Výpis publikací

LABUDA, Ján; Richard BOWATER; Miroslav FOJTA; Gunter GAUGLITZ; Zdeněk GLATZ; Ivan HAPALA; Jan HAVLIŠ; Ferenc KILAR; Aniko KILAR; Lenka MALINOVSKÁ; Heli M. M. SIREN; Petr SKLÁDAL; Federico TORTA; Martin VALACHOVIČ; Michaela WIMMEROVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL a Davin Brynn HIBBERT. Bioanalytical Chemistry. Online. In D. Brynn Hibbert. Compendium of Terminology in Analytical Chemistry. Velká Británie: Royal Society of Chemistry, 2023, s. 512-568. IUPAC Color Books. ISBN 978-1-78262-947-4. Dostupné z: https://doi.org/10.1039/BK9781788012881-00512.

HAVLIŠ, Jan. Experimental Linguopoetics Arises: Phonaesthetics vs Phonaesthemics – could have been Tolkien wrong? In digital Language Creation Conference. 2021.

MIKULÁŠEK, Kamil; Hana KONEČNÁ; David POTĚŠIL; Renata HOLÁNKOVÁ; Jan HAVLIŠ a Zbyněk ZDRÁHAL. SP3 Protocol for Proteomic Plant Sample Preparation Prior LC-MS/MS. Frontiers in Plant Science. Frontiers Research Foundation, 2021, roč. 12, MAR, s. "635550", 12 s. ISSN 1664-462X. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fpls.2021.635550.

HAVLIŠ, Jan. Zvukový symbolizmus v přirozených a tvořených jazycích. In Dny kulturní lingvistiky Praha 2021 - Od kognitivní lingvistiky ke kognitivní poetice a zase zpátky, umělecký text v jazycích různých modalit. 2021.

HAVLIŠ, Jan. Arching Over Natural and Created Languages, or: The Xmetov Shall Live with Esperanto, the Dutch Shall Lie Down with the Ygyde, the Quenya Shall Breathe with the Niotic. In The Eighth Language Creation Conference. 2019.

TOMICZKOVÁ, Petra; Miroslava BITTOVÁ a Jan HAVLIŠ. Unusual puzzle – retention properties of nucleobases and nucleotides as elements for retention model of ultrashort oligonucleotides. In Česka chromatografická škola - HPLC 2019. 2019.

HAVLIŠ, Jan. Empirická východiska v kognitivně lingvistickém studiu jazykové kreativity. In Interdisciplinárne doktorandské kolokvium. 2018.

LABUDA, Ján; Richard BOWATER; Miroslav FOJTA; Gunter GAUGLITZ; Zdeněk GLATZ; Ivan HAPALA; Jan HAVLIŠ; Ferenc KILAR; Aniko KILAR; Lenka MALINOVSKÁ; Heli M. M. SIREN; Petr SKLÁDAL; Federico TORTA; Martin VALACHOVIČ; Michaela WIMMEROVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL a Davin Brynn HIBBERT. Terminology of bioanalytical methods (IUPAC Recommendations 2018). Pure and Applied Chemistry. International Union of Pure and Applied Chemistry, 2018, roč. 90, č. 7, s. 1121-1198. ISSN 0033-4545. Dostupné z: https://doi.org/10.1515/pac-2016-1120.

FIALA, Jan; Miroslava BITTOVÁ a Jan HAVLIŠ. HILIC or ERLIC; could we distinguish them? In HPLC 2017. 2017.

FIALA, Jan; Miroslava BITTOVÁ a Jan HAVLIŠ. ERLIC or just HILIC? Investigation of chromatographic behavior of trinucleotides. In Vítězslav Maier. Advances in chromatography and electrophoresis & Chiranal 2016. Olomouc: Palacký University, Olomouc, 2016, s. 94-95. ISBN 978-80-244-4961-6.

