Masarykova univerzita

Výpis publikací

česky | in English

Filtrování publikací

    2024

    1. LAPČÍK, Petr, R. Greg STACEY, David POTĚŠIL, Petr KULHÁNEK, Leonard J. FOSTER a Pavel BOUCHAL. Global interactome mapping reveals pro-tumorigenic interactions of NF-κB in breast cancer. Molecular and Cellular Proteomics. Elsevier, 2024. ISSN 1535-9484. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.mcpro.2024.100744.
      URL
      angličtina. Nizozemské království.
      Klíčová slova anglicky: NF-κB; RELA; Proteomics; Protein complexes; Interaction; Breast cancer; Protein correlation profiling; AlphaPullDown
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 3. 2024 11:28.
    2. ZEMANÍK, Július a Petr KULHÁNEK. QM/MM Reaction Simulations of Alpha-(1,3)-fucosyltransferase of Helicobacter pylori. In XX Discussions in Structural Molecular Biology and 7th User Meeting of CIISB. 2024. ISSN 1211-5894.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Bc. Július Zemaník, učo 484606. Změněno: 29. 3. 2024 22:08.

    2023

    1. ZEMANÍK, Július a Petr KULHÁNEK. Structure of the Pre-reaction Complex of Alpha-(1,3)-fucosyltransferase of Helicobacter pylori. In XXII. Meeting of Biochemists and Molecular Biologists. 2023. ISBN 978-80-280-0409-5.
      Název anglicky: Structure of the Pre-reaction Complex of Alpha-(1,3)-fucosyltransferase of Helicobacter pylori

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 6. 3. 2024 14:46.
    2. ZEMANÍK, Július a Petr KULHÁNEK. Structure of the Pre-reaction Complex of FucT. In XIX Discussions in Structural Molecular Biology and 6th User Meeting of CIISB (Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology). 2023. ISSN 1211-5894.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 6. 3. 2024 14:47.

    2021

    1. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK a Petr KULHÁNEK. Bending of Canonical and G/T Mismatched DNAs. Journal of Chemical Information and Modeling. American Chemical Society, 2021, roč. 61, č. 12, s. 6000-6011. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00731.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00123499 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bouchal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Durník, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Free energy; Genetics; Chemical structure; Intercalation; Nucleic acid structure
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 3. 2022 10:43.
    2. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK a Petr KULHÁNEK. Bending of Canonical and G/T Mismatched DNAs. In XXVI. Annual Congress of Czech and Slovak Societies for Biochemistry and Molecular Biology with cooperation of Austrian and German Biochemical Section, 2021. 2021. ISBN 978-80-907779-1-0.
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: mismatched DNA; bending; biased MD simulations
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 4. 2022 14:41.
    3. TOMEČEK, Josef, Andrea ČABLOVÁ, Aneta HROMÁDKOVÁ, Jan NOVOTNÝ, Radek MAREK, Ivo DURNÍK, Petr KULHÁNEK, Zdeňka PRUCKOVÁ, Michal ROUCHAL, Lenka DASTYCHOVÁ a Robert VÍCHA. Modes of Micromolar Host-Guest Binding of beta-Cyclodextrin Complexes Revealed by NMR Spectroscopy in Salt Water. The Journal of Organic Chemistry. American Chemical Society, 2021, roč. 86, č. 6, s. 4483-4496. ISSN 0022-3263. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.joc.0c02917.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118870 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Tomeček, Josef (203 Česká republika) -- Čablová, Andrea (203 Česká republika) -- Hromádková, Aneta (203 Česká republika) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Durník, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Prucková, Zdeňka (203 Česká republika) -- Rouchal, Michal (203 Česká republika) -- Dastychová, Lenka (203 Česká republika) -- Vícha, Robert (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: host-guest complex;cyclodextrin;NMR spectroscopy;molecular modeling;binding;salt water
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 22. 3. 2022 18:53.

    2020

    1. KULKARNI, Shantanu Ganesh, Kristýna JELÍNKOVÁ, Marek NEČAS, Zdeňka PRUCKOVÁ, Michal ROUCHAL, Lenka DASTYCHOVÁ, Petr KULHÁNEK a Robert VÍCHA. A Photochemical/Thermal Switch Based on 4,4'-Bis(benzimidazolio)stilbene: Synthesis and Supramolecular Properties. ChemPhysChem. Weinheim: Wiley, 2020, roč. 21, č. 18, s. 2084-2095. ISSN 1439-4235. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cphc.202000472.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118083 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: stilbene switch; cucurbit[n]uril; cyclodextrins; molecular devices; host-guest systems
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 13. 4. 2021 18:21.
    2. BRADY, Kimberly G., Laura GILBERG, David SIGWALT, Joshua BISTANY-RIEBMAN, Steven MURKLI, Jared KLEMM, Petr KULHÁNEK, Vladimír ŠINDELÁŘ a Lyle ISAACS. Conformationally mobile acyclic cucurbit[n]uril-type receptors derived from an S-shaped methylene bridged glycoluril pentamer. Supramolecular Chemistry. Abingdon: Taylor & Francis Ltd., 2020, roč. 32, č. 9, s. 479-494. ISSN 1061-0278. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/10610278.2020.1795173.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00117313 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brady, Kimberly G. (840 Spojené státy) -- Gilberg, Laura (276 Německo, domácí) -- Sigwalt, David (840 Spojené státy) -- Bistany-Riebman, Joshua (840 Spojené státy) -- Murkli, Steven (840 Spojené státy) -- Klemm, Jared (840 Spojené státy) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Acyclic cucurbituril; molecular recognition; isothermal titration calorimetry; foldamer
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 21:47.
    3. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK, Viktor ILLÍK, Kamila RÉBLOVÁ a Petr KULHÁNEK. Importance of base-pair opening for mismatch recognition. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2020, roč. 48, č. 20, s. 11322-11334. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa896.
      URL
      Název anglicky: Importance of base-pair opening for mismatch recognition
      RIV/00216224:14310/20:00114694 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bouchal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Durník, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Illík, Viktor (703 Slovensko, domácí) -- Réblová, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: mismatch repair; MutS/DNA; adaptive biasing force; free energy; simple base-pair parameters
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 17. 2. 2023 23:20.

    2019

    1. RŮŽIČKA, Michal, Přemysl SOUČEK, Petr KULHÁNEK, Lenka RADOVÁ, L. FAJKUSOVA a Kamila RÉBLOVÁ. Bending of DNA duplexes with mutation motifs. DNA RESEARCH. OXFORD: OXFORD UNIV PRESS, 2019, roč. 26, č. 4, s. 341-352. ISSN 1340-2838. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/dnares/dsz013.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108081 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Růžička, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Souček, Přemysl (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Fajkusova, L. (203 Česká republika) -- Réblová, Kamila (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA bending; Muts protein; mutations; hotspots-coldspots; free energy calculations
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2020 10:31.
    2. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK a Petr KULHÁNEK. Importance of Base-pair Probing for Mismatch Recognition. In Advances in Noncanonical Nucleic Acids, Rogaška Slatina, Slovenia. 2019. ISBN 978-961-6104-47-0.
      RIV/00216224:14740/19:00111009 Konferenční abstrakt. angličtina. Slovinsko.
      Bouchal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Durník, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Base-pair Probing; Mismatch Recognition
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:29.

    2018

    1. ŠTĚPÁN, Jakub, Ivo KABELKA, Jaroslav KOČA a Petr KULHÁNEK. Behavior of BsoBI endonuclease in the presence and absence of DNA. Journal of Molecular Modeling. New York: Springer, 2018, roč. 24, č. 1, s. 22-31. ISSN 1610-2940. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00894-017-3557-8.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00102342 Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
      Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Conformational change; Enzyme opening; Molecular dynamics; Metadynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 11:02.
    2. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK a Petr KULHÁNEK. Flexibility of DNA mismatches. In XIX. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, Brno. 2018. 2018. ISBN 978-80-210-9069-9.
      Název česky: Flexibilita DNA mismatchů
      Název anglicky: Flexibility of DNA mismatches
      RIV/00216224:14740/18:00109381 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Bouchal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Durník, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Flexibility; DNA mismatches
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:38.
    3. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK a Petr KULHÁNEK. Flexibility of DNA mismatches. In 2nd Users Conference of IT4Innovations, Ostrava, 2018. 2018.
      Název česky: Flexibilita DNA mismatchů

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Tomáš Bouchal, Ph.D., učo 357534. Změněno: 3. 4. 2019 10:03.
    4. DURNÍK, Ivo, Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Prediction of Binding of Ruthenium Anticancer Drugs into Macromolecular Drug Carriers. In 2nd Users Conference of IT4Innovations, Ostrava. 2018.
      Název anglicky: Prediction of Binding of Ruthenium Anticancer Drugs into Macromolecular Drug Carriers
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 2. 3. 2020 15:51.
    5. DURNÍK, Ivo, Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Ruthenium Anticancer Drugs and Macromolecular Drug Carriers: Prediction of Binding. In XIX. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, Brno. 2018. ISBN 978-80-210-9069-9.
      Název anglicky: Ruthenium Anticancer Drugs and Macromolecular Drug Carriers: Prediction of Binding
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:39.

