Masarykova univerzita

Výpis publikací

česky | in English

Filtrování publikací

    2024

    1. Amphipathic Helices Can Sense Both Positive and Negative Curvatures of Lipid Membranes
      PAJTINKA, Peter a Robert VÁCHA. Amphipathic Helices Can Sense Both Positive and Negative Curvatures of Lipid Membranes. Journal of physical chemistry letters. Washington DC: AMER CHEMICAL SOC1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036, 2024, roč. 15, č. 1, s. 175-179. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpclett.3c02785.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Pajtinka, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: lipid bilayers; amphiphilic helices; positive-negative membrane curvature
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 21. 3. 2024 10:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2361861/cs
    2. Insertases scramble lipids: Molecular simulations of MTCH2
      BARTOŠ, Ladislav, Anant K. MENON a Robert VÁCHA. Insertases scramble lipids: Molecular simulations of MTCH2. Structure. 2024, roč. 2024, č. 32, s. 505-510. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.str.2024.01.012.
      URL

      Klíčová slova anglicky: flip-flop rate; free energy barrier; hydrophilic groove; insertase; membrane defect; molecular dynamics; scramblase
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 9. 4. 2024 13:18.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2392637/cs
    3. Nanoparticle induced fusion of lipid membranes
      BLASCO, Sofia, Lukáš SUKENÍK a Robert VÁCHA. Nanoparticle induced fusion of lipid membranes. Nanoscale. CAMBRIDGE: Royal Society of Chemistry, 2024, roč. 16, č. 21, s. 10221-10229. ISSN 2040-3364. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d4nr00591k.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Blasco, Sofia (724 Španělsko, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: GOLD NANOPARTICLES; VESICLE FUSION; SIMULATIONS; MOLECULES; MECHANISM; STALK
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 5. 6. 2024 10:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2407878/cs
    4. Optimizing properties of translocation-enhancing transmembrane proteins
      BARTOŠ, Ladislav, Martina DRABINOVÁ a Robert VÁCHA. Optimizing properties of translocation-enhancing transmembrane proteins. Biophysical Journal. 2024, roč. 123, č. 10, s. 1240-1252. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2024.04.009.
      URL
      angličtina. Spojené státy.
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 22. 5. 2024 09:39.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403318/cs
    5. Peptide translocation across asymmetric phospholipid membranes
      BARTOŠ, Ladislav a Robert VÁCHA. Peptide translocation across asymmetric phospholipid membranes. Biophysical Journal. 2024, roč. 123, č. 6, s. 693-702. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2024.02.006.
      URL
      angličtina. Spojené státy.
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 22. 5. 2024 10:10.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403339/cs

    2023

    1. De novo design of peptides that form transmembrane barrel pores killing antibiotic resistant bacteria
      DEB, Rahul, Ivo KABELKA, Jan PŘIBYL a Robert VÁCHA. De novo design of peptides that form transmembrane barrel pores killing antibiotic resistant bacteria. In BPS Annual Meeting 2023. 2023.
      URL
      Název česky: De novo design peptidů, které tvoří transmembránové válcovité póry zabíjející bakterie odolné vůči antibiotikům
      RIV/00216224:14740/23:00132296 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Deb, Rahul (356 Indie, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Přibyl, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: antimicrobial peptide design; transmembrane nanopores; atomic force microscopy; CryoEM
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 4. 2024 19:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2340060/cs
    2. Designing spheroidal nanoparticles to induce membrane fusion of liposomes
      BLASCO, Sofia, Lukáš SUKENÍK a Robert VÁCHA. Designing spheroidal nanoparticles to induce membrane fusion of liposomes. In EMBO Workshop Mechanisms of membrane fusion 2023. 2023.
      Název česky: Návrh sférických nanočástic k indukci membránové fúze liposomů
      RIV/00216224:14740/23:00132214 Konferenční abstrakt. angličtina. Německo.
      Blasco, Sofia (724 Španělsko, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: design of nanoparticles; liposomes; membrane fusion; molecular dynamics simulations
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 11. 2023 11:54.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2337579/cs
    3. Elucidating the Mechanisms of Genome Release in Picornaviruses using Cryo-EM and Coarse-Grained Simulations
      SUKENÍK, Lukáš, Liya MUKHAMEDOVA, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Karel ŠKUBNÍK, Pavel PLEVKA a Robert VÁCHA. Elucidating the Mechanisms of Genome Release in Picornaviruses using Cryo-EM and Coarse-Grained Simulations. In EBSA Congress 2023. 2023.
      URL
      Název česky: Objasnění mechanismů uvolnění genomu u pikonavirů pomocí Kryo-EM a "Coarse-Grained" simulací
      RIV/00216224:14740/23:00132208 Konferenční abstrakt. angličtina. Švédsko.
      Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: piconaviruses; genome release; cryoEM; coarse grained simulation; virus like particles
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 3. 2024 09:10.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2337319/cs
    4. Membrane adsorption enhances translocation of antimicrobial peptide buforin 2
      KHODAM HAZRATI, Mehrnoosh a Robert VÁCHA. Membrane adsorption enhances translocation of antimicrobial peptide buforin 2. In EBSA Congress 2023. 2023.
      URL
      Název česky: Membranová adsorpce zvyšuje translokaci antimikrobiálního peptidu buforin 2
      RIV/00216224:14740/23:00132213 Konferenční abstrakt. angličtina. Švédsko.
      Khodam Hazrati, Mehrnoosh (364 Írán, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: antimicrobial peptides; buforin 2; intracelular interactions; buforin 2 membrane translocation
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 11. 2023 12:18.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2337517/cs
    5. Multiple factors modulating the formation of toroidal membrane pores
      BIRIUKOV, Denys, Timothée Emmanuel J. RIVEL a Robert VÁCHA. Multiple factors modulating the formation of toroidal membrane pores. In NIVB MEETING 2023. 2023. ISSN 2336-7202.
      URL
      Název česky: Faktory modulující tvorbu toroidních membránových pórů
      RIV/00216224:14740/23:00132221 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Biriukov, Denys (804 Ukrajina, domácí) -- Rivel, Timothée Emmanuel J. (250 Francie, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: membrane pore formation; cell membrane; drug delivery; molecular dynamics
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 11. 2023 10:07.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2338722/cs
    6. Phospholipids are imported into mitochondria by VDAC, a dimeric beta barrel scramblase
      JAHN, Helene, Ladislav BARTOŠ, Grace I. DEARDEN, Jeremy S. DITTMAN, Joost C. M HOLTHUIS, Robert VÁCHA a Anant K. MENON. Phospholipids are imported into mitochondria by VDAC, a dimeric beta barrel scramblase. Nature Communications. Heidelberger: Nature Research, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-16. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-43570-y.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00133057 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Jahn, Helene (840 Spojené státy) -- Bartoš, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Dearden, Grace I. (840 Spojené státy) -- Dittman, Jeremy S. (840 Spojené státy) -- Holthuis, Joost C. M (276 Německo) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Menon, Anant K. (276 Německo, garant)
      Klíčová slova anglicky: Mitochondria; Phospholipids; Saccharomyces cerevisiae; Voltage-Dependent Anion Channels
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 11. 4. 2024 11:07.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2361877/cs

    2022

    1. Binding of DEP domain to phospholipid membranes: More than just electrostatics
      FALGINELLA, Francesco Luca, Marek KRAVEC, Martina DRABINOVÁ, Petra PACLÍKOVÁ, Vítězslav BRYJA a Robert VÁCHA. Binding of DEP domain to phospholipid membranes: More than just electrostatics. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. Amsterdam: Elsevier, 2022, roč. 1864, č. 10, s. 1-12. ISSN 0005-2736. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2022.183983.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00127606 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Falginella, Francesco Luca (380 Itálie, domácí) -- Kravec, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Drabinová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Paclíková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DVL protein; DEP domain; Lipid membrane; Molecular dynamics; Flow cytometry; QCM-D; Lipid preference; Phosphatidylserine; Phosphatidic acid; Phosphatidylinositol
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 1. 2023 14:31.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2242919/cs
    2. De novo design of peptides that form transmembrane barrel pores killing antibiotic resistant bacteria
      DEB, Rahul, Ivo KABELKA, Jan PŘIBYL a Robert VÁCHA. De novo design of peptides that form transmembrane barrel pores killing antibiotic resistant bacteria. 2022.
      Link to bioRxiv Link to Single-Molecule Protein Sequencing 3 (SMPS3) conference

