Výpis publikací

KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Lenka; Martin KADLEC; Ivana MAŠLAŇOVÁ; Ivo SEDLÁČEK; Pavel ŠVEC; Vojtěch KOVAŘOVIC; Roman PANTŮČEK; Michaela KŇAŽKOVÁ; Daniel NÝVLT a Filip HRBÁČEK. Permafrost as a source of mineral weathering bacteria: Implications of active layer thickening on James Ross Island, Antarctica. CATENA. Elsevier B.V., 2025, roč. 249, February, s. 1-10. ISSN 0341-8162. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.catena.2024.108694.

KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Lenka; Soňa SMETANOVÁ; Jacek MARCINIAK; Kristýna BRODÍKOVÁ; Dominika POLAŠTÍK KLEKNEROVÁ; Barbora LAKOTOVÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Vojtěch THON; Petra VÍDEŇSKÁ a Eva BUDINSKÁ. Sampling frequency matters: mapping of the healthy infants' gut microbiome during the first year of life. Current Research in Microbial Sciences. Elsevier B.V., 2025, roč. 9, January, s. 100470-100484. ISSN 2666-5174. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.crmicr.2025.100470.

ŠTEMPELOVÁ, Lucia; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Petr ANDRLA a Viola STROMPFOVÁ. The skin microbiome on healthy and inflammatory altered canine skin determined by next generation sequencing. Frontiers in Microbiology. Frontiers Media SA, 2025, roč. 16, February, s. 1-10. ISSN 1664-302X. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fmicb.2025.1528747.

KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Lenka; Ivo SEDLÁČEK; Filip HRBÁČEK; Pavel ŠVEC; Daniel NÝVLT; Roman PANTŮČEK a Ivana MAŠLAŇOVÁ. Effect of soil depth on the structure of bacterial composition in the active layer at five geologically distinct sites on James Ross and Vega Islands in Antarctica. Polar Biology. Springer-Verlag GmbH, 2024, roč. 47, č. 3, s. 295-303. ISSN 0722-4060. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00300-024-03230-3.

AUST, Anne-Christine; Veronika VIDOVÁ; Kateřina COUFALÍKOVÁ; Soňa SMETANOVÁ; Kristýna KOŽELUHOVÁ; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ; Stanislav SMATANA; Eva BUDINSKÁ; Ivo BOREK; Petr JANKŮ; Jana KLÁNOVÁ; Zdeněk SPÁČIL a Vojtěch THON. Fecal tryptophan metabolite profiling in newborns in relation to microbiota and antibiotic treatment. Applied Microbiology and Biotechnology. SPRINGER, 2024, roč. 108, č. 1, s. 1-14. ISSN 0175-7598. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00253-024-13339-4.

KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Lenka; Kristýna BRODÍKOVÁ; Soňa SMETANOVÁ; Juraj BOSÁK; David ŠMAJS; Petr ANDRLA a Eva BUDINSKÁ. High colonisation by probiotic Escherichia coli A0 34/86 strain is associated with a less diverse microbiome related to children’s age. Beneficial Microbes. Wageningen Academic, 2024, roč. 15, č. 1, s. 5-17. ISSN 1876-2883. Dostupné z: https://doi.org/10.1163/18762891-20220049.

JELÍNEK, Petr; Eliška KUČEROVÁ; Lucie KUNTOVÁ; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Nikola HANIŠÁKOVÁ a Tibor BOTKA. Indukce životaschopného, ale nekultivovatelného stavu u stafylokoků a jeho dopad na citlivost k fágové terapii. In XXXIII. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2024. 2024. ISBN 978-80-280-0550-4. Dostupné z: https://doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P280-0550-2024.

BOTKA, Tibor; Kristína ROVŇÁKOVÁ; Adam VINCO; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ a Roman PANTŮČEK. Spread of staphylococcal mobilome due to different therapeutic approaches. In 19th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections. 2024.

FEDROVÁ, Pavla; Matěj HRALA; Nikola TOM; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Andrea M. A. NASCIMENTO; Juraj BOSÁK a David ŠMAJS. Complete genome sequences of five Escherichia coli strains with probiotic attributes. Microbiology Resource Announcements. Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 2023, roč. 12, č. 9, s. 1-3. ISSN 2576-098X. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/MRA.00363-23.

