VLBC0321s Biochemie I - seminář

Lékařská fakulta
podzim 2023
Rozsah
0/4/0. 60. 7 kr. Ukončení: z.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
doc. PharmDr. Jiří Kos, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jindra Smutná, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. David Galuška (pomocník)
PharmDr. Kristýna Šebrlová, Ph.D. (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
VLBC0321s/01: Po 14:00–15:40 A16/213, St 8:00–9:40 A16/213, J. Smutná
VLBC0321s/02: Po 14:00–15:40 A16/213, St 8:00–9:40 A16/213, J. Smutná
VLBC0321s/03: Po 12:00–13:40 A16/213, St 12:00–13:40 A16/215, J. Gregorová, O. Peš
VLBC0321s/04: Po 12:00–13:40 A16/213, St 12:00–13:40 A16/215, J. Gregorová, O. Peš
VLBC0321s/05: Po 12:00–13:40 A16/215, St 12:00–13:40 A16/213, M. Králíková
VLBC0321s/06: Po 12:00–13:40 A16/215, St 12:00–13:40 A16/213, M. Králíková
VLBC0321s/07: Út 13:00–14:40 A16/215, Čt 13:00–14:40 A16/213, Z. Fohlerová, J. Kos, M. Tomandlová
VLBC0321s/08: Út 13:00–14:40 A16/215, Čt 13:00–14:40 A16/213, Z. Fohlerová, J. Kos, M. Tomandlová
VLBC0321s/09: Út 12:00–13:40 A16/213, Pá 12:00–13:40 A16/215, H. Paulová, J. Slanina
VLBC0321s/10: Út 12:00–13:40 A16/213, Pá 12:00–13:40 A16/215, H. Paulová, J. Slanina
VLBC0321s/11: Po 14:00–15:40 A16/215, Pá 12:00–13:40 A16/213, E. Táborská
VLBC0321s/12: Po 14:00–15:40 A16/215, Pá 12:00–13:40 A16/213, E. Táborská
VLBC0321s/13: Po 16:00–17:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/213, J. Dostál, M. Králíková
VLBC0321s/14: Po 16:00–17:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/213, J. Dostál, M. Králíková
VLBC0321s/15: Po 10:00–11:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/215, H. Paulová, J. Smutná
VLBC0321s/16: Po 10:00–11:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/215, H. Paulová, J. Smutná
VLBC0321s/17: Po 17:00–18:40 A16/213, St 14:00–15:40 A16/215, O. Peš, M. Tomandlová
VLBC0321s/18: Po 17:00–18:40 A16/213, St 14:00–15:40 A16/215, O. Peš, M. Tomandlová
VLBC0321s/19: Po 8:00–9:40 A16/215, Pá 8:00–9:40 A16/215, J. Dostál, J. Gregorová
VLBC0321s/20: Po 8:00–9:40 A16/215, Pá 8:00–9:40 A16/215, J. Dostál, J. Gregorová
Předpoklady
VLBI0222p Lékařská biologie II-přednáška && VLBF011p Biofyzika - přednáška
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu Biochemie I je procvičit základní metabolické pochody a dráhy probíhající na buněčné úrovni.
Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu bude student schopen:
- porozumět významu základních chemických pojmů a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a proteinů a jejich návaznosti.
- rozumět principům získávání, využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
- porozumět funkci buněčných membrán a principu kompartmentace na buněčné úrovni a transportním procesům v membráně.
- znát syntézu proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy, porozumět vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
- znát funkci hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.
- pochopit principy některých chorob na molekulární úrovni.
Osnova
  • Úvod do biochemie. Elektrolyty, aktivita iontů, osmolarita, osmolalita, tonicita, onkotický tlak.