      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Rahul Deb, M.Sc., učo 241774. Změněno: 9. 11. 2022 11:36.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2230237/cs
    3. HOW LARGE MOLECULES CAN ENTER CELL
      SUKENÍK, Lukáš, Rahul DEB a Robert VÁCHA. HOW LARGE MOLECULES CAN ENTER CELL. In Czech Chemical Society Symposium Series - Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology (NIVB). 2022. ISSN 2336-7202.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128568 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Deb, Rahul (356 Indie, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: LARGE MOLECULES; CELL
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 6. 2. 2023 16:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2253242/cs
    4. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics III: Membrane Fusion and Disruption.
      KABELKA, Ivo, Vasil GEORGIEV, Lisa MARX, Peter PAJTINKA, Karl LOHNER, Georg PABST, Rumiana DIMOVA a Robert VÁCHA. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics III: Membrane Fusion and Disruption. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2022, roč. 121, č. 5, s. 852-861. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2021.12.035.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00125525 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Pajtinka, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cell Membrane; Cryoelectron Microscopy; Lipid Bilayers; Magainins; Membrane Fusion
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 1. 2023 15:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1841097/cs
    5. Magainin 2 and PGLa in bacterial membrane mimics IV: Membrane curvature and partitioning
      SEMERARO, E.F., Peter PAJTINKA, L. MARX, Ivo KABELKA, R. LEBER, K. LOHNER, Robert VÁCHA a G. PABST. Magainin 2 and PGLa in bacterial membrane mimics IV: Membrane curvature and partitioning. BIOPHYSICAL JOURNAL. UNITED STATES: CELL PRESS, 2022, roč. 121, č. 23, s. 4689-4701. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2022.10.018.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00127107 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Pajtinka, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: LIPID-BILAYERSANTIBIOTIC PEPTIDEFORCE-FIELDFLUORESCENCEDYNAMICSSIMULATIONSMECHANISMSYNERGISMFUSIONMODEL
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 2. 2023 21:20.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2230384/cs
    6. Synthesis and Profiling of Highly Selective Inhibitors of Methyltransferase DOT1L Based on Carbocyclic C-Nucleosides
      KHIRSARIYA, PrashantKumar, Patrik POSPÍŠIL, Lukáš MAIER, Miroslav BOUDNÝ, Martin BABÁŠ, Ondřej KROUTIL, Marek MRÁZ, Robert VÁCHA a Kamil PARUCH. Synthesis and Profiling of Highly Selective Inhibitors of Methyltransferase DOT1L Based on Carbocyclic C-Nucleosides. Journal of Medicinal Chemistry. Washington: American Chemical Society, 2022, roč. 65, č. 7, s. 5701-5723. ISSN 0022-2623. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c02228.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125850 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Khirsariya, PrashantKumar (356 Indie, domácí) -- Pospíšil, Patrik (203 Česká republika, domácí) -- Maier, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Boudný, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Babáš, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Kroutil, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Molecular structure; Genetics; Ethanol; Inhibitors; Assays; leukemia; DOT1L
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 5. 2022 16:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1854512/cs

    2021

    1. Advances in Molecular Understanding of α-helical Membrane-Active Peptides.
      KABELKA, Ivo a Robert VÁCHA. Advances in Molecular Understanding of α-helical Membrane-Active Peptides. Accounts of chemical research. American Chemical Society, 2021, roč. 54, č. 9, s. 2196-2204. ISSN 0001-4842. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.accounts.1c00047.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118992 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ANTIMICROBIAL PEPTIDESPORE FORMATIONMAGAININ 2LIPID-BILAYERSBUFORIN IISIMULATIONSMECHANISMTRANSLOCATIONSPECTROSCOPYALAMETHICIN
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2022 15:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773100/cs
    2. Capsid opening enables genome release of iflaviruses.
      ŠKUBNÍK, Karel, Lukáš SUKENÍK, David BUCHTA, Tibor FÜZIK, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Jana MORAVCOVÁ, Lenka ŠMERDOVÁ, Antonín PŘIDAL, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Capsid opening enables genome release of iflaviruses. Science advances. New York: American Association for the Advancement of Science, 2021, roč. 7, č. 1, s. 1-9. ISSN 2375-2548. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/sciadv.abd7130.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118990 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šmerdová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Přidal, Antonín (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DEFORMED WING VIRUSBEE PARALYSIS VIRUSCRYO-EMMOLECULAR-DYNAMICSFORCE-FIELDX-RAYPOLIOVIRUSRNAMODELTRANSITIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 5. 2022 15:18.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773097/cs
    3. Capsid Structure of Leishmania RNA Virus 1
      PROCHÁZKOVÁ, Michaela, Tibor FÜZIK, Danyil GRYBCHUK, Francesco Luca FALGINELLA, Lucie PODEŠVOVÁ, Vyacheslav YURCHENKO, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Capsid Structure of Leishmania RNA Virus 1. Journal of Virology. American Society for Microbiology, 2021, roč. 95, č. 3, s. "e01957", 12 s. ISSN 0022-538X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/JVI.01957-20.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00121505 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Grybchuk, Danyil (804 Ukrajina, domácí) -- Falginella, Francesco Luca (380 Itálie, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: virus; Leishmania; Viannia; leishmaniasis; parasite; RNA; LRV1; Totiviridae; virion; structure; cryo-electron microscopy; capsid; genome; uncoating; mRNA; CAP-4; decapping
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 5. 2022 13:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1764656/cs
    4. Cardiolipin-Containing Lipid Membranes Attract the Bacterial Cell Division Protein DivIVA
      LABAJOVA, N., N. BARANOVA, Miroslav JURÁSEK, Robert VÁCHA, M. LOOSE a I. BARAK. Cardiolipin-Containing Lipid Membranes Attract the Bacterial Cell Division Protein DivIVA. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2021, roč. 22, č. 15, s. 8350-8370. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms22158350.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119690 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Clostridioides difficile; DivIVA; lipid membrane; cardiolipin; phosphatidylglycerol
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 5. 2022 16:23.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1838601/cs
    5. Cargo Release from Nonenveloped Viruses and Virus-like Nanoparticles: Capsid Rupture or Pore Formation
      SUKENÍK, Lukáš, Liya MUKHAMEDOVA, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Karel ŠKUBNÍK, Pavel PLEVKA a Robert VÁCHA. Cargo Release from Nonenveloped Viruses and Virus-like Nanoparticles: Capsid Rupture or Pore Formation. ACS Nano. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2021, roč. 15, č. 12, s. 19233-19243. ISSN 1936-0851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acsnano.1c04814.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119475 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: virus-like nanoparticlesRNA virusgenome releasecapsidcomputer simulationscoarse-grained modelcryo-EM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 29. 4. 2022 08:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1815461/cs
    6. Enhanced translocation of amphiphilic peptides across membranes by transmembrane proteins.
      BARTOŠ, Ladislav, Ivo KABELKA a Robert VÁCHA. Enhanced translocation of amphiphilic peptides across membranes by transmembrane proteins. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2021, roč. 120, č. 11, s. 2296-2305. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2021.04.005.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118993 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bartoš, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CELL-PENETRATING PEPTIDESMOLECULAR-DYNAMICSFORCE-FIELDEXTENSION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 29. 4. 2022 08:15.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773101/cs
    7. Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3
      JURÁSEK, Miroslav, Jitender KUMAR, Petra PACLÍKOVÁ, Alka Kumari JADAUN, Konstantinos TRIPSIANES, Vítězslav BRYJA a Robert VÁCHA. Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3. Scientific Reports. NATURE PUBLISHING GROUP, 2021, roč. 11, č. 1, s. "1484", 14 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-79398-5.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118888 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Jitender (356 Indie, domácí) -- Paclíková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Jadaun, Alka Kumari (356 Indie, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: HUMAN PHOSPHATASE HPTP1E; PARTICLE MESH EWALD; PROTEIN INTERACTIONS; LIGAND RECOGNITION; PAR-6 PDZ; BINDING; DYNAMICS; REVEALS; COMPLEX; MODES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 2. 2023 08:18.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1752563/cs
    8. Selecting Collective Variables and Free Energy Methods for Peptide Translocation Across Membranes.
      KABELKA, Ivo, Radim BROŽEK a Robert VÁCHA. Selecting Collective Variables and Free Energy Methods for Peptide Translocation Across Membranes. Journal of Chemical Information and Modeling. USA, 2021, roč. 61, č. 2, s. 819-830. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.0c01312.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118991 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Brožek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cell Membrane; Entropy; Molecular Dynamics Simulation; Peptides
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 29. 4. 2022 08:15.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773098/cs
    9. The impact of the glycan headgroup on the nanoscopic segregation of gangliosides.
      SARMENTO, M.J., Michael Christopher OWEN, J.C. RICARDO, B. CHMELOVÁ, D. DAVIDOVIĆ, I. MIKHALYOV, N. GRETSKAYA, M. HOF, M. AMARO, Robert VÁCHA a R. ŠACHL. The impact of the glycan headgroup on the nanoscopic segregation of gangliosides. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2021, roč. 120, č. 24, s. 5530-5543. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2021.11.017.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00123439 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Owen, Michael Christopher (124 Kanada, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: GM1 GANGLIOSIDE; ALPHA-SYNUCLEIN; ENERGY-TRANSFER; CHOLERA-TOXIN; CELL-SURFACE; FORCE-FIELD; RECEPTOR; CHOLESTEROL; LIGANDS; DOMAINS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 5. 2022 13:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1815460/cs

