Výpis publikací

POKORNÁ, Petra; Jana ORLÍČKOVÁ; Táňa MACHÁČKOVÁ; Jitka HAUSNEROVÁ; Lucie EHRLICHOVÁ; Robin JUGAS; Eliška HLOUŠKOVÁ; Alena HOMOLOVÁ; Sára VILMANOVÁ; Júlia BOHOŠOVÁ; Kamila SOUČKOVÁ; Marek SVOBODA; Vít WEINBERGER; Ondřej SLABÝ a Markéta BEDNAŘÍKOVÁ. Genomic complexity and evolution of high-grade serous ovarian cancer treated with platinum-based chemotherapy: advancing precision oncology beyond BRCA1/BRCA2. JOURNAL OF OVARIAN RESEARCH. LONDON: BMC, 2026, roč. 19, č. 1, s. 1-10. ISSN 1757-2215. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s13048-025-01911-z.

BOUDNÁ, Marie; Nicolas BLAVET; Tetiana SAMOILENKO; Táňa MACHÁČKOVÁ; Robin JUGAS; Petra VYCHYTILOVÁ; Miroslav BOUDNÝ; Renata BARTOŠOVÁ; Jan KOTOUCEK; Vojtěch BYSTRÝ; Kateřina KOŽELKOVÁ; Ondřej SLABÝ a Kamila SOUČKOVÁ. Analysis of extracellular vesicles of frequently used colorectal cancer cell lines. BMC Cancer. London: BMC, 2025, roč. 25, č. 1, s. 1-17. ISSN 1471-2407. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s12885-025-13936-0.

HENDRYCH, Michal; Petra POKORNÁ; Martin BARÁK; Radim JANČÁLEK; Jiří ŠÁNA; Robin JUGAS; Ondřej SLABÝ; Tomáš KAZDA; Petr POSPÍŠIL; Tomáš JIRÁSEK; Jiří SOUKUP; Dominik HRABOŠ; Martin SYRŮČEK; Patricia DELONGOVÁ; Marián ŠVAJDLER; Petra KAŠPAROVÁ; Miroslav KOBLÍŽEK a Markéta HERMANOVÁ. ASTROCYTOMA IDH-MUTANT WITH PRIMITIVE NEURONAL COMPONENT. In 20th Meeting of the European Association of Neuro-Oncology (EANO 2025). 2025.

RUČKOVÁ, Michaela; Dagmar AL TUKMACHI; Marek VEČEŘA; Tereza DEISSOVÁ; Robin JUGAS; Markéta HERMANOVÁ; Michal HENDRYCH; Leoš KŘEN; Pavel FADRUS; Václav VYBÍHAL; Hana VALEKOVÁ; Radim JANČÁLEK; Tomáš KAZDA; Ondřej SLABÝ; Martin SMRČKA a Jiří ŠÁNA. Circulating MicroRNAs do not provide a diagnostic benefit over tissue biopsy in patients with brain metastases. Nature Scientific Reports. Berlin: NATURE RESEARCH, 2025, roč. 16, č. 1, s. 1-16. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-025-31344-z.

VYCHYTILOVÁ, Petra; Markéta PAVLÍKOVÁ; Lucie PIFKOVÁ; Robin JUGAS; Táňa MACHÁČKOVÁ; Lenka RADOVÁ; Milana SACHLOVA; Renata BARTOŠOVÁ; Tetiana SAMOILENKO; Zuzana FEČKOVÁ; Jana ORLÍČKOVÁ; Erika SLÁMOVÁ; Elleni PONECHAL MICHU; Dagmar AL TUKMACHI; Michaela RUČKOVÁ; Martina VODINSKÁ; Jan KOTOUCEK; Tina CATELA IVKOVIĆ; Marie BOUDNÁ; Lucia BOHOVICOVÁ; Teodor STANĚK; Jana HALÁMKOVÁ; Martin SVOBODA; Vladimír PROCHÁZKA; Tomáš GROLICH; Zdeněk KALA a Ondřej SLABÝ. Comprehensive profiling of lncRNAs and mRNAs enriched in small extracellular vesicles for early noninvasive detection of colorectal cancer: diagnostic panel assembly and extensive validation. MOLECULAR ONCOLOGY. HOBOKEN: WILEY, 2025, roč. 19, č. 11, s. 3445-3462. ISSN 1574-7891. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/1878-0261.70086.

