Výpis publikací

KRISHNAMURTHY, Hari Krishnan; Vasanth JAYARAMAN; Karthik KRISHNA; Tianhao WANG; Kang BEI; Chithra CHANGALATH; Shiny MATILDA; Alex J. RAI; Renata WELC-FALĘCIAK; Agnieszka PAWEŁCZYK; Lucas S. BLANTON; Aleš CHRDLE; Andrea FOŘTOVÁ; Daniel RŮŽEK; Gheyath K. NASRALLAH; Laith J. ABU-RADDADI; Duaa W. AL-SADEQ; Marah Abed Alhakim ABDALLAH; Daniele LILLERI; Chiara FORNARA; Piera D'ANGELO; Milena FURIONE; Maria SÖDERLUND-VENERMO; Klaus HEDMAN; Dimosthenis CHOCHLAKIS; Eirini MAKRIDAKI; Artemis NTOULA; Anna PSAROULAKI; Angélica ESCÁRCEGA-ÁVILA a John J. RAJASEKARAN. A customizable multiplex protein microarray for antibody testing and its application for tick-borne and other infectious diseases. Scientific Reports. NATURE PUBLISHING GROUP, 2025, roč. 15, č. 1, s. 2527-2538. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-024-84467-0.

GAMPAWAR, Piyush G.; Manfred G. SAGMEISTER; Daniel RŮŽEK; Nina AQ. SCHWEINTZGER; Edith HOFER; Benno KOHLMAIER; Vendula ŠVENDOVÁ; Petra BOGOVIČ; Joanna M. ZAJKOWSKA; Lenka KRBKOVÁ; Věra ŠTRUNCOVÁ; Aukse MICKIENE; Daniela S. KOHLFÜRST; Astrig SONNLEITNER; Andrea FOŘTOVÁ; Michaela BERÁNKOVÁ; Martina PÝCHOVÁ; Dace ZAVADSKA; Neneh SALAH; Alexander PICHLER; Dalibor SEDLÁČEK; Aleš CHRDLE; Christoph HAUDUM; Barbara OBERMAYER-PIETSCH; Per HOFFMANN; Markus M. NÖTHEN; Mari-Liis TAMMESOO; Andreas METSPALU; Petr HUSA; Karin STIASTNY; Alexander BINDER; Andrea BERGHOLD; Franc STRLE; Martin L. HIBBERD a Werner ZENZ. Genome-wide association study identifies ABCG1 as a susceptibility locus for tick-borne encephalitis. iScience. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2025, roč. 28, č. 12, s. 1-16. ISSN 2589-0042. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.isci.2025.114017.

SUYAMA, Satoshi; Sally BOXALL; Benjamin GRACE; Andrea FOŘTOVÁ; Martina PÝCHOVÁ; Lenka KRBKOVÁ; Rupasri MANDAL; David WISHART; Diane E GRIFFIN; Daniel RŮŽEK a Niluka GOONAWARDANE. Changes in metabolite profiles in the cerebrospinal fluid and in human neuronal cells upon tick-borne encephalitis virus infection. Journal of neuroinflammation. London: BioMed Central Ltd, 2025, roč. 22, č. 1, s. 1-19. ISSN 1742-2094. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s12974-025-03478-4.

HOLOUBEK, Jiří; Jiří SALÁT; Milos MATKOVIC; Petr BEDNÁŘ; Pavel NOVOTNÝ; Martin HRADILEK; Taťána MAJEROVÁ; Ebba ROSENDAL; Luděk EYER; Andrea FOŘTOVÁ; Michaela BERÁNKOVÁ; Lesley BELL-SAKYI; Anna K ÖVERBY; Andrea CAVALLI; Massimiliano BONOMI; Felix A REY a Daniel RŮŽEK. Irreversible furin cleavage site exposure renders immature tick-borne flaviviruses fully infectious. Nature Communications. Nature Research, 2025, roč. 16, č. 1, s. 7491-7507. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41467-025-62750-6.

