Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů I.

Přírodovědecká fakulta
jaro 2009
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)
RNDr. Aleš Kovařík, CSc. (přednášející)
Garance
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc.
Rozvrh
Po 12:00–13:50 Bpt,01013
Předpoklady
Výuka je určena studentům mikrobiologie, případně studentům jiných oborů. Maximální počet studentů v praktiku je 12 (přednost mají posluchači mikrobiologie). Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie(Bi4020).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Anotace
Metody využívané při analýze mikroorganismů. Fragmentace isolovaných molekul DNA restrikčními enzymy. Metody používané při analýze nukleových kyselin (elektromigrační metody, chromatografické metod, spektrofotometrické metody, sekvencování). Hybridizace nukleových kyselin. Průběh a provedení polymerázové řetězové reakce (PCR). Metody analýzy proteinů. Mikrobiální metabolity a jejich chromatografické stanovení. Chemotaxonomie a stanovení složek bakteriálních stěn. Principy kvantitativní analýzy. Techniky s využitím imunomagnetické a afinitní separace. K přednášce patří cvičení Bi6721c.
Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět principům vybraných molekulárně biologických a chemotaxonomických metod; zvolit vhodnou metodu pro řešení reálného problému; interpretovat výsledky analýz.
Klíčová témata
  • Metody analýzy mikroorganismů. Izolace nukleových kyselin.
  • Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy.
  • Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod.
  • Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin.
  • Sekvenční analýza. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
  • Hybridizace.
  • Polymerázová řetězová reakce (PCR).
  • Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
  • Principy kvantitativní analýzy.
  • Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
Studijní zdroje a literatura
  • Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
  • 1. Rickwood D., Hames B.D. (eds.) Gel electrophoresis of nucleic acids. 2 nd ed. IRL Press, Oxford 1990. 2. Sinden R.R. DNA structure and fuction. Academic Press, San Diego 1994. 3. Churáček J. a kol. Analytická separace látek. SNTL, Praha 1990.
  • G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology, RSC, Cambridge 1999.
  • ŠMARDA, Jan; Jiří DOŠKAŘ; Roman PANTŮČEK; Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Při výuce jsou používány prezentace na blanách. Při vysvětlování problematiky jsou využívány presentace výsledků vlastní analýzy reálných vzorků. Na předmět navazuje laboratorní cvičení.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Předmět je ukončen zkouškou.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025, jaro 2026.