    2017

    1. FIALA, Tomáš, Lucie LUDVÍKOVÁ, Dominik HEGER, Jan ŠVEC, Tomáš SLANINA, Ľubica VETRÁKOVÁ, Michal BABIAK, Marek NEČAS, Petr KULHÁNEK, Petr KLÁN a Vladimír ŠINDELÁŘ. Bambusuril as a One-Electron Donor for Photoinduced Electron Transfer to Methyl Viologen in Mixed Crystals. Journal of the American Chemical Society. WASHINGTON: American Chemical Society, 2017, roč. 139, č. 7, s. 2597-2603. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.6b08589.
      URL
      RIV/00216224:14310/17:00095285 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Fiala, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Ludvíková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Heger, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Slanina, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vetráková, Ľubica (703 Slovensko, domácí) -- Babiak, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Klán, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DENSITY-FUNCTIONAL CALCULATIONS; ORDER REGULAR APPROXIMATION; CHARGE-TRANSFER SALTS; MOLECULAR-DYNAMICS; CATION RADICALS; METHYLVIOLOGEN; REDUCTION; PHOTOCHEMISTRY; ORGANOSILICA; ACETONITRILE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 29. 3. 2018 10:04.
    2. RŮŽIČKA, Michal, Petr KULHÁNEK, Lenka RADOVÁ, Andrea ČECHOVÁ, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Lenka FAJKUSOVÁ a Kamila RÉBLOVÁ. DNA mutation motifs in the genes associated with inherited diseases. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2017, roč. 12, č. 8, s. nestránkováno, 16 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0182377.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095121 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Růžička, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Čechová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Špačková, Naděžda (203 Česká republika, domácí) -- Fajkusová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Réblová, Kamila (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: REPAIR PROTEIN MUTS; MISMATCH REPAIR; STRAND ASYMMETRIES; CONFORMATIONAL-CHANGES; BENDING PROPENSITY; METHYLATION; RECOGNITION; MECHANISMS; HOTSPOTS; COMPLEX

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 3. 2018 14:02.
    3. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK, Viktor ILLÍK a Petr KULHÁNEK. Influence of non-Watson-Crick base pairing on structure of DNA. In Modeling Interactions in Biomolecules VIII, Plzeň, Czech Republic, 3-8 September 2017. 2017.
      angličtina. Česká republika.
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 2. 3. 2020 15:57.
    4. RŮŽIČKA, Michal, Kamila RÉBLOVÁ a Petr KULHÁNEK. Study of structural and elastic properties of DNA mutation motifs using computational methods. In Modeling Interactions in Biomolecules VIII, Plzeň. 2017.
      Název anglicky: Study of structural and elastic properties of DNA mutation motifs using computational methods.
      RIV/00216224:14740/17:00098981 Konferenční abstrakt. angličtina.
      Růžička, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Réblová, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA; methods

      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 14. 2. 2018 15:15.

    2016

    1. USTRNUL, Lukáš, Michal BABIAK, Petr KULHÁNEK a Vladimír ŠINDELÁŘ. A Cucurbituril Derivative That Exhibits Cation-Modulated Self Assembly. Journal of Organic Chemistry. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2016, roč. 81, č. 14, s. 6075-6080. ISSN 0022-3263. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.joc.6b01288.
      URL
      RIV/00216224:14310/16:00088096 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Ustrnul, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Babiak, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SUPRAMOLECULAR CHEMISTRY; CUCURBITURIL; SELF-ASSOCIATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Lukáš Ustrnul, Ph.D., učo 270381. Změněno: 23. 8. 2016 15:21.
    2. RÉBLOVÁ, Kamila, Lenka RADOVÁ, Andrea ČECHOVÁ, Michal RŮŽIČKA, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Petr KULHÁNEK a Lenka FAJKUSOVÁ. Analysis of intrinsic properties of mutation motifs (coldspots-hotspots) in genes associated with inherited disorders using molecular dynamics methods. In 21st EuroQSAR. 2016.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 8. 12. 2016 15:01.
    3. BRANNÁ, Petra, Jarmila ČERNOCHOVÁ, Michal ROUCHAL, Petr KULHÁNEK, Martin BABINSKÝ, Radek MAREK, Marek NEČAS, Ivo KUŘITKA a Robert VÍCHA. Cooperative binding of cucurbit[n]urils and beta-cyclodextrin to heteroditopic imidazolium-based guests. The Journal of Organic Chemistry. Washington: American Chemical Society, 2016, roč. 81, č. 20, s. 9595-9604. ISSN 0022-3263. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.joc.6b01564.
      DOI: 10.1021/acs.joc.6b01564
      RIV/00216224:14740/16:00088189 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Branná, Petra (203 Česká republika) -- Černochová, Jarmila (203 Česká republika) -- Rouchal, Michal (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Kuřitka, Ivo (203 Česká republika) -- Vícha, Robert (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: macrocycle; cyclodextrin; cucurbit[n]uril; NMR; binding; cooperativity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Marek Nečas, Ph.D., učo 18809. Změněno: 13. 3. 2018 10:17.
    4. KUMARI, Manju, Stanislav KOZMON, Petr KULHÁNEK, Jakub ŠTĚPÁN, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Reaction Mechanism of O-GlcNAc Transferase Explored By QM/MM Molecular Dynamics. 2016.
      RIV/00216224:14740/16:00108709 Konferenční abstrakt. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Kumari, Manju (356 Indie, domácí) -- Kozmon, Stanislav (703 Slovensko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Tvaroška, Igor (703 Slovensko, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Reaction Mechanism; O-GlcNAc Transferase; QM/MM
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 21:02.
    5. MIKULÁŠEK, Kamil, Kamil JAROŇ, Petr KULHÁNEK, Miroslava BITTOVÁ a Jan HAVLIŠ. Sequence-dependent separation of trinucleotides by ion-interaction reversed-phase liquid chromatography A structure-retention study assisted by soft-modelling and molecular dynamics. Journal of Chromatography A. Amsterdam: Elsevier Science BV, 2016, roč. 1469, October, s. 88-95. ISSN 0021-9673. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.chroma.2016.09.060.
      supplementary data
      Název anglicky: Sequence-dependent separation of trinucleotides by ion-interaction reversed-phase liquid chromatography A structure-retention study assisted by soft-modelling and molecular dynamics
      RIV/00216224:14740/16:00091922 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Nizozemské království.
      Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Jaroň, Kamil (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bittová, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Havliš, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Sequence-dependent separation; Ion-interaction reversed-phase liquid chromatography; Trinucleotides; Oligonucleotide sequence isomers; QSRR; Molecular dynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 1. 3. 2017 10:27.
    6. STŘELCOVÁ, Zora, Petr KULHÁNEK, Martin FRIÁK, Helge-Otto FABRITIUS, Michal PETROV, Joerg NEUGEBAUER a Jaroslav KOČA. The structure and dynamics of chitin nanofibrils in an aqueous environment revealed by molecular dynamics simulations. RSC Advances. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2016, roč. 6, č. 36, s. 30710-30721. ISSN 2046-2069. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c6ra00107f.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00090502 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Friák, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Fabritius, Helge-Otto (276 Německo) -- Petrov, Michal (276 Německo) -- Neugebauer, Joerg (276 Německo) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: FREE-ENERGY CALCULATIONS; PARTICLE MESH EWALD; ALPHA-CHITIN; CRYSTAL-STRUCTURE; INSECT CHITIN; SURFACE-AREA; AB-INITIO; CUTICLE; EXOSKELETON; CHITOSAN

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 4. 8. 2016 14:00.

