-
Adenosine (de)methylation on the crossroads of RNA and DNA synthesis a - Konferenční abstraktKRISHNA, Shwetha; Aleš OBRDLÍK; Praveenkumar RENGARAJ; Veronika ŠEMBEROVÁ RÁJECKÁ; Anton ZUEV; Helena PESCHELOVÁ; Veronika KOZLOVÁ; Michal ŠMÍDA; David POTĚŠIL; Jana DOBROVOLNÁ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Adenosine (de)methylation on the crossroads of RNA and DNA synthesis. In Microsymposium on RNA Biology, Vienna, 2025. 2025.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2552881/cs
-
FTO m6A RNA demethylase is important for proper DNA replication in human cells, TALK, Heidelberg, The epitranscriptome a - Konferenční abstraktKRISHNA, Shwetha; Aleš OBRDLÍK; Anton ZUEV; Praveenkumar RENGARAJ; Maria ZLOBINA; Helena PESCHELOVÁ; Veronika KOZLOVÁ; Michal ŠMÍDA; Jana DOBROVOLNÁ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. FTO m6A RNA demethylase is important for proper DNA replication in human cells, TALK, Heidelberg, The epitranscriptome. In EMBO workshop: The Epitranscriptome, Heidelberg. 2025.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2553020/cs
-
Global analysis by LC-MS/MS of N6-methyladenosine and inosine in mRNA reveal complex incidence J - Článek v odborném periodikuSTEJSKAL, Stanislav; Veronika ŠEMBEROVÁ RÁJECKÁ; Helena COVELO MOLARES; Ketty SINIGAGLIA; Květoslava BROŽINOVÁ; Linda KAŠIAROVÁ; Michaela DOHNÁLKOVÁ; Paul Eduardo REYES-GUTIERREZ; Hana CAHOVÁ; Liam KEEGAN; Mary Anne O'CONNELL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Global analysis by LC-MS/MS of N6-methyladenosine and inosine in mRNA reveal complex incidence. RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2025, roč. 31, č. 4, s. 514-528. ISSN 1355-8382. Dostupné z: https://doi.org/10.1261/rna.080324.124.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2508622/cs
-
Tackling the molecular function of the human RNA demethylase ALKBH5 a - Konferenční abstraktRENGARAJ, Praveenkumar; Aleš OBRDLÍK; Michaela DOHNÁLKOVÁ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Tackling the molecular function of the human RNA demethylase ALKBH5. In Microsymposium on RNA Biology, Vienna. 2025.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2552898/cs
-
The role of alkbh5 molecular interactions in mRNA processing, POSTER, Heidelberg, The epitranscriptome a - Konferenční abstraktRENGARAJ, Praveenkumar; Aleš OBRDLÍK; Shwetha KRISHNA; Michaela DOHNÁLKOVÁ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The role of alkbh5 molecular interactions in mRNA processing, POSTER, Heidelberg, The epitranscriptome. In EMBO workshop: The Epitranscriptome, Heidelberg. 2025.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2553021/cs
-
Endosome rupture enables enteroviruses from the family Picornaviridae to infect cells J - Článek v odborném periodikuISHEMGULOVA, Aygul; Liya MUKHAMEDOVA; Zuzana TREBICHALSKÁ; Veronika ŠEMBEROVÁ RÁJECKÁ; Pavel PAYNE; Lenka ŠMERDOVÁ; Jana MORAVCOVÁ; Dominik HREBÍK; David BUCHTA; Karel ŠKUBNÍK; Tibor FÜZIK; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Jiří NOVÁČEK a Pavel PLEVKA. Endosome rupture enables enteroviruses from the family Picornaviridae to infect cells. Communications Biology. BERLIN: Nature Research, 2024, roč. 7, č. 1, s. 1-12. ISSN 2399-3642. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s42003-024-07147-9.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2460758/cs
-
m6A sites in the coding region trigger translation-dependent mRNA decay J - Článek v odborném periodikuZHOU, You; Miona COROVIC; Peter HOCH-KRAFT; Nathalie MEISER; Mikhail MESITOV; Nadine KOERTEL; Hannah BACK; Vries Isabel S NAARMANN-DE; Kritika Suresh KATTI; Aleš OBRDLÍK; Anke BUSCH; Christoph DIETERICH; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Martin HENGESBACH; Kathi ZARNACK a Julian KOENIG. m6A sites in the coding region trigger translation-dependent mRNA decay. Molecular Cell. Cambridge: Cell Press, 2024, roč. 84, č. 23, s. 1-31. ISSN 1097-2765. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.molcel.2024.10.033.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2461897/cs
