stanislav KOZUBEK. Gene expression in colorectal carcinoma determined by cDNA microarrays using a combination of several evaluation approaches. In Biophysics of the Genome. First Edition 2004. Brno: Masaryk University, 2004, s. 29-37. ISBN 80-210-3560-9.

JANSOVÁ, Eva; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Tomáš PAVLÍK; Irena KOUTNÁ; Michal KOZUBEK; Jan ŽALOUDÍK a Stanislav KOZUBEK. Nové možnosti v diagnostice kolorektálního karcinomu s využitím technologie cDNA mikročipů. Klinická onkologie. Brno: ApS Brno, spol.s.r.o., 2004, roč. 6/17, č. 6, s. 203-207. ISSN 0862-495X.