    2015

    1. ŠKULTÉTY, Michal a Petr KULHÁNEK. Computational study of carbonic anhydrase IX. In Modeling Interactions in Biomolecules VII, Praha, Czech Republic, 14-18 September, 2015, 2015. 2015.
      Název anglicky: Computational study of carbonic anhydrase IX
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 29. 3. 2016 12:13.
    2. BOUCHAL, Tomáš a Petr KULHÁNEK. Computational study of lectin PA-IIL. In Modeling Interactions in Biomolecules VII, Praha, Czech Republic, 14-18 September, 2015. 2015.
      Název anglicky: Computational study of lectin PA-IIL
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: PA-IIL; computational chemistry
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 29. 3. 2016 12:09.
    3. RÉBLOVÁ, Kamila, Petr KULHÁNEK a Lenka FAJKUSOVÁ. Computational study of missense mutations in phenylalanine hydroxylase. Journal of Molecular Modeling. New York: SPRINGER, 2015, roč. 21, č. 4, s. "nestránkováno", 10 s. ISSN 1610-2940. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00894-015-2620-6.
      URL
      Název česky: Počítačová studie missense mutací fenylalaninehydroxylázy
      RIV/00216224:14740/15:00083364 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Réblová, Kamila (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Fajkusová, Lenka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: mutations; computations; MD simulations; genetic disease;
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 30. 3. 2016 13:41.
    4. KUMARI, Manju, Stanislav KOZMON, Petr KULHÁNEK, Jakub ŠTĚPÁN, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Exploring Reaction Pathways for O-GlcNAc Transferase Catalysis. A String Method Study. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2015, roč. 119, č. 12, s. 4371-4381. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp511235f.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00085002 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kumari, Manju (356 Indie, domácí) -- Kozmon, Stanislav (703 Slovensko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Tvaroška, Igor (703 Slovensko, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CATALYTIC MECHANISM; PK(A) VALUES; ENERGY PATHS; GLYCOSYLTRANSFERASES; SIMULATIONS; PROTEIN; RATIONALIZATION; METABOLISM; SUBSTRATE; CLEAVAGE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 30. 11. 2015 09:39.
    5. USTRNUL, Lukáš, Petr KULHÁNEK, Tomáš LÍZAL a Vladimír ŠINDELÁŘ. Pressocucurbit[5]uril. Organic Letters. WASHINGTON, DC (USA): American Chemical Society, 2015, roč. 17, č. 4, s. 1022-1025. ISSN 1523-7060. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.orglett.5b00123.
      URL
      RIV/00216224:14310/15:00080748 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Ustrnul, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Lízal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SUPRAMOLECULAR CHEMISTRY; CUCURBITURIL; GAS BINDING; PRESSOCUCURBITURIL
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 28. 4. 2016 14:17.
    6. USTRNUL, Lukáš, Vladimír ŠINDELÁŘ a Petr KULHÁNEK. Pressocucurbit[5]uril: synthesis and supramolecular properties. In 10th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry, ISMSC-2015, Strasbourg, France, June 28th-July 2nd, 2015. 2015.
      website of conference
      Organická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: propanediurea; Pressocucurbit[5]uril; macrocycle; supramolecular chemistry; methane binding
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. Ing. Vladimír Šindelář, Ph.D., učo 203255. Změněno: 12. 1. 2016 14:19.
    7. USTRNUL, Lukáš, Vladimír ŠINDELÁŘ a Petr KULHÁNEK. Pressocucurbit[5]urils: Supramolecular properties. In 50th Advances in Organic, Bioorganic and Pharmaceutical Chemistry, "Liblice 2015", Olomouc, Czech republic, 6.-8.11.2015,. 2015.
      website of conference
      Název anglicky: Pressocucurbit[5]urils: Supramolecular properties
      Organická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: propanediurea; Pressocucurbit[5]uril; macrocycle; supramolecular chemistry; methane binding

      Změnil: prof. Ing. Vladimír Šindelář, Ph.D., učo 203255. Změněno: 12. 1. 2016 14:20.
    8. ŠKULTÉTY, Michal a Petr KULHÁNEK. Theoretical study of carbonic anhydrase IX. In XIII Discussions in Structural Molecular Biology. 2015. ISSN 1211-5894.
      URL
      Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: carbonic anhydrase IX, molecular dynamics, computational chemistry
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnil: Mgr. Michal Škultéty, učo 376167. Změněno: 19. 6. 2015 16:14.

    2014

    1. NOVOTNÝ, Jan, Yevgen YURENKO, Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Tailoring the Properties of Quadruplex Nucleobases for Biological and Nanomaterial Applications. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 16, č. 29, s. 15241-15248. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/C4CP00541D.
      DOI: 10.1039/C4CP00541D
      RIV/00216224:14740/14:00075618 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Quadruplex; DNA; guanine; xanthine; 9-deaza-8-haloxanthine; density-functional theory; hydrogen-bonding; stacking; ion coordination; formation energy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 12. 2019 09:29.

    2013

    1. ŠTĚPÁN, Jakub, Petr KULHÁNEK, Milan LENČO, Zora STŘELCOVÁ, Aleš KŘENEK a Jaroslav KOČA. Nemesis - a molecular modeling package. Online. In Uli Fechner. Journal of Cheminformatics 2013, 5(Suppl 1). Goslar (GER): Chemistry Central, 2013, s. 13-14. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-5-S1-P12.
      Přímý odkaz na článek.
      RIV/00216224:14740/13:00087699 Stať ve sborníku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lenčo, Milan (703 Slovensko, domácí) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Křenek, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nemesis molecular modelling 3D structure
      Druh sborníku: postkonferenční sborník

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 3. 5. 2016 16:24.
    2. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK a Michal STRAKA. 129Xe NMR chemical shift in Xe@C60 calculated at experimental conditions: Essential role of the relativity, dynamics, and explicit solvent. Journal of Computational Chemistry. New York: John Wiley & Sons, 2013, roč. 34, č. 22, s. 1890-1898. ISSN 0192-8651. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/jcc.23334.
      DOI: 10.1002/jcc.23334 Inside Cover
      RIV/00216224:14740/13:00068377 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Standara, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Straka, Michal (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 129Xe NMR; Xe@C60; dynamical averaging; explicit solvent ; relativistic effects
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 4. 2014 16:19.

    2012

    1. NOVOTNÝ, Jan, Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Biocompatible Xanthine-Quadruplex Scaffold for Ion-Transporting DNA Channels. The Journal of Physical Chemistry Letters. Washington: American Chemical Society, 2012, roč. 3, č. 13, s. 1788-1792. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jz300559w.
      DOI: 10.1021/jz300559w
      RIV/00216224:14740/12:00060331 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: molecular dynamics; guanine; adaptive biasing force; ion transport; free-energy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 14. 11. 2017 08:32.
    2. CERNOCHOVA, Jarmila, Petra BRANNA, Michal ROUCHAL, Petr KULHÁNEK, Ivo KURITKA a Robert VICHA. Determination of Intrinsic Binding Modes by Mass Spectrometry: Gas-Phase Behavior of Adamantylated Bisimidazolium Guests Complexed to Cucurbiturils. Chemistry - A European Journal. Weinheim: WILEY-VCH Verlag, 2012, roč. 18, č. 43, s. 13633-13637. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201201444.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00075523 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Cernochova, Jarmila (203 Česká republika) -- Branna, Petra (203 Česká republika) -- Rouchal, Michal (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kuritka, Ivo (203 Česká republika) -- Vicha, Robert (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: adamantane; cucurbituril; host–guest systems; imidazolium salts; supramolecular chemistry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 17. 4. 2015 09:52.
    3. SOLIMAN, Namat Ali, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Influence of stereochemistry on proton transfer in protonated tripeptide models. Journal of Molecular Modeling. New York: Springer, 2012, roč. 18, č. 3, s. 871-879. ISSN 1610-2940. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00894-011-1116-2.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00060043 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Soliman, Namat Ali (434 Libye, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Conformational rearrangement; Density functional theory; Protonated peptides; Proton transfer
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 11. 4. 2013 08:18.
    4. MLÁDEK, Arnošt, Judit ŠPONEROVÁ, Petr KULHÁNEK, Xiang-Jun LU, Wilma K. OLSON a Jiří ŠPONER. Understanding the Sequence Preference of Recurrent RNA Building Blocks using Quantum Chemistry: The Intrastrand RNA Dinucleotide Platform. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington: ACS, 2012, roč. 8, č. 1, s. 335-347. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct200712b.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00057217 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Mládek, Arnošt (203 Česká republika) -- Šponerová, Judit (348 Maďarsko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Lu, Xiang-Jun (156 Čína) -- Olson, Wilma K. (840 Spojené státy) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: WATSON-CRICK/SUGAR-EDGE; MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; BASE-PHOSPHATE INTERACTIONS; DENSITY-FUNCTIONAL THEORY; NUCLEIC-ACID STRUCTURES; BASIS-SET CONVERGENCE; AB-INITIO; FORCE-FIELD; TERTIARY INTERACTIONS; CHEMICAL CALCULATIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 7. 4. 2013 14:46.