DVOŘÁK, Michal; Dominik ARBON; Jiří SALÁT; Andrea FOŘTOVÁ; David Pajuelo REGUERA; Tereza FRČKOVÁ; Jiří HOLOUBEK; Jana BALOUNOVA; Jan PROCHAZKA; Radislav SEDLACEK a Daniel RŮŽEK. Sex-dependent impairment of antibody responses to tick-borne encephalitis virus vaccination and infection in obese mice. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY. LONDON: MICROBIOLOGY SOC, 2025, roč. 106, č. 10, s. 1-12. ISSN 0022-1317. Dostupné z: https://doi.org/10.1099/jgv.0.002161.

GERVAIS, Adrian; Astrid MARCHAL; Andrea FOŘTOVÁ; Michaela BERÁNKOVÁ; Lenka KRBKOVÁ; Martina PÝCHOVÁ; Jiří SALÁT; Shuxiang ZHAO; Nacim KERROUCHE; Le Voyer TOM; Karin STIASNY; Simon RAFFL; Schieber Pachart ANNE; Samira FAFI-KREMER; Simon GRAVIER; Davide F ROBBIANI; Laurent ABEL; Margaret R MACDONALD; Charles M RICE; Gaia WEISSMANN; Kamal Eldin TAREK; Eva ROBATSCHER; Elke Maria ERNE; Elisabetta PAGANI; Alessandro BORGHESI; Anne PUEL; Paul BASTARD; Aurelie VELAY; Martin MARTINOT; Yves HANSMANN; Judith H ABERLE; Daniel RŮŽEK; Aurelie COBAT; Shen-Ying ZHANG a Jean-Laurent CASANOVA. Autoantibodies neutralizing type I IFNs underlie severe tick-borne encephalitis in ∼10% of patients. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE. New York: ROCKEFELLER UNIV PRESS, 2024, roč. 221, č. 10, s. 1-14. ISSN 0022-1007. Dostupné z: https://doi.org/10.1084/jem.20240637.

FOŘTOVÁ, Andrea; Petra STRAKOVÁ; Jan HAVIERNIK; Pavel SVOBODA; Tomáš BARTONIČKA; Jana KVIČEROVÁ; Daniel RŮŽEK a Jiří SALÁT. Brno loanvirus (BRNV) in bats inhabiting the urban area of Brno, Czech Republic. Infection, Genetics and Evolution. Amsterdam: Elsevier Science, 2024, roč. 121, July, s. 1-4. ISSN 1567-1348. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.meegid.2024.105604.

ŠIMEČKOVÁ, Pavlína; Josef SLAVÍK; Andrea FOŘTOVÁ; Ivana HUVAROVÁ; Lucie KRÁLIKOVÁ; Michal STEFANIK; Pavel SVOBODA; Daniel RŮŽEK a Miroslav MACHALA. Tick-borne encephalitis virus modulates sphingolipid and phospholipid metabolism in infected human neuronal cells. Microbes and Infection. Elsevier, 2024, roč. 26, č. 4, s. 1-11. ISSN 1286-4579. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.micinf.2024.105303.

STRAKOVÁ, Petra; Petr BEDNÁŘ; Jan KOTOUČEK; Jiří HOLOUBEK; Andrea FOŘTOVÁ; Pavel SVOBODA; Michal ŠTEFÁNIK; Ivana HUVAROVÁ; Pavlína ŠIMEČKOVÁ; Josef MAŠEK; Daniil A GVOZDEV; Igor E MIKHNOVETS; Alexey A CHISTOV; Timofei D NIKITIN; Maxim S KRASILNIKOV; Alexey V USTINOV; Vera A ALFEROVA; Vladimir A KORSHUN; Daniel RŮŽEK a Luděk EYER. Antiviral activity of singlet oxygen-photogenerating perylene compounds against SARS-CoV-2: Interaction with the viral envelope and photodynamic virion inactivation. Virus Research. Elsevier, 2023, roč. 334, September, s. 1-21. ISSN 0168-1702. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.virusres.2023.199158.

SALÁT, Jiří; Milan HUNADY; Pavel SVOBODA; Lucie STŘELCOVÁ; Petra STRAKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Martin PALUS a Daniel RŮŽEK. Efficacy and immunogenicity of a veterinary vaccine candidate against tick-borne encephalitis in dogs. Vaccine. Elsevier Ltd, 2023, roč. 41, č. 42, s. 6150-6155. ISSN 0264-410X. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2023.09.019.