MIKULÁŠEK, Kamil; Kamil JAROŇ; Petr KULHÁNEK; Miroslava BITTOVÁ a Jan HAVLIŠ. Sequence-dependent separation of trinucleotides by ion-interaction reversed-phase liquid chromatography A structure-retention study assisted by soft-modelling and molecular dynamics. Journal of Chromatography A. Amsterdam: Elsevier Science BV, 2016, roč. 1469, October, s. 88-95. ISSN 0021-9673. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.chroma.2016.09.060.

FIALA, Jan; Miroslava BITTOVÁ a Jan HAVLIŠ. Retention behavior of trinucleotides in electrostatic repulsion hydrophilic interaction chromatography. In 22th International Symposium on Electro- and Liquid Phase-Separation Techniques (ITP2015). 2015.

VORÁČ, Aleš; Ondrej ŠEDO; Jan HAVLIŠ a Zbyněk ZDRÁHAL. A simplified method for peptide de novo sequencing using O-18 labeling. European Journal of Mass Spectrometry. CHICHESTER (ENGLAND): IM PUBLICATIONS, 2014, roč. 20, č. 3, s. 255-260. ISSN 1469-0667. Dostupné z: https://doi.org/10.1255/ejms.1277.

VAŠINOVÁ GALIOVÁ, Michaela; Viktor KANICKÝ a Jan HAVLIŠ. Laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry as a toll in biological sciences. In Vladimír Havliček; Jaroslav Spížek. Natural Products Analysis: Instrumentation, Methods, and Applications. New Jersey: Wiley, 2014, s. 313-348. ISBN 978-1-118-46661-2. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/9781118876015.ch9.

HAVLIŠ, Jan. přímá kvantifikace proteinů a peptidů pomocí MS. In label-free quantification of proteins and peptides by MS. 2014.

MIKULÁŠEK, Kamil; Miroslava BITTOVÁ a Jan HAVLIŠ. Study of the retention behavior of trinucleotides in HPLC. In Acta Universitatis Palackianae Olomucensis Chemica 51S. Olomouc: Palacký University, Olomouc, 2014, s. 161-162. ISBN 978-80-244-3950-1.

ROZMAN, Tomáš; Zdeněk FARKA; Jan HAVLIŠ; Přemysl LUBAL a Marta FARKOVÁ. Use of artificial neural networks for optimization of biogenic amines derivatization. Online. In František Foret, Jana Křenková, Iveta Drobníková, Andras Guttman, Karel Klepárník. CECE 2014: 11TH INTERNATIONAL INTERDISCIPLINARY MEETING ON BIOANALYSIS. Brno: Institute of Analytical Chemistry AS CR, 2014, s. 377-380. ISBN 978-80-904959-2-0.

BITTOVÁ, Miroslava; Jan HAVLIŠ; Hana FUKSOVÁ; Blanka VRBKOVÁ a Libuše TRNKOVÁ. Toward reading the sequence of short oligonucleotides from their retention factors obtained by means of hydrophilic interaction chromatography and ion-interaction reversed-phase liquid chromatography. Journal of Separation Science. WILEY-VCH Verlag GmbH & Co., 2012, roč. 35, č. 22, s. 3227–3234. ISSN 1615-9306. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/jssc.201200482.

CHROMÝ, Vratislav; Miroslava BITTOVÁ; Jan HAVLIŠ; Markéta KAJABOVÁ; Vladimír KOMÁREK; Petr SCHNEIDERKA a Miroslav VOTAVA. Bianalytika - Analytické metody v klinické chemii a laboratormí medicíně. 2. vyd. Brno: Masarykova univerzita, PřF, Ústav chemie, 2011, 331 s. ISBN 978-80-904539-3-7.

KANICKÝ, Viktor; Jan HAVLIŠ; Paul EK; Tomáš VACULOVIČ a Hana NEJEZCHLEBOVÁ. Kryogenická postseparační úprava polyakrylamidových gelů prometaloproteomické analýzy kombinací gelové elektroforézy, laserové ablace a hmotnostní spektrometrie s ionizací indukčně vázaným plazmatem. Chemicke listy. Česká republika: Česká společnost chemická, 2011, roč. 105, č. 11, s. 896-902. ISSN 0009-2770.