BUJŇÁKOVÁ, Dobroslava; Katarína KUCKOVÁ; Zora VÁRADYOVÁ; Iveta PLACHÁ; Viola STROMPFOVÁ; Jan BÖHM; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ a Klaudia ČOBANOVÁ. Effects of Dietary Zinc and/or an Herbal Mixture on Intestinal Microbiota and Barrier Integrity in Lambs. Agriculture. MDPI, 2023, roč. 13, č. 9, s. 1-13. ISSN 2077-0472. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/agriculture13091819.

VYDRÁŘ, David; Svatava SNOPKOVÁ; Radek SVAČINKA; Petr HUSA; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Jan BÖHM a Petr HUSA. Gut microbiota changes - dysbiotic senescence pattern in the context of viral suppression. In EACS 2023. 2023.

SNOPKOVÁ, Svatava; Radek SVAČINKA; Petr HUSA; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Jan BÖHM a Petr HUSA. Luminální mikrobiota u lidí žijících s HIV – deplece producentů SCFA. In KMINE 2023 – IX. Kongres klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie. 2023.

LAUKOVÁ, Andrea; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Ivana KUBAŠOVÁ; Eva BINO; Anna KANDRIČÁKOVÁ; Iveta PLACHÁ; Gabriela ŠTRKOLCOVÁ; Branislav GÁLIK; Anton KOVÁČIK; Marko HALO a Monika Pogány SIMONOVÁ. Microbiota, Phagocytic Activity, Biochemical Parameters and Parasite Control in Horses with Application of Autochthonous, Bacteriocin-Producing, Probiotic Strain Enterococcus faecium EF 412. Probiotics and Antimicrobial Proteins. New York: Springer New York LLC, 2023, roč. 15, č. 1, s. 139-148. ISSN 1867-1306. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s12602-022-09918-4.

HUSA, Petr; Petr HUSA; Svatava SNOPKOVÁ; David VYDRÁŘ; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ a Jan BÖHM. Střevní mikrobiota u splenektomovaných pacientů. In Kongres klinické mikrobiologie, infekčního lékařství a epidemiologie (KMINE). 2023.

KUBASOVA, Ivana; Lucia STEMPELOVA; Aladar MADARI; Dobroslava BUJNAKOVA; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ a Viola STROMPFOVA. Application of Canine-Derived Enterococcus faecium DSM 32820 in Dogs with Acute Idiopathic Diarrhoea. Acta Veterinaria Beograd. Warsaw: De Gruyter Open, 2022, roč. 72, č. 2, s. 167-183. ISSN 0567-8315. Dostupné z: https://doi.org/10.2478/acve-2022-0014.

LAUKOVA, Andrea; Lubica CHRASTINOVA; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Eva BINO; Ivana KUBASOVA; Anna KANDRICAKOVA; Sona GANCARCIKOVA; Iveta PLACHA; Monika HOLODOVA; Lubomira GRESAKOVA; Zuzana FORMELOVA a Monika POGANY SIMONOVA. Enterocin M in Interaction in Broiler Rabbits with Autochthonous, Biofilm-Forming Enterococcus hirae Kr8 Strain. Probiotics and Antimicrobial Proteins. New York: Springer New York LLC, 2022, roč. 14, č. 5, s. 845-853. ISSN 1867-1306. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s12602-022-09941-5.

LAUKOVÁ, Andrea; Lenka MICENKOVÁ; Ľubomíra GREŠÁKOVÁ; Michaela MAĎAROVÁ; Monika POGÁNY SIMONOVÁ; Valentína FOCKOVÁ a Jana ŠČERBOVÁ. Microbiome Associated with Slovak Raw Goat Milk, Trace Minerals, and Vitamin E Content. International Journal of Food Science. Hindawi, 2022, roč. 2022, Aug 2022, s. 1-8. ISSN 2356-7015. Dostupné z: https://doi.org/10.1155/2022/4595473.

