PřF:Bi6721c Spec.met.an.mikroorg.I. - cv. - Informace o předmětu
Bi6721c Speciální metody analýzy mikroorganizmů I. - cvičení
Přírodovědecká fakultajaro 2019
- Rozsah
- 0/3/0. 3 kr. Ukončení: z.
- Vyučující
- doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Barbora Burýšková (pomocník) - Garance
- doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Po 18. 2. až Pá 17. 5. Po 14:00–16:50 E25/111
- Předpoklady
- NOW( Bi6721 Spec. met. an. mikroorg. I. )
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 16 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/16, pouze zareg.: 0/16, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/16
Jiné omezení: Přednost mají posluchači specializace mikrobiologie. - Mateřské obory/plány
- předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Cílem praktického kurzu je seznámit studenty s metodou izolace plasmidové a genomové DNA bakterií pomocí kitu, s přípravou PCR a s metodou kontrolní gelové elektroforézy.
- Výstupy z učení
- Na konci kursu studenti prokáží praktickou schopnost provádět izolaci mikrobiální DNA, znalost PCR a gelové elektroforézy.
- Osnova
- 1. Příprava bakteriálních lyzátů z kultur Pseudomonas putida a Escherichia coli.
- 2. Amplifikace čtyř specifických genů.
- 3. Elektroforéza a purifikace PCR produktů.
- 4. Elektroforéza po purifikaci, kvantifikace a příprava vzorku pro odeslání k sekvenování.
- 5. Počítačová analýza výsledku sekvenování.
- 6. Izolace genomové DNA z bakteriální kultury Escherichia coli.
- 7. Stanovení koncentrace a čistoty DNA spektrofotometricky.
- 8. Izolace genomové DNA ze vzorku s obsahem Chlamydia trachomatis.
- 9. Orientační stanovení koncentrace a čistoty DNA spektrofotometricky.
- 10. Polymerázová řetězová reakce systémem end-point, gelová elektroforéza.
- 11. Real-time PCR se vzorkem DNA z Chlamydia trachomatis.
- 12. Odevzdání laboratorních protokolů ze cvičení, diskuse
- Literatura
- Green, M.R., Sambrook, F. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 4th ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2012
Kopecká, J., Bartoš, M. Speciální metody analýzy mikroorganizmů I, návody ke cvičení, 2014
- Green, M.R., Sambrook, F. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 4th ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2012
- Výukové metody
- Při výuce každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky svých experimentů musí shrnout a vyhodnotit v protokolu. Protokoly jsou vypracovány dle instrukcí (informace v prvním cvičení a na přednášce). V každém protokolu student popisuje, srovnává, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje vlastní výsledky.
- Metody hodnocení
- Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za odevzdání správně vypracovaných protokolů.
- Navazující předměty
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
- Statistika zápisu (jaro 2019, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2019/Bi6721c