  • Acidobazické děje, slabé kyseliny/báze. Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
  • Vlastnosti organických sloučenin (alkoholy, aldehydy, ketony, kyseliny a jejich deriváty).
  • Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie. Makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
  • Enzymy – aktivita, enzymová kinetika, kinetické parametry enzymů, inhibice enzymů.
  • Kofaktory enzymů – základní rysy struktury, funkce, vztah k vitaminům.
  • Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxidační fosforylace.
  • Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk.
  • Glykolýza. Glukoneogeneze.
  • Metabolismus glykogenu. Pentosafosfátová dráha. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
  • Struktura a vlastnosti lipidů. Tenzidy. Buněčné membrány, membránový transport.
  • Lipidy ve výživě. Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin. Metabolismus ketolátek.
  • Syntéza, elongace a desaturace mastných kyselin.
  • Metabolismus cholesterolu. Metabolismus žlučových kyselin.
  • Metabolismus triacylglycerolů, fosfolipidů.
  • Lipoperoxidace. Eikosanoidy. Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku.
  • Struktura a funkce hemoglobinu
  • Struktura a vlastnosti aminokyselin, peptidů, proteinů. Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů.
  • Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
  • Katabolismus aminokyselin. Syntéza neesenciálních aminokyselin, vratné přeměny.
  • Přeměny aminokyselin na specializované produkty. Syntéza hemu.
  • Struktura a význam bází/nukleotidů. Močová kyselina. Společné rysy biosyntézy nukleotidů.
  • Metabolismus purinových/pyrimidinových nukleotidů. Význam tetrahydrofolátu a vitaminu B12.
  • Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce, syntéza proteinů, posttranslační modifikace proteinů.
Literatura
    povinná literatura
  • Interaktivní osnova v IS MUNI.
  • TOMANDL, Josef, Jiří DOSTÁL, Hana PAULOVÁ a Eva TÁBORSKÁ. Základy lékařské chemie a biochemie. 5. dotisk 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2023, 212 s. ISBN 978-80-210-6973-2. info
  • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
    doporučená literatura
  • LIEBERMAN, Michael a Alisa PEET. Marks' basic medical biochemistry : a clinical approach. Illustrated by Matthew Chansky. 5th edition. Philadelphia: Wolters Kluwer, 2018, xii, 1051. ISBN 9781496387721. info
  • VASUDEVAN, D. M., S. SREEKUMARI a Kannan VAIDYANATHAN. Úvod do všeobecnej a klinicky aplikovanej biochémie. Edited by Jozef Čársky. Prvé slovenské vydanie. Bratislava: Balneotherma s.r.o., 2015, 669 stran. ISBN 9788097015688. info
  • KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
Výukové metody
Aktivní procvičování a diskuze.
Metody hodnocení
Zápočet. Podmínky pro udělení zápočtu:
1) absolvování všech seminářů a 2) splnění požadavků průběžných kontrol (testů).
Při nesplnění požadavků průběžných kontrol je nutno psát opravný test, který je možné jedenkrát opakovat. Opravný test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky.
Podrobné podmínky jsou zveřejněny ve Studijních materiálech /Interaktivní osnově předmětu.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022.