HAVLIŠ, Jan. Přímá kvantitativní analýza v HPLC-MS (bez izotopového značení). In 11. ročník Školy hmotnostní spektrometrie. 2010.

PROCHÁZKOVÁ, Markéta; Jan HAVLIŠ a Viktor KANICKÝ. Separace metaloproteinů v nativním stavu metodou RP-HPLC se stacionární fází na bázi monolitu. In Chemické listy 6/2010; s. 467; 62. Sjezd chemických společností Pardubice. 2010. ISSN 0009-2770.

HAVLIŠ, Jan. Volba separace pro následnou MS kvantifikaci proteinů. In 11. ročník Školy hmotnostní spektrometrie. 2010.

HAVLIŠ, Jan; Marcela ŽUPKOVÁ; Kateřina NOVÁKOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. 18O-based protein quantitation: influence of separation on quantitation outcome in analysis of Staphylococcus a. enterotoxins. 2010.

POTĚŠIL, David; Ludmila ROČŇOVÁ; Soňa ČEJKOVÁ; Martin TRBUŠEK; Zbyněk ZDRÁHAL a Jan HAVLIŠ. Biomarker discovery - Detection of minor protein concentration changes using ICPL protein labeling and 2D GE. 2009.

HAVLIŠ, Jan. Kvantitativní analýza v MS a HPLC/MS. In Sborník 10. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie. 2009. vyd. Pardubice: Univerzita Pardubice, 2009, s. 20-27. ISBN 978-80-7395-167-2.

OVADOVÁ, Hana; Tomáš VACULOVIČ; Jan HAVLIŠ a Viktor KANICKÝ. Utilization of cryogenically cooled ablation cell for GE of metalloproteins with LA ICP MS detection. In In European Winter Conference on Plasma Spectrochemitry. Graz, Rakousko : Karl-Franzens University Graz, 2009. s. 131-131. 2009.

HAVLIŠ, Jan; Tatiana ŠTOSOVÁ; Marek ŠEBELA; Pavel ŘEHULKA; Ondrej ŠEDO a Zbyněk ZDRÁHAL. Evaluation of the possible proteomic application of trypsin from Streptomyces griseus. Analytical Biochemistry. San Diego: Academic Press, 2008, roč. 376, č. 1, s. 94-102. ISSN 0003-2697.

HAVLIŠ, Jan; Hana OVADOVÁ; Tomáš VACULOVIČ a Viktor KANICKÝ. Gel electrophoresis of metalloproteins and laser ablation with inductively coupled plasma mass spectrometry. In 9th European on Workshop in Elemental and Isotopic Analysis. 2008.

HAVLIŠ, Jan a Mathias MANN. In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes. Nature Protocols. U.S.A.: Nature Publishing Group, 2008, roč. 1, č. 6, s. 2856-2860. ISSN 1745-2473.

HAVLIŠ, Jan. Kvantitativní analýza v hmotnostní spektrometrii. In Sborník 9. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie. 2008. vyd. Pardubice: Univerzita Pardubice, 2008, s. 100-109, 9 s. ISBN 978-80-7395-085-9.

HAVLIŠ, Jan; Hana NEJEZCHLEBOVÁ; Tomáš VACULOVIČ a Viktor KANICKÝ. Laser ablation process as the key point of GLIM. In Book of abstracts XIXthe Slovak Czech Spectroscopic Conference. 2008. vyd. Bratislava: Comenius University, Bratislava, 2008, s. 21-22. ISBN 978-80-223-2557-8.

HAVLIŠ, Jan a Christine WALCH-SOLIMENA. Nucleo-cytoplasmic shuttling of the Golgi phosphatidylinositol 4-kinase Pik1 is regulated by 14-3-3 proteins and coordinates Golgi function with cell growth. Molecular and Cellular Biology. Washington, D.C.: ASM, 2008, roč. 19, č. 3, s. 1046-61, 16 s. ISSN 0270-7306.

POTĚŠIL, David; Soňa ČEJKOVÁ; Ludmila ROČŇOVÁ; Martin TRBUŠEK; Zbyněk ZDRÁHAL a Jan HAVLIŠ. Sensitization of B-CLL lymphocytes, quest for a protein marker. Which mass spectrometry quantitative technique will give answer? 2008.

