Výpis publikací

POSPÍŠILOVÁ, Petra, Darina ČEJKOVÁ, Pavla BURŠÍKOVÁ, Pavla FEDROVÁ, Lenka MIKALOVÁ, David NAJT, Nikola TOM, Linda HISGEN, Simone LUEERT, Johannes T LUMEIJ, Erik O ÅGREN, Sascha KNAUF a David ŠMAJS. The hare syphilis agent is related to, but distinct from, the treponeme causing rabbit syphilis. PLoS One. SAN FRANCISCO: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2024. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0307196.

FEDROVÁ, Pavla, Matěj HRALA, Nikola TOM, Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Andrea M. A. NASCIMENTO, Juraj BOSÁK a David ŠMAJS. Complete genome sequences of five Escherichia coli strains with probiotic attributes. Microbiology Resource Announcements. Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 2023, roč. 12, č. 9, s. 1-3. ISSN 2576-098X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/MRA.00363-23.

POSPÍŠILOVÁ, Petra, Pavla FEDROVÁ, Nikola TOM a David ŠMAJS. RNAseq of Treponema Pallidum during experimental rabbit infection. 2023.

JANEČKOVÁ, Klára, Christian ROOS, Pavla FEDROVÁ, Nikola TOM, Darina CEJKOVA, Simone LUEERT, Julius D KEYYU, Idrissa S CHUMA, Sascha KNAUF a David ŠMAJS. The genomes of the yaws bacterium, Treponema pallidum subsp. pertenue, of nonhuman primate and human origin are not genomically distinct. PLoS neglected tropical diseases. San Francisco: Public Library of Science, 2023, roč. 17, č. 9, s. 1-21. ISSN 1935-2735. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0011602.

POSPÍŠILOVÁ, Petra, Darina ČEJKOVÁ, Pavla HAVLÍČKOVÁ, Pavla FEDROVÁ, Lenka MIKALOVÁ, David NAJT, Nikola TOM, Linda HIGSEN, Simona LUEERT, Johannes T. LUMEIJ, Erik O. ARGEN, Sascha KNAUF a David ŠMAJS. Whole Genome Sequence of Treponema Paraluisleporidarum Ecovar Lepus, Strain V3603-13. 2023.

ZHANG, Yifan, Thomas M. BLOMQUIST, Rebecca KUSKO, Daniel STETSON, Zhihong ZHANG, Lihui YIN, Robert SEBRA, Binsheng GONG, Jennifer S LOCOCO, Vinay K MITTAL, Natalia NOVORADOVSKAYA, Ji-Youn YEO, Nicole DOMINIAK, Jennifer HIPP, Amelia RAYMOND, Fujun QIU, Hanane ARIB, Melissa L SMITH, Jay E BROCK, Daniel H FARKAS, Daniel J CRAIG, Erin L CRAWFORD, Dan LI, Tom MORRISON, Nikola TOM, Wenzhong XIAO, Mary YANG, Christopher E MASON, Todd A RICHMOND, Wendell JONES, Donald J Johann JR, Leming SHI, Weida TONG, James C WILLEY a Joshua XU. Deep oncopanel sequencing reveals within block position-dependent quality degradation in FFPE processed samples. GENOME BIOLOGY. LONDON: BIOMED CENTRAL LTD, 2022, roč. 23, č. 1, s. 141-161. ISSN 1474-760X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13059-022-02709-8.

OLBERTOVÁ, Helena, Karla PLEVOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALCIKOVA, Jana KOTAŠKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Michaela ŠPUNAROVÁ, Martin TRBUŠEK, Veronika NAVRKALOVÁ, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Marie JAROŠOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Evolution of TP53 abnormalities during CLL disease course is associated with telomere length changes. BMC Cancer. London: BMC, 2022, roč. 22, č. 1, s. 1-11. ISSN 1471-2407. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12885-022-09221-z.

POSPÍŠILOVÁ, Petra, Pavla FEDROVÁ, Eliška VRBOVÁ, Nikola TOM a David ŠMAJS. MINION AS A TOOL FOR SEQUENCING OF VARIABLE AND PARALOGOUS GENOMIC LOCI OF TREPONEMA PALLIDUM. In NIVB Meeting 2022. 2022.

JONES, W., B.S. GONG, N. NOVORADOVSKAYA, D. LI, R. KUSKO, T.A. RICHMOND, D.J. JOHANN, H. BISGIN, S.M.E. SAHRAEIAN, P.R. BUSHEL, M. PIROOZNIA, K. WILKINS, M. CHIERICI, W.J. BAO, L.S. BASEHORE, A.B. LUCAS, D. BURGESS, D.J. BUTLER, S. CAWLEY, C.J. CHANG, G.C. CHEN, T. CHEN, Y.C. CHEN, D.J. CRAIG, A. DEL POZO, J. FOOX, M. FRANCESCATTO, YT FU, C. FURLANELLO, K. GIORDA, K.P. GRIST, M.J. GUAN, Y.Y. HAO, S. HAPPE, G. HARIANI, N. HASELEY, J. JASPER, G. JURMAN, D.P. KREIL, P. LABAJ, K. LAI, J.Y. LI, Q.Z. LI, Y.L. LI, Z.G. LI, Z.C. LIU, M.S. LOPEZ, K. MICLAUS, R. MILLER, V.K. MITTAL, M. MOHIYUDDIN, C. PABON-PENA, B.L. PARSONS, F.J. QIU, A. SCHERER, T.L. SHI, S. STIEGELMEYER, C. SUO, Nikola TOM, D. WANG, Z.N. WEN, L.H. WU, W.Z. XIAO, C. XU, Y. YU, J.Y. ZHANG, Y.F. ZHANG, Z.H. ZHANG, Y.T. ZHENG, C.E. MASON, J.C. WILLEY, W.D. TONG, L.M. SHI a J. XU. A verified genomic reference sample for assessing performance of cancer panels detecting small variants of low allele frequency. GENOME BIOLOGY. LONDON: BIOMED CENTRAL LTD, 2021, roč. 22, č. 1, s. 111-148. ISSN 1474-760X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13059-021-02316-z.