VLBC0321s Biochemie I - seminář

Lékařská fakulta
podzim 2022
Rozsah
0/4/0. 60. 7 kr. Ukončení: z.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jindra Smutná, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Galuška (pomocník)
Mgr. Patrícia Kittová (pomocník)
doc. PharmDr. Jiří Kos, Ph.D. (pomocník)
Bc. Ivana Ševčíková (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
VLBC0321s/01: Po 14:00–15:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/215, M. Králíková, J. Smutná
VLBC0321s/02: Po 14:00–15:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/215, M. Králíková, J. Smutná
VLBC0321s/03: Po 14:00–15:40 A16/213, St 14:00–15:40 A16/215, H. Paulová
VLBC0321s/04: Po 14:00–15:40 A16/213, St 14:00–15:40 A16/215, H. Paulová
VLBC0321s/05: Po 12:00–13:40 A16/215, St 12:00–13:40 A16/215, M. Králíková
VLBC0321s/06: Po 12:00–13:40 A16/215, St 12:00–13:40 A16/215, M. Králíková
VLBC0321s/07: Út 12:00–13:40 A16/213, Pá 12:00–13:40 A16/213, O. Peš, J. Smutná
VLBC0321s/08: Út 12:00–13:40 A16/213, Pá 12:00–13:40 A16/213, O. Peš, J. Smutná
VLBC0321s/09: Po 16:00–17:40 A16/215, St 14:00–15:40 A16/213, O. Peš
VLBC0321s/10: Po 16:00–17:40 A16/215, St 14:00–15:40 A16/213, O. Peš
VLBC0321s/11: Po 8:00–9:40 A16/213, St 8:00–9:40 A16/213, J. Slanina
VLBC0321s/12: Po 8:00–9:40 A16/213, St 8:00–9:40 A16/213, J. Slanina
VLBC0321s/13: Út 15:00–16:40 A16/213, Čt 15:00–16:40 A16/215, O. Peš, M. Tomandlová
VLBC0321s/14: Út 15:00–16:40 A16/213, Čt 15:00–16:40 A16/215, O. Peš, M. Tomandlová
VLBC0321s/15: Po 10:00–11:40 A16/213, Pá 10:00–11:40 A16/215, J. Dostál
VLBC0321s/16: Po 10:00–11:40 A16/213, Pá 10:00–11:40 A16/215, J. Dostál
VLBC0321s/17: Po 12:00–13:40 A16/213, St 16:00–17:40 A16/215, E. Táborská
VLBC0321s/18: Po 12:00–13:40 A16/213, St 16:00–17:40 A16/215, E. Táborská
VLBC0321s/19: Po 8:00–9:40 A16/215, St 8:00–9:40 A16/215, J. Gregorová
VLBC0321s/20: Po 8:00–9:40 A16/215, St 8:00–9:40 A16/215, J. Gregorová
Předpoklady
VLBI0222p Lékařská biologie II-přednáška && VLBF011p Biofyzika - přednáška
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Seminář slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu student bude schopen:
- rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
- Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
- Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
- Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
- být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
- má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
- být obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.
Osnova
  • Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
  • Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
  • Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
  • Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
  • Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
  • Biochemicky významné organické sloučeniny.
  • Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
  • Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
  • Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
  • Membránový transport, struktura membrán.
  • Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
  • Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
  • Metabolismus vybraných aminokyselin.
  • Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
  • Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
  • Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
  • Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
  • Replikace, transkripce, proteosyntéza.
Literatura
    povinná literatura
  • Seminární texty dostupné v IS.
  • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
    doporučená literatura
  • LIEBERMAN, Michael a Alisa PEET. Marks' basic medical biochemistry : a clinical approach. Illustrated by Matthew Chansky. 5th edition. Philadelphia: Wolters Kluwer, 2018, xii, 1051. ISBN 9781496387721. info
  • VASUDEVAN, D. M., S. SREEKUMARI a Kannan VAIDYANATHAN. Úvod do všeobecnej a klinicky aplikovanej biochémie. Edited by Jozef Čársky. Prvé slovenské vydanie. Bratislava: Balneotherma s.r.o., 2015, 669 stran. ISBN 9788097015688. info
  • KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
Výukové metody
Teoretická příprava a diskuze k jednotlivým tématům.
Metody hodnocení
Zápočet. Podmínky udělení zápočtu (obě podmínky musí být splněny):
  • Absolvování všech seminářů. Zameškaná výuka musí být omluvena cestou studijního oddělení a nahrazena.
  • Alespoň 70% úspěšnost ze součtu bodů z průběžných testů nebo alespoň 50% úspěšnost ze zápočtového testu, zápočtový test je možno test jednou opakovat.
    Podrobné aktuální podmínky ukončení předmětu jsou dostupné v Informačním systému (Studijní materiály-Organizační pokyny).
    • Další komentáře
    Předmět je vyučován každoročně.
    Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
    Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2023.

