Masarykova univerzita

Výpis publikací

česky | in English

Filtrování publikací

    2020

  1. JASEŇÁKOVÁ, Zuzana, Vojtěch ZAPLETAL, Petr PADRTA, Milan ZACHRDLA, N. BOLIK-COULON, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, F. FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Boosting the resolution of low-field 15N relaxation experiments on intrinsically disordered proteins with triple-resonance NMR. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2020, roč. 74, 2-3, s. 139-145. ISSN 0925-2738. doi:10.1007/s10858-019-00298-6.
  2. 2019

  3. KUBÁŇ, Vojtěch, Pavel SRB, Hana ŠTÉGNEROVÁ, Petr PADRTA, Milan ZACHRDLA, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, H. SANDEROVA, D. VITOVSKA, L. KRASNY, T. KOVAL, J. DOHNALEK, J. ZIEMSKA-LEGIECKA, M. GRYNBERG, P. JARNOT, A. GRUCA, M.R. JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important Electrostatic Interactions in the Intrinsically Disordered Region of Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 141, č. 42, s. 16817-16828. ISSN 0002-7863. doi:10.1021/jacs.9b07837.
  4. 2017

  5. OTRUSINOVÁ, Olga, Gabriel DEMO, Petr PADRTA, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Zuzana GELOVÁ, Agnieszka SZMITKOWSKA, Pavel KADEŘÁVEK, Séverine JANSEN, Milan ZACHRDLA, Tomáš KLUMPLER, Jaromír MAREK, Jozef HRITZ, Lubomír JANDA, Hideo IWAI, Michaela WIMMEROVÁ, Jan HEJÁTKO a Lukáš ŽÍDEK. Conformational dynamics are a key factor in signaling mediated by the receiver domain of a sensor histidine kinase from Arabidopsis thaliana. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 42, s. 17525-17540. ISSN 0021-9258. doi:10.1074/jbc.M117.790212.
  6. ZACHRDLA, Milan, Petr PADRTA, Alzbeta RABATINOVA, Hana SANDEROVA, Ivan BARVIK, Libor KRASNY a Lukáš ŽÍDEK. Solution structure of domain 1.1 of the sigma(A) factor from Bacillus subtilis is preformed for binding to the RNA polymerase core. Journal of Biological Chemistry. Bethesda: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 28, s. 11610-11617. ISSN 0021-9258. doi:10.1074/jbc.M117.784074.
  7. 2016

  8. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Pavel SRB, Petr PADRTA, Jana PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ, Mária ŠOLTÉSOVÁ, Jozef KOWALEWSKI, Göran WIDMALM, Josef CHMELÍK, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc. Elsevier Science, 2016, roč. 266, May, s. 23-40. ISSN 1090-7807. doi:10.1016/j.jmr.2016.02.016.
  9. 2011

  10. KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Complementation of 3D structure of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis with description of internal motions in terms of reduced spectral density mapping. MATERIALS STRUCTURE. 2011, roč. 18, č. 1, s. 3-5. ISSN 1211-5894.
  11. PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Šanderová HANA, Rabatinová ALŽBĚTA, Zawadzka-Kazimierczuk ANNA, Kazimierczuk KRZYSZTOF, Lukáš ŽÍDEK, Kozminski WIKTOR, Krásný LIBOR a Vladimír SKLENÁŘ. Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria. In 9th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady. 2011. ISSN 1211-5894.
  12. 2010

  13. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Jiří JONÁK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. USA: John Wiley and Sons, 2010, roč. 78, č. 7, s. 1807-1810. ISSN 0887-3585.
  14. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Jiří NOVÁČEK, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzysztof KAZIMIERCZUK, Wiktor KOŹMIŃSKI, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference. 2010.
  15. KADEŘÁVEK, Pavel, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Carl DIEHL, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Structure and dynamics of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In International school of biological magnetic resonance, 10th Course, Biophysics and Structure to Counter Threats and Challenges, Erice 2010. 2010.
  16. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Alžbeta ŠVENKOVÁ, Jean Marc NUZILLARD, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2010, roč. 46, č. 2, s. 191-197. ISSN 0925-2738.
  17. 2009

  18. MACEK, Pavel, Josef CHMELÍK, Ivana KŘÍŽOVÁ, Pavel KADEŘÁVEK, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Marcela WILDOVÁ, Romana HADRAVOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Iva PICHOVÁ, Tomáš RUML, Michaela RUMLOVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Structure of the N-Terminal Domain of Capsid Protein from the Mason-Pfizer Monkey Virus. Journal of Molecular Biology. 2009, roč. 392, č. 1, s. 100-114. ISSN 0022-2836.
  19. 2008