GONG, B.S., D. LI, R. KUSKO, N. NOVORADOVSKAYA, Y.F. ZHANG, S.Z. WANG, C. PABON-PENA, Z.H. ZHANG, K. LAI, W.S. CAI, J.S. LOCOCO, E. LADER, T.A. RICHMOND, V.K. MITTAL, L.C. LIU, D.J. JOHANN, J.C. WILLEY, P.R. BUSHEL, Y. YU, C. XU, G.C. CHEN, D. BURGESS, S. CAWLEY, K. GIORDA, N. HASELEY, F.J. QIU, K. WILKINS, H. ARIB, C. ATTWOOLL, K. BABSON, L.L. BAO, W.J. BAO, A.B. LUCAS, H. BEST, A. BHANDARI, H. BISGIN, J. BLACKBURN, T.M. BLOMQUIST, L. BOARDMAN, B. BURGHER, D.J. BUTLER, C.J. CHANG, A. CHAUBEY, T. CHEN, M. CHIERICI, C.R. CHIN, D. CLOSE, J. CONROY, J.C. COLEMAN, D.J. CRAIG, E. CRAWFORD, A. DEL POZO, I.W. DEVESON, D. DUNCAN, A.K. ETEROVIC, X.H. FAN, J. FOOX, C. FURLANELLO, A. GHOSAL, S. GLENN, M.J. GUAN, C. HAAG, X.Y. HANG, S. HAPPE, B. HENNIGAN, J. HIPP, H.X. HONG, K. HORVATH, J.H. HU, L.Y. HUNG, M. JAROSZ, J. KERKHOF, B. KIPP, D.P. KREIL, P. LAPUNZINA, P. LI, Q.Z. LI, W.H. LI, Z.G. LI, Y. LIANG, S.Q. LIU, Z.C. LIU, C. MA, N. MARELLA, R. MARTIN-ARENAS, D.B. MEGHERBI, Q.C. MENG, P.A. MIECZKOWSKI, T. MORRISON, D. MUZNY, B.T. NING, B.L. PARSONS, C.P. PAWELETZ, M. PIROOZNIA, W.B. QU, A. RAYMOND, P. RINDLER, R. RINGLER, B. SADIKOVIC, A. SCHERER, E. SCHULZE, R. SEBRA, R. SHAKNOVICH, Q. SHI, T.L. SHI, J.C. SILLA-CASTRO, M. SMITH, M.S. LOPEZ, P. SONG, D. STETSON, M. STRAHL, A. STUART, J. SUPPLEE, P. SZANKASI, H.W. TAN, L.Y. TANG, Y.H. TAO, S. THAKKAR, D. THIERRY-MIEG, J. THIERRY-MIEG, V.J. THODIMA, D. THOMAS, Boris TICHÝ, Nikola TOM, E.V. GARCIA, S. VERMA, K. WALKER, C. WANG, J.W. WANG, Y.X. WANG, Z.N. WEN, V. WIRTA, L.H. WU, C.L. XIAO, W.Z. XIAO, S.B. XU, M. YANG, J.M. YING, S.H. YIP, G.L. ZHANG, S. ZHANG, M.R. ZHAO, Y.T. ZHENG, X.Y. ZHOU, C.E. MASON, T. MERCER, W.D. TONG, L.M. SHI, W. JONES a J.S. XU. Cross-oncopanel study reveals high sensitivity and accuracy with overall analytical performance depending on genomic regions. GENOME BIOLOGY. LONDON: BIOMED CENTRAL LTD, 2021, roč. 22, č. 1, s. 109-131. ISSN 1474-760X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13059-021-02315-0.

