Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů I. - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2018
Rozsah
0/3/0. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. (cvičící)
Michael Kobza (pomocník)
Garance
Mgr. Iva Buriánková, Ph.D.
Ústav experimentální biologie - Biologická sekce - Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie - Biologická sekce - Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 14:00–16:50 A25-111
Předpoklady
NOW ( Bi6721 Spec. met. an. mikroorg. I. )
Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí prakticky zvládnout metodu PCR (polymerázová řetězová reakce).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 11/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají posluchači specializace mikrobiologie.
Mateřské obory
předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem praktického kurzu je seznámit studenty s metodou izolace DNA pomocí kitu, přípravou reakce na PCR a kontrolní gelovou elektroforézu ze vzorků bakterií a kvasinek.
Výstupy z učení
Na konci kursu studenti prokáží praktickou schopnost provádět izolaci DNA, PCR a gelovou elektroforézu ze vzorků bakterií a kvasinek.
Osnova
  • 1. Příprava bakteriálních lyzátů z kultur čeledi Pasteurellaceae.
  • 2. Amplifikace tří specifických genů.
  • 3. Elektroforéza výsledku, purifikace PCR produktů.
  • 4. Elektroforéza po purifikaci, kvantifikace a příprava vzorku pro odeslání k sekvenování.
  • 5. Počítačová analýza výsledku sekvenování.
  • 6. Izolace genomové DNA z bakteriální kultury Escherichia coli.
  • 7. Stanovení koncentrace a čistoty DNA spektrofotometricky.
  • 8. Izolace genomové DNA ze vzorku s obsahem Chlamydia trachomatis.
  • 9. Orientační stanovení koncentrace a čistoty DNA spektrofotometricky.
  • 10. Polymerázová řetězová reakce systémem end-point, gelová elektroforéza.
  • 11. Real-time PCR pro Chlamydia trachomatis.
  • 12. Izolace DNA z kvasinek (fenol-chloroformová extrakce), gelová elektroforéza.
  • 13. PCR ITS regionu pro odlišení komplexu Saccharomyces sensu stricto, gelová elektroforéza.
  • 14. Štěpení PCR produktu restrikční endonukleázou, gelová elektroforéza.
Literatura
  • Green, M.R., Sambrook, F. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 4th ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2012

    ​Kopecká, J., Bartoš, M. Speciální metody analýzy mikroorganizmů I, návody ke cvičení​, 2014

Výukové metody
Při výuce každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky svých experimentů musí shrnout a vyhodnotit v protokolu. Protokoly jsou vypracovány dle instrukcí (informace v prvním cvičení a na přednášce). V každém protokolu student popisuje, srovnává, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje vlastní výsledky.
Metody hodnocení
Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za odevzdání správně vypracovaných protokolů.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace, jaro 2014, jaro 2016, jaro 2017.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2018/Bi6721c

Nahoru | Aktuální datum a čas: 22. 2. 2018 01:38, 8. (sudý) týden

Kontakty: istech(zavináč/atsign)fi(tečka/dot)muni(tečka/dot)cz, studijní odd., správci práv, is-technici, e-technici, IT podpora | Použití cookies | Více o Informačním systému