    2020

    1. Effect of helical kink in antimicrobial peptides on membrane pore formation
      TÜRKOVÁ, Alžběta, Ivo KABELKA, Tereza KRÁLOVÁ, Lukáš SUKENÍK, Šárka POKORNÁ, Martin HOF a Robert VÁCHA. Effect of helical kink in antimicrobial peptides on membrane pore formation. eLife. Cambridge: eLife Sciences Publications Ltd, 2020, roč. 9, March 2020, s. 1-38. ISSN 2050-084X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7554/eLife.47946.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114711 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Türková, Alžběta (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Melitten; Magainins; Polypeptide Antibiotic Agent
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 19. 2. 2023 22:05.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1731416/cs
    2. Effect of Helical Kink on Peptide Translocation across Phospholipid Membranes
      BROŽEK, Radim, Ivo KABELKA a Robert VÁCHA. Effect of Helical Kink on Peptide Translocation across Phospholipid Membranes. The Journal of Physical Chemistry B. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2020, roč. 124, č. 28, s. 5940-5947. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c03291.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114328 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Brožek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Free energy; Lipids; Peptides and proteins; Membranes; Conformation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 12. 11. 2020 14:07.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1680660/cs
    3. Effect of membrane composition on DivIVA-membrane interaction.
      JURÁSEK, Miroslav, Klas FLÄRDH a Robert VÁCHA. Effect of membrane composition on DivIVA-membrane interaction. BBA Biomembranes. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 1862, č. 8, s. 1-9. ISSN 0005-2736. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2019.183144.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114560 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Flärdh, Klas (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DivIVA protein; Lipid membrane; Molecular dynamics; Negative curvature; Lipid preference; N-terminal domain
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2021 18:51.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1707177/cs
    4. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics II: Membrane Fusion and Sponge Phase Formation.
      KABELKA, Ivo, Michael PACHLER, Sylvain PRÉVOST, Ilse LETOFSKY-PAPST, Karl LOHNER, Georg PABST a Robert VÁCHA. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics II: Membrane Fusion and Sponge Phase Formation. Biophysical Journal. Cambridge, USA: Cell Press, 2020, roč. 118, č. 3, s. 612-623. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2019.12.019.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114044 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: X-RAY-SCATTERING; FORCE-FIELD; PEPTIDES; DYNAMICS; CURVATURE; MECHANISM; TRANSITIONS; VALIDATION; POTENTIALS; EXTENSION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 19. 2. 2023 22:08.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1617676/cs
    5. ROLE OF PROLINE/GLYCINE KINK IN PORE FORMATION BY ANTIMICROBIAL PEPTIDES
      TÜRKOVÁ, Alžběta, Ivo KABELKA, Lukáš SUKENÍK, Šárka POKORNÁ, Martin Peter HOF a Robert VÁCHA. ROLE OF PROLINE/GLYCINE KINK IN PORE FORMATION BY ANTIMICROBIAL PEPTIDES. In XXth INTERDISCIPLINARY MEETING OF YOUNG RESEARCHERS AND STUDENTS IN THE FIELD OF CHEMISTRY, BIOCHEMISTRY, MOLECULAR BIOLOGY, AND BIOMATERIALS. 2020. ISSN 2336-7202.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118418 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Türková, Alžběta (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hof, Martin Peter (276 Německo, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PROLINE/GLYCINE KINK
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 19. 2. 2023 22:07.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1753497/cs
    6. Yeast Spt6 Reads Multiple Phosphorylation Patterns of RNA Polymerase II C-Terminal Domain In Vitro
      BRÁZDA, Pavel, Magdaléna KREJČÍKOVÁ, Aiste KASILIAUSKAITE, Eliška ŠMIŘÁKOVÁ, Tomáš KLUMPLER, Robert VÁCHA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Yeast Spt6 Reads Multiple Phosphorylation Patterns of RNA Polymerase II C-Terminal Domain In Vitro. Journal of Molecular Biology. Academic Press, 2020, roč. 432, č. 14, s. 4092-4107. ISSN 0022-2836. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2020.05.007.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114180 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brázda, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krejčíková, Magdaléna (203 Česká republika, domácí) -- Kasiliauskaite, Aiste (440 Litva, domácí) -- Šmiřáková, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CTD; RNA polymerase II; Spt6; NMR structure; phosphorylation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2021 19:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1662603/cs

    2019

    1. Dishevelled-3 conformation dynamics analyzed by FRET-based biosensors reveals a key role of casein kinase 1
      HARNOŠ, Jakub, M.C.A. CANIZAL, Miroslav JURÁSEK, Jitender KUMAR, Cornelia HOLLER, Alexandra SCHAMBONY, Kateřina HANÁKOVÁ, Ondřej BERNATÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Tomáš GYBEĽ, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Marek KRAVEC, Lukáš TRANTÍREK, Jan RYNEŠ, Zankruti DAVE, Ana Iris FERNANDEZ-LLAMAZARES, Robert VÁCHA, Konstantinos TRIPSIANES, Carsten HOFFMANN a Vítězslav BRYJA. Dishevelled-3 conformation dynamics analyzed by FRET-based biosensors reveals a key role of casein kinase 1. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 10, APR 18 2019, s. 1-18. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-09651-7.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107391 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Canizal, M.C.A. (276 Německo) -- Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Jitender (356 Indie, domácí) -- Holler, Cornelia (276 Německo) -- Schambony, Alexandra (276 Německo) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Gömöryová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Gybeľ, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Kravec, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dave, Zankruti (356 Indie, domácí) -- Fernandez-Llamazares, Ana Iris (528 Nizozemské království) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Hoffmann, Carsten (276 Německo) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PARTICLE MESH EWALD; BETA-CATENIN; WNT/BETA-CATENIN; DIX DOMAIN; MOLECULAR-DYNAMICS; STRUCTURAL BASIS; PDZ DOMAIN; DEP DOMAIN; G-PROTEIN; WNT
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 3. 2020 09:38.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1529116/cs
    2. Enterovirus particles expel capsid pentamers to enable genome release
      BUCHTA, David, Tibor FÜZIK, Dominik HREBÍK, Yevgen LEVDANSKY, Lukáš SUKENÍK, Liya MUKHAMEDOVA, Jana MORAVCOVÁ, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Enterovirus particles expel capsid pentamers to enable genome release. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 10, MAR, s. 1-9. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-09132-x.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00107387 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Hrebík, Dominik (703 Slovensko, domácí) -- Levdansky, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; CONFORMATIONAL-CHANGES; FORCE-FIELD; CELL ENTRY; POLIOVIRUS; VIRUS; RNA; MODEL; TRANSITIONS; RECOGNITION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2020 11:36.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1528796/cs
    3. Force Field Comparison of GM1 in a DOPC Bilayer Validated with AFM and FRET Experiments.
      OWEN, Michael Christopher, Andreas KARNER, Radek ŠACHL, Johannes PREINER, Mariana AMARO a Robert VÁCHA. Force Field Comparison of GM1 in a DOPC Bilayer Validated with AFM and FRET Experiments. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2019, roč. 123, č. 35, s. 7504-7517. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.9b05095.
      Full Text
      RIV/00216224:14740/19:00107895 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Owen, Michael Christopher (124 Kanada, domácí) -- Karner, Andreas (40 Rakousko) -- Šachl, Radek (203 Česká republika) -- Preiner, Johannes (40 Rakousko) -- Amaro, Mariana (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; BRAIN GANGLIOSIDES; MEMBRANE-LIPIDS; CHOLERA-TOXIN; SIMULATIONS; GLYCOSPHINGOLIPIDS; CONFORMATIONS; GLYCOLIPIDS; EXTENSION; GLYCAM06
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 3. 2020 15:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1597056/cs
    4. Kink in Helical Peptides Affects Membrane Pore Formation
      TÜRKOVÁ, Alžběta, Ivo KABELKA, Tereza KRÁLOVÁ, Lukáš SUKENÍK, S. POKORNÁ, M. HOF a Robert VÁCHA. Kink in Helical Peptides Affects Membrane Pore Formation. 2019. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.11.2760.
      Kink in Helical Peptides Affects Membrane Pore Formation
      Název anglicky: Kink in Helical Peptides Affects Membrane Pore Formation
      RIV/00216224:14310/19:00112870 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Türková, Alžběta (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, S. (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Kink; Helical Peptides
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 4. 2020 15:51.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1616699/cs
    5. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics I: Peptide-Peptide and Lipid-Peptide Interactions.
      PACHLER, Michael, Ivo KABELKA, Marie-Sousai APPAVOU, Karl LOHNER, Robert VÁCHA a Georg PABST. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics I: Peptide-Peptide and Lipid-Peptide Interactions. Biophysical Journal. New York: Cell Press, 2019, roč. 117, č. 10, s. 1858-1869. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2019.10.022.
      Full Text
      RIV/00216224:14740/19:00107896 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: X-RAY-SCATTERING; ANTIMICROBIAL PEPTIDES; FORCE-FIELD; DYNAMICS; BILAYERS; MODEL; SIMULATIONS; VALIDATION; POTENTIALS; DERIVATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 21. 2. 2020 10:51.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1597058/cs
    6. Synergism of Magainins is Not Coupled to the Formation of a Well-Defined Peptide Pore
      PACHLER, M., Ivo KABELKA, R. LEBER, I. LETOFSKY-PAPST, K. LOHNER, Robert VÁCHA a G. PABST. Synergism of Magainins is Not Coupled to the Formation of a Well-Defined Peptide Pore. In 63rd Annual Meeting of the Biophysical-Society. 2019. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.11.280.
      RIV/00216224:14740/19:00113469 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Magainin
      Mezinárodní význam: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 4. 2020 15:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1641750/cs
    7. Toxicita a aktivita antimikrobiálních peptidů
      VÁCHA, Robert. Toxicita a aktivita antimikrobiálních peptidů. Masarykova univerzita, 2019.
      Název anglicky: Toxicity and activity of antimicrobial peptides
      RIV/00216224:14740/19:00108436 Projekty výzkumu a vývoje. čeština. Česká republika.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Toxicity; activity; antimicrobial peptides
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 4. 2020 13:14.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1645706/cs