    VLBC0321s Biochemie I - seminář

    Lékařská fakulta
    podzim 2021
    Rozsah
    0/4/0. 60. 7 kr. Ukončení: z.
    Vyučováno prezenčně.
    Vyučující
    doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
    Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
    RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
    doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Jindra Smutná, Ph.D. (cvičící)
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
    doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
    Bc. Ivana Ševčíková (pomocník)
    Garance
    doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D.
    Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Kontaktní osoba: prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Rozvrh seminárních/paralelních skupin
    VLBC0321s/01: Po 10:00–11:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/215, J. Gregorová, M. Králíková
    VLBC0321s/02: Po 10:00–11:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/215, J. Gregorová, M. Králíková
    VLBC0321s/03: Po 10:00–11:40 A16/213, Pá 10:00–11:40 A16/215, J. Dostál, M. Králíková
    VLBC0321s/04: Po 10:00–11:40 A16/213, Pá 10:00–11:40 A16/215, J. Dostál, M. Králíková
    VLBC0321s/05: Út 12:00–13:40 A16/213, Pá 12:00–13:40 A16/215, J. Slanina
    VLBC0321s/06: Út 12:00–13:40 A16/213, Pá 12:00–13:40 A16/215, J. Slanina
    VLBC0321s/07: Po 16:00–17:40 A16/213, St 16:00–17:40 A16/215, E. Táborská
    VLBC0321s/08: Po 16:00–17:40 A16/213, St 16:00–17:40 A16/215, E. Táborská
    VLBC0321s/09: Po 14:00–15:40 A16/213, St 14:00–15:40 A16/215, J. Gregorová, H. Paulová
    VLBC0321s/10: Po 14:00–15:40 A16/213, St 14:00–15:40 A16/215, J. Gregorová, H. Paulová
    VLBC0321s/11: Út 15:00–16:40 A16/215, Čt 15:00–16:40 A16/215, M. Králíková, M. Tomandlová
    VLBC0321s/12: Út 15:00–16:40 A16/215, Čt 15:00–16:40 A16/215, M. Králíková, M. Tomandlová
    VLBC0321s/13: Po 12:00–13:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/213, H. Paulová, J. Smutná
    VLBC0321s/14: Po 12:00–13:40 A16/215, St 10:00–11:40 A16/213, H. Paulová, J. Smutná
    VLBC0321s/15: Po 16:00–17:40 A16/215, Čt 17:00–18:40 A16/215, J. Dostál, H. Paulová
    VLBC0321s/16: Po 16:00–17:40 A16/215, Čt 17:00–18:40 A16/215, J. Dostál, H. Paulová
    VLBC0321s/17: Po 8:00–9:40 A16/215, St 8:00–9:40 A16/213, M. Králíková, J. Slanina
    VLBC0321s/18: Po 8:00–9:40 A16/215, St 8:00–9:40 A16/213, M. Králíková, J. Slanina
    VLBC0321s/19: Po 8:00–9:40 A16/213, St 12:00–13:40 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/20: Po 8:00–9:40 A16/213, St 12:00–13:40 A16/213, J. Gregorová
    Předpoklady
    VLBI0222p Lékařská biologie II-přednáška && VLBF011p Biofyzika - přednáška
    Omezení zápisu do předmětu
    Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
    Mateřské obory/plány
    Cíle předmětu
    Seminář slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.
    Výstupy z učení
    Po absolvování předmětu student bude schopen:
    - rozumět významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
    - Popsat roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
    - Diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
    - Popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
    - Rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
    - být obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
    - má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
    - být obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.
    Osnova
    • Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
    • Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
    • Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
    • Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
    • Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
    • Biochemicky významné organické sloučeniny.
    • Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
    • Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
    • Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
    • Membránový transport, struktura membrán.
    • Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
    • Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
    • Metabolismus vybraných aminokyselin.
    • Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
    • Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
    • Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
    • Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
    • Replikace, transkripce, proteosyntéza.
    Literatura
      povinná literatura
    • Seminární texty dostupné v IS.
    • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
      doporučená literatura
    • LIEBERMAN, Michael a Alisa PEET. Marks' basic medical biochemistry : a clinical approach. Illustrated by Matthew Chansky. 5th edition. Philadelphia: Wolters Kluwer, 2018, xii, 1051. ISBN 9781496387721. info
    • VASUDEVAN, D. M., S. SREEKUMARI a Kannan VAIDYANATHAN. Úvod do všeobecnej a klinicky aplikovanej biochémie. Edited by Jozef Čársky. Prvé slovenské vydanie. Bratislava: Balneotherma s.r.o., 2015, 669 stran. ISBN 9788097015688. info
    • KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
    Výukové metody
    Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály
    Metody hodnocení
    Zápočet. Podmínky udělení zápočtu (obě podmínky musí být splněny):
  • Účast na všech seminářích. Zameškaná výuka musí být omluvena cestou studijního oddělení a nahrazena.
  • Alespoň 70% úspěšnost ze všech dílčích testů nebo 50% úspěšnost ze zápočtového testu, test je možno test pouze jednou opakovat.
    Podrobné aktuální podmínky ukončení předmětu jsou dostupné v Informačním systému (Studijní materiály-Organizační pokyny).
    • Další komentáře
    Předmět je vyučován každoročně.
    Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
    Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2022, podzim 2023.