YUAN, Dongsheng; Robin JUGAS; Petra POKORNÁ; Jaroslav ŠTĚRBA; Ondřej SLABÝ; Simone SCHMID; Christin SIEWERT; Brendan OSBERG; David CAPPER; Skarphedinn HALLDORSSON; Einar O VIK-MO; Pia S ZEINER; Katharina J WEBER; Patrick N HARTER; Christian THOMAS; Anne ALBERS; Markus RECHSTEINER; Regina REIMANN; Anton APPELT; Ulrich SCHUELLER; Nabil JABAREEN; Sebastian MACKOWIAK; Naveed ISHAQUE; Roland EILS; Soeren LUKASSEN a Philipp EUSKIRCHEN. crossNN is an explainable framework for cross-platform DNA methylation-based classification of tumors. NATURE CANCER. BERLIN: NATURE PORTFOLIO, 2025, roč. 6, č. 7, s. 1283-1294. ISSN 2662-1347. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s43018-025-00976-5.

SLABÁ, Kateřina; Petra POKORNÁ; Kateřina KOŽELKOVÁ; Eliška HLOUŠKOVÁ; Robin JUGAS; Jana KUBÁTOVÁ; Regina DEMLOVÁ; Pavlína DANHOFER; Petr JABANDŽIEV; Tereza SVATOŇOVÁ a Ondřej SLABÝ. ReNU syndrom - nově popsané prevalentní neurovývojové onemocnění, první případ v České republice. Česko-slovenská pediatrie. Praha: Česká a slovenská pediatrická společnost, 2025, roč. 80, č. 4, s. 177-181. ISSN 0069-2328. Dostupné z: https://doi.org/10.55095/CSPediatrie2025/029.

BEDNAŘÍKOVÁ, Markéta; Petra POKORNÁ; Jitka HAUSNEROVÁ; Jana ORLÍČKOVÁ; Júlia BOHOŠOVÁ; Táňa MACHÁČKOVÁ; Robin JUGAS; Lucie EHRLICHOVÁ; Michal FELSINGER; Luboš MINÁŘ; Ondřej SLABÝ a Vít WEINBERGER. Results Of Tumor Profiling Using Next-Generation Sequencing In The Real World Cohorts Of Patients With Platinum-Resistant And Platinum-Sensitive High-Grade Serous Ovarian Cancer #439. In 26th European Gynaecological Oncology Congress. 2025.

JUGAS, Robin; Petra POKORNÁ; Soňa ADAMCOVÁ; Kateřina KOŽELKOVÁ; Dana KNOFLÍČKOVÁ; Hana PÁLOVÁ; Jaroslav ŠTĚRBA a Ondřej SLABÝ. Dataset of DNA methylation profiles of 189 pediatric central nervous system, soft tissue, and bone tumors. Data in Brief. Amsterdam: Elsevier, 2024, roč. 55, August 2024, s. 1-8. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.dib.2024.110590.

SLABÁ, Kateřina; Petra POKORNÁ; Robin JUGAS; Hana PÁLOVÁ; Dagmar PROCHÁZKOVÁ; Štefánia AULICKÁ; Klára ŠPANĚLOVÁ; Pavlína DANHOFER; Ondřej HORÁK; Jana TUČKOVÁ; Petra KLEIBLOVÁ; Renata GAILLYOVÁ; Matěj HRUNKA; Martin JOUZA; Blanka PINKOVÁ; Jan PAPEŽ; Petra KONEČNÁ; Jana ZÍDKOVÁ; Petr ŠTOURAČ; Jaroslav ŠTĚRBA; Regina DEMLOVÁ; Eva DEMLOVÁ; Petr JABANDŽIEV a Ondřej SLABÝ. Diagnostic efficacy and clinical utility of whole-exome sequencing in Czech pediatric patients with rare and undiagnosed diseases. SCIENTIFIC REPORTS. BERLIN: NATURE PORTFOLIO, 2024, roč. 14, č. 1, s. 1-11. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-024-79872-4.

BOUDNÁ, Marie; Táňa MACHÁČKOVÁ; Petra VYCHYTILOVÁ; Karolína TRACHTOVÁ; Renata BARTOŠOVÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Dagmar AL TUKMACHI; Robin JUGAS; Lucie PIFKOVÁ; Jana ORLÍČKOVÁ; Jan KOTOUČEK; Markéta PAVLÍKOVÁ; Milana ŠACHLOVÁ; Lucia BOHOVICOVÁ; Teodor STANĚK; Jana HALÁMKOVÁ; Igor KISS; Tomáš GROLICH; Martin SVOBODA; Zdeněk KALA; Kamila SOUČKOVÁ a Ondřej SLABÝ. Investigation of long non-coding RNAs in extracellular vesicles from low-volume blood serum specimens of colorectal cancer patients. CLINICAL AND EXPERIMENTAL MEDICINE. MILAN: SPRINGER-VERLAG ITALIA SRL, 2024, roč. 24, č. 1, s. 1-14. ISSN 1591-8890. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s10238-024-01323-1.