-
Analysis of chimeric reads characterises the diverse targetome of AGO2-mediated regulation J - Článek v odborném periodikuHEJRET, Václav; Nandan Mysore VARADARAJAN; Eva KLIMENTOVÁ; Katarína GREŠOVÁ; Ilektra-Chara GIASSA; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Analysis of chimeric reads characterises the diverse targetome of AGO2-mediated regulation. Scientific Reports. Nature Research, 2023, roč. 13, č. 1, s. 1-9. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-023-49757-z.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2378640/cs
-
EMBO workshop - Eukaryotic RNA turnover and viral biology M - Uspořádání konferenceVAŇÁČOVÁ, Štěpánka a Šárka FAJTLOVÁ. EMBO workshop - Eukaryotic RNA turnover and viral biology. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2375921/cs
-
ISG20L2: an RNA nuclease regulating T cell activation J - Článek v odborném periodikuRODRIGUEZ-GALAN, Ana; Sara G DOSIL; Anna VLČKOVÁ; Lola FERNANDEZ-MESSINA; Zuzana FEKETOVÁ; Julie POKORNÁ; Irene FERNANDEZ-DELGADO; Emilio CAMAFEITA; Manuel Jose GOMEZ; Marta RAMIREZ-HUESCA; Cristina GUTIERREZ-VAZQUEZ; Fatima SANCHEZ-CABO; Jesus VAZQUEZ; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Francisco SANCHEZ-MADRID. ISG20L2: an RNA nuclease regulating T cell activation. Cellular and molecular life sciences. BASEL: BIRKHAUSER VERLAG AG, 2023, roč. 80, č. 9, s. 1-19. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00018-023-04925-2.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2375338/cs
-
The role of long non-coding RNAs in BCR-mediated CLL activation. a - Konferenční abstraktFARIA ZENI, Pedro; Michaela MEDKOVÁ; K. TRACHTOVÁ; L. JANSKÁ; Václav ŠEDA; Eva HOFERKOVÁ; Nandan Mysore VARADARAJAN; Sonali SHARMA; Aleš OBRDLÍK; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; A. MAIQUES-DIAZ; JI. MARTÍN-SUBERO a Marek MRÁZ. The role of long non-coding RNAs in BCR-mediated CLL activation. In CEITEC PhD Conference, Brno. 2023.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2359982/cs
-
HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 reveals interactions with fully processed substrate tRNAs and with specific noncoding RNAs J - Článek v odborném periodikuCAVALLIN, Ivana; Marek BARTOŠOVIČ; Tomáš SKALICKÝ; Praveenkumar RENGARAJ; Martin DEMKO; Martina Christina SCHMIDT-DENGLER; Aleksej DRINO; Mark HELM a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 reveals interactions with fully processed substrate tRNAs and with specific noncoding RNAs. RNA. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2022, roč. 28, č. 12, s. 1568-1581. ISSN 1355-8382. Dostupné z: https://doi.org/10.1261/rna.079421.122.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2252337/cs
-
Noncanonical small RNA chimeras identified by AGO2-CLASH a - Konferenční abstraktHEJRET, Václav; Nandan Mysore VARADARAJAN; Eva KLIMENTOVÁ; Ilektra-Chara GIASSA; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Noncanonical small RNA chimeras identified by AGO2-CLASH. In 16th Microsymposium on RNA Biology. 2022.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1855257/cs
-
The mechanical regulation of RNA binding protein hnRNPC in the failing heart J - Článek v odborném periodikuMARTINO, Fabiana; Nandan Mysore VARADARAJAN; Ana Rubina PERESTRELO; Václav HEJRET; Helena DURIKOVA; Dragana VUKIĆ; Vladimir HORVATH; Francesca CAVALIERI; Frank CARUSO; Waleed S ALBIHLAL; Andre P GERBER; Mary Anne O'CONNELL; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Stefania PAGLIARI a Giancarlo FORTE. The mechanical regulation of RNA binding protein hnRNPC in the failing heart. Science Translational Medicine. Washington: American Association for the Advancement of Science, 2022, roč. 14, č. 672, s. 1-17. ISSN 1946-6234. Dostupné z: https://doi.org/10.1126/scitranslmed.abo5715.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2265424/cs