    2011

    1. STŘELCOVÁ, Zora, Jakub ŠTĚPÁN, Petr KULHÁNEK, Paolo CARLONI a Jaroslav KOČA. Computational study of the dimethylphosphate hydrolysis as the reference system for the understanding of the restriction endonucleases mechanism. In IX Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady. 2011.
      URL
      RIV/00216224:14740/11:00050025 Konferenční abstrakt. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Střelcová, Zora (203 Česká republika, garant, domácí) -- Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Carloni, Paolo (380 Itálie) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: enzyme catalyses MutH ab-inito dynamics CPMD dimethylphosphate metadynamics PMF lib
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Nikola Kostlánová, Ph.D., učo 12689. Změněno: 3. 4. 2012 10:04.
    2. MISHRA, Sushil Kumar, Jan ALÁN, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. How to calculate binding energy in Protein-Carbohydrate complexes. In 5th THEORETICAL BIOPHYSICS INTERNATIONAL SYMPOSIUM, Madeira (Portugal), 8 - 12 June 2011. 2011.
      Název česky: How to calculate binding energy in Protein-Carbohydrate complexes
      Název anglicky: How to calculate binding energy in Protein-Carbohydrate complexes

      Změnil: Sushil Kumar Mishra, Ph.D., učo 346574. Změněno: 4. 11. 2011 13:38.
    3. BABINSKÝ, Martin, Petr KULHÁNEK, Viktor KOLMAN, Vladimír ŠINDELÁŘ a Radek MAREK. NMR and Computational Study of Supramolecular Interactions. In 26th Central European NMR Meeting Valtice. 2011.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Babinský, Ph.D., učo 151360. Změněno: 20. 7. 2011 17:03.
    4. KULHÁNEK, Petr, Letif MONES, Zora STŘELCOVÁ, Istvan SIMON, Monika FUXREITER a Jaroslav KOČA. PMFLib – A TOOLKIT FOR FREE ENERGY CALCULATIONS. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, Czech Republic. 2011.
      RIV/00216224:14740/11:00050024 Konferenční abstrakt. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Mones, Letif (348 Maďarsko) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Simon, Istvan (348 Maďarsko) -- Fuxreiter, Monika (348 Maďarsko) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: free energy; potential of mean force

      Změnila: Mgr. Nikola Kostlánová, Ph.D., učo 12689. Změněno: 4. 4. 2012 10:10.
    5. KULHÁNEK, Petr, Letif MONES, Zora STŘELCOVÁ, Istvan SIMON, Monika FUXREITER a Jaroslav KOČA. PMFLib – A TOOLKIT FOR FREE ENERGY CALCULATIONS II. In Modeling Interactions in Biomolecules V, Kutná Hora, Czech Republic. 2011.
      RIV/00216224:14740/11:00050026 Konferenční abstrakt. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Mones, Letif (348 Maďarsko) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Simon, Istvan (348 Maďarsko) -- Fuxreiter, Monika (348 Maďarsko) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: free energy; potential of mean force

      Změnila: Mgr. Nikola Kostlánová, Ph.D., učo 12689. Změněno: 4. 4. 2012 10:13.
    6. ŠTĚPÁN, Jakub, Zora STŘELCOVÁ, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Reaction Mechanism of MutH Enzyme - Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study 2. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.
      URL
      Název česky: Reakční mechanismus enzymu MutH - Kvantově Mechanická/Molekulově mechanická studie 2
      RIV/00216224:14310/11:00050263 Konferenční abstrakt. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Štěpán, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MutH enzyme QM/MM CPMD Reaction mechanism
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 8. 4. 2012 19:48.
    7. KOLMAN, Viktor, Martin BABINSKÝ, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK a Vladimír ŠINDELÁŘ. Redistribution of electron density in pyridinium and pyrazinium guests induced by complexation with cucurbit[6]uril. New Journal of Chemistry. Oxford: Royal Society of Chemistry, 2011, roč. 35, č. 12, s. 2854-2859. ISSN 1144-0546. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c1nj20631a.
      DOI: 10.1039/C1NJ20631A
      RIV/00216224:14310/11:00050071 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kolman, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: supramolecular chemistry; nuclear magnetic shielding; density-functional theory; point charges; electrostatic repulsion;
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 2. 2. 2012 10:16.
    8. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK, Jan HORNÍČEK, Petr BOUŘ a Michal STRAKA. Simulation of 129Xe NMR chemical shift of Xe@C60 dissolved in liquid benzene. In DFT 2011 Athens : 14th International Density Functional Theory Conference (DFT). 2011.
      URL
      Změnil: Mgr. Stanislav Standara, učo 43015. Změněno: 11. 10. 2011 16:45.
    9. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK, Jan HORNÍČEK, Petr BOUŘ a Michal STRAKA. Simulations of 129 Xe NMR chemical shift of atomic xenon dissolved in liquid benzene. Theoretical Chemistry Accounts. SPRINGER, 2011, roč. 129, 3-5, s. 677-684. ISSN 1432-881X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00214-011-0930-z.
      DOI: 10.1007/s00214-011-0930-z
      RIV/00216224:14740/11:00052404 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Standara, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Horníček, Jan (203 Česká republika) -- Bouř, Petr (203 Česká republika) -- Straka, Michal (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Breit–Pauli perturbation theory; Density functional theory; Dynamical averaging; Relativistic effects; Xe NMR chemical shift
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 18. 1. 2017 15:15.
    10. ALÁN, Jan, Eva DEJMKOVÁ, Petr KULHÁNEK, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Thermodynamics behind CV-IIL binding of saccharides. In 16th European Carbohydrates Symposium. 2011. ISBN 978-88-900948-8-0.
      Název česky: Termodynamika vazby sacharidů do CV-IIL
      RIV/00216224:14310/11:00049907 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Alán, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dejmková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: carbohydrates
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Alán, učo 77541. Změněno: 4. 8. 2011 12:01.
    11. KULHÁNEK, Petr, Jan ALÁN a Jaroslav KOČA. Virtual screening and in silico design of novel inhibitors of bacterial lectins. In Modeling Interactions in Biomolecules V, Kutná Hora, Czech Republic. 2011.
      RIV/00216224:14740/11:00050027 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Alán, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: lectins; virtual screening

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 29. 9. 2011 12:54.
    12. ALÁN, Jan, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Virtual screening and in sillico design of novel inhibitors of bacterial lectins. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2011. ISBN 978-80-210-5549-0.
      Název česky: Virtuální prohledávaní a in sillico návrh nových inhibitorů bakteriálních lektinů
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: Lectin;carbohydrate;PA-IIL;Pseudomonas aeruginosa;lectin;virtual screening
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Alán, učo 77541. Změněno: 2. 11. 2011 17:41.

    2010

    1. RÉBLOVÁ, Kamila, Zora STŘELCOVÁ, Petr KULHÁNEK, Ivana BEŠŠEOVÁ, David H. MATHEWS, Keith VAN NOSTRAND, Ilyas YILDIRIM, Douglas H. TURNER a Jiří ŠPONER. An RNA Molecular Switch: Intrinsic Flexibility of 23S rRNA Helices 40 and 68 5 '-UAA/5 '-GAN Internal Loops Studied by Molecular Dynamics Methods. Journal of Chemical Theory and Computation. 2010, roč. 2010, č. 6, s. 910-929, 19 s. ISSN 1549-9618.
      RIV/00216224:14310/10:00043541 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Réblová, Kamila (203 Česká republika, garant) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Beššeová, Ivana (703 Slovensko) -- Mathews, David H. (840 Spojené státy) -- Van Nostrand, Keith (840 Spojené státy) -- Yildirim, Ilyas (840 Spojené státy) -- Turner, Douglas H. (840 Spojené státy) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: molecular dynamics; free energy; RNA
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 23. 3. 2010 15:52.
    2. KMUNÍČEK, Jan, Zora STŘELCOVÁ a Petr KULHÁNEK. Applicability of Free Energy Calculations using High-Throughput Grid Approach. In Proceedings of International Symposium on Grid Computing (ISGC) 2010. 2010.
      Název česky: Aplikovatelnost výpočtů volné energie pomocí high-throughput gridového přístupu
      Název anglicky: Applicability of Free Energy Calculations using High-Throughput Grid Approach

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 12. 1. 2011 11:32.
    3. KMUNÍČEK, Jan, Daniel KOUŘIL, Luděk MATYSKA, Zora STŘELCOVÁ, Petr KULHÁNEK, Jaroslav KOČA a Eric YEN. Catch-All Virtual Organizations - Solution for Heterogeneous and Disperse Grid Users Communities. In Lin, S. C.; Yen, E. Managed Grids and Cloud Systems in the Asia-Pacific Research Community. New York: Springer, 2010, s. 299-309. ISBN 978-1-4419-6468-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4419-6469-4_22.
      URL
      Název česky: Catch-All virtuální organizace - Řešení pro heterogenní a rozptýlené komunity uživatelů Gridu
      Název anglicky: Catch-All Virtual Organizations - Solution for Heterogeneous and Disperse Grid Users Communities
      RIV: Stať ve sborníku. angličtina. Spojené státy.
      Kmuníček, Jan (203 Česká republika) -- Kouřil, Daniel (203 Česká republika) -- Matyska, Luděk (203 Česká republika) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: virtual organization; grid; Enabling Grids in E-Science
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 9. 2020 15:40.
    4. ALÁN, Jan, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Computational study of lectin-carbohydrate interactions. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010. ISBN 978-80-210-5164-5.
      RIV/00216224:14310/10:00043777 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Alán, Jan (203 Česká republika, garant) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: lectin; carbohydrate; thermodynamic integration; PA-IIL; CV-IIL; molecular modelling
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Alán, učo 77541. Změněno: 22. 4. 2010 09:57.
    5. STŘELCOVÁ, Zora, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Computational Study of the MutH Enzyme Reactivity. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010.
      Název česky: Výpočetní studie reakčního mechanismu enzymu MutH
      RIV/00216224:14310/10:00049618 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Střelcová, Zora (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MutH enzyme reaction mechanism endonucleases QM/MM computational chemistry
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Anísa Kabarová, učo 171777. Změněno: 21. 3. 2012 14:08.
    6. KULHÁNEK, Petr. Distributed Way of Biomolecular Conformational Space Exploration - Experience of grid - CICADA Tool Utilization. 2010.
      Název česky: Distributed Way of Biomolecular Conformational Space Exploration - Experience of grid - CICADA Tool Utilization

