Disertační práce

Identifikace cílů RNA vazných proteinů pomocí Machine Learning algoritmů

RNA binding protein target site identification using Machine Learning algorithms

Mgr. Eliška Chalupová
Anotace

RNA-vazné proteiny hrají klíčovou roli v post-transkripčních procesech a jsou často spojovány s různými poruchami. Objasnění jejich vazebných preferencí je zásadní pro porozumění jejich regulačním mechanismům. Tato disertační práce se zaměřuje na výpočetní přístupy pro identifikaci vazebných míst těchto proteinů a spojuje tři samostatné projekty. První projekt využívá konvoluční neuronové sítě pro …více

Abstract

RNA-binding proteins play a pivotal role in post-transcriptional processes and are often linked to various disorders. Understanding their binding preferences is essential for unraveling their regulatory mechanisms. This thesis focuses on computational approaches for RBP target site identification, combining three distinct projects. First project employs convolutional neural networks for small RNA loci …více

Klíčová slova
RNA-vazné proteiny transkriptomika bioinformatika hluboké učení strojové učení konvoluční neuronové sítě RNA binding proteins Transcriptomics Bioinformatics Deep learning Machine Learning Convolutional neural networks
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
17. 1. 2024 10:49, Panagiotis Alexiou, PhD, učo 241340
Plný text práce
16 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
28. 2. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Panagiotis Alexiou, PhD, učo 241340
NCBR PřF MU

Oponenti

Stanislav Mazurenko, PhD, učo 235907
ArtInt ProtIng RECETOX PřF MU, RECETOX PřF MU
Dr. Julian König
Institute of Molecular Biology gGmbH, Mainz, Germany

Konzultant

Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D., učo 98640
Genomics CMM CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Genomika a proteomika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.