    VLBC0321s Biochemie I - seminář

    Lékařská fakulta
    podzim 2020
    Rozsah
    0/2/0. 30. 4 kr. Ukončení: z.
    Vyučováno částečně online.
    Vyučující
    doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
    Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
    RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
    doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
    doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
    doc. Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D. (pomocník)
    Garance
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Kontaktní osoba: Monika Šudáková
    Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Rozvrh seminárních/paralelních skupin
    VLBC0321s/01: Po 8:00–9:40 A16/215, J. Slanina
    VLBC0321s/02: Po 8:00–9:40 A16/215, J. Slanina
    VLBC0321s/03: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/04: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/05: Po 12:00–13:40 A16/213, M. Tomandlová
    VLBC0321s/06: Po 12:00–13:40 A16/213, M. Tomandlová
    VLBC0321s/07: Po 16:00–17:40 A16/215, E. Táborská
    VLBC0321s/08: Po 16:00–17:40 A16/215, E. Táborská
    VLBC0321s/09: Po 14:00–15:40 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/10: Po 14:00–15:40 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/11: Po 16:00–17:40 A16/213, J. Tomandl
    VLBC0321s/12: Po 16:00–17:40 A16/213, J. Tomandl
    VLBC0321s/13: Po 12:00–13:40 A16/215, M. Hlaváčová
    VLBC0321s/14: Po 12:00–13:40 A16/215, M. Hlaváčová
    VLBC0321s/15: Po 10:00–11:40 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/16: Po 10:00–11:40 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/17: Po 10:00–11:40 A16/215, J. Dostál
    VLBC0321s/18: Po 10:00–11:40 A16/215, J. Dostál
    Předpoklady
    VLBI0222c Lékařská biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení
    Omezení zápisu do předmětu
    Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
    Mateřské obory/plány
    Cíle předmětu
    Semináře slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.
    Výstupy z učení
    Po absolvování předmětu rozumí významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
    Popíše roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
    Diskutuje vlastnosti a funkci enzymů
    Popisuje základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
    Rozumí principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
    Je obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
    Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
    Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.
    Osnova
    • 1A: Úvod do biochemie.
    • 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
    • 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
    • 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
    • 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
    • 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
    • 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
    • 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
    • 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
    • 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
    • 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
    • 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
    • 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
    • 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
    • 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
    • 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
    • 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
    • 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
    • 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
    • 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
    • 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
    • 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
    • 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
    • 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
    • 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
    • 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
    • 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
    • 14B: Náhradní témata, konsultace.
    Literatura
      povinná literatura
    • Podklady k přednáškám dostupné v IS
    • Seminární texty dostupné v IS.
    • KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
    • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
    Výukové metody
    Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály
    Metody hodnocení
    Základní podmínkou je absolvování všech seminářů. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat. V závislosti na epidemiologické situaci mohou být podmínky získání zápočtu modifikovány. Aktuální podmínky budou ve Studijních materiálech předmětu v Organizačních pokynech.
    Další komentáře
    Předmět je vyučován každoročně.
    Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
    Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023.