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 12. 1. 2011 13:11.
    7. ALÁN, Jan, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Employment of free energy calculations to estimation of carbohydrates affinities towards PA-IIL superfamily lectins. In Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. 2010. ISSN 1211-5894.
      RIV/00216224:14310/10:00043537 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Alán, Jan (203 Česká republika, garant) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: lectin; carbohydrate; thermodynamic integration; PA-IIL; CV-IIL; molecular modelling
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 23. 3. 2010 17:15.
    8. ŠTĚPÁN, Jakub, Petr KULHÁNEK, Zdeněk KŘÍŽ, Jan KMUNÍČEK, Jaroslav KOČA a Luděk MATYSKA. grid-CICADA: Efficient Explorer of Conformational Space of Biomolecular Systems. In 5th EGEE User Forum. 2010.
      URL
      RIV/00216224:14310/10:00051414 Prezentace na konferencích. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Švédsko.
      Štěpán, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kříž, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Kmuníček, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Matyska, Luděk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CICADA; PES; conformational space; folding; grid high-throughput computing; distributed computing
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Anísa Kabarová, učo 171777. Změněno: 21. 3. 2012 14:37.
    9. KOLMAN, Viktor, Petr KULHÁNEK a Vladimír ŠINDELÁŘ. Inclusion of Carboxyl Function Inside of Cucurbiturils and its Use in Molecular Switches. Chemistry – An Asian Journal. WILEY-VCH, 2010, roč. 5, č. 11, s. 6926-6931, 7 s. ISSN 1861-4728.
      URL
      Název anglicky: Inclusion of Carboxyl Function Inside of Cucurbiturils and its Use in Molecular Switches
      RIV/00216224:14310/10:00046367 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Německo.
      Kolman, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cucurbiturils;host-guest systems;ionic liquids;supramolecular chemistry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Ing. Vladimír Šindelář, Ph.D., učo 203255. Změněno: 12. 12. 2011 13:03.
    10. BABINSKÝ, Martin, Petr KULHÁNEK, Viktor KOLMAN, Vladimír ŠINDELÁŘ a Radek MAREK. NMR and Computational Study of Supramolecular Complexes. In 1st EAST-NMR Young Investigators Meeting. 2010.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Babinský, Ph.D., učo 151360. Změněno: 4. 8. 2011 09:40.
    11. STŘELCOVÁ, Zora, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Reaction Mechanism of MutH Enzyme: Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study. In Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. 2010. ISSN 1211-5894.
      RIV/00216224:14310/10:00043539 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Střelcová, Zora (203 Česká republika, garant) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: computational chemistry; MutH; QM/MM
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 23. 3. 2010 17:17.
    12. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Petr BOUŘ a Michal STRAKA. Simulation of 129Xe NMR shift of Xe dissolved in benzene. In Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference - A World Wide Magnetic Resonance Conference. 2010.
      Book of Abstracts

      Klíčová slova anglicky: NMR;xenon;129Xe chemical shifts;DFT;MD;solvent effects;relativistic effects;BPPT

      Změnil: Mgr. Stanislav Standara, učo 43015. Změněno: 29. 12. 2010 13:49.
    13. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK, Jan HORNÍČEK, Petr BOUŘ a Michal STRAKA. Simulations of 129Xe chemical shift of atomic xenon dissolved in liquid benzene. In Winter School in Theoretical Chemistry 2010 - Accurate Molecular Structure by Experiment and Theory. 2010.

      Klíčová slova anglicky: 129Xe NMR chemical shift ; quantum-chemical calculations ; molecular dynamics ; density functional theory ; Breit-Pauli Perturbation Theory ; relativistic effects

      Změnil: Mgr. Stanislav Standara, učo 43015. Změněno: 29. 12. 2010 13:50.
    14. FUKAL, Jiří, Petr KULHÁNEK, Eva FADRNÁ a Jaroslav KOČA. Study of HincII endonuclease by molecular dynamics methods. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology. 2010.
      Název česky: Studium endonucleasy HincII metodami molekulové dynamiky
      RIV/00216224:14310/10:00051450 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Fukal, Jiří (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Fadrná, Eva (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Restriction endonuclease; HincII; Molecular dynamics; Anisotropic thermal diffusion

      Změnila: Mgr. Anísa Kabarová, učo 171777. Změněno: 27. 3. 2012 10:00.
    15. BABINSKÝ, Martin, Petr KULHÁNEK, Viktor KOLMAN, Vladimír ŠINDELÁŘ a Radek MAREK. Štúdium supramolekulárnych komplexov cucurbit[6]urilu pomocou NMR spektroskopie a výpočtovej chémie. In Pokroky v organické, bioorganické a farmaceutické chemii – „LIBLICE 2010“. 2010. ISSN 1213-7103.
      Název anglicky: The Study of Supramolecular Complexes of Cucurbit[6]uril Using NMR Spectroscopy and Computational Chemistry
      Organická chemie. slovenština. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Babinský, Ph.D., učo 151360. Změněno: 20. 7. 2011 16:56.