-
Interplays of different types of epitranscriptomic mRNA modifications J - Článek v odborném periodikuRENGARAJ, Praveenkumar; Aleš OBRDLÍK; Dragana VUKIĆ; Nandan Mysore VARADARAJAN; Liam KEEGAN; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Mary Anne O'CONNELL. Interplays of different types of epitranscriptomic mRNA modifications. RNA Biology. Philadelphia: Taylor & Francis Inc, 2021, roč. 18, S1, s. 19-30. ISSN 1547-6286. Dostupné z: https://doi.org/10.1080/15476286.2021.1969113.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1837044/cs
-
Open Week d - Popularizační texty a aktivityPodrobněji: https://is.muni.cz/publication/1846768/cs
-
The comprehensive interactomes of human adenosine RNA methyltransferases and demethylases reveal distinct functional and regulatory features J - Článek v odborném periodikuCOVELO MOLARES, Helena; Aleš OBRDLÍK; I. POSTULKOVA; Michaela DOHNÁLKOVÁ; Pavlína GREGOROVÁ; Sri Ranjani GANJI; David POTĚŠIL; L. GAWRIYSKI; M. VARJOSALO a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The comprehensive interactomes of human adenosine RNA methyltransferases and demethylases reveal distinct functional and regulatory features. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, č. 19, s. 10895-10910. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkab900.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1835965/cs
-
DIS3L2 and LSm proteins are involved in the surveillance of Sm ring-deficient snRNAs J - Článek v odborném periodikuROITHOVA, A.; Zuzana FEKETOVÁ; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a D. STANEK. DIS3L2 and LSm proteins are involved in the surveillance of Sm ring-deficient snRNAs. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, č. 11, s. 6184-6197. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkaa301.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1746813/cs
-
Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition J - Článek v odborném periodikuYADAV, Deepak Kumar; Dagmar ZIGÁČKOVÁ; Maria ZLOBINA; Tomáš KLUMPLER; Christelle BEAUMONT; Monika KUBÍČKOVÁ; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Peter LUKAVSKY. Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, č. 4, s. 2091-2106. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkz1163.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1720519/cs
-
Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition a - Konferenční abstraktYADAV, Deepak Kumar; Dagmar ZIGÁČKOVÁ; Maria ZLOBINA; Tomáš KLUMPLER; Christelle BEAUMONT; Monika KUBÍČKOVÁ; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Peter LUKAVSKY. Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition. In FEBS Congress 2019. 2019. ISSN 2211-5463.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1640523/cs
-
The role of RNA adenosine demethylases in the control of gene expression J - Článek v odborném periodikuRÁJECKÁ, Veronika; Tomáš SKALICKÝ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The role of RNA adenosine demethylases in the control of gene expression. Biochimica et biophysica acta - Gene regulatory mechanisms. Amsterdam: Elsevier, 2019, roč. 1862, č. 3, s. 343-355. ISSN 1874-9399. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.bbagrm.2018.12.001.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1538922/cs
-
Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge J - Článek v odborném periodikuJANTSCH, M.F.; A. QUATTRONE; Mary Anne O'CONNELL; M. HELM; M. FRYE; M. MACIAS-GONZALES; M. OHMAN; S. AMERES; L. WILLEMS; F. FUKS; A. OULAS; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; H. NIELSEN; C. BOUSQUET-ANTONELLI; Y. MOTORIN; J.Y. ROIGNANT; N. BALATSOS; A. DINNYES; P. BARANOV; V. KELLY; A. LAMM; G. RECHAVI; M. PELIZZOLA; J. LIEPINS; I.H. KHOLODNYUK; V. ZAMMIT; D. AYERS; F. DRABLOS; J.A. DAHL; J. BUJNICKI; C. JERONIMO; R. ALMEIDA; M. NEAGU; M. COSTACHE; J. BANKOVIC; B. BANOVIC; J. KYSELOVIC; L.M. VALOR; S. SELBERT; P. PIR; T. DEMIRCAN; V. COWLING; M. SCHAFER; W. ROSSMANITH; D. LAFONTAINE; A. DAVID; C. CARRE; F. LYKO; R. SCHAFFRATH; S. SCHWARTZ; A. VERDEL; A. KLUNGLAND; E. PURTA; G. TIMOTIJEVIC; F. CARDONA; A. DAVALOS; E. BALLANA; D. O CARROLL; J. ULE a R. FRAY. Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge. RNA BIOLOGY. PHILADELPHIA: TAYLOR & FRANCIS INC, 2018, roč. 15, č. 6, s. 829-831. ISSN 1547-6286. Dostupné z: https://doi.org/10.1080/15476286.2018.1460996.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1474618/cs
-
RNA methylation in nuclear pre-mRNA processing J - Článek v odborném periodikuCOVELO MOLARES, Helena; Marek BARTOŠOVIČ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. RNA methylation in nuclear pre-mRNA processing. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. Hoboken, USA: WILEY-BLACKWELL, 2018, roč. 9, č. 6, s. 1489-1505. ISSN 1757-7004. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/wrna.1489.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1479524/cs
-
Summer course on RNA protein interaction W - Uspořádání workshopuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka. Summer course on RNA protein interaction. 2018.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1524117/cs
-
The role of 3 ' end uridylation in RNA metabolism and cellular physiology J - Článek v odborném periodikuZIGÁČKOVÁ, Dagmar a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The role of 3 ' end uridylation in RNA metabolism and cellular physiology. PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES. LONDON: ROYAL SOC, 2018, roč. 373, č. 1762, s. 20180171-20180184. ISSN 0962-8436. Dostupné z: https://doi.org/10.1098/rstb.2018.0171.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1479521/cs
-
N6-methyladenosine demethylase FTO targets pre-mRNAs and regulates alternative splicing and 3'-end processing J - Článek v odborném periodikuBARTOŠOVIČ, Marek; Helena COVELO MOLARES; Pavlína GREGOROVÁ; Dominika HROŠŠOVÁ; G. KUDLA a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. N6-methyladenosine demethylase FTO targets pre-mRNAs and regulates alternative splicing and 3'-end processing. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 45, č. 19, s. 11356-11370. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkx778.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1409373/cs
-
TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs J - Článek v odborném periodikuUSTIANENKO, Dmytro; Josef PASULKA; Zuzana FEKETOVÁ; Lukáš BEDNAŘÍK; Dagmar ZIGÁČKOVÁ; Andrea FOŘTOVÁ; Mihaela ZAVOLAN a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs. EMBO JOURNAL. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2016, roč. 35, č. 20, s. 2179-2191. ISSN 0261-4189. Dostupné z: https://doi.org/10.15252/embj.201694857.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1354631/cs
-
RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs J - Článek v odborném periodikuHROŠŠOVÁ, Dominika; Tomáš ŠIKORSKÝ; David POTĚŠIL; Marek BARTOŠOVIČ; Josef PASULKA; Zbyněk ZDRÁHAL; Richard ŠTEFL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 8, s. 4236-4248. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkv240.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1311339/cs
-
Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation J - Článek v odborném periodikuTUDEK, Agnieszka; Odil Porrua FUERTE; Tomasz KABZINSKI; Michael LIDSCHREIBER; Karel KUBÍČEK; Andrea FOŘTOVÁ; Francoise LACROUTE; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Patrick CRAMER; Richard ŠTEFL a Domenico LIBRI. Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation. Molecular Cell. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2014, roč. 55, č. 3, s. 467-481. ISSN 1097-2765. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.031.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1182103/cs
