PřF:C4182 Biochemistry II - Course Information
C4182 Biochemistry II
Faculty of ScienceSpring 2008
- Extent and Intensity
- 2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Type of Completion: zk (examination).
- Teacher(s)
- doc. RNDr. Petr Zbořil, CSc. (lecturer)
- Guaranteed by
- doc. RNDr. Petr Zbořil, CSc.
Department of Biochemistry – Chemistry Section – Faculty of Science - Timetable
- Mon 14:00–15:50 A,01026
- Prerequisites
- C3190 Biochemistry I - sem.
Basic knowledge of biochemistry I - Course Enrolment Limitations
- The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
- fields of study / plans the course is directly associated with
- there are 17 fields of study the course is directly associated with, display
- Course objectives
- Basic catabolic and anabolic pathways. Glycolysis, citrate cycle, respiration. Synthesis and degradation of aminoacids, fatty acids, proteins, cabohydrates. Photosynthesis. Regulation of meabolic pathways. Physiological processes and their biochemical nature.
- Syllabus
- Biochemie II 1. Catabolism of proteins and amino acids. Peptidases, classification, importance, specificity.Degradation of amino acids, transamination, biogenic amines. Special catabolic pathways (viz. aromatic and essential.) Genetic diseases in amino acid metabolism. 2. Nitrogen excretion, the role of glutamate dehydrogenase, glutamine synthetase, ornithine cycle. Uric acid. Ammonia assimilation. 3. Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza. Syntéza a odbourání bazí. Degradace a syntéza NK. Fosfodiesterasy, palindrom, restrikční endonukleasy. Replikace DNA, replikační vidlička, DNA polymerasa. Transkripce DNA a její faktory, mRNA, kodon, souvislost mezi strukturou bílkoviny a kodony, reverzní transkripce, translace, struktura tRNA, antikodon, ribosomy, translace, posttranslační modifikace. Mutace bodové, inzeční a deleční, Regulace exprese genů u prokaryontů (inducibilní, represibilní systém, operon, represor, regulátorový gen) 4. Metabolismus sacharidů, štěpení a syntéza polysacharidů (škrob, glykogen). Interkonverse monosacharidů. Přímá oxidace glukosy, význam. Pentosový cyklus. Anaerobní glykolýza, její jednotlivé kroky, energetická bilance. Substrátová fosforylace. Glukoneogeneze, syntéza PEP. Coriho cyklus.. Oxidační dekarboxylace pyruvátu. 5. Metabolismus lipidů, odbourání a syntéza tuků a fosfolipidů. Odbourání a syntéza mastných kyselin. Ketonické látky. 6. Citrátový cyklus, reakce, význam, energetická bilance. Anabolický význam, anaplerotické reakce, glyoxylátový cyklus. 7. Redoxní reakce v biochemii. Respirační řetězec, jeho komponenty (cytochromy, ubichinon), struktura komplexů 1-4. Oxidační fosforylace, chemiosmotická teorie, protonmotivní síla a transmembránový potenciál. Syntéza ATP, struktura ATPsyntasy. Inhibitory respirace a syntéza ATP, rozpojovače, ionofory. Bilance oxidační fosforylace. Alternativní respirace. Mikrosomální elektronový transport, cyt P450. Nitrogenasový systém. 8. Fotosyntéza, světelná fáze, chlorofyly, struktura fotosyntetického centra, Komponenty přenosu elektronů (cytochromy, chinony, plastocyanin, ferredoxin), FS-2, FS-1, mechanismus syntézy ATP. Rovnice světelné fáze a její bilance. Temná fáze fotosyntézy (Calvinův cyklus), RUBISCO, mechanismus fixace CO2. 9. Membránový transport, usnadněná difuze, aktivní transport, permeasy a iontové kanály. Transport aminokyselin, cukrů a iontů. Symport, antiport. Fúze membrán. Struktura a funkce K-Na-ATPasy, laktosový přenašeč, struktura K-kanálu. Přenos nervového vzruchu. 10. Principy metabolických regulací, úrovně, mechanismy (regulace konečným produktem, energetický náboj. Allosterie, kooperativita, Hillova rovnice). Molekulové základy hormonální regulace, hierarchie a struktura. 11. Isoprenoidy, karotenoidy, steroidy, (cholesterol, jeho syntéza, konformace, žlučové kyseliny, vitamin D, steroidní hormony). Syntéza porfyrinů - hemu, odbourání hemu, regulace. 12. Základní procesy syntézy aromátů (šikimátová a polyketidová cesta). Sekundární metabolity, obecné reakce syntézy alkaloidů.
- Literature
- Biochemie. Edited by Zdeněk Vodrážka. 2. opr. vyd. Praha: Academia, 1996, 191 s. ISBN 80-200-0600-1. info
- Biochemie. Edited by Daniel Voet - Judith G. Voet, Translated by A. Maelicke - W. Müller-E. Weinheim: VCH Verlagsgesellschaft, 1992, 1237 s. ISBN 3-527-28242-4. info
- ŠÍPAL, Zdeněk. Biochemie. 1. vyd. Praha: Státní pedagogické nakladatelství, 1992, 479 s. ISBN 8004217362. info
- Mikes, V. - Základní pojmy z biochemie
- Assessment methods (in Czech)
- Základní přednáška doplněná seminářem, navazuje základní biochemické praktikum.
- Language of instruction
- Czech
- Follow-Up Courses
- Further comments (probably available only in Czech)
- Study Materials
The course is taught annually. - Listed among pre-requisites of other courses
- C4200 Biochemistry II - seminar
C3181 && NOW(C4182) - C5014 Bachelor thesis from biochemistry
kredity_min(90) && (C3580 || C4182) && !NOWANY(C6000) - C5015 Bachelor thesis I
kredity_min(90) && (C3580 || C4182) && !NOWANY(C6000) - C5017 Final project in biochemistry I
kredity_min(90) && (C3580 || C4182) && !NOWANY(C6000) - C5017f Final project in biochemistry I
kredity_min(90) && (C3580 || C4182) && !NOWANY(C6000) - C6200 Biochemical Methods
(c3181&&C4182)||C3580 - C6219 Clinical Biochemistry
(C4182|| C3580 || C5720) && (!C6221) && (!C6220) && !NOWANY(C6221) - C6221 Clinical Biochemistry
(C4182 || C3580 || C5720) && (!C6219) && (!C6220) && !NOWANY(C6219) - C7150 Regulation of metabolism
C4182 || C3580 || C5720 || LF:BLBC0211p
- C4200 Biochemistry II - seminar
- Enrolment Statistics (Spring 2008, recent)
- Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/spring2008/C4182