    2018

    1. Aggregate Size Dependence of Amyloid Adsorption onto Charged Interfaces
      TESEI, Giulio, Erik HELLSTRAND, Kalyani SANAGAVARAPU, Sara LINSE, Emma SPARR, Robert VÁCHA a Mikael LUND. Aggregate Size Dependence of Amyloid Adsorption onto Charged Interfaces. Langmuir. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036 USA, 2018, roč. 34, č. 4, s. 1266-1273. ISSN 0743-7463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.langmuir.7b03155.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00100839 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Tesei, Giulio (752 Švédsko) -- Hellstrand, Erik (752 Švédsko) -- Sanagavarapu, Kalyani (752 Švédsko) -- Linse, Sara (752 Švédsko) -- Sparr, Emma (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lund, Mikael (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: QUARTZ-CRYSTAL MICROBALANCE; ATOMIC-RESOLUTION STRUCTURE; POISSON-BOLTZMANN THEORY; AIR-WATER-INTERFACE; ALPHA-SYNUCLEIN; MONTE-CARLO; STRUCTURAL BASIS; LIPID-MEMBRANES; BETA-PEPTIDE; FIBRILS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 21. 3. 2019 09:47.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1409325/cs
    2. Optimal Hydrophobicity and Reorientation of Amphiphilic Peptides Translocating through Membrane
      KABELKA, Ivo a Robert VÁCHA. Optimal Hydrophobicity and Reorientation of Amphiphilic Peptides Translocating through Membrane. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2018, roč. 115, č. 6, s. 1045-1054. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.08.012.
      RIV/00216224:14740/18:00101183 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CELL-PENETRATING PEPTIDES; SOLID-STATE NMR; TRANSMEMBRANE HELIX INSERTION; ORIENTED CIRCULAR-DICHROISM; MOLECULAR-DYNAMICS METHOD; ANTIMICROBIAL PEPTIDE; LIPID-BILAYERS; FORCE-FIELD; AMPHIPATHIC PEPTIDES; BUFORIN II
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 16:31.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1438436/cs
    3. Synergism of Antimicrobial Frog Peptides Couples to Membrane Intrinsic Curvature Strain.
      LEBER, R., M. PACHLER, Ivo KABELKA, I. SVOBODA, D. KOLLER, Robert VÁCHA, K. LOHNER a G. PABST. Synergism of Antimicrobial Frog Peptides Couples to Membrane Intrinsic Curvature Strain. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2018, roč. 114, č. 8, s. 1945-1954. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.03.006.
      RIV/00216224:14740/18:00101149 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Leber, R. (40 Rakousko) -- Pachler, M. (40 Rakousko) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Svoboda, I. (203 Česká republika) -- Koller, D. (276 Německo) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lohner, K. (276 Německo) -- Pabst, G. (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: MONOLAYER SPONTANEOUS CURVATURE; RAPID SOLVENT EXCHANGE; HOST-DEFENSE PEPTIDES; MAGAININ 2; ANTIBIOTIC PEPTIDE; ESCHERICHIA-COLI; ACTIVE PEPTIDES; PGLA; MECHANISM; BILAYERS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 21. 3. 2019 09:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1433963/cs

    2017

    1. Design of Multivalent Inhibitors for Preventing Cellular Uptake
      SCHUBERTOVÁ, Veronika, F.J. MARTINEZ-VERACOECHEA a Robert VÁCHA. Design of Multivalent Inhibitors for Preventing Cellular Uptake. Scientific Reports. London: Nature Publishing Group, 2017, roč. 7, SEP, s. 11689-11695. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-11735-7.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095111 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Schubertová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Martinez-Veracoechea, F.J. (233 Estonsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RECEPTOR-MEDIATED ENDOCYTOSIS; SHAPE ANISOTROPY; NANOPARTICLES; NEUTRALIZATION; MATTER; VIRUS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2018 09:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1393665/cs
    2. Self-assembled clusters of patchy rod-like molecules
      JURÁSEK, Miroslav a Robert VÁCHA. Self-assembled clusters of patchy rod-like molecules. SOFT MATTER. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2017, roč. 13, č. 41, s. 7492-7497. ISSN 1744-683X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c7sm01384a.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095110 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: COILED-COIL; HARD SPHEROCYLINDERS; DESIGN
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 3. 2018 13:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1393664/cs

    2016

    1. Anomalous Fibril Interaction with Surfaces
      VÁCHA, Robert. Anomalous Fibril Interaction with Surfaces. In CECAM workshop "Multiscale modeling of biomolecular aggregation and protein-membrane interactions in amyloid diseases". 2016.
      URL

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:43.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373451/cs
    2. Anomalous Fibril Interaction with Surfaces
      VÁCHA, Robert. Anomalous Fibril Interaction with Surfaces. 2016.

      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 24. 2. 2017 10:19.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373450/cs
    3. Efficiency of Nanoparticle Uptake Influenced by Multivalent Inhibitors or Ligand Distribution
      VÁCHA, Robert. Efficiency of Nanoparticle Uptake Influenced by Multivalent Inhibitors or Ligand Distribution. In Biomembrane days 2016. 2016.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373453/cs
    4. (GM1) Ganglioside Inhibits beta-Amyloid Oligomerization Induced bySphingomyelin
      AMARO, Mariana, Radek ŠACHL, Gokcan AYDOGAN, Ilya I. MIKHALYOV, Robert VÁCHA a Martin HOF. (GM1) Ganglioside Inhibits beta-Amyloid Oligomerization Induced bySphingomyelin. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM: Wiley-V C H VERLAG GMBH, 2016, roč. 55, č. 32, s. 9411-9415. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201603178.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00088531 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
      Amaro, Mariana (203 Česká republika) -- Šachl, Radek (203 Česká republika) -- Aydogan, Gokcan (203 Česká republika) -- Mikhalyov, Ilya I. (643 Rusko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hof, Martin (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: Alzheimer's disease; amyloid beta-peptides; diffusion coefficients; fluorescence spectroscopy; neuroprotectives
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 1. 3. 2017 13:59.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1367185/cs
    5. Influence of ligand distribution on the efficiency of nanoparticle uptake
      VÁCHA, Robert. Influence of ligand distribution on the efficiency of nanoparticle uptake. In 10th European Biophysics Congress. 2016.