-
Mammalian DIS3L2 exoribonuclease targets the uridylated precursors of let-7 miRNAs J - Článek v odborném periodikuUSTIANENKO, Dmytro; Dominika HROŠŠOVÁ; David POTĚŠIL; Kateřina CHALUPNÍKOVÁ; Kristýna HRAZDILOVÁ; Jiří PACHERNÍK; Kateřina CETKOVSKÁ; Stjepan ULDRIJAN; Zbyněk ZDRÁHAL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Mammalian DIS3L2 exoribonuclease targets the uridylated precursors of let-7 miRNAs. RNA. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2013, roč. 19, č. 12, s. 1632-1638. ISSN 1355-8382. Dostupné z: https://doi.org/10.1261/rna.040055.113.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1126856/cs
-
Air2p is critical for the assembly and RNA-binding of the TRAMP complex and the KOW domain of Mtr4p is crucial for exosome activation J - Článek v odborném periodikuHOLUB, Peter; Jana LALÁKOVÁ; Hana ČERNÁ; Josef PASULKA; Marie SÁRAZOVÁ; Kristýna HRAZDILOVÁ; Maria SAŇUDO ARCE; Fruzsina HÓBOR; Richard ŠTEFL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Air2p is critical for the assembly and RNA-binding of the TRAMP complex and the KOW domain of Mtr4p is crucial for exosome activation. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2012, roč. 40, č. 12, s. 5679-5693. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gks223.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/982490/cs
-
Serine phosphorylation and proline isomerization in RNAP II CTD control recruitment of Nrd1 J - Článek v odborném periodikuKUBÍČEK, Karel; Hana ČERNÁ; Peter HOLUB; Josef PASULKA; Dominika HROŠŠOVÁ; Frank LOEHR; Ctirad HOFR; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. Serine phosphorylation and proline isomerization in RNAP II CTD control recruitment of Nrd1. Genes & Development. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012, roč. 26, č. 17, s. 1891-1896. ISSN 0890-9369. Dostupné z: https://doi.org/10.1101/gad.192781.112.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988332/cs
-
TRAMP Stimulation of Exosome C - Kapitola resp. kapitoly v odborné knizeHOLUB, Peter a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. TRAMP Stimulation of Exosome. Online. In Guillaume F. Chanfreau; Fuyuhiko Tamanoi. The Enzymes: Eukaryotic RNases and their Partners in RNA Degradation and Biogenesis, Part A. Burlington: Elsevier Inc., 2012, s. 77-95. "Vol. 31"; Part A. ISBN 978-0-12-404740-2. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/B978-0-12-404740-2.00004-5.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1070119/cs
-
Recognition of transcription termination signal by the nuclear polyadenylated RNA-binding (Nab)3 protein J - Článek v odborném periodikuHÓBOR, Fruzsina; Roberto PERGOLI; Karel KUBÍČEK; Dominika HROŠŠOVÁ; Veronika BAČÍKOVÁ; Michal ZIMMERMANN; Josef PASULKA; Ctirad HOFR; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. Recognition of transcription termination signal by the nuclear polyadenylated RNA-binding (Nab)3 protein. The Journal of Biological Chemistry. Am. Soc. for Biochem. and Mol. Biol., 2011, roč. 286, č. 5, s. 3645-3657. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://doi.org/10.1074/jbc.M110.158774.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/907969/cs
-
1H, 13C, and 15N chemical shift assignments of ZCCHC9 J - Článek v odborném periodikuSAŇUDO ARCE, Maria; Martin JACKO; Christiane RAMMELT; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. 1H, 13C, and 15N chemical shift assignments of ZCCHC9. Biomolecular NMR Assignments. SPRINGER, 2010, roč. 5, č. 1, s. 19-21. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s12104-010-9257-2.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902553/cs
-
Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism J - Článek v odborném periodikuSAN PAOLO, Salvatore; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; L. SCHENK; T. SCHERRER; Diana BLANK; Walter KELLER a Andre P. GERBER. Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism. PLoS Genetics. Public Library of Science, 2009, roč. 5, č. 7, s. e1000555, 17 s. ISSN 1553-7390.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840500/cs
-
Distinct Roles of TRAMP complexes in yeast RNA Metabolism a - Konferenční abstraktVAŇÁČOVÁ, Štěpánka. Distinct Roles of TRAMP complexes in yeast RNA Metabolism. In Messenger RNA 3' ends and gene expression - EMBO workshop. 2009.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878314/cs
-
Functional characterization of TRAMP complex and its subunits a - Konferenční abstraktHOLUB, Peter a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Functional characterization of TRAMP complex and its subunits. In EMBO Young Investigator Programme PhD course. 2009.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878435/cs
-
Characterization of a specific 3'- end RNA modification and specific RNA- binding proteins a - Konferenční abstraktHROŠŠOVÁ, Dominika; Stjepan ULDRIJAN; Aleš HAMPL; Zbyněk ZDRÁHAL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Characterization of a specific 3'- end RNA modification and specific RNA- binding proteins. In RNA Club 2009. 2009. ISSN 1214-8598.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878322/cs
-
RNA Club 2009 M - Uspořádání konferenceVAŇÁČOVÁ, Štěpánka. RNA Club 2009. 2009.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878310/cs
-
RNA substrate selection by the TRAMP complex a - Konferenční abstraktVAŇÁČOVÁ, Štěpánka. RNA substrate selection by the TRAMP complex. In 9th EMBO Young Investigator Programme Meeting. 2009.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878318/cs
-
TRAMP-mediated spliceosomal intron turnover a - Konferenční abstraktLALÁKOVÁ, Jana a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. TRAMP-mediated spliceosomal intron turnover. In RNA Club 2009. 2009. ISSN 1214-8598.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/878323/cs
-
Draft genome sequence of the sexually transmitted pathogen Trichomonas vaginalis J - Článek v odborném periodikuCARLTON, Jane; R.P. HIRT; J.C. SILVA; A.L. DELCHER; M. SCHATZ; Q. ZHAO; J.R. WORTMAN; S.L. BIDWELL; U.C. ALSMARK; S. BESTEIRO; T. SICHERITZ-PONTEN; C.J. NOEL; J.B. DACKS; P.G. FOSTER; C. SIMILLION; Y. VAN DE PEER; D. MIRANDA-SAAVEDRA; G.J. BARTON; G.D. WESTROP; S. MULLER; D. DESSI; P.L. FIORI; Q. REN; I. PAULSEN; H. ZHANG; F.D. BASTIDA-CORCUERA; A. SIMOES-BARBOSA; M.T. BROWN; R. HAYES; M. MUKHERJEE; C.Y. OKUMURA; R. SCHNEIDER; A.J. SMITH; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; M. VILLALVAZO; B.J. HAAS; M. PERTEA; T. FELDBLYUM; T.R. UTTERBACK; Chung-Li SHU; K. OSOEGAWA; P.J. DE JONG; Ivan HRDY; Lenka HORVATHOVA; Zuzana ZUBACOVA; Pavel DOLEZAL; S.B. MALIK; J.Jr. LOGSDON; K. HENZE; A. GUPTA; C.C. WANG; R.L. DUNNE; J.A. UPCROFT; Peter UPCROFT; Owen WHITE; S.L. SALZBERG; P. TANG; Cheng-Hsun CHIU; Ying-Shiung LEE; T.M. EMBLEY; G.H. COOMBS; J.C. MOTTRAM; Jan TACHEZY; C. FRASER-LIGGETT a Patricia J. JOHNSON. Draft genome sequence of the sexually transmitted pathogen Trichomonas vaginalis. Science. 2007, roč. 315, č. 5809, s. 207-212. ISSN 0036-8075.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840506/cs
-
The exosome and RNA quality control in the nucleus J - Článek v odborném periodikuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka a Richard ŠTEFL. The exosome and RNA quality control in the nucleus. EMBO REPORTS. Nature Publishing Group, London, UK: Nature Publishing Group, London, UK, 2007, roč. 8, č. 7, s. 651-657. ISSN 1469-221X.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/719399/cs
-
A new yeast poly(A) polymerase complex involved in RNA quality control J - Článek v odborném periodikuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka; Jeannette WOLF; Georges MARTIN; Diana BLANK; Sabine DETTWILER; Arno FRIEDLEIN; Hanno LANGEN; Gerard KEITH a Walter KELLER. A new yeast poly(A) polymerase complex involved in RNA quality control. PLoS Biology. 2005, roč. 3, č. 6, s. e189, 12 s. ISSN 1544-9173.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840509/cs
