Výpis publikací

PROCHÁZKOVÁ, Iva; Juraj LENČO a Pavel BOUCHAL. Targeted Proteomics Driven Verification of Biomarker Candidates Associated with Breast Cancer Aggressiveness. In Minnie M. Sarwal and Tara K. Sigdel. Tissue Proteomics. New York: Humana Press, 2018, s. 177-184. Methods in Molecular Biology 1788. ISBN 978-1-4939-7852-6. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/7651_2017_111.

PROCHÁZKOVÁ, Iva; Juraj LENČO; Alena FUČÍKOVÁ; Jiří DRESLER; Lenka ČÁPKOVÁ; Roman HRSTKA; Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. Targeted proteomics driven verification of biomarker candidates associated with breast cancer aggressiveness. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics. AMSTERDAM: Elsevier Science, 2017, roč. 1865, č. 5, s. 488-498. ISSN 1570-9639. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2017.02.012.

FAKTOR, Jakub; Rita SUCHÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; Vendula PERNIKÁŘOVÁ a Pavel BOUCHAL. Cielené proteomické prístupy pre analýzu ľudského nádorového tkaniva. In Klinická onkologie "XL brněnské onkologické dny a XXX. konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky". 2016. ISSN 1802-5307.

FAKTOR, Jakub; Rita SUCHÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; Juraj LENČO; Vendula PÁRALOVÁ a Pavel BOUCHAL. Comparison of targeted proteomics approaches for quantifying breast cancer associated proteins. In 10th Central and Eastern European Proteomics Conference. 2016. ISBN 978-963-7067-33-4.

DVOŘÁKOVÁ, Monika; Jarmila SOBOTKOVÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; Juraj LENČO; Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. Transgelin is upregulated in stromal cells of lymph node positive breast cancer. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2016, roč. 132, January, s. 103-111. ISSN 1874-3919. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2015.11.025.

FAKTOR, Jakub; Rita SUCHÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. Advantages and drawbacks of SRM, pseudo-SRM and SWATH targeted proteomics modes in cancer research. In 6th RECAMO joint meeting. 2015. ISBN 978-80-86793-37-5.

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Zbyněk BORTLÍČEK; Ivana IHNATOVÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; JTC HO; Josef MARYÁŠ; Hana IMRICHOVÁ; Eva BUDINSKÁ; Rostislav VYZULA; Spiros D, GARBIS; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. Combined proteomics and transcriptomics identifies carboxypeptidase B1 and NF-kappa B associated proteins as putative biomarkers of metastasis in low grade breast cancer. In European Cancer Congress 2015, Vienna, Austria, 25.-29.9.2015 - European Journal of Cancer, Vol. 51, S3. Oxford: Elsevier Science Inc., 2015. s. S24-S25, 2 s. 2015. ISSN 0959-8049.

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Zbyněk BORTLÍČEK; Ivana IHNATOVÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; JTC HO; Josef MARYÁŠ; Hana IMRICHOVÁ; Eva BUDINSKÁ; Rostislav VYZULA; SD GARBIS; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. Combined Proteomics and Transcriptomics Identifies Carboxypeptidase B1 and Nuclear Factor kappa B (NF-kappa B) Associated Proteins as Putative Biomarkers of Metastasis in Low Grade Breast Cancer. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS. BETHESDA: AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INC, 2015, roč. 14, č. 7, s. 1814-1830. ISSN 1535-9476. Dostupné z: https://doi.org/10.1074/mcp.M114.041335.

MARYÁŠ, Josef; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; Rudolf NENUTIL; Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Funkční charakterizace potenciálně pro-metastatických proteinů u nádorů prsu. In XXXIX. Brněnské onkologické dny a XXIX. konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky. 2015.

MARYÁŠ, Josef; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. Investigation of pro-metastatic role of PDLIM2 protein in breast cancer using functional proteomics. In 9th European Summer School ADVANCED PROTEOMICS. 2015.