      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 17:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335969/cs
    6. Peptide Features Determining its Ability of Translocation and Membrane Pore Formation
      VÁCHA, Robert. Peptide Features Determining its Ability of Translocation and Membrane Pore Formation. In 6th International Meeting on Antimicrobial Peptides (IMAP2016). 2016.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373452/cs
    7. Peptide Features Determining its Translocation and Pore Formation
      VÁCHA, Robert. Peptide Features Determining its Translocation and Pore Formation. In Liposomes, Exosomes, and Virosomes: From Modeling Complex Membrane Processes to Medical Diagnostics and Drug Delivery. 2016.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:43.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373456/cs
    8. The role of ganglioside GM1 and sphingomyelin in the oligomerisation of beta-amyloid at physiological conditions: a single molecule study
      AMARO, M., R. SACHL, G. AYDOGAN, I. MIKHALYOV, Robert VÁCHA a Martin Peter HOF. The role of ganglioside GM1 and sphingomyelin in the oligomerisation of beta-amyloid at physiological conditions: a single molecule study. 2016. ISSN 1742-464X.
      angličtina. Spojené státy.
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 4. 2020 11:41.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1645598/cs

    2015

    1. Influence of ligand distribution on nanoparticle uptake effciency
      VÁCHA, Robert. Influence of ligand distribution on nanoparticle uptake effciency. In 3rd European Joint Theory/Experiment Meeting on Membranes – EJTEMM15. 2015.

      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 17:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335971/cs
    2. Influence of ligand distribution on uptake efficiency
      SCHUBERTOVÁ, Veronika, Francisco J. MARTINEZ-VERACOECHEA a Robert VÁCHA. Influence of ligand distribution on uptake efficiency. SOFT MATTER. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2015, roč. 11, č. 14, s. 2726-2730. ISSN 1744-683X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c4sm02815e.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00081252 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Schubertová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Martinez-Veracoechea, Francisco J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RECEPTOR-MEDIATED ENDOCYTOSIS; SHAPE ANISOTROPY; LIPID-BILAYER; NANOPARTICLES; MEMBRANE; TRANSLOCATION; ROTATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 4. 4. 2016 13:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1319430/cs
    3. Optimal conditions for opening of membrane pore by amphiphilic peptides
      KABELKA, Ivo a Robert VÁCHA. Optimal conditions for opening of membrane pore by amphiphilic peptides. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS. Melville (USA): AMER INST PHYSICS, 2015, roč. 143, č. 24, s. nestránkováno, 6 s. ISSN 0021-9606. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1063/1.4933229.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00081581 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PORE FORMATION; ANTIMICROBIAL PEPTIDES; PHOSPHOLIPID MEMBRANE; COMPUTER SIMULATION; COARSE GRAINED; MONTE CARLO
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 5. 4. 2016 16:08.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335966/cs
    4. Self-assembly of prolate patchy particles
      VÁCHA, Robert. Self-assembly of prolate patchy particles. In CECAM workshop on The Physics of Protein Self-Assembly. 2015.

      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 17:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335968/cs
    5. Self-assembly of prolate patchy particles
      VÁCHA, Robert. Self-assembly of prolate patchy particles. In Gordon Research Conference on „Self-Assembly & Supramolecular Chemistry. 2015.

      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 16:52.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335967/cs

    2014

    1. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore
      VÁCHA, Robert. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In 2nd European Joint Theoretical/Experimental Meeting on Membranes. 2014.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:53.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200186/cs
    2. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore
      VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In 4th International Meeting on Antimicrobial Peptides (IMAP). 2014.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:51.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200185/cs
    3. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore
      VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In The Physics of Soft and Biological Matter. 2014.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 20. 9. 2014 16:23.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1198343/cs
    4. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore
      VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In CECAM workshop - How proteins can shape and sense membranes--a closer look at hybrid models. 2014.
      Název anglicky: Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 20. 9. 2014 16:24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1197994/cs
    5. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore
      VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In 58th Annual Meeting of the Biophysical Society. 2014.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 2. 2014 12:54.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1167248/cs
    6. Charges at Aqueous Interfaces: Development of Computational Approaches in Direct Contact with Experiment
      VÁCHA, Robert, Frank UHLIG a Pavel JUNGWIRTH. Charges at Aqueous Interfaces: Development of Computational Approaches in Direct Contact with Experiment. In S. A. Rice and A. R. Dinner. Advances in Chemical Physics. Hoboken: John Wiley & Sons, Inc., 2014, s. 69-95. Volume 155. ISBN 978-1-118-75577-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/9781118755815.ch02.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00079245 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Uhlig, Frank (840 Spojené státy) -- Jungwirth, Pavel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: aqueous interfaces; computational approaches; electronic structure approach; ionic charges; polarization
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 6. 2020 08:42.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1228051/cs
    7. Physics of colloidal particles with heterogeneously patterned surfaces
      VÁCHA, Robert, S LINSE a M LUND. Physics of colloidal particles with heterogeneously patterned surfaces. In CECAM workshop - Physics of colloidal particles with heterogeneously patterned surfaces. 2014.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:49.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200184/cs
    8. Simulations Suggest Possible Novel Membrane Pore Structure
      VÁCHA, Robert a D. FRENKEL. Simulations Suggest Possible Novel Membrane Pore Structure. Langmuir. Washington D.C.: Amer Chemical Soc, 2014, roč. 30, č. 5, s. 1304-1310. ISSN 0743-7463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/la402727a.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00075124 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Frenkel, D. (826 Velká Británie a Severní Irsko)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; ANTIMICROBIAL PEPTIDES; STATE NMR; BILAYER-MEMBRANES; LIPID-BILAYERS; AMYLOID PORES; ION CHANNELS; FORCE-FIELD; MODEL; DISEASE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 24. 10. 2014 11:07.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1168435/cs
    9. Stability of Bicelles: A Simulation Study
      VÁCHA, Robert a D. FRENKEL. Stability of Bicelles: A Simulation Study. Langmuir. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036 USA, 2014, roč. 30, č. 15, s. 4229-4235. ISSN 0743-7463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/la4048159.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077734 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Frenkel, D. (826 Velká Británie a Severní Irsko)
      Klíčová slova anglicky: SOLID-STATE NMR; MODEL MEMBRANE SYSTEM; CAPILLARY-ELECTROPHORESIS; ATOMISTIC SIMULATIONS; PHOSPHOLIPID-BILAYERS; UNILAMELLAR VESICLES; PHOSPHORUS NMR; LIPID MIXTURES; TEMPERATURE; PROTEIN
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 11. 3. 2015 09:24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1212657/cs
    10. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides
      VÁCHA, Robert, S. LINSE a M. LUND. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides. Journal of the American Chemical Society. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2014, roč. 136, č. 33, s. 11776-11782. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja505502e.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073857 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Linse, S. (752 Švédsko) -- Lund, M. (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: BETA PROTEIN FIBRILLATION; ALPHA-SYNUCLEIN; POLYMERIC NANOPARTICLES; MEMBRANE INTERACTIONS; LIPID-BILAYERS; DRUG-DELIVERY; PHASE; NUCLEATION; INHIBITION; INTERFACES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 24. 10. 2014 10:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1197997/cs
    11. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides
      VÁCHA, Robert, S LINSE a M LUND. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides. In CECAM workshop - Molecular and coarse-grained modelling of interactions at bio-nano interface. 2014.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200182/cs
    12. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides
      VÁCHA, Robert, S LINSE a M LUND. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides. In CECAM workshop - Protein assemblies at the interface of functionalised materials. 2014.