ZWINSOVÁ, Barbora; Viacheslav PETROV; Martina HRIVŇÁKOVÁ; Stanislav SMATANA; Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ; Natálie KAZDOVÁ; Vlad POPOVICI; Roman HRSTKA; Roman ŠEFR; Beatrix BENCSIKOVÁ; Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ; Veronika BRYCHTOVÁ; Rudolf NENUTIL; Petra VÍDEŇSKÁ a Eva BUDINSKÁ. Colorectal Tumour Mucosa Microbiome Is Enriched in Oral Pathogens and Defines Three Subtypes That Correlate with Markers of Tumour Progression. Cancers. MDPI, 2021, roč. 13, č. 19, s. 1-25. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/cancers13194799.

HRALA, Matěj; Juraj BOSÁK; Lenka MICENKOVÁ; Jitka KŘENOVÁ; Matej LEXA; Viktória PIRKOVÁ; Zuzana TOMASTIKOVA; Ivana KOLÁČKOVÁ a David ŠMAJS. Escherichia coli Strains Producing Selected Bacteriocins Inhibit Porcine Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) under both In Vitro and In Vivo Conditions. Applied and Environmental Microbiology. WASHINGTON, DC (USA): AMER SOC MICROBIOLOGY, 2021, roč. 87, č. 14, s. 1-12. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/AEM.03121-20.

LAUKOVA, Andrea; Lenka MICENKOVÁ; Monika Pogany SIMONOVA; Valentina FOCKOVA; Jana SCERBOVA; Martin TOMASKA; Emilia DVOROZNAKOVA a Miroslav KOLOSTA. Microbiome Associated with Slovak Traditional Ewe's Milk Lump Cheese. Processes. MDPI, 2021, roč. 9, č. 9, s. 1-8. ISSN 2227-9717. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/pr9091603.

BOSÁK, Juraj; Matěj HRALA; Lenka MICENKOVÁ a David ŠMAJS. Non-antibiotic antibacterial peptides and proteins ofEscherichia coli: efficacy and potency of bacteriocins. EXPERT REVIEW OF ANTI-INFECTIVE THERAPY. ABINGDON: TAYLOR & FRANCIS LTD, 2021, roč. 19, č. 3, s. 309-322. ISSN 1478-7210. Dostupné z: https://doi.org/10.1080/14787210.2020.1816824.

BOSÁK, Juraj; Matej LEXA; Kristýna FIEDOROVÁ; Darshak Chandulal GADARA; Lenka MICENKOVÁ; Zdeněk SPÁČIL; Jiří LITZMAN; Tomáš FREIBERGER a David ŠMAJS. Patients With Common Variable Immunodeficiency (CVID) Show Higher Gut Bacterial Diversity and Levels of Low-Abundance Genes Than the Healthy Housemates. Frontiers in Immunology. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2021, roč. 12, May 2021, s. 1-13. ISSN 1664-3224. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.671239.

MICENKOVÁ, Lenka; Juraj BOSÁK; Stanislav SMATANA; Adam NOVOTNÝ; Eva BUDINSKÁ a David ŠMAJS. Administration of the Probiotic Escherichia coli Strain A0 34/86 Resulted in a Stable Colonization of the Human Intestine During the First Year of Life. Probiotics and Antimicrobial Proteins. New York: Springer New York LLC, 2020, roč. 12, č. 2, s. 343-350. ISSN 1867-1306. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s12602-019-09548-3.

SEDLÁČEK, Ivo; Roman PANTŮČEK; Michal ZEMAN; Pavla HOLOCHOVÁ; Ondrej ŠEDO; Eva STAŇKOVÁ; Pavel ŠVEC; Stanislava KRÁLOVÁ; Petra VÍDEŇSKÁ; Lenka MICENKOVÁ; Sah URVASHI; Suresh KORPOLE a Rup LAL. Hymenobacter terrestris sp. nov. and Hymenobacter lapidiphilus sp. nov., isolated from regoliths in Antarctica. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. London: Microbiology Society, 2020, roč. 70, č. 12, s. 6364-6372. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004540.

ŠVEC, Pavel; Marcel KOSINA; Michal ZEMAN; Pavla HOLOCHOVÁ; Stanislava KRÁLOVÁ; Eva NĚMCOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; Urvashi SINGH B.; Vipin GUPTA; Utkarsh SOOD; Rup LAL; Suresh KORPOLE a Ivo SEDLÁČEK. Pseudomonas karstica sp. nov. and Pseudomonas spelaei sp. nov., isolated from calcite moonmilk deposits from caves. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. London: Microbiology Society, 2020, roč. 70, č. 9, s. 5131-5140. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004393.