MARYÁŠ, Josef; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva PROCHÁZKOVÁ; Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. Investigation of the role of PDLIM2 in breast cancer metastasis. In 6th RECAMO joint meeting. 2015.

BOUCHAL, Pavel; Josef MARYÁŠ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Jakub FAKTOR; Iva PROCHÁZKOVÁ; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. “OMICS” přístupy ve vyhledávání metastatických biomarkerů u nádorů prsu. In XXXIX. Brněnské onkologické dny a XXIX. konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky, Brno, 8.-10.4.2015. 2015. ISSN 0862-495X.

PROCHÁZKOVÁ, Iva a Bořivoj VOJTĚŠEK. Polo-like kináza 1 jako cíl protinádorové terapie. Klinická onkologie. 2015. ISSN 0862-495X.

PERNIKÁŘOVÁ, Vendula; Vojtěch SEDLÁČEK; David POTĚŠIL; Iva PROCHÁZKOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL; Pavel BOUCHAL a Igor KUČERA. Proteome-wide dataset generated by iTRAQ-3DLCMS/MS technique for studying the role of FerB protein in oxidative stress in Paracoccus denitrificans. Data in Brief. Amsterdam: Elsevier, 2015, roč. 4, September, s. 390-394. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.dib.2015.06.015.

PERNIKÁŘOVÁ, Vendula; Vojtěch SEDLÁČEK; David POTĚŠIL; Iva PROCHÁZKOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL; Pavel BOUCHAL a Igor KUČERA. Proteomic responses to a methyl viologen-induced oxidative stress in the wild type and FerB mutant strains of Paracoccus denitrificans. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2015, roč. 125, July, s. 68-75. ISSN 1874-3919. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2015.05.002.

PROCHÁZKOVÁ, Iva; Robert O'NEILL; Robert HUPP a Bořivoj VOJTĚŠEK. Testing of new polo-like kinase 1 inhibitor on oesophageal cancer cell lines. In 6th RECAMO joint meeting. 2015. ISBN 978-80-86793-37-5.

PROCHÁZKOVÁ, Iva; Robert J O NEILL; Ted R HUPP a Bořivoj VOJTĚŠEK. Testing of new polo-like kinase 1 inhibitor on oesophageal cancer cell lines. In 6TH RECAMO JOINT MEETING - THROUGH CANCER RESEARCH TOWARDS APPLIED MOLECULAR ONCOLOGY. 2015.

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Zbyněk BORTLÍČEK; Ivana IHNATOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Spiros D. GARBIS; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. A novel panel of proteins correlating with lymph node metastasis of low-grade breast cancer as identified by combined proteomics and transcriptomics approach. 2014.

BOUCHAL, Pavel; Jakub FAKTOR; Josef MARYÁŠ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Vendula PERNIKÁŘOVÁ; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. Proteomické přístupy ve vyhledávání biomarkerů a molekulární klasifikaci nádorů prsu. In XXI. Biologické dny, Brno, 4.-5.9.2014. 2014. ISBN 978-80-260-6793-1.

MARYÁŠ, Josef; Jakub FAKTOR; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Peter GRELL a Pavel BOUCHAL. Proteomics in investigation of cancer metastasis: Functional and clinical consequences and methodological challenges. Proteomics. Wiley VCH, 2014, roč. 14, 4-5, s. 426-440. ISSN 1615-9853. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/pmic.201300264.

PROCHÁZKOVÁ, Iva; Juraj LENČO; Alena FUČÍKOVÁ; Rudolf NENUTIL; Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Verification of proteins associated with estrogen receptor, tumor grade and lymph node status in breast cancer using targeted proteomics. In 5th RECAMO joint meeting. 2014. ISBN 978-80-86793-33-7.

BOUCHAL, Pavel; Jakub FAKTOR; Josef MARYÁŠ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Lucia KNOPFOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Spiros D. GARBIS; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. A novel panel of proteins correlating with lymph node metastasis of low-grade breast cancer: Towards functional characterization and clinical validation. 2013.