FOŘTOVÁ, Andrea; Andrey BARKHASH; Martina PÝCHOVÁ; Lenka KRBKOVÁ; Martin PALUS; Jiří SALÁT a Daniel RŮŽEK. Genetic polymorphisms in innate immunity genes influence predisposition to tick-borne encephalitis. JOURNAL OF NEUROVIROLOGY. NEW YORK: SPRINGER, 2023, roč. 29, č. 6, s. 699-705. ISSN 1355-0284. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s13365-023-01182-8.

FOŘTOVÁ, Andrea; Václav HÖNIG; Jiří SALÁT; Martin PALUS; Martina PÝCHOVÁ; Lenka KRBKOVÁ; Andrey V. BARKHASH; Michal F. KRIHA; Ales CHRDLE; Marie LIPOLDOVA a Daniel RŮŽEK. Serum matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) as a biomarker in paediatric and adult tick-borne encephalitis patients. Virus Research. Elsevier, 2023, roč. 324, January 2023, s. 1-8. ISSN 0168-1702. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.virusres.2022.199020.

KONKOLOVA, Eva; Kateřina KREJČOVÁ; Luděk EYER; Jan HODEK; Michala ZGARBOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Michael JIRASEK; Filip TEPLY; Paul E. REYES-GUTIERREZ; Daniel RŮŽEK; Jan WEBER a Evzen BOURA. A Helquat-like Compound as a Potent Inhibitor of Flaviviral and Coronaviral Polymerases. Molecules. MDPI, 2022, roč. 27, č. 6, s. 1-10. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/molecules27061894.

FOŘTOVÁ, Andrea; Václav HÖNIG; Martin PALUS; Jiří SALÁT; Martina PÝCHOVÁ; Lenka KRBKOVÁ; Tereza VYHLÍDALOVÁ; Michal F. KŘÍHA; Aleš CHRDLE a Daniel RŮŽEK. Serum and cerebrospinal fluid phosphorylated neurofilament heavy subunit as a marker of neuroaxonal damage in tick-borne encephalitis. Journal of General Virology. Microbiology Society, 2022, roč. 103, č. 5, s. 1-7. ISSN 0022-1317. Dostupné z: https://doi.org/10.1099/jgv.0.001743.

BREZOVSKÝ, Jan; Petra BABKOVÁ; Oksana DEGTJARIK; Andrea FOŘTOVÁ; Artur Wiktor GÓRA; L. IERMAK; Petra ŘEZÁČOVÁ; Pavel DVOŘÁK; Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ; Zbyněk PROKOP; Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering a de Novo Transport Tunnel. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2016, roč. 6, č. 11, s. 7597-7610. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/acscatal.6b02081.

USTIANENKO, Dmytro; Josef PASULKA; Zuzana FEKETOVÁ; Lukáš BEDNAŘÍK; Dagmar ZIGÁČKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Mihaela ZAVOLAN a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs. EMBO JOURNAL. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2016, roč. 35, č. 20, s. 2179-2191. ISSN 0261-4189. Dostupné z: https://doi.org/10.15252/embj.201694857.

SYKORA, J.; Jan BREZOVSKÝ; Táňa KOUDELÁKOVÁ; M. LAHODA; Andrea FOŘTOVÁ; T. CHERNOVETS; Radka CHALOUPKOVÁ; Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ; Zbyněk PROKOP; I. KUTA SMATANOVA; M. HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Dynamics and Hydration Explain Failed Functional Transformation in Dehalogenase Design. Nature Chemical Biology. 2014, roč. 10, č. 6, s. 428-430. ISSN 1552-4450.

TUDEK, Agnieszka; Odil Porrua FUERTE; Tomasz KABZINSKI; Michael LIDSCHREIBER; Karel KUBÍČEK; Andrea FOŘTOVÁ; Francoise LACROUTE; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Patrick CRAMER; Richard ŠTEFL a Domenico LIBRI. Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation. Molecular Cell. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2014, roč. 55, č. 3, s. 467-481. ISSN 1097-2765. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.031.

