Výpis publikací

BRÁZDOVÁ, Marie; Marian Juraj KOVÁČ; Duc Luong DO; Klára BEDNÁŘOVÁ; Marta NEKULOVÁ; Barbora NEKOLOVÁ; Matej ADÁMIK; Zuzana SOLDÁNOVÁ; Robert HELMA; Leon Paul JENNER; Michaela VORLÍČKOVÁ; Eva SÝKOROVÁ a Marek PETR. G-QUADRUPLEXES AND THEIR LIGANDS IN BIOLOGY OF TELOMERE AND PROTEINS OF THE P53 FAMILY. In 53rd conference synthesis and analysis of drugs 2025, September 17-19, 2025 Congress Hotel Kurdějov, Czech Republic. 2025. ISBN 978-80-280-0773-7.

HOLOUBEK, Jiří; Klára BEDNÁŘOVÁ; Jan HAVIERNIK; Ivana HUVAROVÁ; Zuzana DVOŘÁKOVÁ; Jiří ČERNÝ; Martina OUTLÁ; Jiří SALÁT; Eva KONKOLOVA; Evzen BOURA; Daniel RŮŽEK; Michaela VORLÍČKOVÁ; Luděk EYER a Daniel RENČIUK. Guanine quadruplexes in the RNA genome of the tick-borne encephalitis virus: their role as a new antiviral target and in virus biology. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2022, roč. 50, č. 8, s. 4574-4600. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkac225.

NOVOTNÝ, Aleš; Jan NOVOTNÝ; Iva KEJNOVSKÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ; Radovan FIALA a Radek MAREK. Revealing structural peculiarities of homopurine GA repetition stuck by i-motif clip. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, č. 20, s. 11425-11437. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkab915.

TRNKOVÁ, Libuše; Iveta TŘÍSKOVÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Zuzana DVOŘÁKOVÁ; Hana PIVOŇKOVÁ a Radovan FIALA. Comparative Electrochemical and Spectroscopic Studies of I-motif forming DNA Nonamers. Electroanalysis. 2019, roč. 31, č. 10, s. 2081-2093. ISSN 1040-0397. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/elan.201900323.

TŘÍSKOVÁ, Iveta; Libuše TRNKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Electrochemical and Spectral Analysis of Cytosine-rich Nonamers. In Tomáš Navrátil, Miroslav Fojta a Karolina Schwarzová. XXXIX. Moderní elektrochemické metody-sborník přednášek. 1. vyd. Ústí nad Labem: Srsenová Lenka-Best servis Ústí nad Labem, 2019, s. 209-212. ISBN 978-80-905221-7-6.

DVOŘÁKOVÁ, Zuzana; Daniel RENČIUK; Iva KEJNOVSKÁ; Petra ŠKOLÁKOVÁ; Klára BEDNÁŘOVÁ; J SAGI a Michaela VORLÍČKOVÁ. i-Motif of cytosine-rich human telomere DNA fragments containing natural base lesions. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2018, roč. 46, č. 4, s. 1624-1634. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gky035.

KEJNOVSKÁ, Iva; Klára BEDNÁŘOVÁ; Daniel RENČIUK; Zuzana DVOŘÁKOVÁ; Petra ŠKOLÁKOVÁ; Lukáš TRANTÍREK; Radovan FIALA; Michaela VORLÍČKOVÁ a J. SAGI. Clustered abasic lesions profoundly change the structure and stability of human telomeric G-quadruplexes. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 45, č. 8, s. 4294-4305. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkx191.

DVOŘÁKOVÁ, Zuzana; Michaela VORLÍČKOVÁ a Daniel RENČIUK. Spectroscopic insights into quadruplexes of five-repeat telomere DNA sequences upon G-block damage. Biochim. Biophys. Acta. 2017, roč. 1861, č. 11, s. 2750-2757. ISSN 0005-2736. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.bbagen.2017.07.019.

ADÁMIK, Matej; Iva KEJNOVSKÁ; Pavla BAŽANTOVÁ; Marek PETR; Daniel RENČIUK; Michaela VORLÍČKOVÁ; Marie BRÁZDOVÁ a Monika ŠVARCOVÁ. p53 binds human telomeric G-quadruplex in vitro. Biochimie. Paris: Elsevier France- editions Scientifiques Medicales Elsevier, 2016, roč. 128, s. 83-91. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2016.07.004.