      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 20. 9. 2014 16:27.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1198344/cs

    2013

    1. Composition- and Size-Controlled Cyclic Self-Assembly by Solvent- and C60-Responsive Self-Sorting
      SHI, Q., K.-E. BERGQUIST, R. HUO, J. LI, M. LUND, Robert VÁCHA, A. SUNDIN, E. BUTKUS, E. ORENTAS a K. WÄRNMARK. Composition- and Size-Controlled Cyclic Self-Assembly by Solvent- and C60-Responsive Self-Sorting. J AM CHEM SOC. Washington: American Chemical Society, 2013, roč. 135, č. 40, s. 15263-15268. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja408582w.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00069887 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Shi, Q. (752 Švédsko) -- Bergquist, K.-E. (752 Švédsko) -- Huo, R. (156 Čína) -- Li, J. (156 Čína) -- Lund, M. (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sundin, A. (752 Švédsko) -- Butkus, E. (440 Litva) -- Orentas, E. (440 Litva) -- Wärnmark, K. (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: SUPRAMOLECULAR CHEMISTRY; NONCOVALENT SYNTHESIS; FULLERENES; ACID; CUCURBITURIL; RECOGNITION; SYSTEMS; HOSTS; CYCLODEXTRIN; COMPLEXATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 4. 2014 16:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1127135/cs
    2. Faunus - a flexible framework for Monte Carlo simulation
      STENQVIST, Bjoern, Axel THURESSON, Anil KURUT, Robert VÁCHA a Mikael LUND. Faunus - a flexible framework for Monte Carlo simulation. Molecular Simulation. Oxon: Taylor & Francis, 2013, roč. 39, 14-15, s. 1205-1211. ISSN 0892-7022. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/08927022.2013.828207.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00070869 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Stenqvist, Bjoern (752 Švédsko) -- Thuresson, Axel (752 Švédsko) -- Kurut, Anil (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lund, Mikael (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: Metropolis Monte Carlo; coarse graining; C plus plus scientific programming
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 4. 2014 17:11.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1139133/cs
    3. Challenges in Nanoparticle Delivery: Cellular Uptake and Intracellular Escape
      VÁCHA, Robert, F. J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Challenges in Nanoparticle Delivery: Cellular Uptake and Intracellular Escape. In Biophysical Society 57th Annual Meeting. 2013.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 15. 3. 2013 10:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1091379/cs
    4. Self-assembly of amphiphilic peptides and their interaction with membranes
      VÁCHA, Robert. Self-assembly of amphiphilic peptides and their interaction with membranes. In TAPPO workshop. 2013.

      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 6. 12. 2013 09:47.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1132171/cs
    5. Simulations of cellular uptake of nanoparticles with various shapes
      VÁCHA, Robert, F. J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Simulations of cellular uptake of nanoparticles with various shapes. In International Soft Matter Conference. 2013.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 10. 2013 11:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1127154/cs

    2012

    1. Aqueous Solutions at the Interface with Phospholipid Bilayers
      BERKOWITZ, M. L. a Robert VÁCHA. Aqueous Solutions at the Interface with Phospholipid Bilayers. Accounts of chemical research. Washington: American Chemical Society, 2012, roč. 45, č. 1, s. 74-82. ISSN 0001-4842. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ar200079x.
      URL
      Neurologie, neurochirurgie, neurovědy. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATION; LIPID-BILAYERS; PHOSPHATIDYLCHOLINE BILAYERS; MEMBRANE INTERACTIONS; COMPUTER-SIMULATION; HOFMEISTER SERIES; MONOVALENT ANIONS; WATER-INTERFACE; HYDRATION FORCE; IONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 4. 4. 2013 11:12.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/966936/cs
    2. Connecting Macroscopic Observables and Microscopic Assembly Events in Amyloid Formation Using Coarse Grained Simulations
      BIELER, Noah S., Tuomas P.J. KNOWLES, Daan FRENKEL a Robert VÁCHA. Connecting Macroscopic Observables and Microscopic Assembly Events in Amyloid Formation Using Coarse Grained Simulations. PLOS Computational Biology. San Francisco: PLOS, 2012, roč. 8, č. 10, s. "nestránkováno", 10 s. ISSN 1553-7358. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002692.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00061327 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Bieler, Noah S. (756 Švýcarsko) -- Knowles, Tuomas P.J. (246 Finsko) -- Frenkel, Daan (554 Nový Zéland) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: BETA-PEPTIDE; AGGREGATION KINETICS; MOLECULAR-DYNAMICS; PROTEIN; MECHANISM; OLIGOMERS; THERMODYNAMICS; PROPAGATION; IMPACT; OCCURS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 5. 4. 2013 11:58.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1069047/cs
    3. Charge Transfer between Water Molecules As the Possible Origin of the Observed Charging at the Surface of Pure Water
      VÁCHA, Robert, Ondrej MARSALEK, A.P. WILLARD, D.J. BONTHUIS, R.R. NETZ a Pavel JUNGWIRTH. Charge Transfer between Water Molecules As the Possible Origin of the Observed Charging at the Surface of Pure Water. Journal of Physical Chemistry Letters. Washington: American Chemical Society, 2012, roč. 3, č. 1, s. 107–111. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jz20148521.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00059172 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Marsalek, Ondrej (203 Česká republika) -- Willard, A.P. (840 Spojené státy) -- Bonthuis, D.J. (276 Německo) -- Netz, R.R. (276 Německo) -- Jungwirth, Pavel (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: simple continuum model; shear surface; Gibbs dividing surface; water/vapor interface; hydrogen bonding asymmetry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 11. 3. 2013 04:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/963560/cs
    4. Intracellular Release of Endocytosed Nanoparticles Upon a Change of Ligand-Receptor Interaction
      VÁCHA, Robert, Francisco J. MARTINEZ-VERACOECHEA a Daan FRENKEL. Intracellular Release of Endocytosed Nanoparticles Upon a Change of Ligand-Receptor Interaction. ACS Nano. WASHINGTON: American Chemical Society, 2012, roč. 6, č. 12, s. 10598-10605. ISSN 1936-0851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/nn303508c.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00064625 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Martinez-Veracoechea, Francisco J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Frenkel, Daan (826 Velká Británie a Severní Irsko)
      Klíčová slova anglicky: cytosol release; late endosome; ligand-receptor interaction; phospholipid membrane; nanoparticle shape; molecular dynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 3. 4. 2013 07:49.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1094399/cs
    5. Ions at Hydrophobic Aqueous Interfaces: Molecular Dynamics with Effective Polarization.
      VAZDAR, Mario, Eva PLUHAŘOVÁ, Phil E MASON, Robert VÁCHA a Pavel JUNGWIRTH. Ions at Hydrophobic Aqueous Interfaces: Molecular Dynamics with Effective Polarization. Journal of Physical Chemistry Letters. WASHINGTON: American Chemical Society, 2012, roč. 3, č. 15, s. 2087–2091. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jz300805b.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00060530 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vazdar, Mario (191 Chorvatsko) -- Pluhařová, Eva (203 Česká republika) -- Mason, Phil E (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Jungwirth, Pavel (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: ions; aqueous interface; charge scaling; molecular dynamics; polarizability
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 15. 4. 2013 10:51.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988350/cs
    6. Morphology and Kinetics of Self-assembled Peptide Aggregates Using Coarse Grained Simulations
      VÁCHA, Robert, Noah S BIELER, Tuomas P J KNOWLES a Daan FRENKEL. Morphology and Kinetics of Self-assembled Peptide Aggregates Using Coarse Grained Simulations. In Gordon Research Coneference - Peptides, Chemistry and Biology of. 2012.
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 9. 2012 15:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988351/cs
    7. Receptor-mediated endocytosis of nanoparticles of various shapes
      VÁCHA, Robert, F.J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Receptor-mediated endocytosis of nanoparticles of various shapes. In Biomembrane days. 2012.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 9. 2012 15:53.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1066956/cs
    8. Self-Assembly of Patchy Spherocylinders
      VÁCHA, Robert, N.S. BIELER, T.P.J. KNOWLES a D FRENKEL. Self-Assembly of Patchy Spherocylinders. In CECAM workshop - Design of self-assembling materials. 2012.