-
Spliceosomal introns in a deep-branching eukaryote J - Článek v odborném periodikuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka; Y. WEIHONG; Jane M. CARLTON a Patricia J. JOHNSON. Spliceosomal introns in a deep-branching eukaryote. Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 2005, roč. 102, č. 12, s. 4430-4435. ISSN 1091-6490.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840510/cs
-
Malic enzymes of Trichomonas vaginalis: two enzyme families, two distinct origins J - Článek v odborném periodikuDOLEZAL, Pavel; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Jan TACHEZY a Ivan HRDY. Malic enzymes of Trichomonas vaginalis: two enzyme families, two distinct origins. Gene. Elsevier, 2004, roč. 329, March, s. 81-92. ISSN 0378-1119.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840512/cs
-
Targeted gene replacement of a ferredoxin gene in Trichomonas vaginalis does not lead to metronidazole resistance J - Článek v odborném periodikuLAND, K.M.; M.G. DELLGADILLO-CORREA; Jan TACHEZY; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; C.L. HSIEH; R. SUTAK a Patricia J. JOHNSON. Targeted gene replacement of a ferredoxin gene in Trichomonas vaginalis does not lead to metronidazole resistance. Molecular Microbiology. 2004, roč. 51, č. 1, s. 115-122. ISSN 0950-382X.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840516/cs
-
Molecular biology of the amitochondriate parasites, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica and Trichomonas vaginalis. J - Článek v odborném periodikuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka; D.R. LISTON; Jan TACHEZY a Patricia J. JOHNSON. Molecular biology of the amitochondriate parasites, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica and Trichomonas vaginalis. International Journal for Parasitology. Elsevier Science, 2003, roč. 33, č. 3, s. 235-255, 20 s. ISSN 0020-7519.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840519/cs
-
Trichomonas vaginalis initiator binding protein, IBP39, contains a novel DNA binding motif J - Článek v odborném periodikuLAU, A.O.T.; D.R. LISTON; Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Patricia J. JOHNSON. Trichomonas vaginalis initiator binding protein, IBP39, contains a novel DNA binding motif. Molecular and Biochemical Parasitology. ELSEVIER, 2003, roč. 130, č. 2, s. 167-171. ISSN 0166-6851.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840514/cs
-
Cattle pathogen Tritrichomonas foetus (Riedmuller, 1928) and pig commensal Tritrichomonas suis (Gruby & Delafond, 1843) belong to the same species J - Článek v odborném periodikuTACHEZY, Jan; Ruth TACHEZY; Vladimir HAMPL; Mirka SEDINOVA; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Martin VRLIK; Marc VAN RANST; Jaroslav FLEGR a Jaroslav KULDA. Cattle pathogen Tritrichomonas foetus (Riedmuller, 1928) and pig commensal Tritrichomonas suis (Gruby & Delafond, 1843) belong to the same species. The Journal of Eukaryotic Microbiology. 2002, roč. 49, č. 2, s. 154-163. ISSN 1066-5234.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840527/cs
-
Comparison of European Trichobilharzia species based on ITS1 and ITS2 sequences J - Článek v odborném periodikuDVORAK, Jan; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Vladimir HAMPL; Jaroslav FLEGR a Petr HORAK. Comparison of European Trichobilharzia species based on ITS1 and ITS2 sequences. Parasitology. UK, 2002, roč. 124, č. 3, s. 307-313. ISSN 0031-1820.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840529/cs
-
