Výpis publikací

PERCZEL, András, Atanas G. ATANASOV, Vladimír SKLENÁŘ, Jiří NOVÁČEK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Henryk KOZLOWSKI, Joanna WATLY, Aleksandra HECEL, Paulina KOLKOWSKA, Jaroslav KOČA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Lukáš PRAVDA, David SEHNAL, Vladimír HORSKÝ, Stanislav GEIDL, Ricardo D. ENRIZ, Pavel MATĚJKA, Adéla JENIŠTOVÁ, Marcela DENDISOVÁ, Alžběta KOKAISLOVÁ, Volkmar WEISSIG, Mark OLSEN, Aidan COFFEY, Jude AJUEBOR, Ruth KEARY, Marta SANZ-GAITERO, Mark J. VAN RAAIJ, Olivia MCAULIFFE, Birgit WALTENBERGER, Andrei MOCAN, Karel ŠMEJKAL, Elke H. HEISS, Marc DIEDERICH, Robert MUSIOL, Janez KOŠMRLJ, Jaroslaw POLANSKI a Josef JAMPÍLEK. The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot. MOLECULES. Basel: MDPI AG, roč. 21, č. 10, s. nestránkováno, 27 s. ISSN 1420-3049. doi:10.3390/molecules21101381. 2016.

OBR, Martin, Romana HADRAVOVÁ, Michal DOLEŽAL, Ivana KŘÍŽOVÁ, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Richard HRABAL, Tomáš RUML a Michaela RUMLOVÁ. Stabilization of the beta-hairpin in Mason-Pfizer monkey virus capsid protein- a critical step for infectivity. Retrovirology. London: Biomed Central LTD, roč. 11, October 2014, s. "nestránkováno", 14 s. ISSN 1742-4690. doi:10.1186/s12977-014-0094-8. 2014.

DEGTJARIK, Oksana, Radka DOPITOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Tomáš KLUMPLER, Jakub HORÁK, Petra BORKOVCOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, David ŘEHA, Sandra PUEHRINGER, Olga OTRUSINOVÁ, Séverine JANSEN, Michal KUTÝ, Manfred S. WEISS, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Structural Biology in Use : NMR, X-ray and Molecular Dynamics Modeling in Study on Multistep Phosphorelay Signaling in Plants. In 6. Metodické dny. 2/2014. s. 52-52. ISSN 1213-6670. 2014.

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Jan KOMÁREK, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Pavel SRB, Alzbeta RABATINOVA, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela WIMMEROVÁ. X-ray vs. NMR structure of N-terminal domain of delta-subunit of RNA polymerase. Journal of Structural Biology. San Diego: Academic Press, roč. 187, č. 2, s. 174-186. ISSN 1047-8477. doi:10.1016/j.jsb.2014.06.001. 2014.

PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Structural Study of the Partially Disordered Full-Length delta Subunit of RNA Polymerase from Bacillus subtilis. ChemBioChem. WEINHEIM: WILEY-VCH Verlag, roč. 14, č. 14, s. 1772-1779. ISSN 1439-4227. doi:10.1002/cbic.201300226. 2013.

RABATINOVÁ, Alžbeta, Hana ŠANDEROVÁ, Jitka JIRÁT MATĚJČKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Luděk SOJKA, Ivan BARVÍK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Vladimír SKLENÁŘ, Lukáš ŽÍDEK a Libor KRÁSNÝ. The Delta Subunit of RNA Polymerase Is Required for Rapid Changes in Gene Expression and Competitive Fitness of the Cell. Journal of Bacteriology. Washington: American Society for Microbiology, roč. 195, č. 11, s. 2603-2611. ISSN 0021-9193. doi:10.1128/JB.00188-13. 2013.

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Jan KOMÁREK, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Pavel SRB, Alzbeta RABATINOVA, Libor KRASNY, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela WIMMEROVÁ. X ray vs. NMR structure of the N terminal domain of delta subunit of RNA polymerase. In Fifth Joint BER II and BESSY II User Meeting 2013. 2013.

PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Jiří NOVÁČEK, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzystof KAZIMIERCZUK, Lukáš ŽÍDEK, Wiktor KOZMINSKI, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria. ISBN 978-80-86441-43-6. 2012.

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Significant changes between the Xray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase. In Struktura 2012, Cesko-slovenska krystalograficka spolecnost. ISSN 1211-5894. 2012.

KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Complementation of 3D structure of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis with description of internal motions in terms of reduced spectral density mapping. MATERIALS STRUCTURE. roč. 18, č. 1, s. 3-5. ISSN 1211-5894. 2011.

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase. In Higher European Research Course for Users of Large Experimental Systems (HERCULES). 2011.

PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Gordon Research Conference. 2011.

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana SANDEROVA a Michaela WIMMEROVÁ. Structural analysis of delta-subnit of RNA-polymerase by X-ray. In Struktura 2011, Cesko-slovenska krystalograficka spolecnost. ISSN 1211-5894. 2011.