DEVESON, I.W., B.S. GONG, K.V. LAI, J.S. LOCOCO, T.A. RICHMOND, J. SCHAGEMAN, Z.H. ZHANG, N. NOVORADOVSKAYA, J.C. WILLEY, W. JONES, R. KUSKO, G.C. CHEN, B.S. MADALA, J. BLACKBURN, I. STEVANOVSKI, A. BHANDARI, D. CLOSE, J. CONROY, M. HUBANK, N. MARELLA, P.A. MIECZKOWSKI, F.J. QIU, R. SEBRA, D. STETSON, L.Y. SUN, P. SZANKASI, H.W. TAN, L.Y. TANG, H. ARIB, H. BEST, B. BURGHER, P.R. BUSHEL, F. CASEY, S. CAWLEY, C.J. CHANG, J. CHOI, J. DINIS, D. DUNCAN, A.K. ETEROVIC, L. FENG, A. GHOSAL, K. GIORDA, S. GLENN, S. HAPPE, N. HASELEY, K. HORVATH, L.Y. HUNG, M. JAROSZ, G. KUSHWAHA, D. LI, Q.Z. LI, Z.G. LI, L.C. LIU, Z.C. LIU, C. MA, C.E. MASON, D.B. MEGHERBI, T. MORRISON, C. PABON-PENA, M. PIROOZNIA, P.Z. PROSZEK, A. RAYMOND, P. RINDLER, R. RINGLER, A. SCHERER, R. SHAKNOVICH, T.L. SHI, M. SMITH, P. SONG, M. STRAHL, V.J. THODIMA, Nikola TOM, S. VERMA, J.S. WANG, L.H. WU, W.Z. XIAO, C. XU, M. YANG, GL ZHANG, S. ZHANG, Y.L. ZHANG, L.M. SHI, W.D. TONG, D.J. JOHANN, T.R. MERCER a J. XU. Evaluating the analytical validity of circulating tumor DNA sequencing assays for precision oncology. Nature biotechnology. BERLIN: NATURE PORTFOLIO, 2021, roč. 39, č. 9, s. 1115-1128, 19 s. ISSN 1087-0156. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41587-021-00857-z.

ROMŽOVÁ, Marianna, Dagmar SMITALOVÁ, Jakub HYNŠT, Nikola TOM, Tomáš LOJA, Zdeňka HERUDKOVÁ, Tomáš JURČEK, Lukas STEJSKAL, Daniela ŽÁČKOVÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Martin ČULEN. Hierarchical distribution of somatic variants in newly diagnosed chronic myeloid leukaemia at diagnosis and early follow-up. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2021, roč. 194, č. 3, s. 604-612. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.17659.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Šárka PAVLOVÁ, Barbara KUNT VONKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karol PÁL, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, Eva ONDROUŠKOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Boris TICHÝ, Nikola TOM, Jiří MAYER, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Low-burden TP53 mutations in CLL: clinical impact and clonal evolution within the context of different treatment options. Blood. Washington DC, USA: American Society of Hematology, 2021, roč. 138, č. 25, s. 2670-2685. ISSN 0006-4971. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1182/blood.2020009530.

HERUDKOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Adam FOLTA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Jana CERNA, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Jiri SMEJKAL, Lukáš SEMERÁD, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Clonal hierarchy of main molecular lesions in acute myeloid leukaemia. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2020, roč. 190, č. 4, s. 562-572. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.16341.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Šárka PAVLOVÁ, Barbara VONKOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Boris TICHÝ, Nikola TOM, Karol PÁL, Jiří MAYER, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Minor-clone TP53 mutations in CLL patients entering first-line treatment: clonal evolution and clinical impact. In XVIII. International Workshop on CLL (iwCLL), Edinburgh, Spojené království. 2020. ISSN 1042-8194.

ROMŽOVÁ, Marianna, Dagmar SMITALOVÁ, Nikola TOM, Tomáš JURČEK, Martin ČULEN, Daniela ŽÁČKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Novel Illumina-based next generation sequencing approach with one-round amplification provides early and reliable detection of BCR-ABL1 kinase domain mutations in chronic myeloid leukemia. British journal of haematology. England: Wiley-Blackwell, 2020, roč. 189, č. 3, s. 469-474. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.16382.

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Kamila RÉBLOVÁ, V. SVOBODOVA, Lenka RADOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Jiří BALOUN, Kristina ĎURECHOVÁ, Nikola TOM, Tomáš LOJA, Martina BUREŠOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Alexandra OLTOVÁ, Michael DOUBEK, M.L. ATCHISON, Martin TRBUŠEK, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Activation-induced deaminase and its splice variants associate with trisomy 12 in chronic lymphocytic leukemia. Annals of hematology. New York: Springer Verlag, 2019, roč. 98, č. 2, s. 423-435. ISSN 0939-5555. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00277-018-3520-5.

MAREČKOVÁ, Andrea, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Lenka RADOVÁ, David ŠÁLEK, Andrea JANÍKOVÁ, Mojmír MOULIS, Jana ŠMARDOVÁ, Leoš KŘEN, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. ATM and TP53 mutations show mutual exclusivity but distinct clinical impact in mantle cell lymphoma patients. LEUKEMIA & LYMPHOMA. LONDON: INFORMA HEALTHCARE, 2019, roč. 60, č. 6, s. 1420-1428. ISSN 1042-8194. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/10428194.2018.1542144.

HERNANDEZ-SANCHEZ, M., Jana KOTAŠKOVÁ, A.E. RODRIGUEZ, Lenka RADOVÁ, D. TAMBORERO, M. ABAIGAR, Karla PLEVOVÁ, R. BENITO, Nikola TOM, M. QUIJADA-ALAMO, Vasileios BIKOS, A.A. MARTIN, Karol PÁL, A. DE COCA, Michael DOUBEK, N. LOPEZ-BIGAS, J.M. HERNANDEZ-RIVAS a Šárka POSPÍŠILOVÁ. CLL cells cumulate genetic aberrations prior to the first therapy even in outwardly inactive disease phase. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 33, č. 2, s. 518-522. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-018-0255-1.