MICENKOVÁ, Lenka; Juraj BOSÁK; Jiří KUČERA; Matěj HRALA; Tereza DOLEJSOVA; Ondrej ŠEDO; Dirk LINKE; Radovan FISER a David ŠMAJS. Colicin Z, a structurally and functionally novel colicin type that selectively kills enteroinvasive Escherichia coli and Shigella strains. Scientific reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2019, roč. 9, JUL 31 2019, s. 1-12. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-019-47488-8.

BOSÁK, Juraj; Matěj HRALA; Viktória PIRKOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; Alois CIZEK; Jiri SMOLA; Dana KUCEROVA; Zdenka VACKOVA; Eva BUDINSKÁ; Ivana KOLÁČKOVÁ a David ŠMAJS. Porcine pathogenic Escherichia coli strains differ from human fecal strains in occurrence of bacteriocin types. Veterinary Microbiology. AMSTERDAM: Elsevier, 2019, roč. 232, MAY 2019, s. 121-127. ISSN 0378-1135. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2019.04.003.

VÍDEŇSKÁ, Petra; Kristýna ŠMERKOVÁ; Barbora ZWINSOVÁ; Vlad POPOVICI; Lenka MICENKOVÁ; Karel SEDLAR a Eva BUDINSKÁ. Stool sampling and DNA isolation kits affect DNA quality and bacterial composition following 16S rRNA gene sequencing using MiSeq Illumina platform. Scientific reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2019, roč. 9, SEP 2019, s. 1-14. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-019-49520-3.

JIRSOVA, Zuzana; Marie HECZKOVA; Helena DANKOVA; Hana MALINSKA; Petra VÍDEŇSKÁ; Hana VESPALCOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; Lenka BARTONOVA; Eva STICOVA; Alena LODEREROVA; Lucia PREFERTUSOVA; Alena SEKERKOVA; Jaromir HRADECKY a Monika CAHOVA. The Effect of Butyrate-Supplemented Parenteral Nutrition on Intestinal Defence Mechanisms and the Parenteral Nutrition-Induced Shift in the Gut Microbiota in the Rat Model. Biomed Research International. New York: Hindawi Publishing Corporation, 2019, Neuveden, February, s. 1-14. ISSN 2314-6133. Dostupné z: https://doi.org/10.1155/2019/7084734.

BOSÁK, Juraj; Lenka MICENKOVÁ; Matěj HRALA; Katarína POMORSKÁ; Michaela BOSÁKOVÁ; Pavel KREJČÍ; Eduard GÖPFERT; Martin FALDYNA a David ŠMAJS. Colicin F-Y inhibits pathogenic Yersinia enterocolitica in mice. Scientific reports. London: NATURE PUBLISHING GROUP, 2018, roč. 8, č. 12242, s. 1-12. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://doi.org/10.1038/s41598-018-30729-7.

MICENKOVÁ, Lenka; Lucia FRANKOVIČOVÁ; Iva JABORNÍKOVÁ; Juraj BOSÁK; Petr DÍTĚ; Jan ŠMARDA; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; Marta KMEŤOVÁ a David ŠMAJS. Escherichia coli isolates from patients with inflammatory bowel disease: ExPEC virulence- and colicin-determinants are more frequent compared to healthy controls. International Journal of Medical Microbiology. JENA: Urban & Fischer Verlag, 2018, roč. 308, č. 5, s. 498-504. ISSN 1438-4221. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2018.04.008.

JAMBOROVA, Ivana; Brian D. JOHNSTON; Ivo PAPOUSEK; Katerina KACHLIKOVA; Lenka MICENKOVÁ; Connie CLABOTS; Anna SKALOVA; Katerina CHUDEJOVA; Monika DOLEJSKA; Ivan LITERAK a James R. JOHNSON. Extensive Genetic Commonality among Wildlife, Wastewater, Community, and Nosocomial Isolates of Escherichia coli Sequence Type 131 (H30R1 and H30Rx Subclones) That Carry bla(CTX-M-27) or bla(CTX-M-15). Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Washington: American Society for Microbiology, 2018, roč. 62, č. 10, s. 1-15. ISSN 0066-4804. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/AAC.00519-18.