      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 9. 2012 15:51.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1066953/cs
    9. Self-assembly of Proteins and Peptides in Cellular Environment
      VÁCHA, Robert. Self-assembly of Proteins and Peptides in Cellular Environment. In Telluride Science Research Center workshop Protein and Peptide Interactions in Cellular Environments. 2012.
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 7. 8. 2012 16:07.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988352/cs
    10. Sodium Dodecyl Sulfate at Water-Hydrophobic Interfaces: A Simulation Study
      VÁCHA, Robert a Sylvie ROKE. Sodium Dodecyl Sulfate at Water-Hydrophobic Interfaces: A Simulation Study. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2012, roč. 116, č. 39, s. 11936-11942. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp304900z.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00061199 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Roke, Sylvie (528 Nizozemské království)
      Klíčová slova anglicky: FREQUENCY VIBRATIONAL SPECTROSCOPY; NEWTON BLACK FILMS; MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; AIR/WATER INTERFACE; GENERATION SPECTROSCOPY; SURFACTANT MONOLAYERS; COMPUTER-SIMULATIONS; AQUEOUS INTERFACE; LIQUID INTERFACES; IONIC SURFACTANTS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 6. 4. 2013 20:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1067803/cs

    2011

    1. Receptor-Mediated Endocytosis of Nanoparticles of Various Shapes
      VÁCHA, Robert, F.J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Receptor-Mediated Endocytosis of Nanoparticles of Various Shapes. Nano Lett. American Chemical Society, 2011, roč. 11, č. 12, s. 5391–5395. ISSN 1530-6984. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/nl2030213.
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: Effective uptake; passive endocytosis; phospholipid membrane; nanoparticle shape; molecular dynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 8. 10. 2012 01:47.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/963555/cs
    2. Relation between molecular shape and the morphology of self-assembling aggregates
      VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Relation between molecular shape and the morphology of self-assembling aggregates. In CECAM Workshop - Coarse-Grained Methods and Self Assembly. 2011.

      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 2. 2. 2012 13:05.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/969269/cs
    3. Relation between Molecular Shape and the Morphology of Self-Assembling Aggregates: A Simulation Study
      VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Relation between Molecular Shape and the Morphology of Self-Assembling Aggregates: A Simulation Study. Biophysical Journal. Bethesda, USA: Biophysical Society, 2011, roč. 101, č. 6, s. 1432-1439. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2011.07.046.
      URL
      Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: HARD SPHEROCYLINDERS; PROTEIN STRUCTURES; PEPTIDES; SYSTEMS; FLUID
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 10. 2012 10:52.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957098/cs
    4. Sodium dodecyl sulfate at water/hydrophobic interfaces
      VÁCHA, Robert, Pavel JUNGWIRTH, S ROKE a D FRENKEL. Sodium dodecyl sulfate at water/hydrophobic interfaces. In ACS National Meeting & Exposition (242). 2011.

      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 2. 2. 2012 12:37.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/969261/cs
    5. The Orientation and Charge of Water at the Hydrophobic Oil Droplet-Water Interface
      VÁCHA, Robert, S W RICK, P JUNGWIRTH, A G F DE BEER, H B DE AGUIAR, J S SAMSON a S ROKE. The Orientation and Charge of Water at the Hydrophobic Oil Droplet-Water Interface. Journal of the American Chemical Society. Washington, DC., USA: American Chemical Society, 2011, roč. 133, č. 26, s. 10204-10210. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja202081x.
      URL
      Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: SUM-FREQUENCY GENERATION; 2ND-HARMONIC GENERATION; AQUEOUS-SOLUTIONS; LIQUID WATER; VIBRATIONAL SPECTROSCOPY; MOLECULAR-DYNAMICS; HYDRATED PROTON; HYDROXIDE IONS; NEAT WATER; IN-WATER
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 10. 2012 10:50.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957097/cs

    2010

    1. Comment on "An explanation for the charge on water's surface" by A. Gray-Weale and J. K. Beattie, Phys. Chem. Chem. Phys., 2009, 11, 10994
      VÁCHA, Robert, D HORINEK, R BUCHNER, B WINTER a P JUNGWIRTH. Comment on "An explanation for the charge on water's surface" by A. Gray-Weale and J. K. Beattie, Phys. Chem. Chem. Phys., 2009, 11, 10994. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2010, roč. 12, č. 42, s. 14362-14363. ISSN 1463-9076.

      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 21. 12. 2011 12:32.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957094/cs
    2. Dielectric Interpretation of Specificity of Ion Pairing in Water
      LUND, M, B JAGODA-CWIKLIK, C E WOODWARD, Robert VÁCHA a P JUNGWIRTH. Dielectric Interpretation of Specificity of Ion Pairing in Water. Journal of Physical Chemistry Letters. AMER CHEMICAL SOC, 1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036 USA, 2010, roč. 1, č. 1, s. 300-303. ISSN 1948-7185.
      URL

      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 21. 12. 2011 12:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957093/cs
    3. Mechanism of Interaction of Monovalent Ions with Phosphatidylcholine Lipid Membranes
      VÁCHA, Robert, P JURKIEWICZ, M PETROV, ML BERKOWITZ, RA BOCKMANN, J BARUCHA-KRASZEWSKA, M HOF a P JUNGWIRTH. Mechanism of Interaction of Monovalent Ions with Phosphatidylcholine Lipid Membranes. Journal of Physical Chemistry B. USA: ACS Publications, 2010, roč. 114, č. 29, s. 9504-9509. ISSN 1089-5647.
      URL

      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 21. 12. 2011 12:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957095/cs
    4. Three-dimensional energy profile measurement of a molecular ion beam by coincidence momentum imaging compared to a retarding field analyzer
      WOLFF, W, J MCKENNA, Robert VÁCHA, M ZOHRABI, B GAIRE, KD CARNES a I BEN-ITZHAK. Three-dimensional energy profile measurement of a molecular ion beam by coincidence momentum imaging compared to a retarding field analyzer. JOURNAL OF INSTRUMENTATION. IOP PUBLISHING LTD, DIRAC HOUSE, TEMPLE BACK, BRISTOL BS1 6BE, ENGLAND, 2010, roč. 5, s. P10006.
      URL

      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 21. 12. 2011 12:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957096/cs

    2009

    1. Behavior of hydroxide at the water/vapor interface
      WINTER, B, M FAUBEL, Robert VÁCHA a P JUNGWIRTH. Behavior of hydroxide at the water/vapor interface. Chemical Physics Letters. ELSEVIER SCIENCE BV, PO BOX 211, 1000 AE AMSTERDAM, NETHERLANDS, 2009, roč. 474, 4-6, s. 241-247. ISSN 0009-2614.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 11:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957089/cs
    2. Benchmarking Polarizable Molecular Dynamics Simulations of Aqueous Sodium Hydroxide by Diffraction Measurements
      VÁCHA, Robert, T MEGYES, I BAKO, I PUSZTAI a P JUNGWIRTH. Benchmarking Polarizable Molecular Dynamics Simulations of Aqueous Sodium Hydroxide by Diffraction Measurements. Journal of Physical Chemistry A. USA: ACS, 2009, roč. 113, č. 16, s. 4022-4027. ISSN 1089-5639.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957086/cs
    3. Effects of Alkali Cations and Halide Anions on the DOPC Lipid Membrane
      VÁCHA, Robert, S W I SIU, M PETROV, R A BOCKMANN, J BARUCHA-KRASZEWSKA, P JURKIEWICZ, M HOF, M L BERKOWITZ a P JUNGWIRTH. Effects of Alkali Cations and Halide Anions on the DOPC Lipid Membrane. Journal of Physical Chemistry A. AMER CHEMICAL SOC, 1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036 USA, 2009, roč. 113, č. 26, s. 7235-7243. ISSN 1089-5639.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 11:04.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957090/cs
    4. Hofmeister series and specific interactions of charged headgroups with aqueous ions
      VLACHY, N, B JAGODA-CWIKLIK, Robert VÁCHA, D TOURAUD, P JUNGWIRTH a W KUNZ. Hofmeister series and specific interactions of charged headgroups with aqueous ions. ADVANCES IN COLLOID AND INTERFACE SCIENCE. ELSEVIER SCIENCE BV, PO BOX 211, 1000 AE AMSTERDAM, NETHERLANDS, 2009, roč. 146, 1-2, s. 42-47.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957084/cs
    5. Ion specific effects of sodium and potassium on the catalytic activity of HIV-1 protease
      HEYDA, J, J POKORNA, Luboš VRBKA, Robert VÁCHA, B JAGODA-CWIKLIK, J KONVALINKA, P JUNGWIRTH a J VONDRASEK. Ion specific effects of sodium and potassium on the catalytic activity of HIV-1 protease. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2009, roč. 11, č. 35, s. 7599-7604. ISSN 1463-9076.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:53.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957083/cs
    6. Large variations in the propensity of aqueous oxychlorine anions for the solution/vapor interface
      OTTOSSON, N, Robert VÁCHA, E F AZIZ, W POKAPANICH, W EBERHARDT, S SVENSSON, G ÖHRWALL, P JUNGWIRTH, O BJÖRNEHOLM a B WINTER. Large variations in the propensity of aqueous oxychlorine anions for the solution/vapor interface. Journal of the chemical society. Faraday transactions II, Journal of chemical physics. London: Chemical society, 2009, roč. 131, č. 12, s. 124706.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 11:06.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957091/cs
    7. Molecular Model of a Cell Plasma Membrane With an Asymmetric Multicomponent Composition: Water Permeation and Ion Effects
      VÁCHA, Robert, ML BERKOWITZ a P JUNGWIRTH. Molecular Model of a Cell Plasma Membrane With an Asymmetric Multicomponent Composition: Water Permeation and Ion Effects. Biophysical Journal. USA: Biophysical Society, 2009, roč. 96, č. 11, s. 4493-4501. ISSN 0006-3495.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:59.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957088/cs
    8. Reply to comments on Frontiers Article 'Behavior of hydroxide at the water/vapor interface'
      WINTER, B, M FAUBEL, Robert VÁCHA a P JUNGWIRTH. Reply to comments on Frontiers Article 'Behavior of hydroxide at the water/vapor interface'. Chemical Physics Letters. ELSEVIER SCIENCE BV, PO BOX 211, 1000 AE AMSTERDAM, NETHERLANDS, 2009, roč. 481, 1-3, s. 19-21. ISSN 0009-2614.
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 11:09.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957092/cs