    2009

    1. KULHÁNEK, Petr, Letif MONES, Istvan SIMON a Monika FUXREITER. Computational Study of MutH Recognition and Catalysis. In Modelling Interactions in Biomolecules IV. 2009. ISBN 978-80-7378-098-2.
      RIV/00216224:14310/09:00039550 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant) -- Mones, Letif (348 Maďarsko) -- Simon, Istvan (348 Maďarsko) -- Fuxreiter, Monika (348 Maďarsko)
      Klíčová slova anglicky: molecular dynamis; MutH
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 23. 3. 2010 17:25.
    2. KOLMAN, Viktor, Radek MAREK, Zora STŘELCOVÁ, Petr KULHÁNEK, Marek NEČAS, Jan ŠVEC a Vladimír ŠINDELÁŘ. Electron Density Shift in Imidazolium Derivatives upon Complexation with Cucurbit[6]uril. Chemistry - A European Journal. WILEY-VCH, 2009, roč. 15, č. 28, s. 6926-6931. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.200900570.
      DOI: 10.1002/chem.200900570
      Název česky: Posun elektronové hustoty u derivátů imidazolia indukovaný komplexací s cucurbit[6]urilem
      RIV/00216224:14310/09:00029441 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Německo.
      Kolman, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cucurbiturils;host-guest systems;ionic liquids;supramolecular chemistry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 17. 6. 2013 14:38.
    3. SOLT, Ivan, Petr KULHÁNEK, Istvan SIMON, Steven WINFIELD, Mike C PAYNE, Gabor CSANYI a Monika FUXREITER. Evaluating Boundary Dependent Errors in QM/MM Simulations. Journal of Physical Chemistry B. New York: American Chemical Society, 2009, roč. 2009, 113(17), s. 5728-5735, 7 s. ISSN 1520-6106.
      Jaderná a kvantová chemie, fotochemie. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: hybrid quantum mechanics/molecular mechanics; force error
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 23. 3. 2010 16:41.
    4. KOLMAN, Viktor, Radek MAREK, Zora STŘELCOVÁ, Petr KULHÁNEK, Marek NEČAS, Jan ŠVEC a Vladimír ŠINDELÁŘ. Charge Localization on Imidazolium Ring upon Complexation with Cucurbit[6]uril. In First International Conference on Cucurbiturils. 2009.
      URL
      Název česky: Lokalizace náboje na imidazoliovém kruhu způsobená complexací s cucurbit[6]urilem
      RIV/00216224:14310/09:00042714 Konferenční abstrakt. Organická chemie. angličtina. Korejská republika.
      Kolman, Viktor (203 Česká republika) -- Marek, Radek (203 Česká republika) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Nečas, Marek (203 Česká republika) -- Švec, Jan (203 Česká republika) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: cucurbiturils;host-guest systems;ionic liquids;supramolecular chemistry
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: prof. Ing. Vladimír Šindelář, Ph.D., učo 203255. Změněno: 17. 7. 2010 18:07.
    5. KOLMAN, Viktor, Radek MAREK, Zora STŘELCOVÁ, Petr KULHÁNEK, Marek NEČAS, Jan ŠVEC a Vladimír ŠINDELÁŘ. Charge Localization on Imidazolium Ring upon Complexation with Cucurbit[6]uril. In 10th International Conference on Calixarenes. 2009.
      URL
      Název česky: Lokalizace náboje na imidazoliovém kruhu způsobená complexací s cucurbit[6]urilem
      Organická chemie. angličtina. Korejská republika.
      Klíčová slova anglicky: cucurbiturils;host-guest systems;ionic liquids;supramolecular chemistry
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: prof. RNDr. Luděk Bláha, Ph.D., učo 15473. Změněno: 29. 4. 2011 14:20.
    6. STŘELCOVÁ, Zora, Petr KULHÁNEK, Jan KMUNÍČEK, Jaroslav KOČA a Luděk MATYSKA. Implementation and Testing of Multiple Walkers Approach Based Free Energy Calculations in the Grid Environment. In GCCP Proceedings. Bratislava, Slovakia: Institute of Informatics SAS, 2009, s. 29-36, 7 s. ISBN 978-80-970145-1-3.
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: free energy; adaptive biasing force method; multiple walkers approach; pseudorotaxanes; molecular shuttle; cucurbit[n]urils; VOCE; MetaCentrum
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 10. 4. 2010 11:08.
    7. ŠTĚPÁN, Jakub, Petr KULHÁNEK, Jaroslav KOČA a Navnit Kumar MISHRA. Implementation of Parallel Analyzes of Molecular Dynamics Simulation Trajectories. 2009.
      Název anglicky: Implementation of Parallel Analyzes of Molecular Dynamics Simulation Trajectories
      RIV/00216224:14310/09:00051200 Konferenční abstrakt. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Štěpán, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Mishra, Navnit Kumar (356 Indie, domácí)
      Klíčová slova anglicky: parallel analysis; molecular dynamics analysis; MMPB/SA
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Iva Klímová, učo 58563. Změněno: 4. 4. 2012 13:28.
    8. STŘELCOVÁ, Zora, Petr KULHÁNEK, Jan KMUNÍČEK, Jaroslav KOČA a Luděk MATYSKA. Large-Scale Free Energy Calculations as Showcase of Worldwide Grid Usability. In 4th EGEE User Forum/OGF 25 and OGF Europe's 2nd International Event. 2009.
      Název česky: Large-Scale Free Energy Calculations as Showcase of Worldwide Grid Usability
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: voce;charon;free energy;multiple walker approach;adaptive biasing force method;supramolecular chemistry;pseudorotaxanes
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 10. 4. 2010 11:11.
    9. KLVAŇA, Martin, Martina PAVLOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Pavel DVOŘÁK, Zbyněk PROKOP, A. STSIAPANAVA, Michal KUTÝ, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, J. DOHNÁLEK, Petr KULHÁNEK, R. WADE a Jiří DAMBORSKÝ. Pathways and Mechanisms for Product Release in the Engineered Haloalkane Dehalogenases Explored using Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations. JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 2009, roč. 2009, č. 00, s. 0000-0000, 10 s. ISSN 0022-2836.
      Název česky: Cesta a mechanismus vzniku produktu v inženýrství haloalkán dehalogenáz použitím klasické a zrychlené molekulárně-dynamické simulace.
      Název anglicky: Pathways and Mechanisms for Product Release in the Engineered Haloalkane Dehalogenases Explored using Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations.
      RIV/00216224:14310/09:00028564 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Stsiapanava, A. (804 Ukrajina) -- Kutý, Michal (203 Česká republika) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika) -- Dohnálek, J. (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Wade, R. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: DhaA haloalkane dehalogenase; mutations; ubstrate 1.2.3-trichloropropane
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 11. 8. 2009 13:26.
    10. MONES, Letif, Petr KULHÁNEK, Istvan SIMON, Alessandro LAIO a Monika FUXREITER. The Energy Gap as a Universal Reaction Coordinate for the Simulation of Chemical Reactions. Journal of Physical Chemistry B. New York: American Chemical Society, 2009, roč. 2009, 113(22), s. 7867-7873, 6 s. ISSN 1520-6106.
      Jaderná a kvantová chemie, fotochemie. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: free energy; energy gap; empirical valence bond
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 23. 3. 2010 16:43.

    2008

    1. MATOUŠEK, Jiří, Michal ČAJAN, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Mechanism of Hydrogen Bond Array Isomerization in Tetrahydroxycalix[4]arene and Tetrahydroxythiacalix[4]arene. Journal of Physical Chemistry A. USA: The American Chemical Society, 2008, roč. 112, č. 1, s. 1076-1084. ISSN 1089-5639.
      Název česky: Mechanismus přesmyku řetězce vodíkových vazeb v Tetrahydroxycalix[4]arenu a Tetrahydroxythiacalix[4]arenu
      RIV/00216224:14310/08:00024135 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Matoušek, Jiří (203 Česká republika) -- Čajan, Michal (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Calixarene DFT RIMP2 Hydrogen bond array mechanism
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 28. 6. 2009 19:52.
    2. MISHRA, Navnit Kumar, Petr KULHÁNEK, Lenka ŠNAJDROVÁ, Martin PETŘEK, Anne IMBERTY a Jaroslav KOČA. Molecular dynamics study of Pseudomonas eruginosa lectin-II complexed with monosaccharides. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. Wiley, 2008, roč. 72, č. 1, s. 382–392. ISSN 0887-3585.
      Název česky: Molecular dynamics study of Pseudomonas eruginosa lectin-II complexed with monosaccharides
      RIV/00216224:14310/08:00025688 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Mishra, Navnit Kumar (356 Indie) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Šnajdrová, Lenka (203 Česká republika) -- Petřek, Martin (203 Česká republika) -- Imberty, Anne (250 Francie) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: PA-IIL lectin; molecular dynamics; calcium ions; binding affinity; water density map; sodium ions; monosaccharide
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 28. 6. 2009 19:52.
    3. KLVAŇA, Martin, Martina PAVLOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Alena STSIAPANAVA, Michal KUTÝ, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, J. DOHNÁLEK, Petr KULHÁNEK, R.C. WADE a Jiří DAMBORSKÝ. Pathways and Mechanisms for Product Exit and Water Exchange in Engineered Haloalkane Dehalogenase DhaA Exploredusing Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations. 2008.
      URL
      Název česky: Cesta a mechanismus finálního produktu a změny vody při inženýrství dehalogenázy DhaA
      Název anglicky: Pathways and Mechanisms for Product Exit and Water Exchange in Engineered Haloalkane Dehalogenase DhaA Exploredusing Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations
      RIV/00216224:14310/08:00026638 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Španělsko.
      Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Stsiapanava, Alena (616 Polsko) -- Kutý, Michal (203 Česká republika) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika) -- Dohnálek, J. (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Wade, R.C. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Pathways and Mechanisms for Product Exit and Water Exchange in Engineered Haloalkane Dehalogenase DhaA Exploredusing Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 30. 10. 2008 15:44.

    2007

    1. MISHRA, Navnit Kumar, Petr KULHÁNEK, Zdenek KRIZ, Michaela WIMMEROVA a Jaroslav KOCA. Computational Studies on PA-IIL Lectin-Carbohydrate Interactions. In Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. 2007. ISSN 1211-5894.
      URL URL
      RIV/00216224:14310/07:00020642 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Mishra, Navnit Kumar (356 Indie) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Kriz, Zdenek (203 Česká republika) -- Wimmerova, Michaela (203 Česká republika) -- Koca, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Computational studies; Molecular modeling; Interaction energy calculation
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 24. 3. 2010 11:09.
    2. RÉBLOVÁ, Kamila, Eva FADRNÁ, Sarzynska JOANNA, Tadeusz KULINSKI, Petr KULHÁNEK, Eric ENNIFAR, Jaroslav KOČA a Jiri SPONER. Conformations of flanking bases in HIV-1 RNA DIS kissing complexes studied by Molecular Dynamics. Biophysical Journal. New York, USA: Rockefeller University, 2007, roč. 93, č. 11, s. 3932-3949. ISSN 0006-3495.
      Název česky: Konformace volných bází v HIV-1 RNA DIS kissing loop komplexech studovaných molekulovou dynamikou
      Název anglicky: Conformations of flanking bases in HIV-1 RNA DIS kissing complexes studied by Molecular Dynamics
      RIV/00216224:14310/07:00022840 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Réblová, Kamila (203 Česká republika) -- Fadrná, Eva (203 Česká republika) -- Joanna, Sarzynska (616 Polsko) -- Kulinski, Tadeusz (616 Polsko) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Ennifar, Eric (250 Francie) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika) -- Sponer, Jiri (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: molecular dynamics simulations; kissing loop complexes; flanking bases; RNA

      Změnila: Mgr. Kamila Réblová, Ph.D., učo 11846. Změněno: 21. 12. 2007 13:49.
    3. MONES, Letif, Petr KULHÁNEK, Jan FLORIAN, Istvan SIMON a Monika FUXREITER. Probing the two-metal ion mechanism in the restriction endonuclease BamHI. Biochemistry. 2007, roč. 2007, 46(50), s. 14514-14523, 9 s. ISSN 0006-2960.
      Název česky: Probing the two-metal ion mechanism in the restriction endonuclease BamHI
      Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: SUBSTRATE-ASSISTED CATALYSIS; DIVALENT METAL-IONS; DNA-POLYMERASE-I; FREE-ENERGY; ECORV ENDONUCLEASE; CRYSTAL-STRUCTURE; ANGSTROM RESOLUTION; ENZYMATIC-REACTIONS; AQUEOUS-SOLUTION; BINDING-SITES
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 30. 6. 2009 12:11.