ĎURINÍKOVÁ, Anna, Adam FOLTA, Martin ČULEN, Dagmar AL TUKMACHI, Zdeňka KOŠÁŘOVÁ, Nikola TOM, Petr CETKOVSKÝ, P. JINDRA, Tomáš SZOTKOWSKI, P. ŽÁK, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Ivana JEŽÍŠKOVÁ. Consequences of NRAS mutations in patients with acute myeloid leukemia. In 24th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSpehere. 2019.

PAVLOVÁ, Šárka, Jana ŠMARDOVÁ, Nikola TOM a Martin TRBUŠEK. Detection and functional analysis of TP53 mutations in CLL. In Methods in Molecular Biology - Chronic Lymphocytic Leukemia: Methods and Protocols. Humana New York, NY: Springer Science + Business Media, LLC part of Springer Nature, 2019, s. 63-81, 20 s. 1881. ISBN 978-1-4939-9405-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-8876-1.

ŠPUNAROVÁ, Michaela, Nikola TOM, Šárka PAVLOVÁ, Marek MRÁZ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Anna PANOVSKÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Anna BRZOBOHATÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. Impact of gene mutations and chromosomal aberrations on progression-free survival in chronic lymphocytic leukemia patients treated with front-line chemoimmunotherapy: Clinical practice experience. Leukemia Research. Oxford: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2019, roč. 81, JUN 2019, s. 75-81. ISSN 0145-2126. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.leukres.2019.04.015.

FOLTA, Adam, Martin ČULEN, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Zdeňka HERUDKOVÁ, Nikola TOM, Tereza HLUBINKOVÁ, Veronika JANEČKOVÁ, Anna ĎURINÍKOVÁ, Jan VYDRA, Lukáš SEMERÁD, Dana DVOŘÁKOVÁ, Hana REMEŠOVÁ, Ela CEROVSKÁ, Petr CETKOVSKÝ, Pavel JINDRA, Tomáš SZOTKOWSKI, Pavel ŽÁK, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Prognostic significance of mutation profile at diagnosis and mutation persistence during disease remission in adult acute myeloid leukaemia patients. British journal of haematology. England: Wiley-Blackwell, 2019, roč. 186, č. 2, s. 300-310. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.15916.

ĎURINÍKOVÁ, Anna, A FOLTA, Martin ČULEN, Zdeňka KOŠÁŘOVÁ, Nikola TOM, Dagmar AL TUKMACHI, Petr CETKOVSKÝ, P. JINDRA, Tomáš SZOTKOWSKI, P. ŽÁK, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Ivana JEŽÍŠKOVÁ. Vícečetné mutace genu NRAS u pacientů s akutní myeloidní leukémií. In XXXIII. Olomoucké hematologické dny, Olomouc. 2019.

ĎURINÍKOVÁ, Anna, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Dagmar AL TUKMACHI, Zdeňka HERUDKOVÁ, Martin ČULEN, Dana DVOŘÁKOVÁ, Nikola TOM, P. CETKOVSKÝ, P. JINDRA, T. SZOTKOWSKI, P. ŽÁK, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. A quarter of NRAS positive patients carry multiple point mutations, each of them localised separately in different alleles. In 23rd Congress of the European Hematology Association, Stockholm, Sweden in HemaSphere. 2018.

ŠPUNAROVÁ, Michaela, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Marek BORSKÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Anna PANOVSKÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Kristina ĎURECHOVÁ, A. BRZOBOHATÁ, Anna FREIBERGEROVÁ, Marie JAROŠOVÁ, Marek MRÁZ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. Genetic aberrations and progression-free survival in CLL patients treated with front line rituximab-based chemoimmunotherapy (FCR/BR): clinical practice experience. In 23rd Congress of the European Hematology Association, Stockholm, Sweden in HemaSphere. 2018.

ŠPUNAROVÁ, Michaela, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Marek BORSKÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Anna PANOVSKÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Andrea BRZOBOHATÁ, Anna FREIBERGEROVÁ, Marek MRÁZ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. Genetické aberace a doba do progrese onemocnění u pacientů s CLL léčených režimy FCR nebo BR v 1. linii. In I. Český hematologický a transfuziologický sjezd, Praha. 2018.

KUBEŠOVÁ, Blanka, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Boris TICHÝ, Karla PLEVOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Kristýna FIEDOROVÁ, M. SLAVIKOVA, Vojtěch BYSTRÝ, Jarmila KISSOVÁ, B. GISSLINGER, H. GISSLINGER, Miroslav PENKA, Jiří MAYER, R. KRALOVICS, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Low-burden TP53 mutations in chronic phase of myeloproliferative neoplasms: association with age, hydroxyurea administration, disease type and JAK2 mutational status. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2018, roč. 32, č. 2, s. 450-461. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/leu.2017.230.

ĎURINÍKOVÁ, Anna, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Dagmar AL TUKMACHI, Zdeňka HERUDKOVÁ, Martin ČULEN, Dana DVOŘÁKOVÁ, Nikola TOM, Petr CETKOVSKÝ, P. JINDRA, Tomáš SZOTKOWSKI, P. ŽÁK, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Mutace v genu NRAS u pacientů s akutní myeloidní leukemii. In I. Český hematologický a transfuziologický sjezd, Praha in Transfuze a hematologie dnes. 2018.

ČULEN, Martin, Zdeňka HERUDKOVÁ, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA, Nikola TOM, Ondřej VENGLÁŘ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Persistence of mutations during remission in 114 AML patients. In Blood. 2018. ISSN 0006-4971.