    VLBC0321s Biochemie I - seminář

    Lékařská fakulta
    podzim 2019
    Rozsah
    0/2/0. 30. 4 kr. Ukončení: z.
    Vyučující
    doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
    Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
    RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
    doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
    doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
    PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
    Lenka Nerudová (pomocník)
    Garance
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Kontaktní osoba: prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Rozvrh seminárních/paralelních skupin
    VLBC0321s/01: Po 10:00–11:40 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/02: Po 10:00–11:40 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/03: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/04: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/05: Út 12:00–13:40 A16/213, M. Hlaváčová
    VLBC0321s/06: Út 12:00–13:40 A16/213, M. Hlaváčová
    VLBC0321s/07: Po 15:00–16:40 A16/213, J. Dostál
    VLBC0321s/08: Po 15:00–16:40 A16/213, J. Dostál
    VLBC0321s/09: Út 16:00–17:40 A16/215, M. Tomandlová
    VLBC0321s/10: Út 16:00–17:40 A16/215, M. Tomandlová
    VLBC0321s/11: Út 14:00–15:40 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/12: Út 14:00–15:40 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/13: Po 13:00–14:40 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/14: Po 13:00–14:40 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/15: Po 8:00–9:40 A16/215, J. Slanina
    VLBC0321s/16: Po 8:00–9:40 A16/215, J. Slanina
    Předpoklady
    VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení
    Omezení zápisu do předmětu
    Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
    Mateřské obory/plány
    Cíle předmětu
    Semináře slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.
    Výstupy z učení
    Po absolvování předmětu rozumí významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
    Popíše roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
    Diskutuje vlastnosti a funkci enzymů
    Popisuje základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
    Rozumí principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
    Je obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
    Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
    Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.
    Osnova
    • 1A: Úvod do biochemie.
    • 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
    • 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
    • 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
    • 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
    • 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
    • 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
    • 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
    • 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
    • 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
    • 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
    • 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
    • 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
    • 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
    • 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
    • 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
    • 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
    • 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
    • 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
    • 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
    • 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
    • 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
    • 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
    • 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
    • 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
    • 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
    • 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
    • 14B: Náhradní témata, konsultace.
    Literatura
      povinná literatura
    • Podklady k přednáškám dostupné v IS
    • Seminární texty dostupné v IS.
    • KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
    • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
    Výukové metody
    Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály
    Metody hodnocení
    Základní podmínkou je absolvování všech seminářů. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.
    Další komentáře
    Předmět je vyučován každoročně.
    Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
    Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023.

    VLBC0321s Biochemie I - seminář

    Lékařská fakulta
    podzim 2018
    Rozsah
    0/2/0. 30. 4 kr. Ukončení: z.
    Vyučující
    Ing. Martina Čarnecká, Ph.D. (cvičící)
    doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
    Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
    RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
    doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
    doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
    PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
    Lenka Nerudová (pomocník)
    Mgr. Lucie Novotná (pomocník)
    Mgr. Anna Pleskačová, Ph.D. (pomocník)
    Mgr. Roman Sándor, Ph.D. (pomocník)
    Garance
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Kontaktní osoba: prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Rozvrh seminárních/paralelních skupin
    VLBC0321s/01: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Slanina
    VLBC0321s/02: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Slanina
    VLBC0321s/03: Po 10:00–11:40 A16/215, J. Tomandl
    VLBC0321s/04: Po 10:00–11:40 A16/215, J. Tomandl
    VLBC0321s/05: Út 13:00–14:40 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/06: Út 13:00–14:40 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/07: Po 16:00–17:40 A16/215, J. Gregorová
    VLBC0321s/08: Út 15:00–16:40 A16/215, M. Tomandlová
    VLBC0321s/09: Po 16:00–17:40 A16/215, J. Gregorová
    VLBC0321s/10: Út 15:00–16:40 A16/215, M. Tomandlová
    VLBC0321s/11: Po 14:00–15:40 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/12: Po 14:00–15:40 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/13: Po 8:00–9:40 A16/215, H. Paulová
    VLBC0321s/14: Po 8:00–9:40 A16/215, H. Paulová
    VLBC0321s/15: Út 17:00–18:40 A16/215, J. Dostál
    VLBC0321s/16: Út 17:00–18:40 A16/215, J. Dostál
    Předpoklady
    VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení
    Omezení zápisu do předmětu
    Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
    Mateřské obory/plány
    Cíle předmětu
    Semináře slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.
    Výstupy z učení
    Po absolvování předmětu rozumí významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
    Popíše roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
    Diskutuje vlastnosti a funkci enzymů
    Popisuje základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
    Rozumí principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
    Je obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
    Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
    Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.
    Osnova
    • Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
    • Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
    • Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
    • Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
    • Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
    • Biochemicky významné organické sloučeniny.
    • Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
    • Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
    • Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
    • Membránový transport, struktura membrán.
    • Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
    • Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
    • Metabolismus vybraných aminokyselin.
    • Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
    • Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
    • Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
    • Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
    • Replikace, transkripce, proteosyntéza.
    Literatura
      povinná literatura
    • Seminární texty dostupné v IS.
    Výukové metody
    Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály
    Metody hodnocení
    Základní podmínkou je absolvování všech seminářů. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.
    Další komentáře
    Předmět je vyučován každoročně.
    Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
    Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023.