STRUHÁROVÁ, Iva; Juraj LENCO; Alena FUČÍKOVA; Rudolf NENUTIL; Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Biomarker verification in breast cancer using targeted proteomics method selected reaction monitoring. In 4th RECAMO joint meeting. 2013. ISBN 978-80-86793-28-3.

BOUCHAL, Pavel; Jakub FAKTOR; Josef MARYÁŠ; Iva PROCHÁZKOVÁ a Monika DVOŘÁKOVÁ. Proteomické aplikace a experimenty v onkologickém výzkumu. 2013.

PROCHÁZKOVÁ, Iva; Juraj LENČO; Alena FUČÍKOVÁ; Rudolf NENUTIL; Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Quantification of pro-tumorigenic proteins in breast cancer by targeted proteomics. In IntegRECAMO Summer school 2013 "Methods of basic and translational cancer reasearch". 2013.

FAKTOR, Jakub; Monika DVOŘÁKOVÁ; Josef MARYÁŠ; Iva STRUHÁROVÁ a Pavel BOUCHAL. Identification and characterization of pro-metastatic targets, pathways and molecular complexes using a toolbox of proteomic technologies. Klinická onkologie. Praha: Česká lékařská společnost J.E.Purkyně, 2012, roč. 25, Suppl. 2, s. 2S70-2S77, 8 s. ISSN 0862-495X.

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Zbyněk BORTLÍČEK; Ivana IHNATOVÁ; Jenny HO; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Rostislav VYZULA; Spiros D. GARBIS; Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. Molecular players in lymph node metastasis of low grade breast cancer: From proteomics-based target discovery to functional characterization. 2012.

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Juraj LENČO; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci. In XXIII. Biochemický sjezd. Brno, 26.-29.8. 2012. p. 86. 2012.

STRUHÁROVÁ, Iva; Juraj LENČO; Alena FUČÍKOVÁ; Rudolf NENUTIL; Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Validation of prometastatic proteins in low-grade breast cancer by targeted mass spectrometry approach based on selected reaction monitoring. 2012.

STRUHÁROVÁ, Iva; Juraj LENČO; Alena FUČÍKOVÁ; Jiří DRESLER; Rudolf NENUTIL; Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Verification of protein targets related to grade, lymph node and hormonal receptor status in breast cancer via selected reaction monitoring with mTRAQ labeling. 2012.

STRUHÁROVÁ, Iva; Pavel BOUCHAL; Jiří JARKOVSKÝ; Kristýna HRAZDILOVÁ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Lenka HERNYCHOVÁ; Jiří DAMBORSKÝ; Petr SOVA a Bořivoj VOJTĚŠEK. An induction of Retinol Binding Protein 4 by new platinum-based anticancer agent LA-12. In "2nd RECAMO joint meeting": Role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone system in tumour biology. 2011. ISBN 978-80-86793-20-7.

BOUCHAL, Pavel; Tereza VYHLÍDALOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL a Igor KUČERA. Fe/Mn superoxide dismutase in Paracoccus denitrificans is induced by azide and expressed independently on FNR-type regulators. Folia Microbiologica. Dordrecht, The Netherlands: Springer, 2011, roč. 56, č. 1, s. 13-17. ISSN 0015-5632. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s12223-011-0007-3.

FAKTOR, Jakub; Iva STRUHÁROVÁ; Alena FUČÍKOVÁ; Martin HUBÁLEK; Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí. Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2011, roč. 105, č. 11, s. 846-850. ISSN 0009-2770.

STRUHÁROVÁ, Iva; Pavel BOUCHAL; Jiří JARKOVSKÝ; Kristýna HRAZDILOVÁ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Lenka HERNYCHOVÁ; Jiří DAMBORSKÝ; Petr SOVA a Bořivoj VOJTĚŠEK. The new platinum anticancer agent LA-12 induces Retinol Bionding Protein 4 in vivo. In 5th European Summer School in "Proteomics Basics". 2011.

