Bi7420 Microarrays

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011
Rozsah
1/0. 1 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: kz. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
doc. Mgr. Martin Trbušek, Dr. (přednášející)
prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D. (přednášející)
MVDr. Boris Tichý, Ph.D. (přednášející)
prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. (přednášející)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D.
Rozvrh
Čt 8:00–8:50 Kontaktujte učitele
Předpoklady
Bi1700 Buněčná biologie && ( Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie ) && ( Bi4020c Základy metod mol. biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie ) && Bi5000 Bioinformatika I
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Mateřské obory/plány
předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit
Anotace
Seznámit se s principem čipových technologií pro studium genomu, transkriptomu i proteomu; Porozumět statistickým metodám pro analýzu čipových výstupů.
Klíčová témata
1. Technologické aspekty čipových technologií 2. Expresní čipy 3. CGH - čipy 4. SNP - čipy 5. Resekvenační čipy 6. Čipy pro anaýzu metylačního stavu, ChIP on chip 7. Proteinové, buněčné a tkáňové čipy 8. Statistické metody u čipových technologií 9. Využití čipových technologií v molekulární biologii v onkologii i mimo onkologii 10. Výzkumné strategie pro využití čipových technologií 11. Analýzy genomu pomocí sekvenování nové generace
Studijní zdroje a literatura
  • Čipové technologie v onkologickém výzkumu a praxi. Klinická onkologie 2006. Supplement 2
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Přednášky
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Písemný test
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2010 - akreditace, podzim 2010, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024, podzim 2025.