Mechanisms of in vitro development of resistance to metronidazole in Trichomonas vaginalis J - Článek v odborném periodikuRASOLOSON, Dominique; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Eva TOMKOVA; Jakub RAZGA; Ivan HRDY; Jan TACHEZY a Jaroslav KULDA. Mechanisms of in vitro development of resistance to metronidazole in Trichomonas vaginalis. Microbiology-UK. 2002, roč. 148, č. 8, s. 2467-2477. ISSN 1350-0872.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840526/cs
-
Concordance between genetic relatedness and phenotypic similarities of Trichomonas vaginalis strains J - Článek v odborném periodikuHAMPL, Vladimir; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; Jaroslav KULDA a Jaroslav FLEGR. Concordance between genetic relatedness and phenotypic similarities of Trichomonas vaginalis strains. BMC Evolutionary Biology. BioMed Central Ltd: London, 2001, roč. 1, č. 11, 10 s. ISSN 1471-2148.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840538/cs
-
Iron-induced changes in pyruvate metabolism of Tritrichomonas foetus and involvement of iron in expression of hydrogenosomal proteins. J - Článek v odborném periodikuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka; Dominique RASOLOSON; Jakub RAZGA; Ivan HRDY; Jaroslav KULDA a Jan TACHEZY. Iron-induced changes in pyruvate metabolism of Tritrichomonas foetus and involvement of iron in expression of hydrogenosomal proteins. Microbiology-UK. 2001, roč. 147, č. 1, s. 53-62. ISSN 1350-0872.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840531/cs
-
Phylogenetic relationships of class II fumarase genes from trichomonad species. J - Článek v odborném periodikuGERBOD, D.; V.P. EDGCOMB; C. NOEL; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; R. WINTJENS; Jan TACHEZY; M.L. SOGIN a E. VISCOGLIOSI. Phylogenetic relationships of class II fumarase genes from trichomonad species. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION. USA: OXFORD UNIV PRESS, 2001, roč. 18, č. 8, s. 1574-1584. ISSN 0737-4038.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840533/cs
-
Unusual diversity in a-amanitin sensitivity of RNA polymerases in trichomonads. J - Článek v odborném periodikuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka; Jan TACHEZY; Elisabetta ULLU a C. TSCHUDI. Unusual diversity in a-amanitin sensitivity of RNA polymerases in trichomonads. Molecular and Biochemical Parasitology. ELSEVIER, 2001, roč. 115, č. 2, s. 239-47, 9 s. ISSN 0166-6851.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840532/cs
-
Correlation between aerobic and anaerobic resistance to metronidazole in trichomonads: application of a new computer program for permutation tests. J - Článek v odborném periodikuFLEGR, Jaroslav; Pavel ZABOJ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Correlation between aerobic and anaerobic resistance to metronidazole in trichomonads: application of a new computer program for permutation tests. Parasitology Research. Heidelberg: Springer-Verlag, 1998, roč. 84, č. 7, s. 590-592. ISSN 0932-0113.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840539/cs
-
Characterization of trichomonad species and strains by PCR fingerprinting. J - Článek v odborném periodikuVAŇÁČOVÁ, Štěpánka; Jan TACHEZY; Jaroslav KULDA a Jaroslav FLEGR. Characterization of trichomonad species and strains by PCR fingerprinting. The Journal of Eukaryotic Microbiology. 1997, roč. 44, č. 6, s. 545-552. ISSN 1066-5234.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840540/cs
-
Transcription of the Trypanosoma brucei spliced leader RNA gene is dependent only on the presence of upstream regulatory elements J - Článek v odborném periodikuGUNZL, A.; Elisabetta ULLU; S.P. FRAGOSO; K.F. HOFFMANN; J.D. MILNER; Y. MORITA; E.K. NGUU; Štěpánka VAŇÁČOVÁ; S. WUNSCH; A.O. DARE; Helen KWON a C. TSCHUDI. Transcription of the Trypanosoma brucei spliced leader RNA gene is dependent only on the presence of upstream regulatory elements. Molecular and Biochemical Parasitology. ELSEVIER, 1997, roč. 85, č. 1, s. 67-76. ISSN 0166-6851.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/840543/cs