ADÁMIK, Matej; Aneta KREJČÍ; Daniel RENČIUK; Marek PETR; Pavla BAŽANTOVÁ; Robert HELMA; Alena POLÁŠKOVÁ; Zuzana BÁBKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Lucie NAVRÁTILOVÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ a Marie BRÁZDOVÁ. p53 interactions with DNA quadruplexes. In 8th Central European Conference “Chemistry towards Biology“. 2016.

PETR, Marek; Robert HELMA; Alena POLÁŠKOVÁ; Aneta KREJČÍ; Zuzana DVOŘÁKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Lucie NAVRÁTILOVÁ; Matej ADÁMIK; Michaela VORLÍČKOVÁ; Marie BRÁZDOVÁ a Gabriela RUMÍŠKOVÁ. Wild-type p53 binds to MYC promoter G-quadruplex. Bioscience Reports. London: Portland Press LTD, 2016, roč. 36, 11 s. ISSN 0144-8463. Dostupné z: https://doi.org/10.1042/BSR20160232.

KAŠPAROVÁ, Helena; Zuzana DVOŘÁKOVÁ; Daniel RENČIUK; Klára BEDNÁŘOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Lukáš TRANTÍREK; Michaela VORLÍČKOVÁ a Janos SAGI. Diverse effects of naturally occurring base lesions on the structure and stability of the human telomere DNA quadruplex. Biochimie. Paris: Elsevier France- editions Scientifiques Medicales Elsevier, 2015, roč. 118, Nov, s. 15-25. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.biochi.2015.07.013.

HUDCOVÁ, Kristýna; Aneta VEČEŘOVÁ; Libuše TRNKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ a Michal MASAŘÍK. Electrochemical detection of miR-34a-5p as a promising tool for HNC and PCa diagnosis. Brno: Masarykova univerzita, 2015, s. 50. ISBN 978-80-210-7825-3.

VIDLÁKOVÁ, Pavlína; Hana PIVOŇKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Libuše TRNKOVÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ; Miroslav FOJTA a Luděk HAVRAN. G-quadruplex-based structural transitions in 15-mer DNA oligonucleotides varying in lengths of internal oligo(dG) stretches detected by voltammetric techniques. Analytical and Bioanalytical chemistry. HEIDELBERG: SPRINGER HEIDELBERG, 2015, roč. 407, č. 19, s. 5817-5826. ISSN 1618-2642. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00216-015-8768-1.

HUDCOVÁ, Kristýna; Libuše TRNKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ; Jaromír GUMULEC; Rene KIZEK a Michal MASAŘÍK. Novel biophysical determination of miRNAs related to prostate and head and neck cancers. European Biophysics Journal With Biophysics Letters. New York: Springer, 2015, roč. 44, č. 3, s. 131-138. ISSN 0175-7571. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00249-015-1008-y.

HUDCOVÁ, Kristýna; Aneta VEČEŘOVÁ; Libuše TRNKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ a Michal MASAŘÍK. Spectral and electrochemical analysis of miR-34a-5p. In XIII Discussions in Structural Molecular Biology. 2015. ISSN 1211-5894.

ŠKOLÁKOVÁ, Petra; Silvie TRANTÍRKOVÁ; Klára BEDNÁŘOVÁ; Radovan FIALA; Michaela VORLÍČKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Unique C. elegans telomeric overhang structures reveal the evolutionarily conserved properties of telomeric DNA. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford Press, 2015, roč. 43, č. 9, s. 4733-4745. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkv296.

PILAŘOVÁ, Iveta; Michaela VORLÍČKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ a Libuše TRNKOVÁ. AN ELECTROCHEMICAL STUDY OF d(GCGAAGC) DNA HEPTAMER AND ITS SEQUENTIAL ANALOGUES. Online. In Sborník příspěvků XIV. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2014, s. 121 - 123. ISBN 978-80-210-6842-1.