    2006

    1. PETŘEK, Martin, Jan KMUNÍČEK a Petr KULHÁNEK. Computational Chemistry Achievements within VOCE Environment. Geneva, Switzerland, 2006.
      EGEE'06
      Makromolekulární chemie. angličtina. Švýcarsko.
      Změnil: Ing. Martin Petřek, učo 134056. Změněno: 2. 1. 2007 18:41.
    2. MATOUŠEK, Jiří, Petr KULHÁNEK, Michal ČAJAN a Jaroslav KOČA. Effect of Solvation on Pinched Cone-Pinched Cone Interconversion of Tetraethoxycalix[4]arene and Tetraethoxythiacalix[4]arene. Journal of Physical Chemistry A. 2006, roč. 110, č. 3, s. 861-867. ISSN 1089-5639.
      Název česky: Role solventu v pinched cone - pinched cone interkonverzi tetraethoxycalix[4]arenu a tetraethoxythiacalix[4]arenu
      Název anglicky: Effect of Solvation on Pinched Cone-Pinched Cone Interconversion of Tetraethoxycalix[4]arene and Tetraethoxythiacalix[4]arene
      RIV/00216224:14310/06:00015290 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Matoušek, Jiří (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Čajan, Michal (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: calixarene; calix[4]arene; molecular dynamics; force field; free energy calculations; solvent
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 14. 2. 2007 15:16.
    3. KMUNÍČEK, Jan, Martin PETŘEK a Petr KULHÁNEK. Charon Extension Layer - Universal Toolkit for Grid Applications and Computational Jobs Maintenance. Krakow, Poland: CRW06, 2006.
      Název česky: Charon Extension Layer - Univerzální nástroj pro gridové aplikace a výpočetní prostředky

      Změnil: Ing. Martin Petřek, učo 134056. Změněno: 18. 1. 2007 17:55.
    4. KLVAŇA, Martin, R.C. WADE, Petr KULHÁNEK a Jiří DAMBORSKÝ. Modelling of Product Release and Identification of Export Routes in Haloalkane Dehalogenase DhaA. 2006.
      URL
      Název česky: Modelování produktu a identifikace výstuoní cesty v haloalkán dehalogenáze DhaA.
      Název anglicky: Modelling of Product Release and Identification of Export Routes in Haloalkane Dehalogenase DhaA
      RIV/00216224:14310/06:00017466 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klvaňa, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Wade, R.C. (276 Německo) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: modelling; export route; haloalkan dehalogenases; DhaA.

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 10:58.
    5. SOLIMAN, Namat Ali, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Stereochemistry influence on proton transfer in protonated tripeptide model. JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE. ENGLAND: JOHN WILEY & SONS LTD, 2006, roč. 12, č. 2, s. 191-191. ISSN 1075-2617.
      Název česky: Vliv stereochemie na přenos protonu v protonovaných peptidech
      Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klíčová slova anglicky: proton transfer; protonated peptides; density functional theory
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 16. 3. 2007 07:14.

    2005

    1. KULHÁNEK, Petr, Martin PETŘEK a Jan KMUNÍČEK. CHARON System - A Framework for Comfortable Grid Applications & Jobs Management. Pisa, 2005.
      URL URL
      Název česky: Systém CHARON - Systém pro gridové aplikace a správu úloh
      RIV/00216224:14610/05:00019304 Audiovizuální tvorba. Informatika. angličtina. Itálie.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant) -- Petřek, Martin (203 Česká republika) -- Kmuníček, Jan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: grid; VO; EGEE; CHARON; generic application; job submission

      Změnil: RNDr. David Antoš, Ph.D., učo 3077. Změněno: 5. 1. 2007 15:22.
    2. KMUNÍČEK, Jan, Petr KULHÁNEK a Martin PETŘEK. CHARON System - Framework for Applications and Jobs Management in Grid Environment. In Cracow Grid Workshop 05. Cracow: Academic Computer Center CYFRONET AGH, Cracow, Poland, 2005, s. 332-340. ISBN 83-915141-5-3.
      URL
      Název česky: Systém CHARON - Systém pro aplikace a správu úloh v gridovém prostředí
      RIV/00216224:14610/05:00019305 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Polsko.
      Kmuníček, Jan (203 Česká republika, garant) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Petřek, Martin (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: grid; VO; EGEE; CHARON; generic application; job submission

      Změnil: Mgr. Jan Kmuníček, Ph.D., učo 8766. Změněno: 18. 12. 2006 09:49.
    3. ŠPONER, Judit E, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Petr KULHÁNEK, Jerzy LESZCZYNSKI a Jiří ŠPONER. Non-Watson-Crick base pairing in RNA. Quantum chemical analysis of the cis Watson-Crick/sugar edge base pair family. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A. 2005, roč. 109, č. 10, s. 2292-2301. ISSN 1089-5639.
      Název česky: Non-Watson-Crick párování bazí v RNA. Kvantově-chemická analýza cis Watson-Crick/sugar edge rodiny párů bazí
      RIV/00216224:14310/05:00013729 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Šponer, Judit E (203 Česká republika) -- Špačková, Naděžda (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Leszczynski, Jerzy (840 Spojené státy) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: LARGE RIBOSOMAL-SUBUNIT; NONEMPIRICAL AB-INITIO; CATION-PI INTERACTIONS; HYDRATED MG2+ CATION; CENTER-DOT-O; INTERACTION ENERGIES; ELECTRON CORRELATION; MOLECULAR-DYNAMICS; GUANINE-CYTOSINE; METAL-CATIONS

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 30. 5. 2005 08:37.

    2004

    1. ŠNAJDROVÁ, Lenka, Petr KULHÁNEK, Anne IMBERTY a Jaroslav KOČA. Molecular dynamics simulations of glycosyltransferase LgtC. Carbohydrate Research. 2004, roč. 339, č. 5, s. 995-1006. ISSN 0008-6215.
      Science Direct - Carbohydrate Research: Molecular dynamics simulations of glycosyltransferase LgtC
      Název česky: MD simulace glycosyltransferasy LgtC
      Název anglicky: Molecular dynamics simulations of glycosyltransferase LgtC
      RIV/00216224:14310/04:00009950 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Nizozemské království.
      Šnajdrová, Lenka (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Imberty, Anne (250 Francie) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Galactosyltransferase; Molecular dynamics; Loops opening; Structural water molecules

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 13. 2. 2005 16:31.
    2. KULHÁNEK, Petr, Milan POTÁČEK a Jaroslav KOČA. Quantum-chemical insight into mechanism of combined intra-intermolecular cycloaddition. Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Prague, 2004, roč. 69/2004, č. 1, s. 231-241. ISSN 0010-0765.
      Název česky: Kvantová studie mechanismu intra-intermolekulární cykloadice
      Název anglicky: Quantum-chemical insight into mechanism of combined intra-intermolecular cycloaddition
      RIV/00216224:14310/04:00009915 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Potáček, Milan (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: criss-cross cycloadditions; density functional theory; molecular modeling

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 13. 2. 2005 16:31.