FOLTA, Adam, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Anna ĎURINÍKOVÁ, Martin ČULEN, Zdeňka HERUDKOVÁ, Nikola TOM, Tereza HLUBINKOVÁ, Petr CETKOVSKÝ, P. JINDRA, Tomáš SZOTKOWSKI, P. ŽÁK, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Perzistence mutací v genech asociovaných s klonální hematopoézou v remisi onemocnění zhoršuje celkové přežití pacientů s akutní myeloidní leukemií (AML). In I. Český hematologický a transfuziologický, Praha in Transfuze a hematologie dnes. 2018.

HERUDKOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Veronika JANEČKOVÁ, Jana ČERNÁ, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Lukáš SEMERÁD, Zuzana ŠUSTKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Studium klonality AML v imunodeficientním myším modelu. In .I. Český hematologický a transfuziologický sjezd, Praha in Transfuze a hematologie dnes. 2018.

LOJA, Tomáš, Zdeňka HERUDKOVÁ, Martin ČULEN, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Jana ČERNÁ, Nikola TOM, Dana DVOŘÁKOVÁ, Zuzana ŠUSTKOVÁ, Lukáš SEMERÁD a Zdeněk RÁČIL. Study of AML clonality in NGS mouse. In 33rd Congress of the International Society for Advancement of Cytometry, Praha. 2018.

ČULEN, Martin, Zdeňka KOSAŘOVÁ, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Jana CHOVANCOVÁ, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Vojtěch BYSTRÝ, V. JANECKOVA, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. The influence of mutational status and biological characteristics of acute myeloid leukemia on xenotransplantation outcomes in NOD SCID gamma mice. Journal of cancer research and clinical oncology. New York: Springer-Verlag, 2018, roč. 144, č. 7, s. 1239-1251. ISSN 0171-5216. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00432-018-2652-2.

TOM, Nikola, O. TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Blanka KUBEŠOVÁ, T. RAUSCH, M. KOLARIK, V. BENES, Vojtěch BYSTRÝ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. ToTem: a tool for variant calling pipeline optimization. BMC Bioinformatics. London: BioMed Central, 2018, roč. 19, JUN, s. 243-251. ISSN 1471-2105. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12859-018-2227-x.

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, A. BASU, Nikola TOM, V. JHA, S. HODAWADEKAR, Lenka RADOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a M.L. ATCHISON. Transcription factor YY1 can control AID-mediated mutagenesis in mice. EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. HOBOKEN: WILEY, 2018, roč. 48, č. 2, s. 273-282. ISSN 0014-2980. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/eji.201747065.

SMITALOVÁ, Dagmar, Nikola TOM, Tomáš JURČEK, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ. Ultrasensitive detection of TKI resistant mutations using Illumina NGS in chronic myeloid leukemia patients. In CEITEC PHD and POSDOC RETREAT. 2018.

ROMŽOVÁ, Marianna, Dagmar SMITALOVÁ, Nikola TOM, Tomáš JURČEK, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Ultra-sensitive detection of tyrosine kinase inhibitor resistant mutations in chronic myeloid leukemia patients using Miseq Illumina next generation sequencing platform. In 23rd Congress of the European Hematology Association, Stockholm, Sweden in HemaSphere. 2018.

SMITALOVÁ, Dagmar, Nikola TOM, Tomáš JURČEK, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ. Ultrasenzitivní detekce mutací způsobujících rezistenci na tyrozinkinázové inhibitory s použitím Illumina NGS platformy u pacientů s chronickou myeloidní leukémií. In XXXII. Olomoucké hematologické dny 2018, s. 32. 2018.

TOM, Nikola, Filip PARDY, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Základní bioinformatické pojmy a postupy využívané pro analýzu DNA pomocí sekvenování nové generace. Transfuze a hematologie dnes. Praha: Společnost pro transfuzní lékařství a Česká hematologická společnost ČLS JEP, 2018, roč. 24, č. 3, s. 174-180. ISSN 1213-5763.

HLOŽKOVÁ, Michaela, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Marek BORSKÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Anna PANOVSKÁ, Eva DIVÍŠKOVÁ, Marek MRÁZ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. Dopad rekurentních mutací na dobu do progrese po terapiích zahrnujících rituximab v 1. linii u pacientů s CLL. In XXXI. Olomoucké hematologické dny. 2017.

ŠPUNAROVÁ, Michaela, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Marek BORSKÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Anna PANOVSKÁ, Eva DIVÍŠKOVÁ, Marek MRÁZ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. Impact of recurrent mutations on progression-free survival in CLL patients treated with front line rituximab-based regimens. In 22nd congress of EHA, Madrid, Španělsko, červen 2017 in Haematologica (2017). 2017.

FOLTA, A., Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Nikola TOM, Martin ČULEN, Zdeňka KOSAŘOVÁ, Anna ĎURINÍKOVÁ, Petr CETKOVSKÝ, P. JINDRA, Tomáš SZOTKOWSKI, P. ŽÁK a Zdeněk RÁČIL. Mutational analysis of 206 DE NOVO AML patients below 60 years with curative therapy in Czech republic. In Annals of Hematology. 2017.

FOLTA, A., Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Nikola TOM, Martin ČULEN, Zdeňka KOSAŘOVÁ, Anna ĎURINÍKOVÁ, Petr CETKOVSKÝ, P. JINDRA, Tomáš SZOTKOWSKI, P. ŽÁK, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Mutational analysis of 231 de novo AML patients below 60 years with curative therapy. In 22th Congress of EHA, Madrid, Španělsko, červen 2017, in Haematologica (2017); 102. 2017.

KOSAŘOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA, Jana CHOVANCOVÁ, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Dana DVOŘÁKOVÁ, Zuzana ŠUSTKOVÁ, Lukáš SEMERÁD a Zdeněk RÁČIL. Simulation of AML clonality in NOD SCID GAMMA mouse. In Acute Leukemias 17 in Annals of Hematology. 2017.

KOSAŘOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA, Jana CHOVANCOVÁ, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Dana DVOŘÁKOVÁ, Zuzana ŠUSTKOVÁ, Lukáš SEMERÁD a Zdeněk RÁČIL. Simulation of AML clonality in NSG mouse. In CEITEC PHD RETREAT II, Telč. 2017.

KOSAŘOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA, Veronika JANEČKOVÁ, Jana ČERNÁ, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Lukáš SEMERÁD, Zuzana ŠUSTKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Simulation of AML clonality in patient-derived xenografts. In 59th ASH Annual Meeting and Exposition, USA, Atlanta. 2017.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Marek BORSKY, Karla PLEVOVÁ, Jana SMARDOVA, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Martin TRBUSEK, Eva DIVISKOVA, Hana FRANCOVA SKUHROVA, Veronika NAVRKALOVÁ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVA, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Single cell analysis revealed a coexistence of NOTCH1 and TP53 mutations within the same cancer cells in chronic lymphocytic leukaemia patients. British journal of haematology. Hoboken: Wiley, 2017, roč. 178, č. 6, s. 979-982. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.14176.

KOSAŘOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA, Jana CHOVANCOVÁ, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Lukáš SEMERÁD, Zuzana ŠUSTKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ a Zdeněk RÁČIL. Studium klonality AML v imunodeficientní myši. In XXXI. Olomoucké hematologické dny. 2017.

TOM, Nikola, Ondřej TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Blanka KUBEŠOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. ToTem – a tool for automated optimization of variant calling pipelines. In Curie-Pasteur-CEITEC joint young scientist retreat. 2017.

TOM, Nikola, Ondřej TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Blanka KUBEŠOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. ToTem – automated software solution for program selection and parameter optimization. In CEITEC PHD RETREAT II, Telč. 2017.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Tracking Low-Burden TP53-mutated subclones during CLL treatment and remission using ROR1 separation. In XVII International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia. 2017.

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Martin TRBUŠEK, M. ATCHISON a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Activation induced deaminase splice variants expressed in B cell leukemia and lymphoma do not retain their catalytic activity. In Haematologica (2016); 101(s1): 429-430. (21st Congress of the EHA). 2016.

MAREČKOVÁ, Andrea, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, David ŠÁLEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. ATM gene mutations represent a hallmark of mantle cell lymphoma but do not impact patients survival. In Haematologica (2016); 101(s1): 271 (21st Congress of the EHA). 2016.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Ondřej TOM a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Cancer clonal evolution and mutational patterns in leukemia patients and development of software for variant calling. In EMBO Bioinformatics and Comparative Genome Analyses, Turecko, květen 2016. 2016.

BENCÚROVÁ, Petra, Jiří BALOUN, Kateřina MUSILOVÁ, Karol PÁL, Nikola TOM, Jakub HYNŠT, Lenka RADOVÁ, Martin PAIL, Eva BRICHTOVÁ, Markéta HERMANOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Marek MRÁZ a Milan BRÁZDIL. Identification of miRNA expression profiles in human mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis. In 12th European Congress on Epileptology. 2016.

PARDY, Filip, Boris TICHÝ, Karol PÁL, Nikola TOM, Kateřina ČERNÁ, Marek MRÁZ a Kristýna HRAZDILOVÁ. Introduction of nanopore sequencing to genomic core facility RNA workflows. In London calling, Londýn, květen 2016. 2016.

KUBEŠOVÁ, Blanka, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Boris TICHÝ, Karla PLEVOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Kristýna FIEDOROVÁ, Jarmila KISSOVÁ, B. GISSLINGER, H. GISSLINGER, Jiří MAYER, Robert KRALOVICS, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Low-Burden TP53 mutations occur in chronic phase of myeloproliferative neoplasms regardless of hydroxyurea administration, disease type and JAK2 status. In Blood (2016); s. 4284. (58th ASH Annual Meeting and Exposition, San Diego, USA, prosinec 2016). 2016.

KUBEŠOVÁ, Blanka, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Boris TICHÝ, Karla PLEVOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Kristýna FIEDOROVÁ, Jarmila KISSOVÁ, H. GISSLINGER, Jiří MAYER, Robert KRALOVICS, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Minoritní klony s mutací genu TP53 se vyskytují v chronické fázi myeloproliferativních neoplázií nezávisle na léčbě hydroxyureou. In 17. Pražský hematologický den, Praha. 2016.

FOLTA, Adam, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Nikola TOM, Lukáš SEMERÁD, Z. ŠUSTKOVÁ, Martin ČULEN, Zdeňka KOSAŘOVÁ, Pavel ŽÁK, Tomáš SZOTKOWSKI, Pavel JINDRA, Petr CETKOVSKÝ a Zdeněk RÁČIL. Mutační analýza u de novo AML pacientů s kurativní terapií v České republice. In 17. Pražský hematologický den, Praha. 2016.