FOŘTOVÁ, Andrea; Eva ŠEBESTOVÁ; Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Lenka PÁLKOVÁ; Jiří DAMBORSKÝ a Radka CHALOUPKOVÁ. DspA from Strongylocentrotus purpuratus: the First Biochemically Characterized Haloalkane Dehalogenase of Non-Microbial Origin. Biochimie. Elsevier, 2013, roč. 95, č. 11, s. 2091-2096. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2013.07.025.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; F. OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2013. Patent. Číslo: EP 1899022. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 9. 10. 2013.

HASAN, Khomaini; Artur Wiktor GORA; Jan BREZOVSKÝ; Radka CHALOUPKOVÁ; Hana MOSKALÍKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Yuji NAGATA; Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. The Effect of a Unique Halide-Stabilising Residue on the Catalytic Properties of Haloalkane Dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C58. FEBS Journal. Blackwell, 2013, roč. 280, č. 13, s. 3149-3159. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/febs.12238.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; F. OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: CA 2610024. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 26. 6. 2012.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; F. OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: IL 186596. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 1. 5. 2012.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; Filip OPLUŠTIL; Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: IL 186596. Vydavatel: Israeli Patent Office. Místo vydání: Israel. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 11. 10. 2007. Datum přijetí: 31. 1. 2012.

HASAN, Khomaini; Andrea FOŘTOVÁ; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; M. ISHITSUKA; Yuji NAGATA; Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Biochemical Characteristics of the Novel Haloalkane Dehalogenase DatA Isolated from the Plant Pathogen Agrobacterium tumefaciens C58. Applied and Environmental Microbiology. 2011, roč. 77, č. 5, s. 1881-1884. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/AEM.02109-10.

STSIAPANAVA, Alena; Radka CHALOUPKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; J. BRYNDA; M. S. WEISS; Jiří DAMBORSKÝ a I. KUTÁ-SMATANOVÁ. Crystallization and Preliminary Crystallographic Analysis of Rhodococcus rhodochrous Wild-type DhAa Protein and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands. In IX. Discussions in Structural Molecular Biology and Bioinformatics. 2011.

STSIAPANAVA, Alena; Radka CHALOUPKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; J. BRYNDA; M. S. WEISS; Jiří DAMBORSKÝ a Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ. Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of the Wild-Type Haloalkane Dehalogenase DhaA and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands. Acta Crystallographica F. 2011, roč. 67, č. 67, s. 253-257. ISSN 1744-3091. Dostupné z: https://doi.org/10.1107/S1744309110051286.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; František OPLUŠTIL; Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2011. Patent. Číslo: US 7,888,103. Vydavatel: Úřad pro patenty a ochranné známky USA. Místo vydání: USA. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 15. 2. 2011.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; F. OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2011. Patent. Číslo: US 7,888,103. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 15. 2. 2011.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; František OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2011. Patent. Číslo: JP 4793947. Vydavatel: Japonský patentový úřad. Místo vydání: Japonsko. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 5. 8. 2011.

KOUDELÁKOVÁ, Táňa; Eva CHOVANCOVÁ; Jan BREZOVSKÝ; Marta MONINCOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Jiří JARKOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. Substrate Specificity of Haloalkane Dehalogenases. Biochemical Journal. 2011, roč. 435, č. 435, s. 345-354. ISSN 0264-6021. Dostupné z: https://doi.org/10.1042/BJ20101405.

STSIAPANAVA, A.; Radka CHALOUPKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; J.R. MESTERS; J. BRYNDA; Jiří DAMBORSKÝ a Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ. Crystallization and preliminary X-ray analysis of DhaA wild type and DhaA13 proteins from Rhodococcus rhodochrous. In 8th Discussion in Structural Molecular Biology and Bioinformatics. 2010.

PROKOP, Zbyněk; Andrea FOŘTOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; Martina PAVLOVÁ; Eva CHOVANCOVÁ; Jan BREZOVSKÝ; Martin KLVAŇA; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Tomáš MOZGA; Antonín PAVELKA; Pavel DVOŘÁK; Monika STRAKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of Biocatalysts by Modification of Access Tunnels. In Novel Enzymes. 2010.