PEKÁROVÁ, Blanka, Tomáš KLUMPLER, Olga TŘÍSKOVÁ, Jakub HORÁK, Séverine JANSEN, Radka DOPITOVÁ, Petra BORKOVCOVÁ, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK, Lukáš ŽÍDEK, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Structure and binding specificity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana. The Plant Journal. England: BLACKWELL PUBLISHING, roč. 67, č. 5, s. 827-839. ISSN 0960-7412. doi:10.1111/j.1365-313X.2011.04637.x. 2011.

PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Šanderová HANA, Rabatinová ALŽBĚTA, Zawadzka-Kazimierczuk ANNA, Kazimierczuk KRZYSZTOF, Lukáš ŽÍDEK, Kozminski WIKTOR, Krásný LIBOR a Vladimír SKLENÁŘ. Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria. In 9th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady. ISSN 1211-5894. 2011.

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana SANDEROVA, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase. In XV. Setkani biochemiku a molekularnich biologu. ISBN 978-80-210-5594-0. 2011.

NOVÁČEK, Jiří, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ, Wiktor KOZMINSKI a Vladimír SKLENÁŘ. 5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, roč. 50, č. 1, s. 1-11. ISSN 0925-2738. doi:10.1007/s10858-011-9496-2. 2011.

KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika MOTÁČKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. ANALYSIS OF BACKBONE MOTIONS OF DELTA SUBUNIT OF RNA POLYMERASE FROM BACILLUS SUBTILIS. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady, 2010. 2010.

KADEŘÁVEK, Pavel a Veronika MOTÁČKOVÁ. BACKBONE MOTIONS OF DELTA SUBUNIT OF RNA POLYMERASE FROM BACILLUS SUBTILIS ON VARIOUS TIME SCALES. In 25th Central Europen NMR meeting, NMR 2010 Valtice. 2010.

PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Libor KRÁSNÝ a Wiktor KOZMINSKI. NMR as a tool for studies of (partially) disordered proteins and their interactions. In Molecular Perspectives on Protein-Protein Interactions. 2010.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Jiří JONÁK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. USA: John Wiley and Sons, roč. 78, č. 7, s. 1807-1810. ISSN 0887-3585. 2010.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Jiří NOVÁČEK, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzysztof KAZIMIERCZUK, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ, Wiktor KOZMINSKI a Vladimír SKLENÁŘ. Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments. Journal of Biomolecular NMR. Netherlands: Springer Netherlands, roč. 48, č. 3, s. 169-177. ISSN 0925-2738. 2010.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Jiří NOVÁČEK, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzysztof KAZIMIERCZUK, Wiktor KOŹMIŃSKI, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference. 2010.

KADEŘÁVEK, Pavel, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Carl DIEHL, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Structure and dynamics of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In International school of biological magnetic resonance, 10th Course, Biophysics and Structure to Counter Threats and Challenges, Erice 2010. 2010.

MOTÁČKOVÁ, Veronika. Structure and dynamics of RNA polymerase delta subunit from Bacillus subtilis determined by NMR spectroscopy. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady. ISSN 1211-5894. 2010.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Structure determination of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. ISBN 978-80-210-5164-5. 2010.

NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Alžbeta ŠVENKOVÁ, Jean Marc NUZILLARD, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, roč. 46, č. 2, s. 191-197. ISSN 0925-2738. 2010.

KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika MOTÁČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Mikael AKKE. Backbone dynamics of N-terminal Domain of the Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase. In Structural Biology Network 13th Annual Conference. 2009.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Monika KUBÍČKOVÁ, Milan KOŽÍŠEK, Klára GRANTZ ŠAŠKOVÁ, Martin ŠVEC, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Backbone 1H, 13C, and 15N NMR assignment for the inactive form of the retroviral protease of the murine intracisternal A-type particle, inMIA-14 PR. Biomolecular NMR Assignments. Netherlands: Springer Netherlands, roč. 3, č. 2, s. 261-264. ISSN 1874-2718. 2009.

TŘÍSKOVÁ, Olga, Blanka PEKÁROVÁ, Veronika MOTÁČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK a Lubomír JANDA. Effects of magnesium binding and beryllofluoridation on a component of the cytokinin signaling pathway studied by nuclear magnetic resonance. 2009.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR structural study of N-terminal domain of RNA polymerase delta subunit from Bacillus subtilis. In VII Discussions in Structural Molecular Biology Nové Hrady. ISSN 1211-5894. 2009.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Structural study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Central European NMR Meeting Valtice. ISBN 978-80-86441-40-5. 2009.

MOTÁČKOVÁ, Veronika, Monika KUBÍČKOVÁ, Martin ŠVEC, Milan KOŽÍŠEK, Lukáš ŽÍDEK, Jan KONVALINKA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of a single-stranded DNA binding to the C-terminal domain of the protease from murine intracisternal A-type particle. In XXIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems San Diego. 2008.