VYCHYTILOVÁ, Petra; Sára VILMANOVÁ; Lucie PIFKOVÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Marie MĄDRZYK; Robin JUGAS; Táňa MACHÁČKOVÁ; Jan KOTOUČEK; Milana ŠACHLOVÁ; Lucia BOHOVICOVÁ; Teodor STANĚK; Jana HALÁMKOVÁ; Igor KISS a Ondřej SLABÝ. Optimized procedure for high-throughput transcriptome profiling of small extracellular vesicles isolated from low volume serum samples. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. Berlin: WALTER DE GRUYTER, 2024, roč. 62, č. 1, s. 157-167. ISSN 1434-6621. Dostupné z: https://doi.org/10.1515/cclm-2023-0610.

PÁLOVÁ, Hana; Anirban DAS; Petra POKORNÁ; Viera BAJČIOVÁ; Zdeněk PAVELKA; Marta JEŽOVÁ; Karol PÁL; Jose R DIMAYACYAC; Logine NEGM; Lucie STENGS; Vanessa BIANCHI; Klára VEJMĚLKOVÁ; Kristýna NOSKOVÁ; Marie JAROŠOVÁ; Soňa MEJSTŘÍKOVÁ; Peter MÚDRY; Michal KÝR; Tomáš MERTA; Pavel TINKA; Klára DRÁBOVÁ; Štefánia AULICKÁ; Robin JUGAS; Uri TABORI; Ondřej SLABÝ a Jaroslav ŠTĚRBA. Precision immuno-oncology approach for four malignant tumors in siblings with constitutional mismatch repair deficiency syndrome. NPJ PRECISION ONCOLOGY. Belin: NATURE PORTFOLIO, 2024, roč. 8, č. 1, s. 1-9. ISSN 2397-768X. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41698-024-00597-8.

POKORNÁ, Petra; Hana PÁLOVÁ; Soňa ADAMCOVÁ; Robin JUGAS; Dagmar AL TUKMACHI; Michal KÝR; Dana KNOFLÍČKOVÁ; Kateřina KOŽELKOVÁ; Vojtěch BYSTRÝ; Soňa MEJSTŘÍKOVÁ; Tomáš MERTA; Karolína TRACHTOVÁ; Eliška HLOUŠKOVÁ; Peter MÚDRY; Zdeněk PAVELKA; Viera BAJČIOVÁ; Pavel TINKA; Marie JAROŠOVÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Sibylle MADLENER; Karol PÁL; Natalia STEPIEN; Lisa MAYR; Boris TICHÝ; Klára NOVÁKOVÁ; Marta JEŽOVÁ; Šárka KOZÁKOVÁ; Jitka VAŇÁČKOVÁ; Lenka RADOVÁ; Karin STEININGER; Christine HABERLER; Johannes GOJO; Jaroslav ŠTĚRBA a Ondřej SLABÝ. Real-World Performance of Integrative Clinical Genomics in Pediatric Precision Oncology. Laboratory Investigation. NEW YORK: ELSEVIER, 2024, roč. 104, č. 12, s. 1-12. ISSN 0023-6837. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.labinv.2024.102161.

DRÁBOVÁ, Klára; Petra POKORNÁ; Hana PÁLOVÁ; Sabina ADAMCOVÁ; Vojtěch BYSTRÝ; Robin JUGAS; Ondřej SLABÝ a Jaroslav ŠTĚRBA. Výsledky celoexomového sekvenování germinální DNA u dětských pacientů se solidními tumory. In Kaprasův den 2023, Praha. 2023.

DRÁBOVÁ, Klára; Petra POKORNÁ; Hana PÁLOVÁ; Soňa ADAMCOVÁ; Vojtěch BYSTRÝ; Robin JUGAS; Ondřej SLABÝ a Jaroslav ŠTĚRBA. Výsledky celoexomového sekvenování germinální DNA u dětských pacientů se solidními tumory. In XXV. Biologické dny. 2022.