Bi6721 Speciální metody analýzy mikroorganizmů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2026
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
Mgr. Martin Benešík, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Stanislava Bezdíček Králová, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 16. 2. až Pá 22. 5. St 13:00–14:50 E25/209
Předpoklady
Předmět je určen především studentům navazujícího studijního programu Mikrobiologie, případně studentům jiných navazujících studijních programů. Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z molekulární biologie (Bi4020).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Anotace
Cílem předmětu je seznámit studenty s principy vybraných molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod pro analýzu mikroorganismů, s postupem pro volbu vhodné metody pro řešení reálného problému,s rozdíly v postupech používaných pro bakterie a kvasinky a s interpretací výsledků analýz. Studenti získají konkrétní informace o následujících procesech: 1) Izolace nukleových kyselin (NK) z mikroorganismů a analýza NK chromatografickými a elektromigračními metodami 2) Aplikace enzymů v analýze mikrobiálních genů 3) Sekvenční analýza mikrobiálních genů a genomů, sekvenace proteinů 4) Využití hybridizace a polymerázové řetězové reakce v mikrobiologii 5) Metody studia mikrobiálních proteinů a metabolitů 6) Využití rekombinantních NK při studiu mikroorganismů
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu by studenti měli být schopni: porozumět a vysvětlit principy základních molekulárně biologických, biochemických a biofyzikálních metod metod využívaných v mikrobiologii a mikrobiální diagnostice, navrhnout postup pro řešení skutečného problému, realizovat rozdíly v metodách používaných pro bakterie a kvasinky; interpretovat výsledky.
Klíčová témata
  • Metody analýzy mikroorganismů v klinice. 
  • Izolace nukleových kyselin z bakterií, kvasinek a virů.
  • Metody pro studium a aplikaci bakteriofágů.
  • Analýza nukleových kyselin a proteinů pomocí elektromigračních metod.
  • Využití chromatografických metod při analýze nukleových kyselin a proteinů.
  • Sekvenční analýza, klasické a NGS metody. Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin.
  • Hybridizace, fluorescenční in situ hybridizace (FISH).
  • Polymerázová řetězová reakce (PCR) a její aplikace v mikrobiologii.
  • Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn.
  • Imunomagnetické a afinitní separační techniky v diagnostice mikroorganismů.
  • Metody přípravy rekombinantních molekul DNA a RNA a jejich využití při studiu mikroorganismů
Studijní zdroje a literatura
    doporučená literatura
  • Persing D.H. a kol. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 3rd Edition. 2016, 835 p. ISBN: 978-1-555-81908-8
  • Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
  • Brown T.A. Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, 8th Edition. 2020, Wiley-Blackwell, 432 p. ISBN: 978-1-119-64078-3
  • ŠMARDA, Jan; Jiří DOŠKAŘ; Roman PANTŮČEK; Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Výuka probíhá prezenčně. Při výuce jsou používány powerpointové prezentace, texty prezentací jsou v anglickém jazyce, výuka ale probíhá česky. Na předmět navazuje volitelné laboratorní cvičení.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Výuka je ukončena testem. Test obsahuje minimálně 30 otázek, které musí být zodpovězeny písemně. Student musí zodpovědět správně alespoň 16 otázek (více jak 50% správných odpovědí). Výsledek testu je hodnocen zkoušejícím. Následuje krátká diskuse s vyučujícím nad výsledky testu (ústní část zkoušky).
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2026/Bi6721