GRILLOVÁ, Linda; Ivo SEDLÁČEK; Gabriela PÁCHNIKOVÁ; Eva STAŇKOVÁ; Pavel ŠVEC; Pavla HOLOCHOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; Juraj BOSÁK; Iva SLANINOVÁ a David ŠMAJS. Characterization of four Escherichia albertii isolates collected from animals living in Antarctica and Patagonia. JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE. Tokyo: JAPAN SOC VET SCI, 2018, roč. 80, č. 1, s. 138-146. ISSN 0916-7250. Dostupné z: https://doi.org/10.1292/jvms.17-0492.

MICENKOVÁ, Lenka; Alžbeta BEŇOVÁ; Lucia FRANKOVIČOVÁ; Juraj BOSÁK; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; Marta KMEŤOVÁ a David ŠMAJS. Human Escherichia coli isolates from hemocultures: Septicemia linked to urogenital tract infections is caused by isolates harboring more virulence genes than bacteraemia linked to other conditions. International Journal of Medical Microbiology. Jena: Elsevier GmbH, 2017, roč. 307, č. 3, s. 182-189. ISSN 1438-4221. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2017.02.003.

BOSÁK, Juraj; Lenka MICENKOVÁ; Magda DOLEŽALOVÁ a David ŠMAJS. Colicins U and Y inhibit growth of Escherichia coli strains via recognition of conserved OmpA extracellular loop 1. International Journal of Medical Microbiology. Jena: Elsevier GMBH, 2016, roč. 306, č. 7, s. 486-494. ISSN 1438-4221. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2016.07.002.

MICENKOVÁ, Lenka; Juraj BOSÁK; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ a David ŠMAJS. Human extraintestinal pathogenic Escherichia coli strains differ in prevalence of virulence factors, phylogroups, and bacteriocin determinants. BMC Microbiology. London: BioMed Central, 2016, roč. 16, č. 218, s. 1-8. ISSN 1471-2180. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s12866-016-0835-z.

MICENKOVÁ, Lenka; Juraj BOSÁK; Barbora ŠTAUDOVÁ; D. KOHOUTOVA; D. CEJKOVA; Vladana WOZNICOVÁ; M. VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; J. BURES a David ŠMAJS. Microcin determinants are associated with B2 phylogroup of human fecal Escherichia coli isolates. MicrobiologyOpen. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2016, roč. 5, č. 3, s. 490-498. ISSN 2045-8827. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/mbo3.345.

ŠTAUDOVÁ, Barbora; Lenka MICENKOVÁ; Juraj BOSÁK; Kristýna HRAZDILOVÁ; Eva SLANINKOVÁ; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; Darina KOHOUTOVÁ; Vladana WOZNICOVÁ; Jan BUREŠ a David ŠMAJS. Determinants encoding fimbriae type 1 in fecal Escherichia coli are associated with increased frequency of bacteriocinogeny. BMC Microbiology. London: BioMed Central, 2015, roč. 15, č. 201, s. 1-9. ISSN 1471-2180. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s12866-015-0530-5.

MICENKOVÁ, Lenka; Katarína POMORSKÁ a David ŠMAJS. Genetic diversity of colicin E1 and fimbriae type I in Escherichia coli strains. In In 6th Congress of European Microbiologists. Maastricht. 2015.

KUDEROVÁ, Alena; Lucia GALLOVÁ; Katarína KURICOVÁ; Eliška NEJEDLÁ; Anna ČURDOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; Ondřej PLÍHAL; David ŠMAJS; Lukáš SPÍCHAL a Jan HEJÁTKO. Identification of AHK2- and AHK3-like cytokinin receptors in Brassica napus reveals two subfamilies of AHK2 orthologues. Journal of Experimental Botany. Oxford: OXFORD UNIV PRESS, 2015, roč. 66, č. 1, s. 339-353. ISSN 0022-0957. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/jxb/eru422.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Vplyv prostredia na produkciu bakteriocínov u druhu Escherchia coli. In In Tomáškovy dny 2015. XXIV. Konference mladých mikrobiologů. Brno. 2015. ISBN 978-80-210-7851-2.