HASAN, Khomaini; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; Yuji NAGATA; Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Haloalkane dehalogenase from Agrobacterium tumefaciens C58 with new halide-stabilising residues and unique kinetics. In Trends in Enzymology. 2010.

DRIENOVSKÁ, Ivana; Andrea FOŘTOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Characterization of novel haloalkane dehalogenase DhcA from extremophilic microorganism Hahella chejuensis KCTC 2396. In GEM 2010. 2010.

HASAN, Khomaini; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; Yuji NAGATA; Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Kinetics and enantioselectivity of haloalkane dehalogenase from Agrobacterium tumefaciens c58. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; F. OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2010. Patent. Číslo: AU 2006254625. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 4. 2. 2010.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; František OPLUŠTIL; Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2010. Patent. Číslo: AU 2006254625 B2. Vydavatel: Patentový úřad Austrálie. Místo vydání: Austrálie. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 4. 2. 2010.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; František OPLUŠTIL; Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2010. Patent. Číslo: NZ 564218. Vydavatel: Patentový úřad Nový Zéland. Místo vydání: Nový Zěland. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 9. 9. 2010.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; F. OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2010. Patent. Číslo: NZ 564218. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 9. 9. 2010.

SÝKORA, J.; Martin HOF; Andrea FOŘTOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. SENSING HYDRATION AND MOBILITY AT THE VICINITY OF THE ACTIVE SITE OF ENZYMES BY MEANS OF FLUORESCENCE SPECTROSCOPY. 2010.

JESENSKÁ, Andrea; Marta MONINCOVÁ; Táňa KOUDELÁKOVÁ; Khomaini HASAN; Radka CHALOUPKOVÁ; Zbyněk PROKOP; Z. GEERLOF a Jiří DAMBORSKÝ. Characterization of Haloalkane Dehalogenases DrbA and DmbC: Representatives of Novel Subfamily. Applied and Environmental Microbilogy. 2009, roč. 75, č. 15, s. 5157-5160. ISSN 0099-2240.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; F. OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a J. NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2009. Patent. Číslo: RU11311. Vydavatel: ROSPATENT. Místo vydání: Rusko. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 27. 2. 2009.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; František OPLUŠTIL; Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2009. Patent. Číslo: RU 11311. Vydavatel: Patentový úřad Ruska. Místo vydání: Ruska federace. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 27. 2. 2009.

FOŘTOVÁ, Andrea; J. SÝKORA; Agniezska OLZYNSKA; Jan BREZOVSKÝ; Zbyněk ZDRÁHAL; Jiří DAMBORSKÝ a Martin HOF. Nanosecond Time-Dependent Stokes Shift at the Tunnel Mouth of Haloalkane Dehalogenases. JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 2009, roč. 0000, č. 131, s. 494-501, 12 s. ISSN 0002-7863.

KOUDELÁKOVÁ, Táňa; Eva CHOVANCOVÁ; Jan BREZOVSKÝ; Martina PAVLOVÁ; Marta MONINCOVÁ; Tomáš MOZGA; Andrea FOŘTOVÁ; Khomaini HASAN; Pavel DVOŘÁK; J. JARKOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. Quantitative Analyses of Substrate Specifity of Haloalkane Dehalogenase. 2009.

FOŘTOVÁ, Andrea; J. SÝKORA; A. OLZYŃSKA; Jan BREZOVSKÝ; Zbyněk ZDRÁHAL; Martin HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Studium dynamiky molekul vody v ústí tunelu haloalkándehalogenáz. 2009.

FOŘTOVÁ, Andrea; J. SÝKORA; Agniezska OLZYNSKA; Jan BREZOVSKÝ; Zbyněk ZDRÁHAL; Martin HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Study of water molecule dynamics at the tunnel openings of haloalkane dehalogenase. 2009.

