FB820 Strukturní elektronová mikroskopie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2019
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
Mgr. Jiří Nováček, Ph.D. (přednášející)
Dr. Tanvir Shaikh (přednášející)
Garance
doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Ústav fyziky kondenzovaných látek - Fyzikální sekce - Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek - Fyzikální sekce - Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Znalosti matematiky a fyziky na středoškolské úrovni
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
Kurz nabízí úvod do elektronové mikroskopie pro strukturní biologii a vědy o živé přírodě.
Zahrnuje anatomii elektronového mikroskopu, princip tvorby obrazu a úvod do metod přípravy vzorků pro elektronovou mikroskopii. Studenti získají poznatky o analýze obrazů z kryoelektronové mikroskopie, o jednočásticové analýze a elektronové tomografii.
Osnova
  • 1. Historie elektronové mikroskopie, aplikace a současné trendy
  • 2. Uspořádání elektronového mikroskopu a princip vytváření obrazu
  • 3. Transmisní a skenovací mikroskopie
  • 4. Metody přípravy vzorku
  • 5. Negativní barvení a a kryoelektronová mikroskopie makromolekulárních systémů
  • 6. Fourierova transformace
  • 7. Vzorkování a multivariantní analýza
  • 8. Jednočásticová analýza
  • 9. 3D reknostrukční metody
  • 10. Rozlišení a statistika
  • 11. Elektronová tomografie
  • 12. Interpretace EM dat ve strukturní biologii
  • 13. Korelativní přístupy
Literatura
  • Annie Cavalier, Daniele Spehner, Bruno M. Humbel: Handbook of Cryo-Preparation Methods for Electron Microscopy (Methods in Visualization), CRC Press; 1st Ed., 2008
  • R. A Crowther: The Resolution Revolution: Recent Advances In cryoEM, Volume 579 (Methods in Enzymology) 1st Edition, Academic Press, 2016
  • John Kuo: Electron Microscopy: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology), Humana Press; 3rd ed. 2014
Metody hodnocení
Písemná zkouška
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2019/FB820