PILAŘOVÁ, Iveta; Iva KEJNOVSKÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ a Libuše TRNKOVÁ. Dynamic Structures of DNA Heptamers with Different Central Trinucleotide Sequences Studied by Electrochemical and Spectral Methods. Electroanalysis. 2014, roč. 26, č. 10, s. 2118-2128. ISSN 1040-0397. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/elan.201400288.

LEXA, Matej; Pavlina STEFLOVA; Tomáš MARTÍNEK; Michaela VORLÍČKOVÁ; Boris VYSKOT a Eduard KEJNOVSKÝ. Guanine quadruplexes are formed by specific regions of human transposable elements. BMC Genomics. London: BioMed Central Ltd, 2014, roč. 15, č. 1, s. 1032-1043. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/1471-2164-15-1032.

BABINSKÝ, Martin; Radovan FIALA; Iva KEJNOVSKÁ; Klára BEDNÁŘOVÁ; Radek MAREK; Janos SAGI; Vladimír SKLENÁŘ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Loss of loop adenines alters human telomere d(AG3(TTAG3)3) quadruplex folding. Nucleic Acids Research. UK: Oxford University Press, 2014, roč. 42, č. 22, s. 14031-14041. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gku1245.

LEXA, Matej; Eduard KEJNOVSKÝ; Pavlína ŠTEFLOVÁ; Helena KONVALINOVÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ a Boris VYSKOT. Quadruplex-forming sequences occupy discrete regions inside plant LTR retrotransposons. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2014, roč. 42, č. 2, s. 968-978. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkt893.

KEJNOVSKÁ, Iva; Michaela VORLÍČKOVÁ; Marie BRÁZDOVÁ a Janos SAGI. Stability of human telomere quadruplexes at high DNA concentrations. Biopolymers. Hoboken: WILEY-BLACKWELL, 2014, roč. 101, č. 4, s. 428-438. ISSN 0006-3525. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/bip.22400.

RENČIUK, Daniel; Olivier BLACQUE; Michaela VORLÍČKOVÁ a Bernhard SPINGLER. Crystal structures of B-DNA dodecamer containing the epigenetic modifications 5-hydroxymethylcytosine or 5-methylcytosine. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2013, roč. 41, č. 21, s. 9891-9900. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkt738.

PALACKÝ, Jan; Michaela VORLÍČKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ a Peter MOJZEŠ. Polymorphism of human telomeric quadruplex structure controlled by DNA concentration: a Raman study. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2013, roč. 41, č. 2, s. 1005-1016. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gks1135.

VORLÍČKOVÁ, Michaela; Iva KEJNOVSKÁ; Janos SAGI; Daniel RENČIUK; Klára BEDNÁŘOVÁ; Jitka MOTLOVÁ a Jaroslav KYPR. Circular dichroism and guanine quadruplexes. Methods. SAN DIEGO: ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 2012, roč. 57, č. 1, s. 64-75. ISSN 1046-2023. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2012.03.011.

VORLÍČKOVÁ, Michaela; Iva KEJNOVSKÁ; Klára BEDNÁŘOVÁ; Daniel RENČIUK a Jaroslav KYPR. Circular Dichroism Spectroscopy of DNA: From Duplexes to Quadruplexes. Chirality. New York: John Wiley & Sons, Inc., 2012, roč. 24, č. 9, s. 691-698. ISSN 0899-0042. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/chir.22064.

KYPR, Jaroslav; Iva KEJNOVSKÁ; Klára BEDNÁŘOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. CIRCULAR DICHROISM SPECTROSCOPY OF NUCLEIC ACIDS. In Berova, N., Polavarapu, L. P., Nakanishi, K., Woody, R.W. Comprehensive Chiroptical Spectroscopy : Applications in Stereochemical Analysis of Synthetic Compounds, Natural Products, and Biomolecules. Hoboken (NJ, USA): John Wiley & Sons, 2012, s. 575-586. Volume 2. ISBN 978-1-118-01292-5. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/9781118120392.ch17.

RACHE, Aurore De; Iva KEJNOVSKÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ a Claudine BUESS-HERMAN. Elongated Thrombin Binding Aptamer: A G-Quadruplex Cation-Sensitive Conformational Switch. Chemistry - A European Journal. WEINHEIM: WILEY-VCH, 2012, roč. 18, č. 14, s. 4392-4400. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/chem.201103381.

