PřF:Bi7420 Metody analýzy genomu - Informace o předmětu
Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
Přírodovědecká fakultapodzim 2016
- Rozsah
- 1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- MVDr. Boris Tichý, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D. (přednášející)
prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Nikola Tom, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Karol Pál, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Martin Trbušek, Dr. (přednášející) - Garance
- prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Po 19. 9. až Ne 18. 12. Pá 10:00–11:50 B11/235
- Předpoklady
- Bi1700 Buněčná biologie && ( Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie ) && ( Bi4020c Základy metod mol. biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie )
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 40 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/40, pouze zareg.: 0/40, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/40 - Mateřské obory/plány
- Lékařská genetika a molekulární diagnostika pro odborné pracovníky v laboratorních metodách (program PřF, N-BI)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
- Cíle předmětu
- Na konci tohoto kurzu bude student schopen s orientovat v moderních mmolekulárně-biologických metodách a vysvětlit principy čipových technologií a sekvenování nové generace
- Osnova
- 1. Microarrays - technologické aspekty čipových technologií; expresní, CGH, SNP čipy, resekvenační, a proteinové čipy 2. Sekvenování nové generace (NGS) – technologické aspekty různých NGS platforem 3. Příprava knihoven pro sekvenování nové generace 4. Metody pro analýzu nekódujících RNA – miRNA, lncRNA, příklady využití v onkologii 5. Analýza dat – bioinformatické přístupy a statistické metody hodnocení 6. Aplikace - Využití čipových a NGS technologií, design experimentů
- Literatura
- Koubková L, Vojtěšek B, Vyzula R. Next generation sequencing - application in clinical practice. Klin Onkol. 2014;27 Suppl 1:S61-8.
- Výukové metody
- Teoretická příprava.
- Metody hodnocení
- písemný test
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
- Statistika zápisu (podzim 2016, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2016/Bi7420