    VLBC0321s Biochemie I - seminář

    Lékařská fakulta
    podzim 2017
    Rozsah
    0/2/0. 4 kr. Ukončení: z.
    Vyučující
    Ing. Martina Čarnecká, Ph.D. (cvičící)
    doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
    Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
    RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
    doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
    doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
    PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
    Lenka Nerudová (pomocník)
    Mgr. Lucie Novotná (pomocník)
    Mgr. Anna Pleskačová, Ph.D. (pomocník)
    Mgr. Roman Sándor, Ph.D. (pomocník)
    Mgr. Ondřej Wiewiorka, Ph.D. (pomocník)
    Garance
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Rozvrh seminárních/paralelních skupin
    VLBC0321s/01: Po 7:30–9:10 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/02: Po 7:30–9:10 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/03: Po 9:30–11:10 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/04: Po 9:30–11:10 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/05: Út 13:00–14:40 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/06: Út 13:00–14:40 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/07: Po 16:20–18:00 A16/213, M. Čarnecká
    VLBC0321s/08: Út 14:50–16:30 A16/213, M. Tomandlová
    VLBC0321s/09: Po 16:20–18:00 A16/213, M. Čarnecká
    VLBC0321s/10: Út 14:50–16:30 A16/213, M. Tomandlová
    VLBC0321s/11: Po 14:00–15:40 A16/213, J. Slanina
    VLBC0321s/12: Po 14:00–15:40 A16/213, J. Slanina
    VLBC0321s/13: Po 7:30–9:10 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/14: Po 7:30–9:10 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/15: Út 17:00–18:40 A16/213, J. Dostál
    VLBC0321s/16: Út 17:00–18:40 A16/213, J. Dostál
    VLBC0321s/17: Po 11:30–13:10 A16/213, J. Tomandl
    VLBC0321s/18: Po 11:30–13:10 A16/213, J. Tomandl
    Předpoklady
    VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení
    Omezení zápisu do předmětu
    Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
    Mateřské obory/plány
    Cíle předmětu
    Semináře slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.
    Výstupy z učení
    Po absolvování předmětu rozumí významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
    Popíše roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
    Diskutuje vlastnosti a funkci enzymů
    Popisuje základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
    Rozumí principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
    Je obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
    Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
    Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.
    Osnova
    • Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
    • Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
    • Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
    • Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
    • Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
    • Biochemicky významné organické sloučeniny.
    • Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
    • Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
    • Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
    • Membránový transport, struktura membrán.
    • Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
    • Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
    • Metabolismus vybraných aminokyselin.
    • Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
    • Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
    • Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
    • Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
    • Replikace, transkripce, proteosyntéza.
    Literatura
      povinná literatura
    • Seminární texty dostupné v IS.
    Výukové metody
    Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály
    Metody hodnocení
    Základní podmínkou je absolvování všech seminářů. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.
    Další komentáře
    Předmět je vyučován každoročně.
    Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
    Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023.