VORLÍČKOVÁ, Michaela; Martin TOMAŠKO; Andras J. SAGI; Klára BEDNÁŘOVÁ a Janos SAGI. 8-Oxoguanine in a quadruplex of the human telomere DNA sequence. FEBS Journal. 2012, č. 279, s. 29-39. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/j.1742-4658.2011.08396.x.

ŠKOLÁKOVÁ, Petra; Klára BEDNÁŘOVÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ a Janos SAGI. Quadruplexes of human telomere dG(3)(TTAG(3))(3) sequences containing guanine abasic sites. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2010. ISSN 0006-291X. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2010.07.055.

RENČIUK, Daniel; Iva KEJNOVSKÁ; Petra ŠKOLÁKOVÁ; Klára BEDNÁŘOVÁ; Jitka MOTLOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Arrangements of human telomere DNA quadruplex in physiologically relevant K+ solutions. Nucleic Acids Research. 2009, roč. 37, č. 19, s. 6625–6634. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkp701.

KYPR, Jaroslav; Iva KEJNOVSKÁ; Daniel RENČIUK a Michaela VORLÍČKOVÁ. Circular dichroism and conformational polymorphism of DNA. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford Press, 2009, roč. 37, č. 6, s. 1713-1725. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkp026.

TRNKOVÁ, Libuše; František JELEN; Iva KEJNOVSKÁ; Michaela VORLÍČKOVÁ; Zdeňka BALCAROVÁ a Kamila NEPLECHOVÁ. Electrochemical and CD spectroscopy study of DNA and RNA hairpins. In International Symposium on Frontiers of Electrochemical Science and Technology - Book of Abstracts. Xi an, China: Xiamen University, 2009, s. P11, 1 s.

MIKELOVÁ, Radka; Libuše TRNKOVÁ; František JELEN; Iva KEJNOVSKÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Electrochemical and circular dichroic analysis of DNA fragments formed by cytosine and adenine bases. In The 60th Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry – book of abstracts. Beijing, China: International Society of Electrochemistry, 2009, 1 s.

TRNKOVÁ, Libuše; Radka MIKELOVÁ; František JELEN; Iva KEJNOVSKÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Elektrochemická a spektrální studie krátkých oligonukleotidů. In XXIX. moderní elektrochemické metody - sborník příspěvků. Ústí nad Labem: BEST servis, 2009, 4 s. ISBN 978-80-254-3997-5.

JELEN, František; Libuše TRNKOVÁ; Alena KOUŘILOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Elimination and adsorptive transfer techniques in an oligonucleotide analysis. In International Symposium on Frontiers of Electrochemical Science and Technology – book of abstracts. Xi an, China: Xiamen University, China, 2009, s. P12, 1 s.

VONDRUŠKOVÁ, Jitka; Jaroslav KYPR; Iva KEJNOVSKÁ; Markéta FIALOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Guanine quadruplex formation by RNA/DNA hybrid analogs of Oxytricha telomere G4T4G4 fragment. Biopolymers. Wiley InterScience, 2008. ISSN 0006-3525.

VONDRUŠKOVÁ, Jitka; Jaroslav KYPR; Iva KEJNOVSKÁ; Markéta FIALOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Role of loops in the guanine quadruplex formation by DNA/RNA hybrid analogs of G4T4G4. International Journal of Biological Macromolecules. Elsevier, 2008. ISSN 0141-8130.

PŘIBYL, Jan; Petr SKLÁDAL; Daniel RENČIUK a Michaela VORLÍČKOVÁ. High resolution AFM as a tool for analysis of short-chain DNA structure and properties. In Biosurf 2007, Zurich. Zurich: ETH Zurich, CH, 2007, s. 41-42, 150 s. ISSN 1473-2262.

VORLÍČKOVÁ, Michaela; Klára BEDNÁŘOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ a Jaroslav KYPR. Intramolecular and intermolecular guanine quadruplexes of DNA in aqueous salt and ethanol solutions. Biopolymers. United States of America: JOHN WILEY & SONS INC, 111 RIVER ST, HOB, 2007, roč. 86, č. 1, s. 1-10. ISSN 0006-3525. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/bip.20672.