KAZDA, Jindrich; Ivo PAVLIK; J.O. FALKLINHAM III.; Karel HRUSKA; Jiří DAMBORSKÝ a Andrea FOŘTOVÁ. The ecology of Mycobacteria: Impact on Animal´s and Human Health. In DAMBORSKÝ, Jiří a Andrea FOŘTOVÁ. The ecology of Mycobacteria: Impact on Animal´s and Human Health. Heidelberg: Springer, 2009, s. 10-20, 10 s. 2008940658. ISBN 978-1-4020-9412-5.

KOUDELÁKOVÁ, Táňa; Eva CHOVANCOVÁ; Martina PAVLOVÁ; Marta MONINCOVÁ; Tomáš MOZGA; Andrea FOŘTOVÁ; Khomaini HASAN; Pavel DVOŘÁK; J. JARKOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. Analysis of Substrate Specificities of Wild-type Haloalkane Dehalogenases and their Mutants by Multivariate Statistics. 2008.

HASAN, Khomaini; Marta MONINCOVÁ; Andrea JESENSKÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; Táňa KOUDELÁKOVÁ a Zbyněk PROKOP. Characterization of Haloalkane Dehalogenase DmbC from Mycobacterium tubercul.sis H37Rv,. 2008.

PAVLOVÁ, Martina; Martin KLVAŇA; Andrea JESENSKÁ; Zbyněk PROKOP; Hana KONEČNÁ; Yukari SATO; M. TSUDA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution. Journal of Structural Biology. 2007, roč. 157, č. 2, s. 384-392. ISSN 1047-8477.

KOUDELÁKOVÁ, Táňa; Zbyněk PROKOP; Yukari SATO; Marta MONINCOVÁ; Andrea JESENSKÁ; Lucie GRODECKÁ; T. SENDA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Změna enantioselektivity a substrátové specifity haloalkan dehalogenázy proteinovým inženýrstvím. 2007.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; František OPLUŠTIL; Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. ZPŮSOB DETOXIKACE SULFIDICKÉHO YPERITU ÚČINKEM HALOGENALKANDEHALOGENÁZ. 2007. Patent. Číslo: 298287. Vydavatel: Úřad průmyslového vlastnictví ČR. Místo vydání: ČR. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 3. 6. 2005. Datum přijetí: 4. 7. 2007.

PAVLOVÁ, Martina; Andrea FOŘTOVÁ; Martin KLVAŇA; Pavel BANÁŠ; Michal OTYEPKA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Computer-assisted Directed Evolution of Haloalkane Dehalogenase DhaA Towards Degradation of 1,2,3-Trichloropropane. 2006.

KOUDELÁKOVÁ, Táňa; Zbyněk PROKOP; Marta MONINCOVÁ; Andrea JESENSKÁ; Lucie GRODECKÁ; Yukari SATO; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of enantioselective enzyme by cumulative mutagenesis. 2006.

KOUDELÁKOVÁ, Táňa; Yukari SATO; Zbyněk PROKOP; Marta MONINCOVÁ; Andrea JESENSKÁ; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of Enantioselective Haloalkane Dehalogenase by Cumulative Mutagenesis. 2006.

KOUDELÁKOVÁ, Táňa; Zbyněk PROKOP; Yukari SATO; Marta MONINCOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Lucie GRODECKÁ; T. SENDA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of Haloalkane Dehalogenase DhaA from Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 Towards Higher Enantioselectivity. 2006.

MONINCOVÁ, Marta; Andrea FOŘTOVÁ; Radka CHALOUPKOVÁ; Yukari SATO; Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. High-throughput characterization of enzymes from genomic and proteomic projects-multivariate statistical approach. In Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. 2006.

FOŘTOVÁ, Andrea; Martina PAVLOVÁ; Martin KLVAŇA; Radka CHALOUPKOVÁ; Marta MONINCOVÁ; T. SATO; M. TSUDA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Mycobacteria as a Source of Haloalkane Dehalogenases: Identification of the Catalytic Pentad within the Structure of DhmA from Mycobacterium avium N85. 2006.