    2008

    1. Adsorption of aromatic hydrocarbons and ozone at environmental aqueous surfaces
      VÁCHA, Robert, L CWIKLIK, J REZAC, Pavel HOBZA, P JUNGWIRTH, K Bahr S VALSARAJ a V KEMPTER. Adsorption of aromatic hydrocarbons and ozone at environmental aqueous surfaces. Journal of Physical Chemistry A. USA: The American Chemical Society, 2008, roč. 112, č. 22, s. 4942-4950. ISSN 1089-5639.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957080/cs
    2. Biomolecular simulations of membranes: Physical properties from different force fields
      SIU, S.W.I., Robert VÁCHA, P. JUNGWIRTH a R.A. BOCKMANN. Biomolecular simulations of membranes: Physical properties from different force fields. Journal of the chemical society. Faraday transactions II, Journal of chemical physics. London: Chemical society, 2008, roč. 128, č. 12, s. 125103. ISSN 0021-9606.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 28. 3. 2012 16:44.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957076/cs
    3. Cation-specific interactions with carboxylate in amino acid and acetate aqueous solutions: X-ray absorption and ab initio calculations
      AZIZ, E F, N OTTOSSON, S EISEBITT, B JAGODA-CWIKLIK, Robert VÁCHA, P JUNGWIRTH a B WINTER. Cation-specific interactions with carboxylate in amino acid and acetate aqueous solutions: X-ray absorption and ab initio calculations. Journal of Physical Chemistry B. USA: ACS Publications, 2008, roč. 112, č. 40, s. 12567-12570. ISSN 1089-5647.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:50.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957081/cs
    4. Hydronium and hydroxide at the interface between water and hydrophobic media
      VÁCHA, Robert, D HORINEK, ML BERKOWITZ a P JUNGWIRTH. Hydronium and hydroxide at the interface between water and hydrophobic media. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2008, roč. 10, č. 32, s. 4975-4980, 5 s. ISSN 1463-9076.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:31.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957074/cs
    5. Response to Comment on Autoionization at the surface of neat water: is the top layer pH neutral, basic, or acidic? by J. K. Beattie, Phys. Chem. Chem. Phys., 2007, 9, DOI : 10.1039/b713702h
      VÁCHA, Robert, V BUCH, A MILET, JP DEVLIN a P JUNGWIRTH. Response to Comment on Autoionization at the surface of neat water: is the top layer pH neutral, basic, or acidic? by J. K. Beattie, Phys. Chem. Chem. Phys., 2007, 9, DOI : 10.1039/b713702h. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2008, roč. 10, č. 2, s. 332-333. ISSN 1463-9076.
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:38.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957075/cs
    6. Specific ion binding to macromolecules: Effects of hydrophobicity and ion pairing
      LUND, M, Robert VÁCHA a P JUNGWIRTH. Specific ion binding to macromolecules: Effects of hydrophobicity and ion pairing. Langmuir. AMER CHEMICAL SOC, 1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036 USA, 2008, roč. 24, č. 7, s. 3387-3391. ISSN 0743-7463.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:45.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957077/cs
    7. Water structuring and hydroxide ion binding at the interface between water and hydrophobic walls of varying rigidity and van der waals interactions
      VÁCHA, Robert, R ZANGI, JBFN ENGBERTS a P JUNGWIRTH. Water structuring and hydroxide ion binding at the interface between water and hydrophobic walls of varying rigidity and van der waals interactions. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2008, roč. 112, č. 20, s. 7689-7692. ISSN 1932-7447.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:46.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957079/cs

    2007

    1. Autoionization at the surface of neat water: is the top layer pH neutral, basic, or acidic?
      VÁCHA, Robert, V BUCH, MILET a P JUNGWIRTH. Autoionization at the surface of neat water: is the top layer pH neutral, basic, or acidic? Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2007, roč. 9, č. 34, s. 4736-4747, 11 s. ISSN 1463-9076.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:21.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957070/cs
    2. Ion pairing as a possible clue for discriminating between sodium and potassium in biological and other complex environments
      JAGODA-CWIKLIK, B, Robert VÁCHA, M LUND, M SREBRO a P JUNGWIRTH. Ion pairing as a possible clue for discriminating between sodium and potassium in biological and other complex environments. Journal of Physical Chemistry B. USA: ACS Publications, 2007, roč. 111, č. 51, s. 14077-14079, 2 s. ISSN 1089-5647.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957072/cs
    3. Water surface is acidic
      BUCH, V, A MILET, Robert VÁCHA, P JUNGWIRTH a JP DEVLIN. Water surface is acidic. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. NATL ACAD SCIENCES, 2101 CONSTITUTION AVE NW, WASHINGTON, DC 20418 USA, 2007, roč. 104, č. 18, s. 7342-7347, 5 s. ISSN 0027-8424.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957071/cs

    2006

    1. Adsorption of polycyclic aromatic hydrocarbons at the air-water interface: Molecular dynamics simulations and experimental atmospheric observations
      VÁCHA, Robert, P JUNGWIRTH, J CHENB a K VALSARAJ. Adsorption of polycyclic aromatic hydrocarbons at the air-water interface: Molecular dynamics simulations and experimental atmospheric observations. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2006, roč. 8, č. 38, s. 4461-4467, 6 s. ISSN 1463-9076.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957059/cs
    2. Propensity for the air/water interface and ion pairing in magnesium acetate vs magnesium nitrate solutions: Molecular dynamics simulations and surface tension measurements
      MINOFAR, Babak, Robert VÁCHA, WAHAB, W KUNZ a P JUNGWIRTH. Propensity for the air/water interface and ion pairing in magnesium acetate vs magnesium nitrate solutions: Molecular dynamics simulations and surface tension measurements. Journal of Physical Chemistry B. USA: ACS Publications, 2006, roč. 110, č. 32, s. 15939-15944, 5 s. ISSN 1089-5647.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957067/cs
    3. Quantification and rationalization of the higher affinity of sodium over potassium to protein surfaces
      VRBKA, Luboš, J VONDRASEK, B JAGODA-CWIKLIK, Robert VÁCHA a P JUNGWIRTH. Quantification and rationalization of the higher affinity of sodium over potassium to protein surfaces. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. NATL ACAD SCIENCES, 2101 CONSTITUTION AVE NW, WASHINGTON, DC 20418 USA, 2006, roč. 103, č. 42, s. 15440-15444, 4 s. ISSN 0027-8424.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:19.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957069/cs

    2004

    1. Adsorption of atmospherically relevant gases at the air/water interface: Free energy profiles of aqueous solvation of N(2), O(2), O(3), OH, H(2)O, HO(2), and H(2)O(2)
      VÁCHA, Robert, P SLAVICEK, M MUCHA, BJ FINLAYSON-PITTS a P JUNGWIRTH. Adsorption of atmospherically relevant gases at the air/water interface: Free energy profiles of aqueous solvation of N(2), O(2), O(3), OH, H(2)O, HO(2), and H(2)O(2). Journal of Physical Chemistry A. USA: The American Chemical Society, 2004, roč. 108, č. 52, s. 11573-11579, 6 s. ISSN 1089-5639.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 9. 11. 2011 10:11.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957065/cs
Zobrazeno: 25. 7. 2024 12:26