    VLBC0321s Biochemie I - seminář

    Lékařská fakulta
    podzim 2016
    Rozsah
    0/2/0. 4 kr. Ukončení: z.
    Vyučující
    Ing. Martina Čarnecká, Ph.D. (cvičící)
    doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
    MUDr. Lenka Gescheidtová, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Milena Matejovičová, Ph.D. (cvičící)
    RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
    doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
    MUDr. RNDr. Michal Řiháček, Ph.D., EuSpLM (cvičící)
    Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
    doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
    Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
    PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
    Lenka Nerudová (pomocník)
    Mgr. Lucie Novotná (pomocník)
    Mgr. Anna Pleskačová, Ph.D. (pomocník)
    Mgr. Roman Sándor, Ph.D. (pomocník)
    Garance
    prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
    Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
    Rozvrh seminárních/paralelních skupin
    VLBC0321s/01: Po 7:30–9:10 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/02: Po 7:30–9:10 A16/213, E. Táborská
    VLBC0321s/03: Po 9:30–11:10 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/04: Po 9:30–11:10 A16/213, J. Gregorová
    VLBC0321s/05: Út 13:00–14:40 A16/213, M. Tomandlová
    VLBC0321s/06: Út 13:00–14:40 A16/213, M. Tomandlová
    VLBC0321s/07: Po 16:20–18:00 A16/213, M. Čarnecká
    VLBC0321s/08: Út 14:50–16:30 A16/213, J. Tomandl
    VLBC0321s/09: Po 16:20–18:00 A16/213, M. Čarnecká
    VLBC0321s/10: Út 14:50–16:30 A16/213, J. Tomandl
    VLBC0321s/11: Po 14:00–15:40 A16/213, J. Slanina
    VLBC0321s/12: Po 14:00–15:40 A16/213, J. Slanina
    VLBC0321s/13: Po 7:30–9:10 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/14: Po 7:30–9:10 A16/213, H. Paulová
    VLBC0321s/15: Út 17:00–18:40 A16/213, J. Dostál
    VLBC0321s/16: Út 17:00–18:40 A16/213, J. Dostál
    VLBC0321s/17: Po 11:30–13:10 A16/213, M. Králíková
    VLBC0321s/18: Po 11:30–13:10 A16/213, M. Králíková
    Předpoklady
    VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení
    Omezení zápisu do předmětu
    Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
    Mateřské obory/plány
    Cíle předmětu
    Semináře slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. Jsou probírány základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na biochemické dráhy v buňkách. Po absolvování předmětu je student schopen diskutovat principy acidobazických, srážecích a redoxních reakcí, je obeznámen s rolí makro- a mikrobiogenních prvků v organismu,  vlastnostmi a funkcí enzymů, aktivně popisuje základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti. Rozumí principům získávání energie pochody na buněčné úrovni. Je obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně. Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce po translaci a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů. Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy. Porozumí principům některých chorob na molekulární úrovni.
    Osnova
    • Chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků.
    • Voda (vlastnosti, distribuce v těle), elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, osmolalita, osmolarita.
    • Acidobazické děje (pH, hodnoty pH v organismu). Pufry, Hendersonova-Hasselbalchova rovnice.
    • Úvod do bioenergetiky (Gibbsova energie, ATP a makroergní sloučeniny a jejich vznik, chemická rovnováha).
    • Redoxní rovnováhy (elektrodový potenciál, Nernstova-Petersova rovnice, biologické redoxní systémy).
    • Biochemicky významné organické sloučeniny.
    • Hemoglobin, struktura, saturace hemoglobinu kyslíkem, glykace hemoglobinu, hemoglobinopatie.
    • Kinetika enzymových reakcí, kvantifikace enzymu, optický test, rychlost enzymové reakce, saturační křivka, inhibitory, izoenzymy.
    • Kofaktory oxidoreduktas, kofaktory transferas.
    • Membránový transport, struktura membrán.
    • Metabolismus glukosy, glykolýza, glukoneogeneze, glykogen.
    • Metabolismus proteinů, transaminace, deaminace, detoxikace amoniaku.
    • Metabolismus vybraných aminokyselin.
    • Metabolismus lipidů, beta-oxidace MK, ketolátky, syntéza MK, syntéza lipidů a cholesterolu.
    • Peroxidace lipidů. Desaturace MK. Ikosanoidy.
    • Citrátový cyklus. Syntéza hemu.
    • Respirační řetězec, aerobní fosforylace.
    • Replikace, transkripce, proteosyntéza.
    Výukové metody
    Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály
    Metody hodnocení
    Základní podmínkou je absolvování všech seminářů. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.
    Další komentáře
    Předmět je vyučován každoročně.
    Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
    Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023.