Diplomová práce

Segmentation of Dense Cell Populations using Convolutional Neural Networks

Bc. Filip Lux
Anotace

Diplomová práce se zabývá schopnostmi konvolučních neurálních sítí segmentovat mikroskopové snímky hustých buněčných populací. Pro výzkum byl zvolen datová množina obrazů ze soutěže Cell Tracking Challenge, který není snadné řešit tradičními technikami zpracování obrazu. Vytvořili jsme a natrénovali vlastní konvoluční neurání síť segmentující tyto snímky, která je úspěšná i v mezinárodním srovnání …více

Abstract

This thesis examines the ability of convolutional neural networks to segment microscopy images of dense cell populations. We chose an image dataset from the Cell Tracking Challenge competition, which is not easy to solve using traditional image processing techniques. We built and trained our convolutional neural network able to segment these images, which is successful also in the international context …více

Klíčová slova
cell segmentation convolutional neural networks deep learning image analysis
Zadání práce
The main goal of the thesis is to study convolutional neural networks and their suitability for image segmentation of dense cell populations in difficult imaging modalities (such as differential interference contrast). The student should focus on situations with limited training data and propose solutions to overcome these limitations. The theoretical part of the thesis must survey the studied methods and detail own approach. In the practical part the trained network must be evaluated based on the biomedical images given by the supervisor. The evaluation results must be included in the text part.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
4. 6. 2018 09:07, doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
Plný text práce
18,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
18. 6. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019
CABO KVI FI MU

Oponent

prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., učo 3740
CABO KVI FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.