MICENKOVÁ, Lenka; Barbora ŠTAUDOVÁ; Juraj BOSÁK; Lenka MIKALOVÁ; Simona LITTNEROVÁ; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; Vladana WOZNICOVÁ a David ŠMAJS. Bacteriocin-encoding genes and ExPEC virulence determinants are associated in human fecal Escherichia coli strains. BMC Microbiology. LONDON: BioMed Central, 2014, roč. 14, č. 109, s. 1-9. ISSN 1471-2180. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/1471-2180-14-109.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Bakteriocinogénia ako virulentný faktor kmeňov E. coli. In In Konferencia mladých mikrobiológov. Čo nového v mikrobiológii. ČSSM. 2014.

MICENKOVÁ, Lenka; Petra ŠIŠKOVÁ; Juraj BOSÁK; Ivana JAMBOROVÁ; Lenka ČERNOHORSKÁ a David ŠMAJS. Characterization of Human Uropathogenic ESBL-Producing Escherichia coli in the Czech Republic: Spread of CTX-M-27-Producing Strains in a University Hospital. Microbial Drug Resistance. New Rochelle: Mary Ann Liebert Inc., 2014, roč. 20, č. 6, s. 610-617. ISSN 1076-6294. Dostupné z: https://doi.org/10.1089/mdr.2014.0013.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Characterization of human uropathogenic ESBL-producing Escherichia coli: spread of CTX-M-27-producing B2-O25b-ST131 strains in Brno, Czech Republic. In In 24rd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Barcelona. 2014. 2014.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Produkcia bakteriocínov ako virulentný faktor kmeňov Escherichia coli. In In Tomáškovy dny 2014. XXIII. Konference mladých mikrobiologů. 2014.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Význam bakteriocinogénie vo virulencii kmeňov Escherichia coli. In In 58. Studentská vědecká konference LF MU. 2014.

BOSÁK, Juraj; Lenka MICENKOVÁ a David ŠMAJS. Colicin FY inhibits a broad spectrum of Y. enterocolitica isolates. In BioMicroWorld 2013 - V International Conference of Environmental, Industrial and Applied Microbiology. 2013.

ŠTAUDOVÁ, Barbora; Lenka MICENKOVÁ; Juraj BOSÁK; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; Darina KOHOUTOVÁ; Vladana WOZNICOVÁ; Jan BUREŠ a David ŠMAJS. Escherichia coli strains encoding type 1 fimbriae are more often bacteriocin producers. In BioMicroWorld. 2013.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Novel antibacterial substance produced by Escherichia coli O104:H4. In 23rd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Berlin. 2013.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Nový typ antibakteriálnej substancie produkovaný E. coli O104:H4. In Konferencia mladých mikrobiológov. Čo nového v mikrobiológii. ČSSM. 2013.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Nový typ antibakteriálnej substancie produkovaný E. coli O104:H4. In 26. Kongres Československé společnosti mikrobiologické, Brno. 2013.

BOSÁK, Juraj; Lenka MICENKOVÁ; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; Daniela DĚDIČOVÁ; Debora GARZETTI a David ŠMAJS. Unique Activity Spectrum of Colicin FY: All 110 Characterized Yersinia enterocolitica Isolates Were Colicin FY Susceptible. Plos One. PUBLIC LIBRARY SCIENCE: SAN FRANCISCO, 2013, roč. 8, č. 12, s. e81829, 7 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0081829.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Význam bakteriocinogénie v patogenite Escherichia coli. In 57. Studentská vědecká konference LF MU. 2013.

MICENKOVÁ, Lenka. Diverzita kmeňov Escherichia coli izolovaných od pacientov s ochoreniami gastrointestinálneho traktu. In 56.Studentská vědecká konference, 23.5.2012, Brno. 2012.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Diverzita kmeňov Escherichia coli izolovaných od pacientov s ochoreniami gastrointestinálneho traktu. In 56. Studentská vědecká konference LF MU. 2012.

ŠMAJS, David; Darina ČEJKOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; Claudia I. LIMA-BITTENCOURT; Edmar CHARTONE-SOUZA; Jan ŠMARDA a Andréa M. A. NASCIMENTO. Human Escherichia coli strains of different geographical and time source: bacteriocin types and their gene sequences are population-specific. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS. 2012, roč. 4, č. 4, s. 459-466. ISSN 1758-2229. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/j.1758-2229.2012.00365.x.