HLOŽKOVÁ, Michaela, Jana FIGULOVÁ, Veronika NAVRKALOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Nikola TOM, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. Mutations in SF3B1 gene are selected independently on ATM/TP53 status and reduce the time to first treatment in CLL patients. In Haematologica (2016); 101(s1): 417 (21st Congress of the EHA). 2016.

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, M. ATCHISON a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Studium funkce sestřihových variant aktivací indukované deaminázy. In XL. brněnské onkologické dny (Klinická Onkologie (2016); 29(s2): 2S120). 2016.

ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, M. ATCHISON a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Studium funkčních vlastností sestřihových variant aktivací indukované deaminázy exprimovaných u B buněčných malignit. Klinická onkologie. Praha: Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně, 2016, roč. 29, Supplementum 2, s. 142-143. ISSN 0862-495X.

FOLTA, Adam, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Nikola TOM, Lukáš SEMERÁD, Zuzana ŠUSTKOVÁ, Martin ČULEN, Zdeňka KOSAŘOVÁ, Pavel ŽÁK, Tomáš SZOTKOWSKI, Pavel JINDRA, Petr CETKOVSKÝ a Zdeněk RÁČIL. Studium heterogenity mutací v průběhu terapie pacientů s akutní myeloidní leukémií. In XX. Celostátní konference DNA diagnostiky, Dolní Morava. 2016.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Boris TICHÝ, Barbara KANTOROVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Lenka RADOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Filip PARDY, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Marek MRÁZ, Karla PLEVOVÁ, Eva DIVÍŠKOVÁ, Alexandra OLTOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. Detailed analysis of therapy-driven clonal evolution of TP53 mutations in chronic lymphocytic leukemia. Leukemia. London: NATURE PUBLISHING GROUP, 2015, roč. 29, č. 4, s. 877-885. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/leu.2014.297.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Gabriela PAVLASOVÁ, Michal JEŽ, Nikola TOM, Filip PARDY, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER, Jaroslav KOČA, R. CALOGERO, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNA involvement in DNA damage response and BCR signaling in malignant B cells. In AACR Annual Meeting 2015. 2015.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Gabriela PAVLASOVÁ, Michal JEŽ, Nikola TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER, Jaroslav KOČA, M. ARIGONI, F. RICARDO, R. CALOGERO, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNAs in DNA damage response and BCR signaling in malignant B cells. In MicroRNAs and Noncoding RNAs in Cancer. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Vasileios BIKOS, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show feature sof somatic hypermutation process with prominent diference between IGHV mutated and unmutated chronci lymphocytic leukemia. In CEITEC PhD Retreat. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Marek MRÁZ, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show features of somatic hypermutation process with prominent difference between IGHV mutated and unmutated chronic lymphocytic leukemia. In 20th Congress of the European Hematology Association in Haematologica. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Vasileios BIKOS, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show features of somatic hypermutation process with prominent difference between IGHV mutated and unmutated chronic lymphocytic leukemia. In International Workshop Algorithmics, Bioinformatics and Statistics for NGS data analysis. 2015.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Martin TRBUŠEK, Nikola TOM, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Sim TRUONG, Eva DIVISKOVA, Jana KOTAŠKOVÁ, Alexandra OLTOVÁ, Nancy PATTEN, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. TP53 mutation analysis in chronic lymphocytic leukemia: comparison of different detection methods. Tumor Biology. Dordrecht: Springer, 2015, roč. 36, č. 5, s. 3371-3380. ISSN 1010-4283. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s13277-014-2971-0.

LEXA, Matej, Lenka RADOVÁ, Martin LYSÁK, Tomáš MARTÍNEK, Nikola TOM, Karol PÁL, Alexandru POPA a Jana KAPUSTOVÁ. Bioinformatics Summer School 2014: Theoretical and practical aspects of processing and analysis of sequencing data. 2014. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.13140/RG.2.1.4517.0721.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Filip PARDY, Nikola TOM, Kateřina MUSILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jaroslav KOČA, Calogero RINOLDO, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. Biological and clinical relevance of mirnas induced in chronic lymphocytic leukemia (CLL) cells during administration of therapy in vivo and in vitro. 2014. ISSN 0390-6078.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Boris TICHÝ, Barbara KANTOROVÁ, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Vasileios BIKOS, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. Deep sequencing for detailed analysis of TP53 mutations clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia. In 1st International conference on new concepts in B-cell malignancies, Řecko. 2014.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Boris TICHÝ, Barbara KANTOROVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Filip PARDY, Lenka RADOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. Deep sequencing for identification of minor-clone TP53 mutations before their clonal selection by therapy in chronic lmyphocytic leukemia. In 16th International p53 workshop, Švédsko. 2014.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Nikola TOM, Filip PARDY, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER a Jaroslav KOČA. Identification of microRNAs involved in DNA damage response in malignant B cells and their biological and clinical relevance. In AACR Annual Meeting, San Diego. 2014.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Kateřina MUSILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jaroslav KOČA, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. Identification of microRNAs involved in DNA damage response in malignant B cells and their biological and clinical relevance. In CEITEC Annual Conference "Frontiers in Material and Life Sciences. 2014.