BOUCHAL, Pavel; Jiří JARKOVSKÝ; Kristýna HRAZDILOVÁ; Monika DVOŘÁKOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Lenka HERNYCHOVÁ; Jiří DAMBORSKÝ; Petr SOVA a Bořivoj VOJTĚŠEK. The new platinum-based anticancer agent LA-12 induces retinol binding protein 4 in vivo. Proteome Science. BioMed Central, 2011, roč. 9, č. 68, s. "nestránkováno", 9 s. ISSN 1477-5956. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/1477-5956-9-68.

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Zbyněk BORTLÍČEK; Iva STRUHÁROVÁ; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Towards understanding the mechanisms of metastasis in low grade breast cancer: Discovery of new targets via "omics" techniques. In HUPO 2011 10th Annual World Congress. 2011.

BOUCHAL, Pavel; Monika DVOŘÁKOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Zbyněk BORTLÍČEK; Iva STRUHÁROVÁ; Michaela ŠČIGELOVÁ; Alexander SCHERL; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Towards understanding the mechanisms of metastasis in low grade breast cancer: Discovery of new targets with proteomics-driven transcriptomic approach. In „2nd RECAMO joint meeting“: Role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone systém in tumour biology. 2011. ISBN 978-80-86793-20-7.

BOUCHAL, Pavel; Monika MUDROCHOVÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Theodoros ROUMELIOTIS; Eva BUDINSKÁ; Dominika VÁŇOVÁ; Lenka HERNYCHOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Roman HRSTKA; Petr MÜLLER; Alexander SCHERL; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarker discovery in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach. In Abstract book of "3rd joint meeting on the role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone system in tumour biology". 2010. ISBN 978-80-86793-16-0.

BOUCHAL, Pavel; Monika MUDROCHOVÁ; Eva BUDINSKÁ; Zbyněk BORTLÍČEK; Iva STRUHÁROVÁ; Lenka HERNYCHOVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Spiros D. GARBIS; Roman HRSTKA; Petr MÜLLER; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach. In XXII. Biochemický zjazd: The Book of Abstracts. 2010. ISBN 978-80-88866-83-1.

BOUCHAL, Pavel; Monika MUDROCHOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Theodoros ROUMELIOTIS; Lenka HERNYCHOVÁ; Roman HRSTKA; Spiros D. GARBIS; Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Biomarkers of metastatic potential in low grade breast cancer. 2010.

BOUCHAL, Pavel; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Ondrej ŠEDO; Tereza VYHLÍDALOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL; Rob VAN SPANNING a Igor KUČERA. Unraveling an FNR based regulatory circuit in Paracoccus denitrificans using a proteomics-based approach. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics. Amsterdam, The Netherlands: Elsevier, 2010, roč. 1804, č. 6, s. 1309-1316. ISSN 1570-9639. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2010.01.016.

BOUCHAL, Pavel; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Ondrej ŠEDO; Tereza VYHLÍDALOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL; Rob VAN SPANNING a Igor KUČERA. The study on Fnr-type transcription regulators functions in bacterium Paracoccus denitrificans using proteomics, transcriptomics and bioinformatics tools. In FEBS JOURNAL. Conference Information: 34th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies. 2009. ISSN 1742-464X.

BOUCHAL, Pavel; Iva STRUHÁROVÁ; Eva BUDINSKÁ; Ondrej ŠEDO; Tereza VYHLÍDALOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL; Rob VAN SPANNING a Igor KUČERA. Unraveling a FNR-based regulatory circuit in bacterium Paracoccus denitrificans using proteomics, transcriptomic and bioinformatic approaches. In 2009 SPS Scientific Meeting: "Proteome Dynamics: Protein Quantification in Time and Space". 2009.

BOUCHAL, Pavel; Tereza VYHLÍDALOVÁ; Iva STRUHÁROVÁ; Ondrej ŠEDO; Zbyněk ZDRÁHAL; Willem REIJNDERS; Rob VAN SPANNING a Igor KUČERA. The study on the FnrP, NNR and NarR transcription regulator function in bacterium Paracoccus denitrificans at global proteome level. In 8th Siena Meeting: From Genome To Proteome: Integration and Proteome Completion. 2008.