KUDEROVÁ, Alena; Katarína KURICOVÁ; Eliška NEJEDLÁ; Anna ČURDOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; David ŠMAJS a Jan HEJÁTKO. Identification of cytokinin receptors of Brassica napus. In Functional Genomics and Proteomics for Sustainable Agriculture book of abstracts, a conference commemorating the 190th birth anniversary of Gregor Mendel, Brno, 13th-14th June 2012. 2012. ISBN 978-80-7375-624-6.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. New antibacterial substance produced by Escherichia coli O104:H4. In How bugs kill bugs: progress and challenges in bacteriocin research. Biochemical Society. 2012.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Zmeny v genetickej výbave kmeňov E. coli izolovaných od pacientov s diagnostikovaným ochorením tráviacej sústavy. In Odborný seminár pre mladých mikrobiológov ČSSM. 2012.

ŠMAJS, David; Barbora ŠTAUDOVÁ; Lenka MICENKOVÁ; Jan ŠMARDA; Martin VRBA; Alena ŠEVČÍKOVÁ; Zuzana VALIŠOVÁ a Vladana WOZNICOVÁ. Bacteriocin genes among E. coli strains: the incidence depends on genotype and phenotype of E. coli strains. In Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica, vol. 58, Supplement : 16th International Congress of the Hungarian Society for Microbiology. 2011. ISSN 1217-8950.

ŠMAJS, David; Lenka MICENKOVÁ; Jan ŠMARDA; M VRBA; A. ŠEVČÍKOVÁ; Z. VALIŠOVÁ a Vladana WOZNICOVÁ. Bacteriocinogeny in E. coli phylogroups: commensal E. coli strains produce more often colicins whereas pathogenic strains microcins. In . International Union of Microbiological Societies 2011 Congress. 2011.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Charakterizácia kmeňov Escherichia coli izolovaných od osôb s ochoreniami tráviaceho traktu. In 55. Studentská vědecká konference LF MU, Brno, 18. 5. 2011. 2011.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Identifikácia nových typov antibakteriálnych proteínov produkovaných baktériou Escherichia coli. In Genetická konference, Lednice, 14.-16.9.2011. 2011.

ŠMAJS, David; Lenka MICENKOVÁ; Jan ŠMARDA; M. VRBA; A. ŠEVČÍKOVÁ; Zuzana VALIŠOVÁ a Vladana WOZNICOVÁ. Bacteriocin synthesis in uropathogenic and commensal Escherichia coli: colicin E1 is a potential virulence factor. BMC Microbiology. BioMed Central, 2010, roč. 10, č. 288, 10 s. ISSN 1471-2180.

ŠMAJS, David; Lenka MICENKOVÁ; Jan ŠMARDA; M. VRBA a A. ŠEVČÍKOVÁ. Diverzita a frekvence výskytu bakteriocinů u lidských komensálních a patogenních kmenů E. coli. In 25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. 2010.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Identifikácia bakteriocínov u kmeňov Escherichia coli izolovaných z črevnej flóry pacientov s ochoreniami tráviaceho traktu. In 54. Studentská vědecká konference LF MU. 2010.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Identifikácia bakteriocínov u kmeňov Escherichia coli izolovaných z črevnej flóry pacientov u infekčných a neinfekčných ochorení tráviaceho traktu. In XIX. Tomáškovy dny. 2010.

ŠMAJS, David; Lenka MICENKOVÁ; Jan ŠMARDA; M. VRBA a A. ŠEVČÍKOVÁ. Incidence of bacteriocin types among human commensal and pathogenic E. coli strains. In XXXIII. International Congress on Microbial Ecology and Disease. 2010.

ŠMAJS, David; Lenka MICENKOVÁ; Jan ŠMARDA; M. VRBA; A. ŠEVČÍKOVÁ; Zuzana VALIŠOVÁ a Vladana WOZNICOVÁ. Colicin E1 production is associated with bacteriocin multiproducer strains in uropathogenic Escherichia coli. In III. International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology (BioMicroWorld2009). 2009.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Molekulárna typizácia bakteriocínov v skupinách kmeňov Escherichia coli. In 53. Studentská vědecká konference. 2009.

MICENKOVÁ, Lenka a David ŠMAJS. Molekulárne typovanie bakteriocínov v skupinách kmeňov Escherichia coli. In XIII.Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2009, s. 80. ISBN 978-80-210-4830-0.