  20. PRECECHTELOVA, Jana, Petr PADRTA, Marketa L MUNZAROVA a Vladimir SKLENAR. P-31 chemical shift tensors for canonical and non-canonical conformations of nucleic acids: A DFT study and NMR implications. Journal of Physical Chemistry B. USA: ACS Publications, 2008, roč. 112, č. 11, s. 3470-3478. ISSN 1089-5647. doi:10.1021/jp076073n.
  21. PRECECHTELOVA, Jana, Petr PADRTA, Marketa MUNZAROVA a Vladimír SKLENÁŘ. P-31 Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids from the Quantum Chemistry Point of View. In 23rd NMR Valtice. 2008. vyd. Brno: Masaryk University, 2008. s. 7. ISBN 978-80-86441-39-9.
  22. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Petr PADRTA, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. 31P Chemical Shift Tensors for Canonical and Non-Canonical Nucleic Acid Conformations: DFT Calculations and NMR Implications. Journal of Physical Chemistry B. American Chemical Society, 2008, roč. 112, č. 11, s. 3470-3478. ISSN 1520-6106.
  23. 2007

  24. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Pavel MACEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Program for Analysis of Internal Motion in Molecular Dynamics Simulation. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2007. 1 s.
  25. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Petr PADRTA, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. P-31 Chemical Shift Tensors in RNA and DNA Backbone. A DFT Study of Conformational Dependence and Its Implications for NMR Studies. In 43rd Symposium on Theoretical Chemistry: Large, Non-Biological Systems. 2007.
  26. JANSEN, Séverine, Josef CHMELÍK, Lukáš ŽÍDEK, Petr PADRTA, Petr NOVÁK, Zbyněk ZDRÁHAL, Jean-François PICIMBON, Christer LÖFSTEDT a Vladimír SKLENÁŘ. Structure of Bombyx mori chemosensory protein 1 in solution. Archives of Insect Biochemistry and Physiology. Wiley, 2007, roč. 66, č. 3, s. 135-145. ISSN 0739-4462.
  27. 2006

  28. MATEJKOVÁ, Michaela, Petr NOVÁK, Radovan FIALA, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Distance Restraints At Low Temperatures: Application To DNA Hairpin. In International school on High field NMR spectroscopy for solids and liquids. Les Houches, France: Physics Centre, Les Houches, 2006. s. 45-45.
  29. 2005

  30. MATEJKOVÁ, Michaela, Petr NOVÁK, Radovan FIALA, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Analysis of NMR Distance Restraints - An Application To DNA and RNA Hairpins. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2005. s. 11-11.
  31. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Pavel MACEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. NEW TOOLS FOR AN ANALYSIS OF EXPERIMENTAL (NMR) AND THEORETICAL (MD) DATA. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2005. 1 s.
  32. MATEJKOVÁ, Michaela, Petr NOVÁK, Radovan FIALA, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Distance Restraints At Low temperatures : An Application To DNA Hairpin. Materials Structure. Praha: The Czech and Slovak Cryst. Assoc., 2005, roč. 12, č. 1, s. 33-33. ISSN 1211-5894.
  33. 2004

  34. MATEJKOVÁ, Michaela, Petr PADRTA, Radovan FIALA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Distance Restraints At Low Temperatures : An Application to DNA Hairpin. In 19th NMR Valtice : Central European NMR Discussion Groups. Brno: Masarykova univerzita, 2004. s. 29-29. ISBN 80-210-3352-5.
  35. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Refinement of Trypanosoma U6 RNA Stem-Loop Structure Using 1- and 2-Bond Residual Dipolar Couplings. In 19th NMR Valtice. Brno: Masarykova universita v Brně, 2004. s. 30-30. ISBN 80-210-3352-5.
  36. 2003

  37. ŽÍDEK, Lukáš, Petr PADRTA, Josef CHMELÍK a Vladimír SKLENÁŘ. Internal Consistency of NMR Data Obtained in Partially Aligned Biomacromolecules. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press, 2003, roč. 162, č. 1, s. 385-395. ISSN 1090-7807.
  38. 2002

  39. PADRTA, Petr a Vladimír SKLENÁŘ. Program MULDER - A tool for extracting torsion angles from NMR data. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2002, roč. 24, č. 4, s. 339-349. ISSN 0925-2738.
  40. PADRTA, Petr, Richard ŠTEFL, Lukáš KRÁLÍK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Refinement of d(GCGAAGC) hairpin structure using one- and two-bond residual dipolar couplings. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2002, roč. 24, č. 1, s. 1-14. ISSN 0925-2738.
Zobrazit podrobně
Zobrazeno: 25. 9. 2021 23:44