HAVLIŠ, Jan. Analýza metaloproteinů pomocí MS - paralelně kombinované techniky GLIM. In 8. ročník Školy hmotnostní spektrometrie - Sborník přednášek. Brno: Fakulta Chemická, VUT, Brno, 2007, s. 100-108. ISBN 978-80-214-3477-6.

HAVLIŠ, Jan a Hana OVADOVÁ. METALO + PROTEIN = GE + LA + ICP + MS. In KANICKÝ, Viktor a Tomáš VACULOVIČ. 13. Spektrometrická konference - sborník. 2007.

HAVLIŠ, Jan a Lenka MONINCOVÁ. Prediction of tryptic peptide retention times by means of soft modelling as a tool for liquid chromatography-mass spectrometry driven proteomics. Trends in Chromatography. Indie: Research Trends (P) Ltd., 2007, roč. 3, -, s. 65-72. ISSN 0972-8635.

HAVLIŠ, Jan. Speciace metaloproteinů - využití paralelně kombinovaných spektrometrických technik. In 13. Spektrometrická konference - sborník. 2007.

HAVLIŠ, Jan; Marek ŠEBELA; Tatiana ŠTOSOVÁ; Petr TARKOWSKI; Natalie WIELSCH; Henrik THOMAS a Andrej SHEVCHENKO. Modification of Trypsin for Improvement of Its Stability in Protein Digestion Process. In Abstract Book 17th IMSC Prague. 2006.

HAVLIŠ, Jan; Zbyněk ZDRÁHAL a Ondrej ŠEDO. Protein Modification Degree - An Indirect MS Quantitation Approach. In Abstract Book 17th IMSC Prague. 2006.

HAVLIŠ, Jan; Marek ŠEBELA; Tatiana ŠTOSOVÁ; Natalie WIELSCH; Henrik THOMAS; Zbyněk ZDRÁHAL a Andrej SHEVCHENKO. Thermostable trypsin conjugates for high-throughput proteomics: synthesis and performance evaluation. Proteomics. Weinheim: Wiley-VCH, 2006, roč. 10, č. 6, s. 2959-2963, 4 s. ISSN 1615-9853.

HAVLIŠ, Jan; Ondrej ŠEDO a Zbyněk ZDRÁHAL. Indirect quantification of protein modification degree. In Book of abstracts 2nd Czech Proteomic Conference. 2005.

HAVLIŠ, Jan; Klára NOVOTNÁ a Josef HAVEL. Optimization of high performance liquid chromatography separation of neuroprotective peptides. Fractional experimental design combined with Artificial neural networks. Journal of Chromatography A. Elsevier B.V., 2005, roč. 1096, 1-2, s. 50-57. ISSN 0021-9673.

HAVLIŠ, Jan. Praktické aspekty absolutní kvantifikace proteinů a peptidů pomocí MS. In 3. ročník Školy HPLC/MS - Sborník přednášek. Pardubice: Univerzita Pardubice, 2005, s. 175-179, 4 s. ISBN 80-7194-785-7.

HAVLIŠ, Jan; Tatiana ŠTOSOVÁ; Marek ŠEBELA a René LENOBL. Proteolytické enzymy: význam pro proteomiku. Chemické listy. Praha: Czech Chemical Society, 2005, roč. 99, č. 12, s. 896-905. ISSN 0009-2770.

HAVLIŠ, Jan; Tobias OELSCHLAEGEL; Martin SCHWICKART; Joao MATOS; Aliona BOGDANOVA; Alain CAMASSES; Andrej SHEVCHENKO a Wolfgang ZACHARIAE. The yeast APC/C subunit Mnd2 prevents premature sister chromatid separation triggered by the meiosis-specific APC/C-Ama1. Cell. United States of America: Cell Press, Cambridge, MA, USA, 2005, roč. 120, č. 6, s. 773-788, 15 s. ISSN 0092-8674.