KANTOROVÁ, Barbara, Veronika NAVRKALOVÁ, Boris TICHÝ, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Sylvia TAKÁČOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Martin TRBUŠEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulární prognostické markery chronické lymfocytární leukemie a význam sekvenování nové generace při studiu patogeneze onemocnění. In XXIII. Olomoucké hematologické dny, Olomouc. 2014.

KUBEŠOVÁ, Blanka, Šárka PAVLOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Michael DOUBEK, Róbert KRÁLOVICS a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutace genu TP53 u pacientů s myeloproliferativními neoplasiemi. In XXI. Biologické dny, Brno. 2014.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Veronika NAVRKALOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Kamila BRÁZDILOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Eva DIVÍŠKOVÁ, Marek BORSKÝ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Martin TRBUŠEK, Alexandra OLTOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Prognostic impact of NOTCH1 hotspot mutation in TP53-mutated patients with chronic lymphocytic leukemia. In 56th ASH Annual Meeting and Exposition, USA. 2014.

KUBEŠOVÁ, Blanka, Šárka PAVLOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Michael DOUBEK, Róbert KRÁLOVICS a Šárka POSPÍŠILOVÁ. TP53 mutations in chronic phase of myeloproliferative neoplasias. In 16th International p53 workshop, Švédsko. 2014.

KANTOROVÁ, Barbara, Veronika NAVRKALOVÁ, Boris TICHÝ, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Sylvia TAKÁČOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Martin TRBUŠEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Význam mutační analýzy prognostických markerů u chronické lymfocytární leukemie s využitím přístupů další generace sekvenováním. In Kaprasův den - Klinická genetika, Praha. 2014.

STAŇO KOZUBÍK, Kateřina, Jitka MALČÍKOVÁ, Martin TRBUŠEK, Nikola TOM, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Boris TICHÝ. Clonal selection of TP53 mutations in chronic lymphocytic leukaemia detected by ultra-deep pyrosequencing. In 22nd Biennial Congress of the European association for cancer research in European Journal of Cancer. 2012.

TRBUŠEK, Martin, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Ludmila ŠEBEJOVÁ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, M. SVITÁKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Marek MRÁZ, Karla PLEVOVÁ, V. VRÁNOVÁ, Nikola TOM, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Boris TICHÝ. Deep sequencing identifies TP53 mutations before their clonal selection by therapy in chronic lymphocytic leukemia. In 17th Congress of the European Hematology Association in Haematologica, the hematology journal. 2012.

TICHÝ, Boris, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Jitka MALČÍKOVÁ, Martin TRBUŠEK, Nikola TOM, Jana ŠMARDOVÁ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Detekce klonální selekce u CLL pacientů pomocí ultra-deep sekvenování. In XVI. Česko-slovenský hematologický a transfuziologický sjezd, Brno. 2012.

PLEVOVÁ, Karla, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikos DARZENTAS, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Lenka JURAČKOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Genomic copy number alternations in high-risk CLL patients harboring TP53 defects: insights from consecutive investigations. In 17th Congress of the European Hematology Association in Haematlogica - the Hematology Journal. 2012.

PLEVOVÁ, Karla, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Nikos DARZENTAS, Kateřina BURČKOVÁ, Kamila BRÁZDILOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Lenka JURAČKOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK, Boris TICHÝ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulárně genetické aspekty klonální evoluce chronické lymfocytární leukémie. In XVI. Česko-slovenský hematologický a transfuziologický sjezd, Brno. 2012.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana KMÍNKOVÁ, Boris TICHÝ, Veronika NAVRKALOVÁ, Barbora DVOŘÁKOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Martin TRBUŠEK, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Nikola TOM, Karol PÁL, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulárně-biologické přístupy mutační analýzy genu TP53 u onkologických pacientů. In XXXVI. Brněnské onkologické dny. 2012.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana KMÍNKOVÁ, Veronika NAVRKALOVÁ, Barbora DVOŘÁKOVÁ, Boris TICHÝ, Jana ŠMARDOVÁ, Martin TRBUŠEK, Sim TRUONG, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Nikola TOM, Karol PÁL, Ludmila ŠEBEJOVÁ, Nancy PATTEN, Lin WU, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutational analysis of TP53 gene in chronic lymphocytic leukemia: comparison of different methodological approaches. In 54th ASH Annual Meeting and Exposition, Atlanta, USA in Blood. 2012.

STAŇO KOZUBÍK, Kateřina, Jitka MALČÍKOVÁ, Martin TRBUŠEK, Nikola TOM, Jana ŠMARDOVÁ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Boris TICHÝ. "ULTRA-DEEP" sekvenování identifikuje TP53 mutace před jejich klonální selekcí léčbou u chronické lymfocytární leukémie. In Konference mladých v Chemické listy 106(5). 2012. ISSN 0009-2770.

TICHÝ, Boris, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Nikola TOM, Jana LOCHMANOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Detection of clonal evolution and subclonal heterogeneity in chronic lymphocytic leukemia using deep sequencing of antioncogene TP53. In Cancer Genomics. 2011.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Martin TRBUŠEK, Nikola TOM, Jana ŠMARDOVÁ, Boris TICHÝ, Petr KUGLÍK, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Identification of minor proportion p53 mutations selected later by therapy. In XIV. International workshop on chronic lymphocytic leukemia in Clinical Lymphoma, Myeloma and Leukemia. 2011. ISSN 2152-2650.