FIALOVÁ, Markéta a Michaela VORLÍČKOVÁ. Tetraplex structures of two biologically important molecules: Thrombin binding aptamer and nuclease hypersensitive element in the human c-myc promoter. In XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 31.01.2007-01.02.2007, Praha. 2007. ISBN 978-80-210-4234-6.

VORLÍČKOVÁ, Michaela; Klára BEDNÁŘOVÁ a Jaroslav KYPR. Ethanol is a better inducer of DNA guanine tetraplexes than potassium cations. Biopolymers. USA: JOHN WILEY & SONS INC, 111 RIVER ST, HOB, 2006, roč. 82, č. 3, s. 253-260. ISSN 0006-3525. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/bip.20488.

FIALOVÁ, Markéta; Jaroslav KYPR a Michaela VORLÍČKOVÁ. The thrombin binding aptamer GGTTGGTGTGGTTGG forms a bimolecular guanine tetraplex. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2006. ISSN 0006-291X.

FIALOVÁ, Markéta a Michaela VORLÍČKOVÁ. DNA aptamer specifický pro thrombin tvoří bimolekulární tetraplex. In IX. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů: sborník příspěvků. 2005. ISBN 80-210-3635-4.

VORLÍČKOVÁ, Michaela; Jana CHLÁDKOVÁ; Iva KEJNOVSKÁ a Markéta FIALOVÁ. Guanine tetraplex topology of human telomere DNA is governed by the number of (TTAGGG) repeats. Nucleic Acids Research. 2005. ISSN 0305-1048.

ZEMÁNEK, Michal; Markéta FIALOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Conformational properties of DNA containing (CCA)n/(TGG)n trinucleotide repeats. In Zborník abstraktov prác diplomantov a doktorandov. Bratislava. 2003.

FIALOVÁ, Markéta a Michaela VORLÍČKOVÁ. Interkalované tetraplexy ve fragmentech lidského onkogenu c-Myc. In Symposium teoretické a aplikované biofyziky. Program a soubory sdělení. České Budějovice. 2003.

ZEMÁNEK, Michal; Markéta FIALOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Konformační vlastnosti trinukleotidových motivů (TGG)n a (CCA)n: formování, stabilita a kompetice tetraplexů a klasického heteroduplexu. In Symposium teoretické a aplikované biofyziky. Program a soubory sdělení. České Budějovice. 2003.

KYPR, Jaroslav; Markéta FIALOVÁ; Jana CHLÁDKOVÁ; Marcela TŮMOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Conserved guanine-guanine stacking in tetraplex and duplex DNA. European Biophysics Journal With Biophysics Letters. 2001. ISSN 0175-7571.

SIMONSSON, Thomas; Markéta FIALOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. A Nuclease Hypersensitive Element in the Human c-myc Promoter Adopts Several Distinct i-Tetraplex Structures. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2000. ISSN 0006-291X.

KYPR, Jaroslav; János SÁGI; Erika SZAKONYI; Katalin EBINGER; Hana PEŇÁZOVÁ; Jana CHLÁDKOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Thymine Methyl-Groups Stabilize the Putative A-Form of the Synthetic DNA poly(amino(2) dA-dT). Biochemistry. 1994, roč. 33, č. 13, s. 3801-3806. ISSN 0006-2960.

KYPR, Jaroslav; Hana PEŇÁZOVÁ; János SÁGI; Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. UV Light-Induced Cross-Linking of the Strands of Poly(dA-dT) and Related Altenrating Purine-Pyrimidine DNAs. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. 1994, roč. 11, č. 6, s. 1225-1236. ISSN 0739-1102.

PEŇÁZOVÁ, Hana; Šárka POSPÍŠILOVÁ; János SÁGI; Michaela VORLÍČKOVÁ a Jaroslav KYPR. Crosslinking of Natural and Synthetic DNA Strands upon UV Light Irradiation. In Analysis of Structure of Biomacromolecules and their Interactions with Enviromental Cytotoxic Agents. Brno, 1993, s. P20, 1 s.