ŠEBELA, Marek; David KOPEČNÝ; Zbyněk LAMPLOT; Jan HAVLIŠ; Henrik THOMAS a Andrej SHEVCHENKO. Thermostable -cyclodextrin conjugates of two similar plant amine oxidases and their properties. Biotechnology and Applied Biochemistry. 2005, roč. 41, s. 77-84, 7 s. ISSN 0885-4513.

HAVLIŠ, Jan. Využití izotopového značení v hmotnostní spektrometrii. In 3. ročník Školy HPLC/MS - Sborník přednášek. Pardubice: Univerzita Pardubice, 2005, s. 147-153, 6 s. ISBN 80-7194-785-7.

HAVLIŠ, Jan a Andrej SHEVCHENKO. Absolute Quantification of Proteins in Solutions and in Polyacrylamide Gels by Mass Spectrometry. Analytical Chemistry. Washington, D.C., USA: American Chemical Society, 2004, roč. 76, č. 11, s. 3029-3036, 7 s. ISSN 0003-2700.

THOMAS, Henrik; Jan HAVLIŠ; Jan PEYCHL a Andrej SHEVCHENKO. Dried-Droplet Probe Preparation on AnchorChip(TM) Targets for Navigating the Acquisition of MALDI TOF Spectra by Fluorescence of Matrix / Analyte Crystals. Rapid Communications in Mass Spectrometry. United Kingdom: John Wiley & Sons, Ltd, 2004, roč. 18, č. 9, s. 923-930. ISSN 0951-4198.

SCHWICKART, Martin; Jan HAVLIŠ; Bianca HABERMANN; Aliona BOGDANOVA; Alain CAMASSES; Tobias OELSCHLAEGEL; Andrej SHEVCHENKO a Wolfgang ZACHARIAE. Swm1/Apc13 is an evolutionarily conserved subunit of the anaphase-promoting complex stabilizing the association of Cdc16 and Cdc27. Molecular and Cellular Biology. Washington, D.C.: ASM, 2004, roč. 24, č. 8, s. 3562-3576. ISSN 0270-7306.

ŠEBELA, Marek; Zbyněk LAMPLOT; Michal MALOŇ; René LENOBEL; Karel LEMR; Jan HAVLIŠ; Pavel PEČ; Chunhua QIAO a Lawrence M. SAYRE. 1,5-Diamino-2-pentyne is both a substrate and inactivator of plant copper amine oxidases. European Journal of Biochemistry. 2004, č. 271, s. 4696-4708, 12 s. ISSN 0014-2956.

HAVLIŠ, Jan; Henrik THOMAS; Marek ŠEBELA a Andrej SHEVCHENKO. Fast Response Proteomics by Accelerated In-gel Digestion of Proteins. Analytical Chemistry. Washington, D.C., USA: American Chemical Society, 2003, roč. 75, č. 6, s. 1300-1306, 6 s. ISSN 0003-2700.

HAVLIŠ, Jan; Anna SHEVCHENKO a Andrej SHEVCHENKO. Protein Identification by MALDI TOF MS: Practical Assessment of the Fast In-gel Digestion Protocol. 50th ASMS, Orlando, Florida, USA, 2002.

SHEVCHENKO, Anna; Daniel SCHAFT; Assen ROGUEV; Pim PIJNAPPEL; Jan HAVLIŠ; Francis STEWART a Andrej SHEVCHENKO. SEAMing Proteins from the TAP: Charting Protein Interaction Networks in Yeast by Tandem Affinity Purification and Mass Spectrometry. 50th ASMS, Orlando, Florida, USA, 2002.

HAVLIŠ, Jan a Martin TRBUŠEK. 5-methyl-cytosine as a marker for monitoring of DNA methylation. Journal of Chromatography B. Amsterdam: Elsevier, 2002, roč. 781, 1-2, s. 373-391. ISSN 1570-0232.

ČEŠKOVÁ, Pavla; Zdirad ŽÁK; Jan HAVLIŠ; Barrie JOHNSON; Oldřich JANICZEK a Martin MANDL. Partial characterisation of a colored metabolite of Acidithiobacillus ferrooxidans grown on elemental sulfur. In Biohydrometallurgy: Fundamentals, Technology and Sustainable Development. Amsterdam: Elsevier, 2001, s. 363-367. ISBN 0 444 50623 3.