    2003

    1. KULHÁNEK, Petr, Edward W. SCHLAG a Jaroslav KOČA. A Novel Mechanism of Proton Transfer in Protonated Peptides. Journal of the American Chemical Society. Washington, DC., USA: American Chemical Society, 2003, roč. 125, č. 45, s. 13678-13679, 1 s. ISSN 0002-7863.
      URL
      Název anglicky: A Novel Mechanism of Proton Transfer in Protonated Peptides
      RIV/00216224:14310/03:00009226 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Schlag, Edward W. (276 Německo) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: proton transfer; proton exchange; proton interaction; DFT

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 13. 12. 2003 11:36.
    2. KULHÁNEK, Petr, Robert VÍCHA, Tomáš POSPÍŠIL, Richard ČMELÍK a Milan POTÁČEK. Automatizovaný systém zkoušení KERBEROS v2.0. Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2003, roč. 97, č. 8, s. 703-704. ISSN 0009-2770.
      Název anglicky: Automatic system of examination KERBEROS v2.0
      RIV: Článek v odborném periodiku. Pedagogika a školství. čeština. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Vícha, Robert (203 Česká republika) -- Pospíšil, Tomáš (203 Česká republika) -- Čmelík, Richard (203 Česká republika) -- Potáček, Milan (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: e-learnig; testing; preparation for practcal education

      Změnil: prof. RNDr. Milan Potáček, CSc., učo 638. Změněno: 23. 6. 2009 13:25.
    3. KULHÁNEK, Petr, Edward W. SCHLAG a Jaroslav KOČA. Mechanism of Proton Transfer in Short Protonated Oligopeptides. 1. N-Methylacetamide and N2-Acetyl-N1-methylglycinamide. J. Phys. Chem. A. American Chemical Society, 2003, roč. 107, č. 30, s. 5789-5797, 8 s. ISSN 1089-5639.
      URL
      RIV/00216224:14310/03:00008940 Článek v odborném periodiku. Jaderná a kvantová chemie, fotochemie. angličtina. Spojené státy.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Schlag, Edward W. (276 Německo) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: proton transfer; proton exchange; proton interaction; DFT

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 13. 12. 2003 11:44.
    4. LITERÁK, Jaromír, Stanislav RELICH, Petr KULHÁNEK a Petr KLÁN. Temperature Dependent Photochemical Cleavage of 2,5-Dimethylphenacyl Esters. Molecular Diversity. Basel, Switzerland: Kluwer, 2003, roč. 7, 2-4, s. 265-271. ISSN 1381-1991.
      Název anglicky: Temperature Dependent Photochemical Cleavage of 2,5-Dimethylphenacyl Esters
      RIV/00216224:14310/03:00008279 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Švýcarsko.
      Literák, Jaromír (203 Česká republika) -- Relich, Stanislav (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Klán, Petr (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: photochemistry; microwave; protecting groups
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. RNDr. Petr Klán, Ph.D., učo 32829. Změněno: 9. 2. 2007 14:21.

    2002

    1. KULHÁNEK, Petr a Jaroslav KOČA. Influence of Water Molecule To Proton Transfer in Dipeptide Model. In International Chemometric Conference, CHEMOMETRICS VI. 1. vyd. Brno: Masaryk University, 2002, s. O20, 1 s. ISBN 80-210-2918-8.
      RIV/00216224:14310/02:00006730 Stať ve sborníku. Jaderná a kvantová chemie, fotochemie. angličtina. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: proton transfer; proton exchange; proton interaction; DFT

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 20. 5. 2003 14:57.
    2. MAN, Stanislav, Petr KULHÁNEK a Milan POTÁČEK. Kombinované intra-intermolekulární criss-cross cykloadice allenylazinů. Chem. listy. Praha: Česká společnost chemická, 2002, roč. 96, č. 6, s. 404. ISSN 0009-2770.
      Název anglicky: Combined intra-intermolecular criss-cross cycloadditions of allenylazines
      RIV/00216224:14310/02:00006236 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. čeština. Česká republika.
      Man, Stanislav (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Potáček, Milan (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: combined intra-intermolecular criss-cross cycloaddition

      Změnil: prof. RNDr. Milan Potáček, CSc., učo 638. Změněno: 12. 7. 2002 14:36.
    3. KULHÁNEK, Petr a Jaroslav KOČA. Kvantově-chemická studie přenosu protonu v oligopeptidech. Chem. listy. Praha: Česká společnost chemická, 2002, roč. 96, č. 6, s. 425. ISSN 0009-2770.
      Název anglicky: Quantum-chemical Study of Proton Transfer in Oligopeptides
      RIV/00216224:14310/02:00006729 Článek v odborném periodiku. Jaderná a kvantová chemie, fotochemie. čeština. Česká republika.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: proton transfer; DFT; peptides

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 20. 5. 2003 15:00.
    4. MAN, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Milan POTÁČEK a Marek NEČAS. New fused heterocycles by combined intra-intermolecular criss-cross cycloaddition of nonsymmetrical azines. Tetrahedron Letters. Oxford: Pergamon - Elsevier Science, 2002, roč. 36, č. 43, s. 6431-6433. ISSN 0040-4039.
      Název anglicky: New fused heterocycles by combined intra-intermolecular criss-cross cycloaddition of nonsymmetrical azines
      RIV/00216224:14310/02:00006279 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Man, Stanislav (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Potáček, Milan (203 Česká republika, garant) -- Nečas, Marek (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: criss-cross cycloaddition; 1;3-dipolar; nonsymmetrical azine; 1;3;10-triazatricyklo[5.2.1.04;10]dec-6-en-2-one

      Změnil: doc. Mgr. Marek Nečas, Ph.D., učo 18809. Změněno: 25. 6. 2009 11:52.
    5. MAN, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Hana ZACHOVÁ a Milan POTÁČEK. New Type of ortho-peri-fused Heterocycles via Combined Intra-intermolecular Cycloaddition. In 9th Blue Danube Symposium on Heterocyclic Chemistry, Book of Abstracts. 1. vyd. Bratislava, Slovak Republic: Publishing House of Slovak University of Technology, Bratislava, 2002, s. 180. ISBN 80-227-1705-3.
      Název anglicky: New Type of ortho-peri-fused Heterocycles via Combined Intra-intermolecular Cycloaddition
      RIV/00216224:14310/02:00006159 Stať ve sborníku. Organická chemie. angličtina. Slovensko.
      Man, Stanislav (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Zachová, Hana (203 Česká republika) -- Potáček, Milan (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: New fused three five-membered heterocycles; ortho-peri-fused Heterocycles; Combined Intra-intermolecular Cycloaddition; Criss-cross addition

      Změnil: prof. RNDr. Milan Potáček, CSc., učo 638. Změněno: 12. 7. 2002 10:01.
    6. KLÁN, Petr, Radovan RŮŽIČKA, Dominik HEGER, Jaromír LITERÁK, Petr KULHÁNEK a André LOUPY. Temperature-sensitive photochemical aromatic substitution on 4-nitroanisole. Photochemical and Photobiological Sciences. Cambridge, United Kingdom: Royal Society of Chemistry, 2002, roč. 1, č. 12, s. 1012-1017. ISSN 1474-905X.
      Název anglicky: Temperature-sensitive photochemical aromatic substitution on 4-nitroanisole
      RIV/00216224:14310/02:00006717 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klán, Petr (203 Česká republika, garant) -- Růžička, Radovan (203 Česká republika) -- Heger, Dominik (203 Česká republika) -- Literák, Jaromír (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Loupy, André (250 Francie)
      Klíčová slova anglicky: microwave; photochemistry
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. RNDr. Petr Klán, Ph.D., učo 32829. Změněno: 9. 2. 2007 14:21.

    2001

    1. KULHÁNEK, Petr, Robert VÍCHA, Richard ČMELÍK a Milan POTAČEK. Automatizovaný systém zkoušení KERBEROS. In Sborník príspevkov 53. zjazd Chemických spoločností. 1. vyd. Banká Bystrica: FPV Univerzita Mateja Bela v Banskej Bystrici, 2001, s. 138. ISBN 80-89029-22-1.
      Název anglicky: Automatic system of examination KERBEROS
      RIV/00216224:14310/01:00004423 Stať ve sborníku. Pedagogika a školství. čeština. Slovensko.
      Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Vícha, Robert (203 Česká republika) -- Čmelík, Richard (203 Česká republika) -- Potaček, Milan (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: computer; program; examination

      Změnil: prof. RNDr. Milan Potáček, CSc., učo 638. Změněno: 23. 6. 2009 13:24.
    2. KULHÁNEK, Petr, Stanislav MAN a Milan POTÁČEK. Nesymetrický allenylazin jako prekurzor pro smíšené intra-inter-molekulární criss-cross cykloadice. In Zborník príspevkov (53. Zjazd chemických spoločností). 1. vyd. Bánská Bystrica: FPV Univerzita Mateja Bela v Banskej Bystrici, 2001, s. 166-167. č. svazku 3. ISBN 80-89029-24-8.
      Název anglicky: Nonsymetrical allenylazine as precursor for a mixed intra-inter molecular criss-cross cycloadditions
      RIV/00216224:14310/01:00004414 Stať ve sborníku. Organická chemie. čeština. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: criss-cross cykloaddition;mixed intra - intermolecular; allenylazine; allenylaldehyde; propargylvinylethers

      Změnil: prof. RNDr. Milan Potáček, CSc., učo 638. Změněno: 26. 9. 2001 16:07.

    1999

    1. POTÁČEK, Milan, Petr KULHÁNEK a Jiří VERNER. Criss-cross Cycloaddition - Source of New Heterocyclic Compounds. In Boook of Abstracts (17 th International Congress of Heterocyclic Chemistry). 1. vyd. Wien: Vienna University of Technology, 1999, s. 197. Book of Abstracts (17th ICHC).
      RIV/00216224:14310/99:00001163 Stať ve sborníku. Organická chemie. angličtina. Rakousko.
      Změnil: prof. RNDr. Milan Potáček, CSc., učo 638. Změněno: 24. 2. 2000 16:16.
Zobrazeno: 5. 5. 2024 10:43