MONINCOVÁ, Marta; Yuji NAGATA; Radka CHALOUPKOVÁ; Zbyněk PROKOP; Andrea FOŘTOVÁ; Martina PAVLOVÁ; Masataka TSUDA a Jiří DAMBORSKÝ. Protein engineering of haloalkane dehalogenase LinB: reconstruction of active site and modification of entrance tunnel. In Book of Abstracts, 10th International Symposium of the Genetics of Industrial Microorganisms. 1. vyd. Praha: Institute of Microbiology ASCR, 2006, s. 160-161. ISBN 80-239-7323-1.

MONINCOVÁ, Marta; Radka CHALOUPKOVÁ; Yuji NAGATA; Zbyněk PROKOP; Soňa MARVANOVÁ; Jana SÝKOROVÁ; Andrea JESENSKÁ; Martina PAVLOVÁ; M. TSUDA a Jiří DAMBORSKÝ. Structure-Based Engineering of Haloalkane Dehalogenase. 2006.

PAVLOVÁ, Martina; Martin KLVAŇA; Andrea JESENSKÁ; Zbyněk PROKOP; Hana KONEČNÁ; T. SATO; M. TSUDA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution. JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY. 2006, roč. 1/2006, č. 1, s. 9999-10007. ISSN 1047-8477.

JESENSKÁ, Andrea; Martina PAVLOVÁ; Michal STROUHAL; Radka CHALOUPKOVÁ; Iva TĚŠÍNSKÁ; Marta MONINCOVÁ; Zbyněk PROKOP; Milan BARTOŠ; Ivo PAVLÍK; Ivan RYCHLÍK; Petra MOBIUS; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Mycobacterial Haloalkane Dehalogenases: Cloning, Biochemical Properties and distribution. Applied and Environmental Microbiology. 2005, roč. 71, č. 11, s. 6736-6745. ISSN 0099-2240.

PROKOP, Zbyněk; Jiří DAMBORSKÝ; František OPLUŠTIL; Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Způsob detoxikace sulfidického yperitu psobením halogenalkandehalogenázami. 2005. Patent. Číslo: PV2005/352. Vydavatel: Masarykova univerzita, rektorát. Místo vydání: Brno, Česká republika. Název vlastníka: Masarykova univerzita, rektorát. Datum registrace: 3. 6. 2005. Datum přijetí: 3. 6. 2005.

CHALOUPKOVÁ, Radka; Jana SÝKOROVÁ; Zbyněk PROKOP; Andrea JESENSKÁ; Marta MONINCOVÁ; Martina PAVLOVÁ; Masataka TSUDA; Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Modification of Activity and Specificity of Haloalkane Dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26 by Engineering of its Entrance Tunnel. Journal of Biological Chemistry. 2003, roč. 278, č. 52, s. 52622-52628. ISSN 1083-351X.

JESENSKÁ, Andrea; Milan BARTOŠ; Vladimíra CZERNEKOVÁ; Ivan RYCHLÍK; Ivo PAVLÍK a Jiří DAMBORSKÝ. Cloning, expression and preliminary characterization of novel haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85. Applied and Environmental Microbiology. 2002, roč. 68, č. 8, s. 3724-7453. ISSN 1098-5336.

DAMBORSKÝ, Jiří; Emiel RORIJE; Andrea JESENSKÁ; Yuji NAGATA; Gilles KLOPMAN a Willie PEIJNENBURG. Structure-specificity relationships for haloalkane dehalogenases. Environmental Toxicology and Chemistry. 2001, roč. 20, č. 12, s. 2681-2689.

JESENSKÁ, Andrea; Ivo SEDLÁČEK a Jiří DAMBORSKÝ. Dehalogenation of haloalkanes by Mycobacterium tuberculosis H37Rv and other mycobacteria. Applied and Environmental Microbiology. 2000, roč. 66, č. 1, s. 219-222. ISSN 0099-2240.

DAMBORSKÝ, Jiří; Martina DAMBORSKÁ; Svatopluk ŠTÍPEK; Andrea JESENSKÁ; Lukáš TRANTÍREK a Vladimír SKLENÁŘ. Effect of the carbon source on assessment of degrading bacteria with the spread-plating technique during in situ bioremediation. Folia Microbiologica. 2000, roč. 45, č. 1, s. 35-40. ISSN 0015-5632.