HAVEL, Josef; David FETSCH; Eladia María PEŇA MÉNDEZ; Přemysl LUBAL a Jan HAVLIŠ. Recent developments in humic acid characterisation by CE and MALDI-TOF mass spectrometry. In Understanding and Managing Organic Matter in Soils, Sediments and Waters. Atlanta: IHSS, 2001, s. 77-82.

HAVEL, Josef; David FETSCH; Eladia María PEŇA MÉNDEZ; Přemysl LUBAL a Jan HAVLIŠ. Recent Developments in Humic Acid Characterization. Acidobasic and Complexation Properties Separation and Reliable Fingerprints by Capillary Electrophoresis and MALDI-TOF Mass Spectrometry, SWIFT, R:S., SPARK. K.M., (Eds.), Understanding and Managing Org. 2001, 6 s. Atlanta. ISBN 0-909816-38-7.

ŠEBELA, Marek; Pavel PEČ; Petr GALUSZKA a Jan HAVLIŠ. Characterisation of a homogenous plant aminoaldehyde dehydrogenase. Biochimica et Biophysica Acta. Amsterdam: Elsevier Science B.V., 2000, -, č. 1480, s. 329-669. ISSN 0005-2728.

CHROMÁ-KEULL, Hana; Jan HAVLIŠ a Josef HAVEL. Reactive Dye Ostazine Black V-B: Determination in Dye-bath and Hydrolysis Montoring by Matrix Assisted Laser Desorption/Ionisation Time-of-Flight Mass Spectrometry. Rapid Communications in Mass Spectrometry. United Kingdom: John Wiley & Sons, Ltd, 2000, roč. 2000, č. 14, s. 40-42. ISSN 0951-4198.

CHROMÁ-KEULL, Hana; Jan HAVLIŠ a Josef HAVEL. : Reactive Dye Ostazine Black V-B: Determination in Dye-bath and Hydrolysis Monitoring by Matrix Assisted Laser Desorption-Ionisation Time-of-Flight Mass Spectrometry. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1999, roč. 13, č. 1, s. 40-43. ISSN 0951-4198.

HAVLIŠ, Jan; Alma Luísa REVILLA VÁZQUEZ; Libor KOZÁK a Josef HAVEL. Determination of purins, pyrimidines and their nucleosides in urine by HPLC and MALDI-TOF mass spectrometry. 23rd HPLC, Granada, Spain: n / a, 1999. n / a.

HAVLIŠ, Jan; Vlastimil DOHNAL; Alma Luísa REVILLA VÁZQUEZ; Libor KOZÁK a Josef HAVEL. Determination of 5-methyl-2'-deoxycytidine 5'-monophosphate and 2'-deoxycytidine 5'-monophosphate in the cell homogenate using HPLC. 14th IMD, Litomyšl, Czech Rep.: n / a, 1999. n / a.

HAVLIŠ, Jan a Oldřich JANICZEK. Influence of protein-bound copper(II) on properties of bovine serum albumin-tryptophan complex. Scripta Facultatis Scientiarum Naturalium Universitatis Masarykianae - Chemistry. Brno: Přírodovědecká fakulta MU, 1998, roč. 1997-1998, 27-28, s. 43-49. ISSN 2100-6828.

HAVLIŠ, Jan; Oldřich JANICZEK a Martin MANDL. Influence of protein-bound copper(II) on properties of bovine serum albumin-tryptophan complex. In International Biometals Symposium. Calgary: University of Calgary, 1997, s. 25.

HAVLIŠ, Jan a Marie STUDNICKOVA. Zinc centres in alcohol dehydrogenase from liver and from bakers yeast are metal dithiolenes. Biochemistry and bioenergeics : section of Journal of electroanalytical chemistry and electrochemistry. Lausanne: Elsevier Sequoia S.A., 1997, roč. 43, -, s. 157-159. ISSN 0302-4598.